Malá GTPáza - Small GTPase
| Malá monomerní GTPáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 3.6.5.2 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| |||||||||
Malé GTPasy (ES 3.6.5.2 ), také známý jako malé G-proteiny, jsou rodinou hydroláza enzymy to může svázat a hydrolyzovat guanosin trifosfát (GTP). Jsou druhem G-protein nalezen v cytosol to jsou homologní k alfa podjednotce heterotrimerní G-proteiny, ale na rozdíl od alfa podjednotky G proteinů může malá GTPáza fungovat samostatně jako hydrolázový enzym, který se váže na a hydrolyzuje guanosintrifosfát (GTP) za vzniku guanosin difosfát (HDP). Nejznámějšími členy jsou Ras GTPasy a proto se jim někdy říká Ras podčeleď GTPasy.
Typický G-protein je aktivní, když se váže na GTP, a neaktivní, když se váže na GDP (tj. Když je GTP hydrolyzován na GDP). HDP lze poté nahradit bezplatným GTP. Proto lze G-protein zapnout a vypnout. Hydrolýza GTP je urychlena o Proteiny aktivující GTPázu (GAP), zatímco výměna GTP je katalyzována guaninové nukleotidové výměnné faktory (GEF). Aktivace GEF typicky aktivuje jeho příbuzný G-protein, zatímco aktivace GAP má za následek inaktivaci příbuzného G-proteinu.Inhibitory disociace guanosin nukleotidů (GDI) udržují malé GTPasy v neaktivním stavu.
Malé GTPasy regulují širokou škálu procesů v EU buňka, včetně růstu, buněčná diferenciace, pohyb buněk a lipid váček doprava.
Nadrodina Ras
V nadrodině Ras je více než sto proteinů.[1] Na základě struktury, sekvence a funkce je nadrodina Ras rozdělena do pěti hlavních rodin (Ras, Rho, Běžel, Rab a Arf GTPázy).[2] Samotná rodina Ras je dále rozdělena do 6 podskupin: Ras, Ral, Rit, Rap, Rheb, a Rad. Miro je nedávným přispěvatelem do superrodiny.
Každá podrodina sdílí společnou jádrovou G doménu, která poskytuje základní aktivitu GTPázy a nukleotidů.
Okolní sekvence pomáhá určit funkční specificitu malé GTPázy, například 'Insert Loop', společná pro podrodinu Rho, specificky přispívá k vazbě na efektorové proteiny, jako je IQGAP a VOSA.
Rodina Ras je obecně zodpovědná za buněčnou proliferaci, Rho za morfologii buněk, Ran za jaderný transport a Rab a Arf za transport vezikul.[3]
Viz také
Reference
- ^ Wennerberg K, Rossman KL, Der CJ (březen 2005). „Superrodina Ras na první pohled“. J. Cell Sci. 118 (Pt 5): 843–6. doi:10.1242 / jcs.01660. PMID 15731001.
- ^ Goitre, L; Trapani, E; Trabalzini, L; Retta, SF (26. prosince 2013). Nadrodina Ras malých GTPas: odemknutá tajemství. Metody v molekulární biologii. 1120. s. 1–18. doi:10.1007/978-1-62703-791-4_1. ISBN 978-1-62703-790-7. PMID 24470015.
- ^ Munemitsu S, Innis M, Clark R, McCormick F, Ullrich A, Polakis P (1990). „Molekulární klonování a exprese cDNA G25K, lidského homologu genu pro buněčný cyklus kvasinek CDC42“. Mol Cell Biol. 10 (11): 5977–82. doi:10.1128 / MCB.10.11.5977. ISSN 0270-7306. PMC 361395. PMID 2122236.
externí odkazy
- Malé + GTPasy v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
