ATP2B4 - ATP2B4

ATP2B4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1CFF, 2KNE
Identifikátory
Aliasy	ATP2B4, ATP2B2, MXRA1, PMCA4, PMCA4b, PMCA4x, ATPázová plazmatická membrána transportující Ca2 + 4
Externí ID	OMIM: 108732 MGI: 88111 HomoloGene: 48034 Genové karty: ATP2B4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	203,744,081 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	133,801,041 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • Vazba domény PDZ; • aktivita regulátoru sodíkového kanálu; • vazba syntázy oxidu dusnatého; • vazba proteinu lešení; • vazba kovových iontů; • kalmodulinová vazba; • aktivita inhibitoru syntázy oxidu dusnatého; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba proteinové fosfatázy 2B; • ATP vazba; • aktivita hydrolázy; • aktivita ATPázy transportující vápník; • vazba protein kinázy;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • buněčná projekce; • membrána; • intracelulární membránou vázaná organela; • T-tubule; • buněčná membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • spermie bičík; • hlavní kus spermatu; • bazolaterální plazmatická membrána; • Z disk; • Caveola; • neuronová projekce; • sarcolemma; • cilium; • pohyblivé cilium; • makromolekulární komplex; • glutamátergická synapse; • integrální součást presynaptické membrány aktivní zóny;
Biologický proces	• negativní regulace přenosu signálu zprostředkovaná oxidem dusnatým; • bičíkatá motilita spermií; • regulace srdečního vedení; • negativní regulace aktivity syntázy oxidu dusnatého; • negativní regulace kalcineurin-NFAT signalizační kaskády; • negativní regulace procesu biosyntézy citrulinu; • negativní regulace peptidyl-cystein S-nitrosylace; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • import iontů vápníku přes plazmatickou membránu; • reakce na hydrostatický tlak; • buněčná homeostáza iontů vápníku; • iontový transport; • pozitivní regulace fosforylace peptidyl-serinu; • buněčná odpověď na stimul adrenalinu; • iontový transmembránový transport; • negativní regulace procesu biosyntézy oxidu dusnatého; • transmembránový transport vápenatých iontů; • transmembránový dovoz vápenatých iontů do cytosolu; • spermatogeneze; • pozitivní regulace aktivity proteinkinázy závislé na cAMP; • regulace fázového přechodu G1 / S buněčného cyklu; • regulace transmembránového transportu sodíkových iontů; • export iontů vápníku; • vývoj hipokampu; • negativní regulace katabolického procesu argininu; • vývoj nervové sítnice; • negativní regulace síly kontrakce srdce; • transport iontů vápníku; • negativní regulace hypertrofie srdečního svalu v reakci na stres; • doprava; • regulace koncentrace cytosolických iontů vápníku; • negativní regulace signální dráhy adrenergního receptoru aktivující adenylátcyklázu zapojené do srdečního procesu; • kontrakce hladkého svalstva močového měchýře; • buněčná odpověď na acetylcholin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	493
	381290
	ENSG00000058668
	ENSMUSG00000026463
	P23634
	Q6Q477
	NM_001684; NM_001001396; NM_001365783; NM_001365784
	NM_001167949; NM_213616
	NP_001001396; NP_001675; NP_001352712; NP_001352713
	NP_001161421; NP_998781
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

ATPáza 4 transportující vápník v plazmě je enzym že u lidí je kódován ATP2B4 gen.^[5]^[6]

Protein kódovaný tímto genem patří do rodiny primárních iontových transportních ATPáz typu P charakterizovaných tvorbou meziproduktu aspartylfosfátu během reakčního cyklu. Tyto enzymy odstraňují bivalentní ionty vápníku z eukaryotických buněk proti velmi velkým koncentračním gradientům a hrají klíčovou roli v intracelulární homeostáze vápníku. Izoformy vápníkové ATPázy plazmatické membrány savců jsou kódovány alespoň čtyřmi samostatnými geny a rozmanitost těchto enzymů je dále zvýšena alternativní sestřih přepisů. Exprese různých izoforem a variant sestřihu je regulována vývojově, tkáňově a buněčně typově, což naznačuje, že tyto pumpy jsou funkčně přizpůsobeny fyziologickým potřebám konkrétních buněk a tkání. Tento gen kóduje izoformu vápníkové ATPázy plazmatické membrány 4. Alternativně byly identifikovány sestřihané varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že ATP2B4 komunikovat s SUD.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000058668 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000026463 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Olson S, Wang MG, Carafoli E, Strehler EE, McBride OW (duben 1991). "Lokalizace dvou genů kódujících plazmatickou membránu Ca2 (+) - transportující ATPázy do lidských chromozomů 1q25-32 a 12q21-23". Genomika. 9 (4): 629–41. doi:10.1016 / 0888-7543 (91) 90356-J. PMID 1674727.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ATP2B4 ATPáza, transport Ca ++, plazmatická membrána 4“.
^ Schuh K, Uldrijan S, Gambaryan S, Roethlein N, Neyses L (březen 2003). „Interakce plazmatické membrány Ca2 + pumpa 4b / CI s Ca2 + / kalmodulinem závislou membránovou kinázou CASK“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (11): 9778–83. doi:10,1074 / jbc.M212507200. PMID 12511555.

Další čtení

Møller JV, Juul B, le Maire M (květen 1996). "Strukturální organizace, iontový transport a energetická transdukce P-typu ATPáz". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Recenze na biomembrány. 1286 (1): 1–51. doi:10.1016/0304-4157(95)00017-8. PMID 8634322.
Strehler EE, Zacharias DA (leden 2001). "Úloha alternativního sestřihu při vytváření diverzity izoforem mezi vápenatými pumpami s plazmatickou membránou". Fyziologické recenze. 81 (1): 21–50. doi:10.1152 / physrev.2001.81.1.21. PMID 11152753.
Strehler EE, Treiman M (květen 2004). "Vápníkové pumpy plazmatické membrány a vnitřku buňky". Současná molekulární medicína. 4 (3): 323–35. doi:10.2174/1566524043360735. PMID 15101689.
Heim R, Hug M, Iwata T, Strehler EE, Carafoli E (duben 1992). „Mikrodiverzita izoformy 2 vápníkové pumpy lidské plazmy s membránou generovaná alternativním sestřihem RNA v N-koncové oblasti kódování“. European Journal of Biochemistry. 205 (1): 333–40. doi:10.1111 / j.1432-1033.1992.tb16784.x. PMID 1313367.
Brandt P, Neve RL, Kammesheidt A, Rhoads RE, Vanaman TC (březen 1992). „Analýza tkáňově specifické distribuce mRNA kódujících plazmatické membrány ATPázy čerpající vápník a charakterizace střídavě sestřižené formy PMCA4 na úrovni cDNA a genomu“. The Journal of Biological Chemistry. 267 (7): 4376–85. PMID 1531651.
Strehler EE, James P, Fischer R, Heim R, Vorherr T, Filoteo AG, Penniston JT, Carafoli E (únor 1990). „Analýza peptidové sekvence a molekulární klonování odhalily dvě izoformy vápníkové pumpy v lidské membráně erytrocytů“. The Journal of Biological Chemistry. 265 (5): 2835–42. PMID 2137451.
James P, Maeda M, Fischer R, Verma AK, Krebs J, Penniston JT, Carafoli E (únor 1988). „Identifikace a primární struktura domény vázající kalmodulin Ca2 + pumpy lidských erytrocytů“. The Journal of Biological Chemistry. 263 (6): 2905–10. PMID 2963820.
Brandt P, Zurini M, Neve RL, Rhoads RE, Vanaman TC (květen 1988). „C-koncová, kalmodulinem podobná regulační doména z plazmatické membrány Ca2 + čerpající ATPázy“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 85 (9): 2914–8. Bibcode:1988PNAS ... 85.2914B. doi:10.1073 / pnas.85.9.2914. PMC 280113. PMID 2966397.
Howard A, Barley NF, Legon S, Walters JR (říjen 1994). „Izoformy vápníkové pumpy na plazmatické membráně v játrech člověka a potkanů“. The Biochemical Journal. 303 (Pt 1) (Pt 1): 275–9. doi:10.1042 / bj3030275. PMC 1137587. PMID 7945253.
Stauffer TP, Hilfiker H, Carafoli E, Strehler EE (prosinec 1994). "Kvantitativní analýza alternativních možností sestřihu genů vápníkové pumpy lidské plazmatické membrány". The Journal of Biological Chemistry. 269 (50): 32022. PMID 7989379.
Stauffer TP, Hilfiker H, Carafoli E, Strehler EE (prosinec 1993). "Kvantitativní analýza alternativních možností sestřihu genů vápníkové pumpy lidské plazmatické membrány". The Journal of Biological Chemistry. 268 (34): 25993–6003. PMID 8245032.
Váradi A, Molnár E, Ashcroft SJ (březen 1996). „Unikátní kombinace izoforem Ca2 + -ATPázy v plazmatické membráně je vyjádřena v Langerhansových ostrůvcích a pankreatických beta-buněčných liniích“. The Biochemical Journal. 314 (Pt 2) (Pt 2): 663–9. doi:10.1042 / bj3140663. PMC 1217098. PMID 8670083.
Santiago-García J, Mas-Oliva J, Saavedra D, Zarain-Herzberg A (únor 1996). "Analýza exprese mRNA a klonování nové varianty sestřihu Ca (2 +) - ATPázy plazmové membrány v lidském srdci". Molekulární a buněčná biochemie. 155 (2): 173–82. doi:10.1007 / BF00229314. PMID 8700162.
Zacharias DA, DeMarco SJ, Strehler EE (duben 1997). "mRNA exprese čtyř izoforem lidské plazmatické membrány Ca (2 +) - ATPázy v lidském hipokampu". Výzkum mozku. Molekulární výzkum mozku. 45 (1): 173–6. doi:10.1016 / S0169-328X (97) 00009-0. PMID 9105688.
Dean WL, Chen D, Brandt PC, Vanaman TC (červen 1997). "Regulace destičkové plazmatické membrány Ca2 + -ATPázy závislou na cAMP a fosforylací tyrosinu". The Journal of Biological Chemistry. 272 (24): 15113–9. doi:10.1074 / jbc.272.24.15113. PMID 9182531.
Kim E, DeMarco SJ, Marfatia SM, Chishti AH, Sheng M, Strehler EE (leden 1998). „Izoforma 4b plazmatické membrány Ca2 + ATPázy se váže na proteiny guanylátkinázy asociované s membránou (MAGUK) prostřednictvím svých domén PDZ (PSD-95 / Dlg / ZO-1)“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (3): 1591–5. doi:10.1074 / jbc.273.3.1591. PMID 9430700.
Guerini D, García-Martin E, Gerber A, Volbracht C, Leist M, Merino CG, Carafoli E (leden 1999). „Exprese izoforem pumpy plazmatické Ca2 + v neuronech cerebelárních granulí je modulována Ca2 +“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (3): 1667–76. doi:10.1074 / jbc.274.3.1667. PMID 9880546.
Rosado JA, Sage SO (červen 2000). "Regulace plazmatické membrány Ca2 + -ATPázy malými GTPázami a fosfoinositidy v lidských krevních destičkách". The Journal of Biological Chemistry. 275 (26): 19529–35. doi:10,1074 / jbc.M001319200. PMID 10748016.

externí odkazy

Člověk ATP2B2 umístění genomu a ATP2B2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Člověk ATP2B4 umístění genomu a ATP2B4 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000058668 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000026463 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1674727-5] Olson S, Wang MG, Carafoli E, Strehler EE, McBride OW (duben 1991). "Lokalizace dvou genů kódujících plazmatickou membránu Ca2 (+) - transportující ATPázy do lidských chromozomů 1q25-32 a 12q21-23". Genomika. 9 (4): 629–41. doi:10.1016 / 0888-7543 (91) 90356-J. PMID 1674727.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: ATP2B4 ATPáza, transport Ca ++, plazmatická membrána 4“.

[pmid12511555-7] Schuh K, Uldrijan S, Gambaryan S, Roethlein N, Neyses L (březen 2003). „Interakce plazmatické membrány Ca2 + pumpa 4b / CI s Ca2 + / kalmodulinem závislou membránovou kinázou CASK“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (11): 9778–83. doi:10,1074 / jbc.M212507200. PMID 12511555.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]