Rnd1 - Rnd1

RND1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2 CLS, 2REX, 3Q3J
Identifikátory
Aliasy	RND1, ARHS, RHO6, RHOS, Rnd1, Rho rodina GTPase 1
Externí ID	OMIM: 609038 MGI: 2444878 HomoloGene: 8706 Genové karty: RND1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	48,865,870 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	98,677,461 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • Vazba GTP; • vazba na receptory; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita GTPázy; • vazba protein kinázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • adherens křižovatka; • cytosol; • cytoskelet; • membrána; • buněčná membrána; • aktinový cytoskelet; • intracelulární membránou vázaná organela; • intracelulární; • buněčná kůra; • místo buněčného dělení;
Biologický proces	• přestavba neuronů; • malá transdukce signálu zprostředkovaná GTPázou; • negativní regulace buněčné adheze; • organizace aktinových vláken; • Rho proteinová signální transdukce; • regulace tvaru buňky; • regulace buněčné migrace; • vytvoření nebo udržení polarity aktinového cytoskeletu; • regulace organizace aktinového cytoskeletu; • sestava svazku aktinových vláken;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	27289
	223881
	ENSG00000172602
	ENSMUSG00000054855
	Q92730
	Q8BLR7
	NM_014470
	NM_172612
	NP_055285
	NP_766200
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Rnd1 je malá (~ 21 kDa) signalizace G protein (konkrétně a GTPáza ) a je členem Rnd podskupina Rodina Rho GTPas.^[5] Je kódován genem RND1.^[6]

Přispívá k regulaci organizace aktinového cytoskeletu v reakci na extracelulární růstové faktory (Nobes et al., 1998). [Dodává OMIM]^[6]

Interakce

Rnd1 bylo prokázáno komunikovat s GRB7,^[7] PLXNB1,^[8] PDE6D,^[9]^[10] ARHGAP5^[11] a UBXD5.^[12]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000172602 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000054855 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ridley AJ (říjen 2006). "Rho GTPasy a dynamika aktinů v membránových výčnělcích a obchodování vezikul". Trendy v buněčné biologii. 16 (10): 522–9. doi:10.1016 / j.tcb.2006.08.006. PMID 16949823.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RND1 Rho family GTPase 1“.
^ Vayssière B, Zalcman G, Mahé Y, Mirey G, Ligensa T, Weidner KM, Chardin P, Camonis J (únor 2000). „Interakce adaptačního proteinu Grb7 s Rnd1, novým členem rodiny Rho“. FEBS Dopisy. 467 (1): 91–6. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01530-6. PMID 10664463. S2CID 4901644.
^ Oinuma I, Katoh H, Harada A, Negishi M (červenec 2003). „Přímá interakce Rnd1 s plexinem-B1 reguluje aktivaci Rho zprostředkovanou PDZ-RhoGEF pomocí plexinu-B1 a indukuje kontrakci buněk v buňkách COS-7“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (28): 25671–7. doi:10,1074 / jbc.M303047200. PMID 12730235.
^ Nancy V, Callebaut I, El Marjou A, de Gunzburg J (duben 2002). „Delta podjednotka cGMP fosfodiesterázy retinální tyčinky reguluje membránovou asociaci Ras a Rap GTPáz“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (17): 15076–84. doi:10,1074 / jbc.M109983200. PMID 11786539.
^ Hanzal-Bayer M, Renault L, Roversi P, Wittinghofer A, Hillig RC (květen 2002). "Komplex delta Arl2-GTP a PDE: od struktury k funkci". Časopis EMBO. 21 (9): 2095–106. doi:10.1093 / emboj / 21.9.2095. PMC 125981. PMID 11980706.
^ Wennerberg K, Forget MA, Ellerbroek SM, Arthur WT, Burridge K, Settleman J, Der CJ, Hansen SH (červenec 2003). "Rnd proteiny fungují jako antagonisté RhoA aktivací p190 RhoGAP". Aktuální biologie. 13 (13): 1106–15. doi:10.1016 / S0960-9822 (03) 00418-4. PMC 6918695. PMID 12842009.
^ Katoh H, Harada A, Mori K, Negishi M (květen 2002). „Socius je nový protein interagující s Rnd GTPázou, který se podílí na rozkladu aktinových stresových vláken“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (9): 2952–64. doi:10.1128 / MCB.22.9.2952-2964.2002. PMC 133765. PMID 11940653.

Další čtení

Nobes CD, Lauritzen I, Mattei MG, Paris S, hala A, Chardin P (duben 1998). „Nový člen rodiny Rho, Rnd1, podporuje demontáž struktur aktinových vláken a ztrátu adheze buněk“. The Journal of Cell Biology. 141 (1): 187–97. doi:10.1083 / jcb.141.1.187. PMC 2132722. PMID 9531558.
Vayssière B, Zalcman G, Mahé Y, Mirey G, Ligensa T, Weidner KM, Chardin P, Camonis J (únor 2000). „Interakce adaptačního proteinu Grb7 s Rnd1, novým členem rodiny Rho“. FEBS Dopisy. 467 (1): 91–6. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01530-6. PMID 10664463. S2CID 4901644.
Aoki J, Katoh H, Mori K, Negishi M (listopad 2000). „Rnd1, nová GTPáza rodiny rho, indukuje tvorbu neuritických procesů v buňkách PC12“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 278 (3): 604–8. doi:10,1006 / bbrc.2000.3842. PMID 11095956.
Rohm B, Rahim B, Kleiber B, Hovatta I, Püschel AW (prosinec 2000). „Semaforinový 3A receptor může přímo regulovat aktivitu malých GTPáz“. FEBS Dopisy. 486 (1): 68–72. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 02240-7. PMID 11108845. S2CID 7914214.
Nancy V, Callebaut I, El Marjou A, de Gunzburg J (duben 2002). „Delta podjednotka cGMP fosfodiesterázy retinální tyčinky reguluje membránovou asociaci Ras a Rap GTPáz“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (17): 15076–84. doi:10,1074 / jbc.M109983200. PMID 11786539.
Katoh H, Harada A, Mori K, Negishi M (květen 2002). „Socius je nový protein interagující s Rnd GTPázou, který se podílí na rozkladu aktinových stresových vláken“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (9): 2952–64. doi:10.1128 / MCB.22.9.2952-2964.2002. PMC 133765. PMID 11940653.
Hanzal-Bayer M, Renault L, Roversi P, Wittinghofer A, Hillig RC (květen 2002). "Komplex delta Arl2-GTP a PDE: od struktury k funkci". Časopis EMBO. 21 (9): 2095–106. doi:10.1093 / emboj / 21.9.2095. PMC 125981. PMID 11980706.
Oinuma I, Katoh H, Harada A, Negishi M (červenec 2003). „Přímá interakce Rnd1 s plexinem-B1 reguluje aktivaci Rho zprostředkovanou PDZ-RhoGEF pomocí plexinu-B1 a indukuje kontrakci buněk v buňkách COS-7“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (28): 25671–7. doi:10,1074 / jbc.M303047200. PMID 12730235.
Oinuma I, Ishikawa Y, Katoh H, Negishi M (srpen 2004). „Semaforinový 4D receptor Plexin-B1 je protein aktivující GTPázu pro R-Ras“. Věda. 305 (5685): 862–5. doi:10.1126 / science.1097545. PMID 15297673. S2CID 39544623.
Harada A, Katoh H, Negishi M (květen 2005). „Přímá interakce Rnd1 s FRS2 beta reguluje Rnd1 indukovanou down-regulaci aktivity RhoA a podílí se na růstu neuritů vyvolaných fibroblastovým růstovým faktorem v buňkách PC12“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (18): 18418–24. doi:10,1074 / jbc.M411356200. PMID 15738000.
Kim YS, Hori M, Yasuda K, Ozaki H (prosinec 2005). "Rozdíly v gestačním vzoru exprese mRNA rodiny Rnd v krysí a lidské myometrii". Srovnávací biochemie a fyziologie A. 142 (4): 410–5. doi:10.1016 / j.cbpa.2005.08.028. PMID 16311049.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000172602 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000054855 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[Ridley-5] Ridley AJ (říjen 2006). "Rho GTPasy a dynamika aktinů v membránových výčnělcích a obchodování vezikul". Trendy v buněčné biologii. 16 (10): 522–9. doi:10.1016 / j.tcb.2006.08.006. PMID 16949823.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: RND1 Rho family GTPase 1“.

[pmid10664463-7] Vayssière B, Zalcman G, Mahé Y, Mirey G, Ligensa T, Weidner KM, Chardin P, Camonis J (únor 2000). „Interakce adaptačního proteinu Grb7 s Rnd1, novým členem rodiny Rho“. FEBS Dopisy. 467 (1): 91–6. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01530-6. PMID 10664463. S2CID 4901644.

[pmid12730235-8] Oinuma I, Katoh H, Harada A, Negishi M (červenec 2003). „Přímá interakce Rnd1 s plexinem-B1 reguluje aktivaci Rho zprostředkovanou PDZ-RhoGEF pomocí plexinu-B1 a indukuje kontrakci buněk v buňkách COS-7“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (28): 25671–7. doi:10,1074 / jbc.M303047200. PMID 12730235.

[pmid11786539-9] Nancy V, Callebaut I, El Marjou A, de Gunzburg J (duben 2002). „Delta podjednotka cGMP fosfodiesterázy retinální tyčinky reguluje membránovou asociaci Ras a Rap GTPáz“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (17): 15076–84. doi:10,1074 / jbc.M109983200. PMID 11786539.

[pmid11980706-10] Hanzal-Bayer M, Renault L, Roversi P, Wittinghofer A, Hillig RC (květen 2002). "Komplex delta Arl2-GTP a PDE: od struktury k funkci". Časopis EMBO. 21 (9): 2095–106. doi:10.1093 / emboj / 21.9.2095. PMC 125981. PMID 11980706.

[pmid12842009-11] Wennerberg K, Forget MA, Ellerbroek SM, Arthur WT, Burridge K, Settleman J, Der CJ, Hansen SH (červenec 2003). "Rnd proteiny fungují jako antagonisté RhoA aktivací p190 RhoGAP". Aktuální biologie. 13 (13): 1106–15. doi:10.1016 / S0960-9822 (03) 00418-4. PMC 6918695. PMID 12842009.

[pmid11940653-12] Katoh H, Harada A, Mori K, Negishi M (květen 2002). „Socius je nový protein interagující s Rnd GTPázou, který se podílí na rozkladu aktinových stresových vláken“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (9): 2952–64. doi:10.1128 / MCB.22.9.2952-2964.2002. PMC 133765. PMID 11940653.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]