GAK (protein) - GAK (protein)

GAK
3LL6.pdb1.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyGAK, D130045N16Rik, DNAJ26, DNAJC26, kináza spojená s cyklinem G
Externí IDOMIM: 602052 MGI: 2442153 HomoloGene: 3846 Genové karty: GAK
Umístění genu (člověk)
Chromozom 4 (lidský)
Chr.Chromozom 4 (lidský)[1]
Chromozom 4 (lidský)
Genomické umístění pro GAK
Genomické umístění pro GAK
Kapela4p16.3Start849,276 bp[1]
Konec932,373 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001286833
NM_005255
NM_001318134

RefSeq (protein)

NP_001305063
NP_005246

Místo (UCSC)Chr 4: 0,85 - 0,93 MbChr 5: 108,57 - 108,63 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Kináza spojená s cyklinem G (GAK) je serin / threonin kináza že u lidí je kódován GAK gen.[5][6]

Funkce

Celkově eukaryoty, buněčný cyklus se řídí cyklin-dependentní protein kinázy (CDK), jejichž činnosti jsou regulovány cykliny a inhibitory CDK v různých souborech mechanismů, které zahrnují kontrolu fosforylace a defosforylace Ser, Thr nebo Tyr zbytků. Cykliny jsou molekuly, které mají konsensuální doménu zvanou „cyklinová schránka“. V savčích buňkách bylo identifikováno 9 druhů cyklinů, které se označují jako cykliny A až I. Cyclin G. je přímým transkripčním cílem p53 produkt tumor supresorového genu a tak funguje downstream od p53. GAK je asociačním partnerem cyklinu G a CDK5.[5]

Kináza asociovaná s cyklinem G získala svůj název, protože imunoprecipitovala s cyklinem G, ačkoli se nyní zdá, že s ní není spojena. Kináza spojená s cyklinem G je homologní svou funkcí s proteinovým auxilinem, který je ve spojení s HSC70 odváží klatrin v neuronálních buňkách. Umístění kinázy spojené s cyklinem G však není v mozku, ale v blízkosti trans-Golgiho sítě jiných než neuronálních buněk, jako jsou buňky nalezené v játrech a varlatech. GAK je také známo, že je spojován s fokální adheze přesný vztah mezi nimi není znám.[7]

Struktura

Struktura GAK byla stanovena pomocí rentgenové difrakce na rozlišení 2,10 Á.[8]

Kináza spojená s cyklinem G je cystolický protein se dvěma doménami. Doménou zájmu je C-terminál doména, která se skládá ze tří subdomén, jako je C-terminální J doména, a Clathrin -vázací doména a napětí N-terminál doména. Druhou doménou je N koncová kinázová doména, což je funkční proteinová kináza Ser / Thr. N-terminální kinázová doména je schopna fosforylovat histon H1. Funkce terminálu N podobná napětí v subdoméně ještě nebyla stanovena, ačkoli doména sdílí vysokou homologii s potlačujícím nádorem PTEN. Klíčovou charakteristikou je cysteinová skupina, která je nutná pro fosforylaci; napěťově podobná N koncová subdoména však chybí u některých důležitých funkčních zbytků, které má PTEN. C-koncová J doména je zodpovědná za interakci s HSC70, což je molekulární chaperon zodpovědný za odvíjení váčků potažených klatrinem během endocytóza. Doména vázající clathrin shromažďuje clathrin do košů. Při pH 7 umožňuje GAK Hsc70 odbarvit klatrinové koše a při pH 6 Hsc70 váže klatrinové koše bez odlakování klatrinu. Bez ohledu na kinázovou doménu GAK je GAK totožná se 43% auxilin, neuronální buňka nepotahující klatrinový kofaktor ve svém složení aminokyselin. GAK je 57% homologní s auxilinem, pokud jsou do srovnání zahrnuty konzervované zbytky. Ačkoli podobné domény těchto dvou molekul naznačují a mají podobné funkce, proteiny provádějí tyto funkce různými způsoby. GAK iniciuje montáž košů s klatrinem stechiometricky, ale při různých hodnotách pH buď naváže Hsc70 na koše, nebo přiměje Hsc70 k katalytickému odkrytí košů s klatrinem, což je jeden rozdíl mezi auxilinem a GAK. Tato katalytická cesta vysvětluje, proč je k provedení podobné funkce zapotřebí méně GAK než auxilinu.[7]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000178950 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000062234 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b „Entrez Gene: cyklin G asociovaná kináza“.
  6. ^ Kimura SH, Tsuruga H, Yabuta N, Endo Y, Nojima H (září 1997). "Struktura, exprese a chromozomální lokalizace lidské GAK". Genomika. 44 (2): 179–87. doi:10.1006 / geno.1997.4873. PMID  9299234.
  7. ^ A b Kanaoka Y, Kimura SH, Okazaki I, Ikeda M, Nojima H (leden 1997). "GAK: kináza asociovaná s cyklinem G obsahuje doménu podobnou tensinu / auxilinu". FEBS Dopisy. 402 (1): 73–80. doi:10.1016 / S0014-5793 (96) 01484-6. PMID  9013862. S2CID  22697554.
  8. ^ Zhang R, Hatzos-Skintges C, Weger A, Eswaran J, Fedorov O, King O, Von Delft F, Bountra C, Arrowsmith CH, Weigelt J, Edwards A, Knapp S, Joachimiak A, Midwest Center for Structural Genomics (MCSG) (2010). "Krystalová struktura kinázy asociované s lidským cyklinem G". Bude zveřejněno. doi:10,2210 / pdb3ll6 / pdb.

Další čtení

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.