RAB3A - RAB3A

RAB3A
Identifikátory
Aliasy	RAB3A, člen rodiny onkogenů RAS
Externí ID	OMIM: 179490 MGI: 97843 HomoloGene: 20629 Genové karty: RAB3A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	18,204,042 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	70,758,677 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • Vazba ATPázy; • Vazba GTP; • vazba myosinu V; • vazba na C-konec proteinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita ATPázy; • Vazba na protein závislá na GTP; • Aktivita GTPázy; • Vazba inhibitoru GDP-disociace;
Buněčná složka	• extracelulární vezikul; • endozom; • klatrinem vytvarovaná monoaminová transportní vezikulární membrána; • membrána; • synaptický váček; • buněčná membrána; • membrána gama-aminomáselné kyseliny vytvarovaná do klatrinu; • klatrinem vyřezávaná membrána transportního váčku acetylcholinu; • axon; • terminální tlačítko; • Akrozom; • intracelulární organela; • klatrinem vytesaná glutamátová transportní vezikulární membrána; • cytosol; • sekreční granulovaná membrána; • zakotvená součást membrány synaptických vezikul; • váček; • makromolekulární komplex; • presynaptická aktivní zóna; • sekreční granule; • perinukleární oblast cytoplazmy;
Biologický proces	• proces dýchacího systému; • pozitivní regulace aktivity ATPázy; • axonogeneze; • vývoj plic; • exocytóza synaptických vezikul; • regulace krátkodobé neuronální synaptické plasticity; • vyvolala sekreci neurotransmiteru; • organizace mitochondrií; • reakce na elektrický podnět; • post-embryonální vývoj; • konstitutivní sekreční cesta; • údržba presynaptické struktury aktivní zóny; • sekrece glutamátu; • regulace exocytózy; • regulace fúze synaptických vezikul na presynaptickou membránu aktivní zóny; • neuromuskulární synaptický přenos; • recyklace synaptických vezikul; • smyslové vnímání dotyku; • transport bílkovin; • pozitivní regulace exocytózy; • zrání synaptických vezikul; • GO: Sekrece neurotransmiteru 0010554; • pozitivní regulace regulované sekreční dráhy; • exocytóza; • degranulace neutrofilů; • posttranslační modifikace; • doprava; • transport intracelulárních proteinů; • dokování vezikul zapojené do exocytózy; • sekrece bílkovin; • Transdukce signálu Rab proteinu; • lokalizace proteinu na plazmatickou membránu; • oprava plazmatické membrány; • regulace primování synaptických vezikul; • transport synaptických vezikul; • exocytóza akrozomálních vezikul; • regulace exaptózy synaptických vezikul; • exocytóza regulovaná ionty vápníku; • shlukování synaptických vezikul;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5864
	19339
	ENSG00000105649
	ENSMUSG00000031840
	P20336
	P63011
	NM_002866
	NM_001166399; NM_009001; NM_001328047
	NP_002857; NP_002857.1
	NP_001159871; NP_001314976; NP_033027; NP_001365821; NP_001365822
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein související s Ras Rab-3A je protein že u lidí je kódován RAB3A gen.^[5]^[6]^[7] Podílí se na exocytóze vyvolané vápníkem v neuronech.

Interakce

RAB3A bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000105649 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031840 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Rousseau-Merck MF, Zahraoui A, Bernheim A, Touchot N, Miglierina R, Tavitian A, Berger R (leden 1990). "Chromozomové mapování lidského genu rab3A souvisejícího s ras na 19p13.2". Genomika. 5 (4): 694–8. doi:10.1016/0888-7543(89)90110-9. PMID 2687157.
^ Brondyk WH, McKiernan CJ, Fortner KA, Stabila P, Holz RW, Macara IG (březen 1995). „Interakční klonování Rabin3, nového proteinu, který se asociuje s Ras-jako GTPáza Rab3A“. Mol Cell Biol. 15 (3): 1137–43. doi:10.1128 / MCB.15.3.1137. PMC 230335. PMID 7532276.
^ „Entrez Gene: RAB3A RAB3A, člen RAS onkogenní rodiny“.
^ ^A ^b Fukuda M (duben 2003). "Zřetelná Rabova vazebná specificita pro Rim1, Rim2, rabphilin a Noc2. Identifikace kritického determinantu rozpoznávání Rab3A / Rab27A pomocí Rim2". J. Biol. Chem. 278 (17): 15373–80. doi:10,1074 / jbc.M212341200. PMID 12578829.
^ Betz A, Thakur P, Junge HJ, Ashery U, Rhee JS, Scheuss V, Rosenmund C, Rettig J, Brose N (duben 2001). "Funkční interakce proteinů aktivní zóny Munc13-1 a RIM1 při aktivaci synaptických vezikul". Neuron. 30 (1): 183–96. doi:10.1016 / s0896-6273 (01) 00272-0. hdl:11858 / 00-001M-0000-0012-F596-C. PMID 11343654. S2CID 155875.
^ „Protein unc-13 homolog A“. UniProt.
^ Ostermeier C, Brunger AT (únor 1999). "Strukturní základ Rab efektorové specificity: krystalová struktura malého G proteinu Rab3A v komplexu s efektorovou doménou rabphilinu-3A". Buňka. 96 (3): 363–74. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80549-8. PMID 10025402. S2CID 15162326.
^ Weber E, Jilling T, Kirk KL (březen 1996). "Výrazné funkční vlastnosti Rab3A a Rab3B v neuroendokrinních buňkách PC12". J. Biol. Chem. 271 (12): 6963–71. doi:10.1074 / jbc.271.12.6963. PMID 8636125.
^ Cremers FP, Armstrong SA, Seabra MC, Brown MS, Goldstein JL (leden 1994). „REP-2, doprovodný protein Rab kódovaný genem podobným choroideremii“. J. Biol. Chem. 269 (3): 2111–7. PMID 8294464.
^ Pereira-Leal JB, Strom M, Godfrey RF, Seabra MC (leden 2003). "Strukturní determinanty interakce Rab a Rab Escort Protein: Motivy rodiny Rab definují konzervovaný vazebný povrch". Biochem. Biophys. Res. Commun. 301 (1): 92–7. doi:10.1016 / s0006-291x (02) 02963-7. PMID 12535645.

Další čtení

Khosravi-Far R, Lutz RJ, Cox AD, Conroy L, Bourne JR, Sinensky M, Balch WE, Buss JE, Der CJ (1991). "Isoprenoidová modifikace rab proteinů končících v CC nebo CXC motivech". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 88 (14): 6264–8. doi:10.1073 / pnas.88.14.6264. PMC 52063. PMID 1648736.
Zahraoui A, Touchot N, Chardin P, Tavitian A (1989). „Lidské geny Rab kódují rodinu proteinů vázajících GTP souvisejících s produkty kvasinek YPT1 a SEC4 zapojenými do sekrece.“ J. Biol. Chem. 264 (21): 12394–401. PMID 2501306.
Farnsworth CC, Seabra MC, Ericsson LH, Gelb MH, Glomset JA (1995). „Rab geranylgeranyl transferáza katalyzuje geranylgeranylaci sousedních cysteinů v malých GTPázách Rab1A, Rab3A a Rab5A“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (25): 11963–7. doi:10.1073 / pnas.91.25.11963. PMC 45356. PMID 7991565.
McKiernan CJ, Brondyk WH, Macara IG (1993). "Rab3A GTPáza interaguje s více faktory prostřednictvím stejné efektorové domény. Mutační analýza zesíťování Rab3A na domnělý cílový protein". J. Biol. Chem. 268 (32): 24449–52. PMID 8226995.
Trask B, Fertitta A, Christensen M, Youngblom J, Bergmann A, Copeland A, de Jong P, Mohrenweiser H, Olsen A, Carrano A (1993). „Fluorescenční in situ hybridizační mapování lidského chromozomu 19: umístění cytogenetického pásma 540 kosmidů a 70 genů nebo markerů DNA“. Genomika. 15 (1): 133–45. doi:10.1006 / geno.1993.1021. PMID 8432525.
Johannes L, Perez F, poslanec Laran-Chich, Henry JP, Darchen F (1996). „Charakterizace interakce monomerního proteinu vázajícího GTP Rab3a s geranylgeranyl transferázou II“. Eur. J. Biochem. 239 (2): 362–8. doi:10.1111 / j.1432-1033.1996.0362u.x. PMID 8706741.
Burton JL, Slepnev V, De Camilli PV (1997). „Evolučně konzervovaná doména v podčeledi Rabs je zásadní pro interakci s guanyl nukleotidovým výměnným faktorem Mss4“. J. Biol. Chem. 272 (6): 3663–8. doi:10.1074 / jbc.272.6.3663. PMID 9013620.
Geppert M, Goda Y, Stevens CF, Südhof TC (1997). „Malý protein vázající GTP Rab3A reguluje pozdní krok fúze synaptických vezikul“. Příroda. 387 (6635): 810–4. doi:10.1038/42954. PMID 9194562. S2CID 4359038.
Martincic I, Peralta ME, Ngsee JK (1997). „Izolace a charakterizace duálního prenylovaného receptoru Rab a VAMP2“. J. Biol. Chem. 272 (43): 26991–8. doi:10.1074 / jbc.272.43.26991. PMID 9341137.
Ostermeier C, Brunger AT (1999). „Strukturní základ Rab efektorové specificity: krystalová struktura malého G proteinu Rab3A v komplexu s efektorovou doménou rabfilinu-3A“. Buňka. 96 (3): 363–74. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80549-8. PMID 10025402. S2CID 15162326.
Jung YJ, Lee TH, Lee JY, Kim JH, Park JB (1999). „Kyselina fosfatidová je důležitá pro translokaci Rab3A z cytosolu na fosfolipidové membrány“. NeuroReport. 10 (13): 2859–63. doi:10.1097/00001756-199909090-00029. PMID 10511453.
Sullivan M, Olsen AS, Houslay MD (2000). "Genomická organizace lidského genu pro cyklickou AMP-specifickou fosfodiesterázu PDE4C a jeho chromozomální lokalizace na 19p13.1, mezi RAB3A a JUND". Buňka. Signál. 11 (10): 735–42. doi:10.1016 / S0898-6568 (99) 00037-6. PMID 10574328.
Clabecq A, Henry JP, Darchen F (2000). „Biochemická charakterizace proteinu aktivujícího Rab3-GTPázu odhaluje mechanismus podobný mechanismu Ras-GAP“. J. Biol. Chem. 275 (41): 31786–91. doi:10,1074 / jbc.M003705200. PMID 10859313.
Haynes LP, Evans GJ, Morgan A, Burgoyne RD (2001). „Přímá inhibiční role pro Rab3-specifický efektor, Noc2, při exocytóze regulované Ca2 + v neuroendokrinních buňkách“. J. Biol. Chem. 276 (13): 9726–32. doi:10,1074 / jbc.M006959200. PMID 11134008.
Zhang Y, Luan Z, Liu A, Hu G (2001). „Lešení protein CASK zprostředkovává interakci mezi rabphilin3a a beta-neurexiny“. FEBS Lett. 497 (2–3): 99–102. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 02450-4. PMID 11377421. S2CID 33119468.
Luo HR, Saiardi A, Nagata E, Ye K, Yu H, Jung TS, Luo X, Jain S, Sawa A, Snyder SH (2001). „GRAB: fyziologický výměnný faktor guaninového nukleotidu pro Rab3A, který interaguje s inositol hexakisfosfátkinázou“. Neuron. 31 (3): 439–51. doi:10.1016 / S0896-6273 (01) 00384-1. PMID 11516400. S2CID 10990373.
Piiper A, Leser J, poslanec Lutz, Beil M, Zeuzem S (2001). "Subcelulární distribuce a funkce Rab3A-D v pankreatických acinárních buňkách AR42J". Biochem. Biophys. Res. Commun. 287 (3): 746–51. doi:10.1006 / bbrc.2001.5651. PMID 11563859.
Kuroda TS, Fukuda M, Ariga H, Mikoshiba K (2002). „Doména Slp homologie synaptotagminových proteinů 1-4 a Slac2 funguje jako nová vazebná doména Rab27A“. J. Biol. Chem. 277 (11): 9212–8. doi:10,1074 / jbc.M112414200. PMID 11773082.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000105649 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031840 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid2687157-5] Rousseau-Merck MF, Zahraoui A, Bernheim A, Touchot N, Miglierina R, Tavitian A, Berger R (leden 1990). "Chromozomové mapování lidského genu rab3A souvisejícího s ras na 19p13.2". Genomika. 5 (4): 694–8. doi:10.1016/0888-7543(89)90110-9. PMID 2687157.

[pmid7532276-6] Brondyk WH, McKiernan CJ, Fortner KA, Stabila P, Holz RW, Macara IG (březen 1995). „Interakční klonování Rabin3, nového proteinu, který se asociuje s Ras-jako GTPáza Rab3A“. Mol Cell Biol. 15 (3): 1137–43. doi:10.1128 / MCB.15.3.1137. PMC 230335. PMID 7532276.

[entrez-7] „Entrez Gene: RAB3A RAB3A, člen RAS onkogenní rodiny“.

[pmid12578829-8] A ^b Fukuda M (duben 2003). "Zřetelná Rabova vazebná specificita pro Rim1, Rim2, rabphilin a Noc2. Identifikace kritického determinantu rozpoznávání Rab3A / Rab27A pomocí Rim2". J. Biol. Chem. 278 (17): 15373–80. doi:10,1074 / jbc.M212341200. PMID 12578829.

[pmid11343654-9] Betz A, Thakur P, Junge HJ, Ashery U, Rhee JS, Scheuss V, Rosenmund C, Rettig J, Brose N (duben 2001). "Funkční interakce proteinů aktivní zóny Munc13-1 a RIM1 při aktivaci synaptických vezikul". Neuron. 30 (1): 183–96. doi:10.1016 / s0896-6273 (01) 00272-0. hdl:11858 / 00-001M-0000-0012-F596-C. PMID 11343654. S2CID 155875.

[10] „Protein unc-13 homolog A“. UniProt.

[pmid10025402-11] Ostermeier C, Brunger AT (únor 1999). "Strukturní základ Rab efektorové specificity: krystalová struktura malého G proteinu Rab3A v komplexu s efektorovou doménou rabphilinu-3A". Buňka. 96 (3): 363–74. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80549-8. PMID 10025402. S2CID 15162326.

[pmid8636125-12] Weber E, Jilling T, Kirk KL (březen 1996). "Výrazné funkční vlastnosti Rab3A a Rab3B v neuroendokrinních buňkách PC12". J. Biol. Chem. 271 (12): 6963–71. doi:10.1074 / jbc.271.12.6963. PMID 8636125.

[pmid8294464-13] Cremers FP, Armstrong SA, Seabra MC, Brown MS, Goldstein JL (leden 1994). „REP-2, doprovodný protein Rab kódovaný genem podobným choroideremii“. J. Biol. Chem. 269 (3): 2111–7. PMID 8294464.

[pmid12535645-14] Pereira-Leal JB, Strom M, Godfrey RF, Seabra MC (leden 2003). "Strukturní determinanty interakce Rab a Rab Escort Protein: Motivy rodiny Rab definují konzervovaný vazebný povrch". Biochem. Biophys. Res. Commun. 301 (1): 92–7. doi:10.1016 / s0006-291x (02) 02963-7. PMID 12535645.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]