PAK3 - PAK3

PAK3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1EES
Identifikátory
Aliasy	PAK3, CDKN1A, MRX30, MRX47, OPHN3, PAK3beta, bPAK, hPAK-3, beta-PAK, ARA, p21 (RAC1) aktivovaná kináza 3
Externí ID	OMIM: 300142 MGI: 1339656 HomoloGene: 55664 Genové karty: PAK3
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	111,227,361 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	143,797,796 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • aktivita proteinkinázy; • Vazba domény SH3; • vazba kovových iontů; • kinázová aktivita; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • katalytická aktivita; • Vazba GTPázy; • Vazba Rho GTPázy; • ATP vazba; • Aktivita kinázy MAP kinázy; • aktivita proteinové serin / threoninkinázy; • Rac GTPase vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • endozom; • buněčná membrána; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota; • glutamátergická synapse;
Biologický proces	• regulace vývoje neuronové projekce; • fosforylace; • signální dráha receptoru efrinu; • vývoj dendritů; • Kostimulace T buněk; • organizace synapse; • buněčná odpověď na organickou cyklickou sloučeninu; • stimulační signální dráha lektinového receptoru typu C; • vývoj mnohobuněčných organismů; • fosforylace bílkovin; • regulace polymerace aktinových vláken; • pozitivní regulace neuronového apoptotického procesu; • vývoj dendritické páteře; • pozitivní regulace procesu biosyntézy DNA; • metabolismus; • Signální dráha receptoru T buněk; • pozitivní regulace morfogeneze dendritické páteře; • Kaskáda MAPK; • regulace organizace aktinového cytoskeletu; • pozitivní regulace migrace fibroblastů; • aktivace aktivity MAPK; • morfogeneze dendritické páteře; • Rho proteinová signální transdukce; • regulace mitotického buněčného cyklu; • axonogeneze; • migrace buněk; • stresem aktivovaná signální kaskáda protein kinázy; • regulace axonogeneze; • regulace apoptotického procesu; • signální transdukce fosforylací proteinů; • aktivace aktivity proteinkinázy; • regulace kaskády MAPK;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5063
	18481
	ENSG00000077264
	ENSMUSG00000031284
	O75914
	Q61036
NM_001128166; NM_001128167; NM_001128168; NM_001128172; NM_001128173;
	NM_002578; NM_001324325; NM_001324326; NM_001324327; NM_001324328; NM_001324329; NM_001324330; NM_001324331; NM_001324332; NM_001324333; NM_001324334
	NM_001195046; NM_001195047; NM_001195048; NM_001195049; NM_008778
NP_001121638; NP_001121639; NP_001121640; NP_001121644; NP_001121645;
	NP_001311254; NP_001311255; NP_001311256; NP_001311257; NP_001311258; NP_001311259; NP_001311260; NP_001311261; NP_001311262; NP_001311263; NP_002569
	NP_001181975; NP_001181976; NP_001181977; NP_001181978; NP_032804
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

PAK3 (p21-aktivovaná kináza 2, beta-PAK) je jedním ze tří členů skupiny I PAK evolučně konzervované serin / threonin kinázy.^[5]^[6]^[7] PAK3 je přednostně exprimován v neuronálních buňkách ^[8]^[9] a podílí se na synapse formování a plasticita a mentální retardace.^[10]^[11]

Objev

PAK3 byl původně klonován z myšího fibroblastu cDNA knihovna a z knihovny cDNA myšího embrya.^[8]^[9] Stejně jako ostatní PAK skupiny I je PAK3 stimulován aktivací Cdc42 a Rac1.

Genové a sestříhané varianty

Lidský gen PAK3, nejdelší člen rodiny skupiny I, je dlouhý 283 kb. Gen PAK3 se skládá z 22 exony z toho 6 exonů je pro 5’-UTR a generuje 13 alternativních sestřihů přepisy. Z transkriptů PAK3 je 11 transkriptů pro kódování proteinů v rozmezí od 181 do 580 aminokyselin, zatímco zbývající dva transkripty jsou nekódující RNA.^[12] Myší gen PAK3 obsahuje 10 transkriptů kódujících šest proteinů z 544 aminokyselin a 559 aminokyselin dlouhých a čtyři menší polypeptidy od 23 do 366 aminokyselin.

Proteinové domény

Podobný PAK1, PAK2 obsahuje doménu vázající p21 (PBD) a autoinhibiční doménu (AID) a existuje v neaktivní konformaci.^[13]

Aktivátory a inhibitory

Aktivita PAK3 je stimulována Dbl, Cdc42 a Cool-2,^[14]^[15] a tím Transkripční faktor AP1.^[16] Stimulace aktivity PAK3 předcházejícími stimulátory, jako je Dbl nebo Cdc42, je inhibována p50 (Cool-1)^[15] Aktivita PAK3 je inhibována FRAX597, PAN inhibitorem PAK.^[17]

Funkce

PAK3 je nadměrně exprimován v neuroendokrinních / karcinoidech nádory.^[18] Ukázalo se, že PAK3 je důležitý pro tvorbu a plasticitu synapsí a přispívá k mentální retardaci.^[10] Dále, a bodová mutace v genu PAK3 byla spojena s nesyndromickou mentální retardací spojenou s X.^[11]

Poznámky

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000077264 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031284 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Knaus UG, Morris S, Dong HJ, Chernoff J, Bokoch GM (červenec 1995). "Regulace kináz aktivovaných lidskými leukocyty p21 prostřednictvím receptorů spřažených s G proteinem". Věda. 269 (5221): 221–3. doi:10.1126 / science.7618083. PMID 7618083.
^ Manser E, Chong C, Zhao ZS, Leung T, Michael G, pavilon C, Lim L (říjen 1995). „Molekulární klonování nového člena rodiny p21-Cdc42 / Rac-aktivované kinázy (PAK)“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (42): 25070–8. doi:10.1074 / jbc.270.42.25070. PMID 7559638.
^ Kumar A, Molli PR, Pakala SB, Bui Nguyen TM, Rayala SK, Kumar R (červenec 2009). „PAK vlákno od améby po savce“. Journal of Cellular Biochemistry. 107 (4): 579–85. doi:10.1002 / jcb.22159. PMC 2718766. PMID 19350548.
^ ^A ^b Bagrodia S, Taylor SJ, Creasy CL, Chernoff J, Cerione RA (září 1995). "Identifikace myší p21Cdc42 / Rac aktivované kinázy". The Journal of Biological Chemistry. 270 (39): 22731–7. doi:10.1074 / jbc.270.39.22731. PMID 7559398.
^ ^A ^b Burbelo PD, Kozak CA, Finegold AA, hala A, Pirone DM (květen 1999). "Klonování, exprese v centrálním nervovém systému a chromozomální mapování myších genů PAK-1 a PAK-3". Gen. 232 (2): 209–15. doi:10.1016 / s0378-1119 (99) 00110-9. PMID 10352232.
^ ^A ^b Boda B, Alberi S, Nikonenko I, Node-Langlois R, Jourdain P, Moosmayer M, Parisi-Jourdain L, Muller D (prosinec 2004). „Protein mentální retardace PAK3 přispívá k tvorbě synapsí a plasticitě v hipokampu“. The Journal of Neuroscience. 24 (48): 10816–25. doi:10.1523 / jneurosci.2931-04.2004. PMC 6730202. PMID 15574732.
^ ^A ^b Allen KM, Gleeson JG, Bagrodia S, Partington MW, MacMillan JC, Cerione RA, Mulley JC, Walsh CA (září 1998). "PAK3 mutace v nesyndromické X-vázané mentální retardaci". Genetika přírody. 20 (1): 25–30. doi:10.1038/1675. PMID 9731525.
^ Kreis P, Rousseau V, Thévenot E, Combeau G, Barnier JV (srpen 2008). „Čtyři varianty savčích sestřihů kódované genem kinázy 3 aktivovaným p21 mají různé biologické vlastnosti“. Journal of Neurochemistry. 106 (3): 1184–97. doi:10.1111 / j.1471-4159.2008.05474.x. PMID 18507705.
^ Kumar R, Li DQ (2016). PAK v progresi rakoviny člověka: od počátku k léčbě rakoviny k budoucí onkobiologii. Pokroky ve výzkumu rakoviny. 130. s. 137–209. doi:10.1016 / bs.acr.2016.01.002. ISBN 9780128047897. PMID 27037753.
^ Bagrodia S, Bailey D, Lenard Z, Hart M, Guan JL, Premont RT, Taylor SJ, Cerione RA (srpen 1999). „Tyrosin-fosforylovaný protein, který se váže na důležitou regulační oblast v chladné rodině proteinů vázajících kinázu p21“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (32): 22393–400. doi:10.1074 / jbc.274.32.22393. PMID 10428811.
^ ^A ^b Bagrodia S, Taylor SJ, Jordon KA, Van Aelst L, Cerione RA (září 1998). „Nový regulátor kináz aktivovaných p21“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (37): 23633–6. doi:10.1074 / jbc.273.37.23633. PMID 9726964.
^ Holderness Parker N, Donninger H, Birrer MJ, Leaner VD (2013). „p21-aktivovaná kináza 3 (PAK3) je AP-1 regulovaný gen přispívající k organizaci aktinu a migraci transformovaných fibroblastů“. PLOS ONE. 8 (6): e66892. doi:10.1371 / journal.pone.0066892. PMC 3688571. PMID 23818969.
^ Licciulli S, Maksimoska J, Zhou C, Troutman S, Kota S, Liu Q, Duron S, Campbell D, Chernoff J, Field J, Marmorstein R, Kissil JL (říjen 2013). „FRAX597, inhibitor malých molekul kináz aktivovaných p21, inhibuje tumorigenezu schwannomů spojených s neurofibromatózou typu 2 (NF2)“. The Journal of Biological Chemistry. 288 (40): 29105–14. doi:10.1074 / jbc.m113.510933. PMC 3790009. PMID 23960073.
^ Liu RX, Wang WQ, Ye L, Bi YF, Fang H, Cui B, Zhou WW, Dai M, Zhang J, Li XY, Ning G (srpen 2010). „p21-aktivovaná kináza 3 je nadměrně exprimována v thymických neuroendokrinních nádorech (karcinoidech) s ektopickým ACTH syndromem a podílí se na migraci buněk“. Endokrinní. 38 (1): 38–47. doi:10.1007 / s12020-010-9324-6. PMID 20960100.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: O75914 (Lidská serin / threonin-protein kináza PAK 3) na PDBe-KB.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q61036 (Myší serin / threonin-protein kináza PAK 3) na PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000077264 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031284 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[5] Knaus UG, Morris S, Dong HJ, Chernoff J, Bokoch GM (červenec 1995). "Regulace kináz aktivovaných lidskými leukocyty p21 prostřednictvím receptorů spřažených s G proteinem". Věda. 269 (5221): 221–3. doi:10.1126 / science.7618083. PMID 7618083.

[6] Manser E, Chong C, Zhao ZS, Leung T, Michael G, pavilon C, Lim L (říjen 1995). „Molekulární klonování nového člena rodiny p21-Cdc42 / Rac-aktivované kinázy (PAK)“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (42): 25070–8. doi:10.1074 / jbc.270.42.25070. PMID 7559638.

[7] Kumar A, Molli PR, Pakala SB, Bui Nguyen TM, Rayala SK, Kumar R (červenec 2009). „PAK vlákno od améby po savce“. Journal of Cellular Biochemistry. 107 (4): 579–85. doi:10.1002 / jcb.22159. PMC 2718766. PMID 19350548.

[RA-8] A ^b Bagrodia S, Taylor SJ, Creasy CL, Chernoff J, Cerione RA (září 1995). "Identifikace myší p21Cdc42 / Rac aktivované kinázy". The Journal of Biological Chemistry. 270 (39): 22731–7. doi:10.1074 / jbc.270.39.22731. PMID 7559398.

[DM-9] A ^b Burbelo PD, Kozak CA, Finegold AA, hala A, Pirone DM (květen 1999). "Klonování, exprese v centrálním nervovém systému a chromozomální mapování myších genů PAK-1 a PAK-3". Gen. 232 (2): 209–15. doi:10.1016 / s0378-1119 (99) 00110-9. PMID 10352232.

[D-10] A ^b Boda B, Alberi S, Nikonenko I, Node-Langlois R, Jourdain P, Moosmayer M, Parisi-Jourdain L, Muller D (prosinec 2004). „Protein mentální retardace PAK3 přispívá k tvorbě synapsí a plasticitě v hipokampu“. The Journal of Neuroscience. 24 (48): 10816–25. doi:10.1523 / jneurosci.2931-04.2004. PMC 6730202. PMID 15574732.

[CA-11] A ^b Allen KM, Gleeson JG, Bagrodia S, Partington MW, MacMillan JC, Cerione RA, Mulley JC, Walsh CA (září 1998). "PAK3 mutace v nesyndromické X-vázané mentální retardaci". Genetika přírody. 20 (1): 25–30. doi:10.1038/1675. PMID 9731525.

[12] Kreis P, Rousseau V, Thévenot E, Combeau G, Barnier JV (srpen 2008). „Čtyři varianty savčích sestřihů kódované genem kinázy 3 aktivovaným p21 mají různé biologické vlastnosti“. Journal of Neurochemistry. 106 (3): 1184–97. doi:10.1111 / j.1471-4159.2008.05474.x. PMID 18507705.

[13] Kumar R, Li DQ (2016). PAK v progresi rakoviny člověka: od počátku k léčbě rakoviny k budoucí onkobiologii. Pokroky ve výzkumu rakoviny. 130. s. 137–209. doi:10.1016 / bs.acr.2016.01.002. ISBN 9780128047897. PMID 27037753.

[14] Bagrodia S, Bailey D, Lenard Z, Hart M, Guan JL, Premont RT, Taylor SJ, Cerione RA (srpen 1999). „Tyrosin-fosforylovaný protein, který se váže na důležitou regulační oblast v chladné rodině proteinů vázajících kinázu p21“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (32): 22393–400. doi:10.1074 / jbc.274.32.22393. PMID 10428811.

[RAA-15] A ^b Bagrodia S, Taylor SJ, Jordon KA, Van Aelst L, Cerione RA (září 1998). „Nový regulátor kináz aktivovaných p21“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (37): 23633–6. doi:10.1074 / jbc.273.37.23633. PMID 9726964.

[16] Holderness Parker N, Donninger H, Birrer MJ, Leaner VD (2013). „p21-aktivovaná kináza 3 (PAK3) je AP-1 regulovaný gen přispívající k organizaci aktinu a migraci transformovaných fibroblastů“. PLOS ONE. 8 (6): e66892. doi:10.1371 / journal.pone.0066892. PMC 3688571. PMID 23818969.

[17] Licciulli S, Maksimoska J, Zhou C, Troutman S, Kota S, Liu Q, Duron S, Campbell D, Chernoff J, Field J, Marmorstein R, Kissil JL (říjen 2013). „FRAX597, inhibitor malých molekul kináz aktivovaných p21, inhibuje tumorigenezu schwannomů spojených s neurofibromatózou typu 2 (NF2)“. The Journal of Biological Chemistry. 288 (40): 29105–14. doi:10.1074 / jbc.m113.510933. PMC 3790009. PMID 23960073.

[18] Liu RX, Wang WQ, Ye L, Bi YF, Fang H, Cui B, Zhou WW, Dai M, Zhang J, Li XY, Ning G (srpen 2010). „p21-aktivovaná kináza 3 je nadměrně exprimována v thymických neuroendokrinních nádorech (karcinoidech) s ektopickým ACTH syndromem a podílí se na migraci buněk“. Endokrinní. 38 (1): 38–47. doi:10.1007 / s12020-010-9324-6. PMID 20960100.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]