Integrin alfa 6 - Integrin alpha 6

ITGA6
Identifikátory
Aliasy	ITGA6, CD49f, ITGA6B, VLA-6, integrinová podjednotka alfa 6
Externí ID	OMIM: 147556 MGI: 96605 HomoloGene: 20091 Genové karty: ITGA6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	172,506,459 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	71,858,416 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kovových iontů; • integrinová vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • lamininová vazba; • vazba neuregulinu; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu; • vazba inzulínového růstového faktoru I.; • kadherinová vazba;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • ohnisková adheze; • bazální část buňky; • buněčná membrána; • hemidesmosom; • bazální membrána; • povrch buňky; • komplex integrinu; • bazální plazmatická membrána; • bazolaterální plazmatická membrána; • vnější strana plazmatické membrány; • komplex integrin alfa6-beta4; • filopodium;
Biologický proces	• buněčná odpověď na extracelulární stimul; • sestava hemidesmosomu; • vývoj ledvinového systému; • vývoj nehtů; • pozitivní regulace adheze buněk k buňkám; • sestava filopodia; • negativní regulace vnější apoptotické signální dráhy; • organizace extracelulární matice; • odontogeneze zubu obsahujícího dentin; • adheze buněk a substrátů; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy; • buněčná adheze; • buněčná adheze zprostředkovaná integrinem; • diferenciace hnědých tukových buněk; • pozitivní regulace apoptotického procesu; • sestava spojení buňka-substrát; • integrinem zprostředkovaná signální dráha; • pozitivní regulace fosforylace; • buněčná matice adheze; • vývoj trávicího traktu; • ektodermální diferenciace buněk; • migrace leukocytů; • vývoj kůže; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • amelogeneze; • buněčná odpověď na organickou cyklickou sloučeninu; • pozitivní regulace adheze buněk k substrátu; • pozitivní regulace buněčné migrace; • buněčná adheze; • pozitivní regulace vývoje projekce neuronů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3655
	16403
	ENSG00000091409
	ENSMUSG00000027111
	P23229
	Q61739
	NM_000210; NM_001079818; NM_001316306; NM_001365529; NM_001365530
	NM_001277970; NM_008397
	NP_000201; NP_001073286; NP_001303235; NP_001352458; NP_001352459
	NP_001264899; NP_032423
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Integrin alfa-6 je protein že u lidí je kódován ITGA6 gen.

Funkce

Produktem proteinu ITGA6 je integrinový alfa řetězec alfa 6. Integriny jsou integrální proteiny buněčného povrchu složené z alfa řetězce a beta řetězce. Daný řetězec se může kombinovat s více partnery, což vede k různým integrinům. Například alfa 6 se může kombinovat s beta 4 v integrinu označovaném jako TSP180 nebo s beta 1 v integrinu VLA-6. Je známo, že integriny se účastní buněčné adheze i signalizace zprostředkované buněčným povrchem. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[5] Specifická ztráta tohoto integrinového řetězce ve střevním epitelu, a tím i jeho hemidesmosomech, vyvolává dlouhodobou kolitidu a infiltrující adenokarcinomy.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že ITGA6 komunikovat s TSPAN4^[7] a GIPC1.^[8]

Viz také

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000091409 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027111 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: ITGA6 integrin, alfa 6“.
^ De Arcangelis A, Hamade H, Alpy F, Normand S, Bruyère E, Lefebvre O a kol. (Říjen 2017). „Integrita hemidesmosomu chrání tlusté střevo před kolitidou a kolorektálním karcinomem“. Střevo. 66 (10): 1748–1760. doi:10.1136 / gutjnl-2015-310847. PMC 5595104. PMID 27371534.
^ Tachibana I, Bodorova J, Berditchevski F, Zutter MM, Hemler ME (listopad 1997). „NAG-2, nový protein transmembránové 4 superrodiny (TM4SF), který se komplexuje s integriny a dalšími proteiny TM4SF“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (46): 29181–9. doi:10.1074 / jbc.272.46.29181. PMID 9360996.
^ Tani TT, Mercurio AM (září 2001). „Místa interakce PDZ v podjednotkách integrinu alfa. T14853, TIP / GIPC se váže na rozpoznávací sekvenci typu I v alfa 6A / alfa 5 a novou sekvenci v alfa 6B“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (39): 36535–42. doi:10,1074 / jbc.M105785200. PMID 11479315.

Další čtení

Lipscomb EA, Mercurio AM (září 2005). „Mobilizace a aktivace signálního kompetentního alfa6beta4integrinu je základem jeho příspěvku k progresi karcinomu“. Recenze metastázy rakoviny. 24 (3): 413–23. doi:10.1007 / s10555-005-5133-4. PMID 16258729. S2CID 26150860.

externí odkazy

CD49f + antigen v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
ITGA6 Informace s odkazy v Brána pro migraci buněk

Tento membránový protein –Příbuzný článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000091409 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027111 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[5] „Entrez Gene: ITGA6 integrin, alfa 6“.

[pmid27371534-6] De Arcangelis A, Hamade H, Alpy F, Normand S, Bruyère E, Lefebvre O a kol. (Říjen 2017). „Integrita hemidesmosomu chrání tlusté střevo před kolitidou a kolorektálním karcinomem“. Střevo. 66 (10): 1748–1760. doi:10.1136 / gutjnl-2015-310847. PMC 5595104. PMID 27371534.

[pmid9360996-7] Tachibana I, Bodorova J, Berditchevski F, Zutter MM, Hemler ME (listopad 1997). „NAG-2, nový protein transmembránové 4 superrodiny (TM4SF), který se komplexuje s integriny a dalšími proteiny TM4SF“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (46): 29181–9. doi:10.1074 / jbc.272.46.29181. PMID 9360996.

[pmid11479315-8] Tani TT, Mercurio AM (září 2001). „Místa interakce PDZ v podjednotkách integrinu alfa. T14853, TIP / GIPC se váže na rozpoznávací sekvenci typu I v alfa 6A / alfa 5 a novou sekvenci v alfa 6B“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (39): 36535–42. doi:10,1074 / jbc.M105785200. PMID 11479315.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Proteiny: shluky diferenciace (viz také seznam lidských klastrů diferenciace )
1–50	CD1 a-c 1A 1B 1D 1E CD2 CD3 y δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 A CD9 CD10 CD11 A b C d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 A b C d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 A b C d E F CD50
51–100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 A b C d E F CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 A b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 A d E h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 - CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101–150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 A b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 A b CD121 A b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151–200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 A b C CD157 CD158 (A d E i k ) CD159 A C CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 A b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 A b G CD174 CD177 CD178 CD179 A b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201–250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 A b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (A b ) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 A b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 - CD248 CD249
251–300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301–350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350