ATP2A3 - ATP2A3

ATP2A3
Identifikátory
Aliasy	ATP2A3, SERCA3, transport sarkoplazmatického / endoplazmatického retikula ATPázy Ca2 + transport 3
Externí ID	OMIM: 601929 MGI: 1194503 HomoloGene: 69131 Genové karty: ATP2A3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	3,964,464 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	72,993,044 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • aktivita ATPázy transportující vápník; • vazba kovových iontů; • aktivita hydrolázy; • ATP vazba; • GO: 0036442 aktivita ATPázy exportující vodík, fosforylační mechanismus;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • ne membrána; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • sarkoplazmatické retikulum; • destičková hustá trubicová síťová membrána; • endoplazmatické retikulum; • buněčné jádro; • sarkoplazmatická retikulární membrána;
Biologický proces	• regulace srdečního vedení; • iontový transport; • iontový transmembránový transport; • transmembránový transport vápenatých iontů; • transport iontů vápníku; • buněčná homeostáza iontů vápníku; • transmembránový transport vodíkových iontů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	489
	53313
	ENSG00000074370
	ENSMUSG00000020788
	Q93084
	Q64518
NM_005173; NM_174953; NM_174954; NM_174955; NM_174956;
	NM_174957; NM_174958
	NM_001163336; NM_001163337; NM_016745
NP_005164; NP_777613; NP_777614; NP_777615; NP_777616;
	NP_777617; NP_777618
	NP_001156808; NP_001156809; NP_058025
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Sarkoplazmatická / endoplazmatická retikula vápenatá ATPáza 3 je enzym že v lidé je kódován ATP2A3 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje jeden ze SERCA Ca²⁺-ATPázy, což jsou intracelulární pumpy umístěné v sarkoplazmatický nebo endoplazmatická síťka buněk. Exprese SERCA3 byla původně popsána jako nesvalová, ale byla nedávno pozorována u kardiomyocyt. Tento enzym katalyzuje hydrolýzu ATP spojenou s translokací vápník z cytosol do sarkoplazmatického retikula lumen a podílí se na sekvestraci vápníku spojené se svalovou excitací a kontrakcí. Výsledkem alternativního sestřihu je 6 variant transkriptu kódujících různé izoformy pojmenované SERCA3a až SERCA3f.^[6]

Rakovina

Gen ATP2A3 byl pozorován progresivně downregulovaný v Lidsky papillomavirus -pozitivní neoplastické keratinocyty odvozeno z děložního čípku preneoplastické léze na různých úrovních malignity.^[7] Z tohoto důvodu je ATP2A3 pravděpodobně spojena s tumorigenezí a může být potenciálním prognostickým markerem pro děložní děložní hrdlo. preneoplastické léze postup.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000074370 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020788 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Dode L, Wuytack F, Kools PF, Baba-Aissa F, Raeymaekers L, Brike F, van de Ven WJ, Casteels R (listopad 1996). „cDNA klonování, exprese a chromozomální lokalizace lidského sarko / endoplazmatického retikula Ca²⁺-ATPase 3 gen ". Biochem J.. 318 (2): 689–99. doi:10.1042 / bj3180689. PMC 1217674. PMID 8809064.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ATP2A3 ATPase, transport Ca ++, všudypřítomný“.
^ ^A ^b Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (duben 2015). "Změny genové exprese v progresi cervikální neoplazie odhalené mikroarray analýzou cervikálních neoplastických keratinocytů". J Cell Physiol. 230 (4): 802–812. doi:10,1002 / jcp.24808. PMID 25205602. S2CID 24986454.

externí odkazy

Člověk ATP2A3 umístění genomu a ATP2A3 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Wuytack F, Papp B, Verboomen H a kol. (1994). „Sarko / endoplazmatické retikulum Ca²⁺-ATPase 3 typu Ca²⁺ pumpa je exprimována v krevních destičkách, v lymfoidních buňkách a v žírných buňkách ". J. Biol. Chem. 269 (2): 1410–6. PMID 8288608.
Dode L, De Greef C, Mountian I a kol. (1998). "Struktura lidského sarko / endoplazmatického retikula Ca²⁺-ATPáza 3 gen. Analýza promotorů a alternativní sestřih pre-mRNA SERCA3 ". J. Biol. Chem. 273 (22): 13982–94. doi:10.1074 / jbc.273.22.13982. PMID 9593748.
Poch E, Leach S, Snape S a kol. (1999). Msgstr "Funkční charakterizace alternativně sestřižených lidských transkriptů SERCA3". Dopoledne. J. Physiol. 275 (6 Pt 1): C1449–58. doi:10.1152 / ajpcell.1998.275.6.C1449. PMID 9843705.
Martin V, Bredoux R, Corvazier E a kol. (2002). "Tři nové sarko / endoplazmatické retikulum Ca²⁺-ATPáza (SERCA) 3 izoformy. Exprese, regulace a funkce membrán rodiny SERCA3 ". J. Biol. Chem. 277 (27): 24442–52. doi:10,1074 / jbc.M202011200. PMID 11956212.
Gélébart P, Kovács T, Brouland JP a kol. (2002). "Exprese endomembránových vápenatých pump v buňkách rakoviny tlustého střeva a žaludku. Indukce exprese SERCA3 během diferenciace". J. Biol. Chem. 277 (29): 26310–20. doi:10,1074 / jbc.M201747200. PMID 11986315.
Dode L, Vilsen B, Van Baelen K a kol. (2003). "Disekce funkčních rozdílů mezi sarko (endo) plazmatickým retikulem Ca²⁺-ATPáza (SERCA) 1 a 3 izoformy ustálenou a přechodnou kinetickou analýzou ". J. Biol. Chem. 277 (47): 45579–91. doi:10,1074 / jbc.M207778200. PMID 12207029.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Houston R (2003). "Podélné úseky nefixovaného svalu". Biotechnika a histochemie. 77 (4): 229–30. PMID 12503734.
Borge PD, Wolf BA (2003). "Regulace substrátu inzulínového receptoru 1 sarko-endoplazmatického retikula vápenatého ATPázy 3 v beta-buňkách vylučujících inzulín". J. Biol. Chem. 278 (13): 11359–68. doi:10,1074 / jbc.M209521200. PMID 12524443.
Chandrasekera CP, Lytton J (2003). "Inhibice lidského SERCA3 pomocí PL / IM430. Molekulární analýza interakce". J. Biol. Chem. 278 (14): 12482–8. doi:10,1074 / jbc.M212745200. PMID 12540840.
Gevaert K, Goethals M, Martens L a kol. (2004). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Bobe R, Bredoux R, Corvazier E a kol. (2004). „Identifikace, exprese, funkce a lokalizace nové (šesté) izoformy lidského sarko / endoplazmatického retikula Ca²⁺Gen ATPázy 3 ". J. Biol. Chem. 279 (23): 24297–306. doi:10,1074 / jbc.M314286200. PMID 15028735.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Brouland JP, Gélébart P, Kovàcs T a kol. (2005). „Ztráta exprese transportu vápníku sarko / endoplazmatickým retikulem ATPázy 3 je časná událost během vícestupňového procesu karcinogeneze tlustého střeva“. Dopoledne. J. Pathol. 167 (1): 233–42. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 62968-9. PMC 1603437. PMID 15972967.
Hadri L, Pavoine C, Lipskaia L a kol. (2006). "Přepis sarkoplazmatického / endoplazmatického retikula Ca²⁺- gen ATPázy typu 3, ATP2A3, je regulován cestou kalcineurin / NFAT v endoteliálních buňkách ". Biochem. J. 394 (Pt 1): 27–33. doi:10.1042 / BJ20051387. PMC 1385999. PMID 16250893.
Wootton LL, Michelangeli F (2006). „Účinky fenylalaninu 256 na mutaci valinu na citlivost sarkoplazmatického / endoplazmatického retikula Ca²⁺ ATPáza (SERCA) Ca²⁺ pumpovat izoformy 1, 2 a 3 na thapsigargin a další inhibitory ". J. Biol. Chem. 281 (11): 6970–6. doi:10,1074 / jbc.M510978200. PMID 16410239.
Chaâbane C, Corvazier E, Bredoux R a kol. (2006). „Sarco / endoplazmatické retikulum Ca²⁺Izoformy ATPázy typu 3 (SERCA3b a SERCA3f): odlišné role v buněčné adhezi a ER stresu ". Biochem. Biophys. Res. Commun. 345 (4): 1377–85. doi:10.1016 / j.bbrc.2006.05.054. PMID 16725111.
Bredoux R, Corvazier E, Dally S a kol. (2006). „Lidská destička Ca²⁺-ATPázy: nové markery buněčné diferenciace, jak je znázorněno na idiopatické skolióze ". Trombocyty. 17 (6): 421–33. doi:10.1080/09537100600758719. PMID 16973504. S2CID 24473757.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000074370 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020788 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8809064-5] Dode L, Wuytack F, Kools PF, Baba-Aissa F, Raeymaekers L, Brike F, van de Ven WJ, Casteels R (listopad 1996). „cDNA klonování, exprese a chromozomální lokalizace lidského sarko / endoplazmatického retikula Ca²⁺-ATPase 3 gen ". Biochem J.. 318 (2): 689–99. doi:10.1042 / bj3180689. PMC 1217674. PMID 8809064.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: ATP2A3 ATPase, transport Ca ++, všudypřítomný“.

[Rotondo_2015-7] A ^b Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (duben 2015). "Změny genové exprese v progresi cervikální neoplazie odhalené mikroarray analýzou cervikálních neoplastických keratinocytů". J Cell Physiol. 230 (4): 802–812. doi:10,1002 / jcp.24808. PMID 25205602. S2CID 24986454.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]