CD1A - CD1A

CD1A
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1 ONQ, 1XZ0, 4X6C, 4X6D, 4X6E, 4X6F
Identifikátory
Aliasy	CD1A, Molekula CD1, FCB6, HTA1, R4, T6, CDla
Externí ID	OMIM: 188370 HomoloGene: 113556 Genové karty: CD1A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	158,258,269 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba beta-2-mikroglobulinu; • vazba endogenního lipidového antigenu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba exogenního lipidového antigenu; • vazba lipopeptidů;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membránový vor; • endosom; • integrální součást plazmatické membrány; • endosomová membrána; • membrána; • buněčná membrána; • povrch buňky; • extracelulární; • vnější strana plazmatické membrány;
Biologický proces	• zpracování a prezentace antigenu, exogenní lipidový antigen prostřednictvím MHC třídy Ib; • adaptivní imunitní odpověď; • proces imunitního systému; • imunitní odpověď; • regulace imunitní odpovědi; • pozitivní regulace cytotoxicity zprostředkované T buňkami; • zpracování a prezentace antigenu, endogenní lipidový antigen prostřednictvím MHC třídy Ib;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	909
	n / a
	ENSG00000158477
	n / a
	P06126
	n / a
	NM_001763; NM_001320652
	n / a
	NP_001307581; NP_001754
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

CD1a (Clesk Differentiation 1a) je člověk protein kódováno CD1A gen.^[3]

Tento gen kóduje člena Rodina CD1 transmembránových glykoproteinů, které strukturně souvisí s hlavní komplex histokompatibility (MHC) proteiny a tvoří heterodimery s beta-2-mikroglobulinem. Proteiny CD1 zprostředkovávají prezentaci primárně lipidových a glykolipidových antigenů vlastního nebo mikrobiálního původu do T buněk. Lidský genom obsahuje pět genů rodiny CD1 uspořádaných v klastru na chromozomu 1. Předpokládá se, že členové rodiny CD1 se liší svou buněčnou lokalizací a specificitou pro konkrétní lipidové ligandy. Protein kódovaný tímto genem se lokalizuje na plazmatickou membránu a recykluje vezikuly časného endocytického systému. Alternativně byly pozorovány sestřižené varianty transkriptu, ale jejich biologická platnost nebyla stanovena.^[3] Úrovně transkriptů genu CD1A jsou nadměrně regulovány v plicním parenchymu kuřáků. ^[4]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000158477 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b "Entrezův gen: molekula CD1A CD1a".
^ Pintarelli G, Noci S, Maspero D, Pettinicchio A, Dugo M, De Cecco L, Incarbone M, Tosi D, Santambrogio L, Dragani TA, Colombo F (září 2019). „Cigaretový kouř mění transkriptom nezúčastněné plicní tkáně u pacientů s plicním adenokarcinomem“. Vědecké zprávy. 9 (1): 13039. doi:10.1038 / s41598-019-49648-2. PMC 6736939. PMID 31506599.

externí odkazy

Člověk CD1A umístění genomu a CD1A stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P06126 (Povrchový glykoprotein lidských T-buněk CD1a) na PDBe-KB.

Další čtení

Melián A, Beckman EM, Porcelli SA, Brenner MB (1996). "Prezentace antigenu CD1 a MHC kódovanými molekulami typu I". Curr. Opin. Immunol. 8 (1): 82–8. doi:10.1016 / S0952-7915 (96) 80109-9. PMID 8729450.
Park SH, Bendelac A (2000). "Odpovědi T-buněk omezených na CD1 a mikrobiální infekce". Příroda. 406 (6797): 788–92. doi:10.1038/35021233. PMID 10963609.
Brigl M, Brenner MB (2004). "CD1: prezentace antigenu a funkce T buněk". Annu. Rev. Immunol. 22 (1): 817–90. doi:10.1146 / annurev.immunol.22.012703.104608. PMID 15032598.
Coventry B, Heinzel S (2004). „CD1a u lidských rakovin: nová role pro starou molekulu“. Trends Immunol. 25 (5): 242–8. doi:10.1016 / j.it.2004.03.002. PMID 15099564.
Moody DB, Zajonc DM, Wilson IA (2005). "Anatomie komplexů antigenu CD1-lipid". Nat. Rev. Immunol. 5 (5): 387–99. doi:10.1038 / nri1605. PMID 15864273.
Sporák V, Verhasselt B (2006). "Modelování brzlíkových účinků HIV-1 Nef". Curr. HIV Res. 4 (1): 57–64. doi:10.2174/157016206775197583. PMID 16454711.
Quaranta MG, Mattioli B, Giordani L, Viora M (2006). „Imunoregulační účinky HIV-1 Nef na dendritické buňky a patogeneze AIDS“. FASEB J. 20 (13): 2198–208. doi:10.1096 / fj.06-6260rev. PMID 17077296.
Oakey RJ, Watson ML, Seldin MF (1993). "Konstrukce fyzické mapy na myší a lidském chromozomu 1: srovnání 13 Mb myší a 11 Mb lidské DNA". Hučení. Mol. Genet. 1 (8): 613–20. doi:10,1093 / hmg / 1,8,613. PMID 1301170.
Martin LH, Calabi F, Lefebvre FA a kol. (1988). "Struktura a exprese lidských thymocytových antigenů CD1a, CD1b a CD1c". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 84 (24): 9189–93. doi:10.1073 / pnas.84.24.9189. PMC 299718. PMID 2447586.
Moseley WS, Watson ML, Kingsmore SF, Seldin MF (1989). „CD1 definuje konzervovanou hranici skupiny vazeb mezi lidskými chromozomy 1 a myšími chromozomy 1 a 3“. Imunogenetika. 30 (5): 378–82. doi:10.1007 / BF02425278. PMID 2478463.
Yu CY, Milstein C (1990). „Fyzická mapa spojující pět genů antigenu pro diferenciaci lidského thymocytů CD1“. EMBO J.. 8 (12): 3727–32. doi:10.1002 / j.1460-2075.1989.tb08548.x. PMC 402056. PMID 2583117.
Aruffo A, Seed B (1989). "Exprese cDNA klonů kódujících thymocytové antigeny CD1a, b, c ukazuje hierarchii vylučování ve fibroblastech". J. Immunol. 143 (5): 1723–30. PMID 2701945.
Longley J, Kraus J, Alonso M, Edelson R. (1989). „Molekulární klonování CD1a (T6), markeru lidské epidermální dendritické buňky související s MHC molekulami I. třídy“. J. Invest. Dermatol. 92 (4): 628–31. doi:10.1111 / 1523-1747.ep12712175. PMID 2784820.
Albertson DG, Fishpool R, Sherrington P a kol. (1988). „Citlivá hybridizace in situ s vysokým rozlišením na lidské chromozomy pomocí sond značených biotinem: přiřazení genů antigenu lidského thymocytů CD1 k chromozomu 1“. EMBO J.. 7 (9): 2801–5. doi:10.1002 / j.1460-2075.1988.tb03135.x. PMC 457071. PMID 3053166.
Calabi F, Milstein C (1986). „Nová rodina genů souvisejících s lidským hlavním histokompatibilním komplexem, které se nemapují na chromozom 6“. Příroda. 323 (6088): 540–3. doi:10.1038 / 323540a0. PMID 3093894.
Martin LH, Calabi F, Milstein C (1987). „Izolace genů CD1: rodina hlavních diferenciačních antigenů souvisejících s histokompatibilním komplexem“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 83 (23): 9154–8. doi:10.1073 / pnas.83.23.9154. PMC 387093. PMID 3097645.
Woolfson A, Milstein C (1994). „Alternativní sestřih generuje sekreční izoformy lidského CD1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (14): 6683–7. doi:10.1073 / pnas.91.14.6683. PMC 44267. PMID 7517559.
Han M, Hannick LI, DiBrino M, Robinson MA (2000). „Polymorfismus lidských genů CD1“. Tkáňové antigeny. 54 (2): 122–7. doi:10.1034 / j.1399-0039.1999.540202.x. PMID 10488738.
Sugita M, Grant EP, van Donselaar E a kol. (2000). "Oddělené dráhy pro prezentaci antigenu molekulami CD1". Imunita. 11 (6): 743–52. doi:10.1016 / S1074-7613 (00) 80148-X. PMID 10626896.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento membránový protein –Příbuzný článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000158477 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-3] A ^b "Entrezův gen: molekula CD1A CD1a".

[pmid31506599-4] Pintarelli G, Noci S, Maspero D, Pettinicchio A, Dugo M, De Cecco L, Incarbone M, Tosi D, Santambrogio L, Dragani TA, Colombo F (září 2019). „Cigaretový kouř mění transkriptom nezúčastněné plicní tkáně u pacientů s plicním adenokarcinomem“. Vědecké zprávy. 9 (1): 13039. doi:10.1038 / s41598-019-49648-2. PMC 6736939. PMID 31506599.

[1]

[2]

[3]

[4]

Proteiny: shluky diferenciace (viz také seznam lidských klastrů diferenciace )
1–50	CD1 a-c 1A 1B 1D 1E CD2 CD3 y δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 A CD9 CD10 CD11 A b C d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 A b C d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 A b C d E F CD50
51–100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 A b C d E F CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 A b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 A d E h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 - CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101–150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 A b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 A b CD121 A b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151–200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 A b C CD157 CD158 (A d E i k ) CD159 A C CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 A b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 A b G CD174 CD177 CD178 CD179 A b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201–250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 A b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (A b ) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 A b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 - CD248 CD249
251–300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301–350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350