Sfingomonas - Sphingomonas
Sfingomonas byla definována v roce 1990 jako skupina Gramnegativní ve tvaru tyče, chemoheterotrofní, přísně aerobní bakterie. Mají ubichinon 10 jako jejich major respirační chinon obsahují glykosfingolipidy (GSL), konkrétně ceramid,[2] namísto lipopolysacharid (LPS) ve svých buněčných obálkách a obvykle produkují žlutě zbarvené kolonie.[3]
Do roku 2001 rod zahrnoval více než 20 druhů, které byly velmi rozmanité, pokud jde o jejich fylogenetické, ekologické a fyziologické vlastnosti. Jako výsledek, Sfingomonas byl rozdělen do různých rodů: Sfingomonas, Sfingobium, Novosphingobium, Sfingosinicella, a Sfingopyxis. Tyto rody se běžně označují souhrnně jako sfingomonády. Sfingomonády jsou v přírodě široce rozšířeny, protože byly izolovány z mnoha různých pozemních a vodních stanovišť, stejně jako z kořenových systémů rostlin, klinických vzorků a dalších zdrojů; je to způsobeno jejich schopností přežít v nízkých koncentracích živin a také metabolizovat širokou škálu zdrojů uhlíku. Četné kmeny byly izolovány z prostředí kontaminovaného toxickými sloučeninami, kde vykazují schopnost využívat kontaminující látky jako živiny.[3]
Některé ze sfingomonád (zejména Sphingomonas paucimobilis) také hrají roli v lidských onemocněních, primárně tím, že způsobují řadu většinou nozokomiální, neohrožující život infekce které jsou obvykle snadno léčitelné antibiotikum terapie.[4][5]
Kvůli jejich biodegradativní a biosyntetický schopnosti, sfingomonády byly použity pro širokou škálu biotechnologických aplikací, od bioremediace kontaminantů životního prostředí na produkci extracelulárních polymerů, jako je sfingany (např., gellan, Welan, a rhamsan ) hojně používaný v potravinářském a jiném průmyslu.[6] Čím kratší uhlohydrát část GSL ve srovnání s částí LPS vede k tomu, že buněčný povrch je více hydrofobní než u jiných gramnegativních bakterií, pravděpodobně za obojí Sphingomonas ' citlivost na hydrofobní antibiotika a jeho schopnost degradovat hydrofobní polycyklické aromatické uhlovodíky.[3] Jeden kmen, Sfingomonas sp. 2 MPII, může degradovat 2-methylfenanthren.[7] V květnu 2008 vyhrál Daniel Burd, 16letý Kanaďan Kanadský vědecký veletrh v Ottawě poté, co to zjistil Sfingomonas může degradovat více než 40% hmotnosti plastových sáčků (Polyethylen ) za méně než tři měsíce.[8]
A Sfingomonas sp. kmen BSAR-1 exprimující vysokou aktivitu alkalická fosfatáza (PhoK) bioprecipitace z uran z alkalických roztoků. Schopnost srážení byla zvýšena nadměrnou expresí proteinu PhoK v E-coli. Toto je první zpráva o bioprecipitaci uranu za alkalických podmínek.[9]
Reference
- ^ A b C d E F G h i j k l m n Ó str q r s LPSN lpsn.dsmz.de
- ^ Minamino, Miki; Sakaguchi, Ikuyo; Naka, Takashi; Ikeda, Norikazu; Kato, Yoshiko; Tomiyasu, Ikuko; Yano, Ikuya; Kobayashi, Kazuo (2003). „Bakteriální ceramidy a sfingofosfolipidy indukují apoptózu lidských leukemických buněk“. Mikrobiologie. 149 (8): 2071–2081. doi:10,1099 / mic. 0,25922-0. PMID 12904547.
- ^ A b C Sfingomonas, Microbewiki
- ^ Ryan MP, Adley CC (2010). „Sphingomonas paucimobilis: perzistentní gramnegativní nozokomiální infekční organismus“. J Hosp Infect. 75 (3): 153–7. doi:10.1016 / j.jhin.2010.03.007. PMID 20434794.
- ^ Sphingomonas paucimobilis Infekce krevního řečiště spojené s kontaminovaným intravenózním fentanylem, Lisa L. Maragakis, Romanee Chaiwarith, Arjun Srinivasan, Francesca J. Torriani, Edina Avdic, Andrew Lee, Tracy R. Ross, Karen C. Carroll a Trish M. Perl, Emerging Infectious Diseases Vol. 15, č. 1, leden 2009
- ^ Yabuuchi E, Kosako Y (2015). "Sphingomonas". Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. John Wiley & Sons. s. 1–39. doi:10.1002 / 9781118960608.gbm00924. ISBN 9781118960608.
- ^ G.M. Ni'matuzahroh; M. Gilewicz; M. Guiliano & J.C.Bertrand (květen 1999). "In vitro studie interakce mezi fotooxidací a biodegradací 2-methylfenanthrenu pomocí Sfingomonas sp 2MPII ". Chemosféra. 38 (11): 2501–2507. Bibcode:1999Chmsp..38.2501N. doi:10.1016 / S0045-6535 (98) 00456-1. ISSN 0045-6535. PMID 10204235.
- ^ TheRecord.com - CanadaWorld - studentka WCI izoluje mikroby, které obíhají na plastových pytlích
- ^ K.S. Nilgiriwala; A. Alahari; A. S. Rao & S.K. Apte (září 2008). "Klonování a nadměrná exprese alkalické fosfatázy PhoK ze Sphingomonas sp. Kmen BSAR-1 pro bioprecipitaci uranu z alkalických roztoků" (PDF). Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 74 (17): 5516–5523. doi:10.1128 / AEM.00107-08. ISSN 1098-5336. PMC 2546639. PMID 18641147.
externí odkazy
- Článek popisující objev Sfingomonas jako biodegradátor plastových sáčků Kawawada, Karen, The Record (22. května 2008).