COPB2 - COPB2

COPB2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	5A1U, 5A1V, 5A1W, 5A1X, 5A1Y
Identifikátory
Aliasy	COPB2, beta'-COP, podjednotka komplexu proteinů coatomer beta 2, MCPH19, COPI plášťová podjednotka beta 2
Externí ID	OMIM: 606990 MGI: 1354962 HomoloGene: 3499 Genové karty: COPB2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	139,389,680 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	98,588,382 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita strukturních molekul; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • Golgiho aparát; • membrána; • Golgiho membrána; • Membrána vezikul pokrytá COPI; • transportní váček; • membránový plášť; • Kabát vezikuly COPI; • cytoplazmatický váček; • membrána endoplazmatického retikula;
Biologický proces	• retrográdní transport zprostředkovaný vezikuly, Golgi do ER; • transport toxinů; • ER na transport zprostředkovaný vezikuly Golgi; • transport bílkovin; • transport intracelulárních proteinů; • transport zprostředkovaný vezikuly uvnitř Golgi; • transport zprostředkovaný vezikuly;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9276
	50797
	ENSG00000184432
	ENSMUSG00000032458
	P35606
	O55029
	NM_004766
	NM_015827
	NP_004757
	NP_056642
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Coatomer podjednotka beta ' je protein že u lidí je kódován COPB2 gen.^[5]^[6]

Funkce

Golgiho koatomerový komplex (viz MIM 601924) tvoří plášť nepochlatrinem potažených váčků a je nezbytný pro Golgiho pučení a vezikulární obchodování. Skládá se ze 7 proteinových podjednotek, včetně COPB2. [Dodává OMIM]^[6]

Interakce

COPB2 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000184432 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032458 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ De Baere E, Speleman F, Van Roy N, De Paepe A, Messiaen L (únor 1999). „Přiřazení buněčného genu pro protein 1 vázajícího retinol (RBP1) a genu podjednotky beta-coatomeru (COPB2) k lidskému chromozomovému pásmu 3q23 hybridizací in situ“. Cytogenet Cell Genet. 82 (3–4): 226–7. doi:10.1159/000015107. PMID 9858824. S2CID 46851294.
^ ^A ^b „Entrez Gene: COPB2 coatomer protein komplex, podjednotka beta 2 (beta prime)“.
^ Eugster A, Frigerio G, Dale M, Duden R (srpen 2000). „Domény COP I potřebné pro integritu coatomeru a nové interakce s ARF a ARF-GAP“. EMBO J.. 19 (15): 3905–17. doi:10.1093 / emboj / 19.15.3905. PMC 306616. PMID 10921873.
^ Lowe M, Kreis TE (listopad 1996). „In vivo sestavení coatomeru, prekurzor pláště COP-I“. J. Biol. Chem. 271 (48): 30725–30. doi:10.1074 / jbc.271.48.30725. PMID 8940050.
^ England K, Ashford D, Kidd D, Rumsby M (červen 2002). „PKC epsilon je spojen s myosinem IIA a aktinem ve fibroblastech“. Buňka. Signál. 14 (6): 529–36. doi:10.1016 / s0898-6568 (01) 00277-7. PMID 11897493.
^ Sullivan BM, Harrison-Lavoie KJ, Marshansky V, Lin HY, Kehrl JH, Ausiello DA, Brown D, Druey KM (září 2000). „RGS4 a RGS2 váží koatomer a inhibují asociaci COPI s Golgiho membránami a intracelulárním transportem“. Mol. Biol. Buňka. 11 (9): 3155–68. doi:10,1091 / mbc. 11.9.3155. PMC 14982. PMID 10982407.

externí odkazy

Člověk COPB2 umístění genomu a COPB2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: O55029 (Podjednotka myšího coatomeru beta ') u PDBe-KB.

Další čtení

Pelham HR, Rothman JE (2000). „Debata o dopravě v Golgi - dvě strany téže mince?“. Buňka. 102 (6): 713–9. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00060-X. PMID 11030615. S2CID 18044044.
Stenbeck G, Harter C, Brecht A, Herrmann D, Lottspeich F, Orci L, Wieland FT (1993). „beta'-COP, nová podjednotka coatomeru“. EMBO J.. 12 (7): 2841–5. doi:10.1002 / j.1460-2075.1993.tb05945.x. PMC 413534. PMID 8334999.
Harrison-Lavoie KJ, Lewis VA, Hynes GM, Collison KS, Nutland E, Willison KR (1993). „Podjednotka 102 kDa částice spojené s Golgi má homologii k beta podjednotkám trimerních G proteinů“. EMBO J.. 12 (7): 2847–53. doi:10.1002 / j.1460-2075.1993.tb05946.x. PMC 413536. PMID 8335000.
Lowe M, Kreis TE (1996). „In vitro montáž a demontáž coatomeru“. J. Biol. Chem. 270 (52): 31364–71. doi:10.1074 / jbc.270.52.31364. PMID 8537409.
Lowe M, Kreis TE (1997). „In vivo sestavení coatomeru, prekurzor pláště COP-I“. J. Biol. Chem. 271 (48): 30725–30. doi:10.1074 / jbc.271.48.30725. PMID 8940050.
Csukai M, Chen CH, De Matteis MA, Mochly-Rosen D (1997). „Coatomer protein beta'-COP, protein selektivní vazby (RACK) pro protein kinázu Cepsilon“. J. Biol. Chem. 272 (46): 29200–6. doi:10.1074 / jbc.272.46.29200. PMID 9360998.
Eugster A, Frigerio G, Dale M, Duden R (2000). „Domény COP I potřebné pro integritu coatomeru a nové interakce s ARF a ARF-GAP“. EMBO J.. 19 (15): 3905–17. doi:10.1093 / emboj / 19.15.3905. PMC 306616. PMID 10921873.
Sullivan BM, Harrison-Lavoie KJ, Marshansky V, Lin HY, Kehrl JH, Ausiello DA, Brown D, Druey KM (2000). „RGS4 a RGS2 Bind Coatomer and Inhibit COPI Association with Golgi Membranes and Intracellular Transport“. Mol. Biol. Buňka. 11 (9): 3155–68. doi:10,1091 / mbc. 11.9.3155. PMC 14982. PMID 10982407.
Zhang T, Hong W (2001). „Ykt6 tvoří komplex SNARE se syntaxinem 5, GS28 a Bet1 a účastní se pozdního stadia transportu endoplazmatického retikula-Golgiho“. J. Biol. Chem. 276 (29): 27480–7. doi:10,1074 / jbc.M102786200. PMID 11323436.
Xu Y, Martin S, James DE, Hong W (2003). „GS15 tvoří komplex SNARE se syntaxinem 5, GS28 a Ykt6 a je zapojen do provozu v raných cisternách přístroje Golgi“ (PDF). Mol. Biol. Buňka. 13 (10): 3493–507. doi:10,1091 / mbc.E02-01-0004. PMC 129961. PMID 12388752.
Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (2004). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Rohde HM, Cheong FY, Konrad G, Paiha K, Mayinger P, Boehmelt G (2004). „Lidská fosfatidylinositolfosfatáza SAC1 interaguje s komplexem coatomer I“. J. Biol. Chem. 278 (52): 52689–99. doi:10,1074 / jbc.M307983200. PMID 14527956.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (2004). "Fyzická a funkční mapa lidské signální transdukční dráhy TNF-alfa / NF-kappa B". Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. doi:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Tu LC, Yan X, Hood L, Lin B (2007). „Proteomická analýza internomomu N-myc downstream regulovaného genu 1 a jeho interakcí s programem androgenní odpovědi v buňkách rakoviny prostaty“. Mol. Buňka. Proteomika. 6 (4): 575–88. doi:10,1074 / mcp.M600249-MCP200. PMID 17220478.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000184432 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032458 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9858824-5] De Baere E, Speleman F, Van Roy N, De Paepe A, Messiaen L (únor 1999). „Přiřazení buněčného genu pro protein 1 vázajícího retinol (RBP1) a genu podjednotky beta-coatomeru (COPB2) k lidskému chromozomovému pásmu 3q23 hybridizací in situ“. Cytogenet Cell Genet. 82 (3–4): 226–7. doi:10.1159/000015107. PMID 9858824. S2CID 46851294.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: COPB2 coatomer protein komplex, podjednotka beta 2 (beta prime)“.

[pmid10921873-7] Eugster A, Frigerio G, Dale M, Duden R (srpen 2000). „Domény COP I potřebné pro integritu coatomeru a nové interakce s ARF a ARF-GAP“. EMBO J.. 19 (15): 3905–17. doi:10.1093 / emboj / 19.15.3905. PMC 306616. PMID 10921873.

[pmid8940050-8] Lowe M, Kreis TE (listopad 1996). „In vivo sestavení coatomeru, prekurzor pláště COP-I“. J. Biol. Chem. 271 (48): 30725–30. doi:10.1074 / jbc.271.48.30725. PMID 8940050.

[pmid11897493-9] England K, Ashford D, Kidd D, Rumsby M (červen 2002). „PKC epsilon je spojen s myosinem IIA a aktinem ve fibroblastech“. Buňka. Signál. 14 (6): 529–36. doi:10.1016 / s0898-6568 (01) 00277-7. PMID 11897493.

[pmid10982407-10] Sullivan BM, Harrison-Lavoie KJ, Marshansky V, Lin HY, Kehrl JH, Ausiello DA, Brown D, Druey KM (září 2000). „RGS4 a RGS2 váží koatomer a inhibují asociaci COPI s Golgiho membránami a intracelulárním transportem“. Mol. Biol. Buňka. 11 (9): 3155–68. doi:10,1091 / mbc. 11.9.3155. PMC 14982. PMID 10982407.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]