Syntaxin - Syntaxin
Syntaxin | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Struktura evolučně konzervované N-terminální domény syntaxinu 1A.[1] | |||||||||
Identifikátory | |||||||||
Symbol | Syntaxin | ||||||||
Pfam | PF00804 | ||||||||
InterPro | IPR006011 | ||||||||
CHYTRÝ | SM00503 | ||||||||
SCOP2 | 1br0 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
OPM nadčeleď | 197 | ||||||||
OPM protein | 2xhe | ||||||||
Membranome | 349 | ||||||||
|
Syntaxiny jsou rodina membrána integrovaný Q-SNARE bílkoviny účastnit se exocytóza.[2]
Domény
Syntaxiny mají jednu C-koncovou transmembránovou doménu, SNARE doménu (známou jako H3) a N-koncovou regulační doménu (Habc). Syntaxin 17 může mít dvě transmembránové domény.
- Doména SNARE (H3) se váže k oběma synaptobrevin a SNAP-25 tvořící základní komplex SNARE. Předpokládá se, že tvorba tohoto stabilního komplexu jádra SNARE generuje volnou energii potřebnou k zahájení fúze mezi membránou vezikul a plazmatickou membránou.[3]
- N-koncová Habc doména je tvořena 3 α-šroubovicemi a při zhroucení na vlastní H3 šroubovice vytváří neaktivní "uzavřenou" konformaci syntaxinu. Předpokládá se, že tato uzavřená konformace syntaxinu je stabilizována vazbou Munc-18 (nSec1), i když novější údaje naznačují, že nSec1 se může vázat i na jiné konformace syntaxinu. „Otevřená“ konformace syntaxinu je konformace, která je kompetentní formovat se do komplexů jádra SNARE.
Funkce
In vitro syntaxin sám o sobě je dostatečný k vyvolání spontánní fúze nezávislé na vápníku synaptické vezikuly obsahující v-SNARE.[5]
Novější a poněkud kontroverzní amperometrické údaje naznačují, že transmembránová doména Syntaxin1A může tvořit část fúzního póru exocytózy.[6]
Vazba
Syntaxiny se vážou synaptotagmin způsobem závislým na vápníku a interagovat s napěťově závislými kanály vápníku a draslíku prostřednictvím C-koncové domény H3. Přímá interakce syntaxinového kanálu je vhodným molekulárním mechanismem pro blízkost mezi fúzním aparátem a bránami Ca2+ vstup během depolarizace presynaptické axonální boutony.
Je známo, že rodina proteinů Sec1 / Munc18 se váže na syntaxin a reguluje syntaxinové mechanizmy. Munc18-1 se váže na syntaxin 1A prostřednictvím dvou odlišných míst označovaných jako vazba N-konce a "uzavřená" konformace, která zahrnuje jak centrální doménu Habc, tak jádrovou doménu SNARE. Předpokládá se, že vazba Munc18-1 na N-konec syntaxinu-1 usnadňuje interakci syntaxinu-1 s jiným SNARE, zatímco vazba na „uzavřenou“ konformaci syntaxinu-1 je považována za inhibiční.
Nedávno publikovaná data ukazují, že alternativní sestřih syntaxinu 1 (STX1B), kterému chybí transmembránová doména, se lokalizuje v jádrech.[7]
Geny
Lidské geny kódující proteiny syntaxinu zahrnují:
- STX1A, STX1B, STX2, STX3, STX4, STX5, STX6, STX7, STX8,
- STX10, STX11, STX12, STX16, STX17, STX18, STX19
Viz také
- Tomosyn, protein vázající syntaxin
Reference
- ^ Fernandez I, Ubach J, Dulubova I, Zhang X, Südhof TC, Rizo J (září 1998). "Trojrozměrná struktura evolučně konzervované N-terminální domény syntaxinu 1A". Buňka. 94 (6): 841–9. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81742-0. PMID 9753330.
- ^ Bennett MK, García-Arrarás JE, Elferink LA, Peterson K, Fleming AM, Hazuka CD, Scheller RH (září 1993). "Rodina syntaxinů vezikulárních transportních receptorů". Buňka. 74 (5): 863–73. doi:10.1016/0092-8674(93)90466-4. PMID 7690687.
- ^ Lam AD, Tryoen-Toth P, Tsai B, Vitale N, Stuenkel EL (2008). „Události fúze katalyzované SNARE jsou regulovány interakcemi Syntaxin1A-lipid“. Molekulární biologie buňky. 19 (2): 485–97. doi:10,1091 / mbc.E07-02-0148. PMC 2230580. PMID 18003982.
- ^ Georgiev DD, Glazebrook JF (2007). "Subneuronální zpracování informací osamělými vlnami a stochastickými procesy". V Lyshevski SE (ed.). Příručka pro nano a molekulární elektroniku. Série nano a mikroinženýrství. CRC Press. str. 17–1–17–41. ISBN 978-0-8493-8528-5.
- ^ Woodbury DJ, Rognlien K (2000). „Syntaxin t-SNARE je dostatečný pro spontánní fúzi synaptických vezikul k rovinným membránám.“ Cell Biology International. 24 (11): 809–18. doi:10.1006 / cbir.2000.0631. PMID 11067766.
- ^ Han X, Wang CT, Bai J, Chapman ER, Jackson MB (duben 2004). "Transmembránové segmenty syntaxinu lemují fúzní póry exocytózy vyvolané Ca2 +". Věda. 304 (5668): 289–92. doi:10.1126 / science.1095801. PMID 15016962.
- ^ Pereira S, Massacrier A, Roll P, Vérine A, Etienne-Grimaldi MC, Poitelon Y, Robaglia-Schlupp A, Jamali S, Roeckel-Trevisiol N, Royer B, Pontarotti P, Lévêque C, Seagar M, Lévy N, Cau P , Szepetowski P (listopad 2008). "Jaderná lokalizace nové izoformy lidského syntaxinu 1B". Gen. 423 (2): 160–71. doi:10.1016 / j.gene.2008.07.010. PMID 18691641.
externí odkazy
- Syntaxin v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)