STXBP1 - STXBP1

STXBP1
Protein STXBP1 PDB 1dn1.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasySTXBP1, MUNC18-1, NSEC1, P67, RBSEC1, UNC18, protein vázající syntaxin 1
Externí IDOMIM: 602926 MGI: 107363 HomoloGene: 2382 Genové karty: STXBP1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 9 (lidský)
Chr.Chromozom 9 (lidský)[1]
Chromozom 9 (lidský)
Genomické umístění pro STXBP1
Genomické umístění pro STXBP1
Kapela9q34.11Start127,579,370 bp[1]
Konec127,696,027 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE STXBP1 202260 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

6812

20910

Ensembl

ENSG00000136854

ENSMUSG00000026797

UniProt

P61764

O08599

RefSeq (mRNA)

NM_003165
NM_001032221

NM_001113569
NM_009295

RefSeq (protein)

NP_001107041
NP_033321

Místo (UCSC)Chr 9: 127,58 - 127,7 MbChr 2: 32,79 - 32,85 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Protein vázající syntaxin 1 (také známý jako Munc18-1 ) je protein že u lidí je kódován STXBP1 gen.[5] Tento gen kóduje a vazba syntaxinu protein. Zdá se, že kódovaný protein hraje roli při uvolňování neurotransmitery regulací syntaxinu, transmembránového vazebného proteinového receptoru. Mutace v tomto genu byly spojeny s infantilní epileptická encefalopatie-4.[6]

Struktura

The STXBP1 Gen se nachází na rameni q chromozom 9 na pozici 34,11 a má 20 exony překlenující 80 510 párů bází.[6] Kódovaný protein je a protein periferní membrány nachází se v cytosol.[7][8] V sítnice a mozeček, an alternativně sestříhané je exprimována varianta transkriptu, obsahující další exon a celkem 603 aminokyseliny.[9] Alternativní sestřih může vést k izoforma s exonem 19 a izoformou bez.[10][11]

Funkce

Kódovaný protein se může účastnit regulace synaptický váček dokovací a fúze, možná prostřednictvím interakce s GTP-vazebné proteiny. Je to nezbytné pro neurotransmise a váže syntaxin, součást mechanismu fúze synaptických vezikul pravděpodobně v poměru 1: 1. Může interagovat se syntaxiny 1, 2 a 3, ale ne se syntaxinem 4 a může hrát roli při určování specificity intracelulárních fúzních reakcí.[7][8] Tento protein funguje v pozdním stadiu procesu fúze intracelulární membrány exocytóza. Disociace tohoto proteinu od syntaxinu určuje kinetika událostí po fúzi.[12] Tento protein je nezbytný pro presynpatické váček uvolnění a je rychle fosforylovaný podle protein kináza C. na neuron depolarizace.[13] Protein se účastní sekreční cesta mezi Golgiho aparát a buněčná membrána.[14][11]

Klinický význam

Epileptická encefalopatie

Mutace v STXBP1 způsobit Raná infantilní epileptická encefalopatie typu 4 (EIEE4), těžká forma epilepsie charakterizované častými tonickými záchvaty nebo křečemi začínajícími v kojeneckém věku se specifickým EEG nález potlačení vzory charakterizované vysokonapěťovými záblesky střídajícími se s téměř plochými fázemi potlačení. Dotčené osoby mají novorozenec nebo infantilní nástup záchvaty, hluboký mentální retardace, a MRI důkaz mozku hypomyelinizace. Dědičnost EIEE4 je autosomálně dominantní.[7][8]

Tento gen byl původně objeven v roce 2008 jako příčina Ohtaharův syndrom. Od té doby se stal jedním z nejvýznamnějších genů pro epileptické encefalopatie.[15]

Výraz

v melanocytární buňky STXBP1 genová exprese možná regulované podle MITF.[16]

The STXBP1 gen je exprimován v mozek a mícha a velmi obohacený axony.[7][8] Exprese tohoto proteinu je nejvyšší v sítnici a v mozečku.[9][11]

Interakce

Kódovaný protein se váže SYTL4.[7][8] STXBP1 bylo prokázáno komunikovat s STX2,[17][18] STX4[17][18] a STX1A.[18][19][20][21][22]

externí odkazy

  • Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P61765 (Protein vázající syntaxin krysy 1) na PDBe-KB.

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136854 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026797 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Swanson DA, Steel JM, Valle D (březen 1998). „Identifikace a charakterizace lidského ortologu krysího STXBP1, proteinu zapojeného do přenosu vezikul a uvolňování neurotransmiteru“. Genomika. 48 (3): 373–6. doi:10.1006 / geno.1997.5202. PMID  9545644.
  6. ^ A b „Entrez Gene: STXBP1 syntaxin binding protein 1“. Citováno 2018-08-29. Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v veřejná doména.
  7. ^ A b C d E „STXBP1 - protein vázající syntaxin 1 - Homo sapiens (člověk) - gen a protein STXBP1“. www.uniprot.org. Citováno 2018-08-29. Tento článek včlení text dostupný pod CC BY 4.0 licence.
  8. ^ A b C d E „UniProt: univerzální znalostní databáze proteinů“. Výzkum nukleových kyselin. 45 (D1): D158 – D169. Ledna 2017. doi:10.1093 / nar / gkw1099. PMC  5210571. PMID  27899622.
  9. ^ A b Swanson DA, Steel JM, Valle D (březen 1998). „Identifikace a charakterizace lidského ortologu krysího STXBP1, proteinu zapojeného do přenosu vezikul a uvolňování neurotransmiteru“. Genomika. 48 (3): 373–6. doi:10.1006 / geno.1997.5202. PMID  9545644.
  10. ^ Hamdan FF, Piton A, Gauthier J, Lortie A, Dubeau F, Dobrzeniecka S, Spiegelman D, Noreau A, Pellerin S, Côté M, Henrion E, Fombonne E, Mottron L, Marineau C, Drapeau P, Lafrenière RG, Lacaille JC , Rouleau GA, Michaud JL (červen 2009). „De novo STXBP1 mutace v mentální retardaci a nesyndromické epilepsii“. Annals of Neurology. 65 (6): 748–53. doi:10,1002 / ana.21625. PMID  19557857. S2CID  23892974.
  11. ^ A b C Online Mendelian Inheritance in Man, OMIM®. Johns Hopkins University, Baltimore, MD. Číslo MIM: {602926}: {04/22/2014}:. Adresa URL webu: https://omim.org/
  12. ^ Fisher RJ, Pevsner J, Burgoyne RD (únor 2001). "Řízení dynamiky fúzních pórů během exocytózy pomocí Munc18". Věda. 291 (5505): 875–8. doi:10.1126 / science.291.5505.875. PMID  11157167. S2CID  27780447.
  13. ^ Wierda KD, Toonen RF, de Wit H, Brussaard AB, Verhage M (duben 2007). "Vzájemná závislost PKC závislých a PKC nezávislých drah pro presynaptickou plasticitu". Neuron. 54 (2): 275–90. doi:10.1016 / j.neuron.2007.04.001. PMID  17442248. S2CID  15142600.
  14. ^ Pevsner J, Hsu SC, Scheller RH (únor 1994). „n-Sec1: neuronově specifický protein vázající syntaxin“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 91 (4): 1445–9. doi:10.1073 / pnas.91.4.1445. PMC  43176. PMID  8108429.
  15. ^ STXBP1 - to je to, co potřebujete vědět v roce 2015
  16. ^ Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, Widmer DS, Praetorius C, Einarsson SO, Valgeirsdottir S, Bergsteinsdottir K, Schepsky A, Dummer R, Steingrimsson E (prosinec 2008). "Nové cíle MITF identifikované pomocí dvoustupňové strategie DNA microarray". Výzkum pigmentových buněk a melanomu. 21 (6): 665–76. doi:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID  19067971. S2CID  24698373.
  17. ^ A b Schraw TD, Lemons PP, Dean WL, Whiteheart SW (srpen 2003). „Role pro proteiny Sec1 / Munc18 při exocytóze krevních destiček“. The Biochemical Journal. 374 (Pt 1): 207–17. doi:10.1042 / BJ20030610. PMC  1223584. PMID  12773094.
  18. ^ A b C Hata Y, Südhof TC (červen 1995). „Nová všudypřítomná forma Munc-18 interaguje s více syntaxiny. Použití kvasinkového dvouhybridního systému ke studiu interakcí mezi proteiny zapojenými do membránového přenosu“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (22): 13022–8. doi:10.1074 / jbc.270.22.13022. PMID  7768895.
  19. ^ Bhaskar K, Shareef MM, Sharma VM, Shetty AP, Ramamohan Y, Pant HC, Raju TR, Shetty KT (leden 2004). "Společné čištění a lokalizace Munc18-1 (p67) a Cdk5 s neuronálními cytoskeletálními proteiny". Neurochemistry International. 44 (1): 35–44. doi:10.1016 / S0197-0186 (03) 00099-8. PMID  12963086. S2CID  23783141.
  20. ^ Dulubova I, Sugita S, Hill S, Hosaka M, Fernandez I, Südhof TC, Rizo J (srpen 1999). "Konformační přechod v syntaxinu během exocytózy: role munc18". Časopis EMBO. 18 (16): 4372–82. doi:10.1093 / emboj / 18.16.4372. PMC  1171512. PMID  10449403.
  21. ^ McMahon HT, Missler M, Li C, Südhof TC (říjen 1995). "Komplexiny: cytosolické proteiny, které regulují funkci receptoru SNAP". Buňka. 83 (1): 111–9. doi:10.1016/0092-8674(95)90239-2. PMID  7553862. S2CID  675343.
  22. ^ Pérez-Brangulí F, Muhaisen A, Blasi J (červen 2002). „Vazba Munc 18a na izoformy syntaxinu 1A a 1B definuje jeho lokalizaci na plazmatické membráně a blokuje sestavu SNARE v testu s třemi hybridními systémy“. Molekulární a buněčné neurovědy. 20 (2): 169–80. doi:10.1006 / mcne.2002.1122. PMID  12093152. S2CID  23927545.

Další čtení

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.