AP1B1 - AP1B1 - Wikipedia

AP1B1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4HMY, 4P6Z
Identifikátory
Aliasy	AP1B1, ADTB1, AP105A, BAM22, CLAPB2, proteinový komplex související s adaptérem 1 beta 1 podjednotka, proteinový komplex související s adaptérem 1 podjednotka beta 1, KIDAR
Externí ID	OMIM: 600157 MGI: 1096368 HomoloGene: 21972 Genové karty: AP1B1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	29,423,179 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	5,042,791 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transportéru; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba protein kinázy; • clathrinová vazba;
Buněčná složka	• trans-Golgiho síťová membrána; • membrána; • Golgiho membrána; • lysozomální membrána; • klatrinem potažená membrána vezikul; • membránový plášť; • cytoplazmatická vezikulární membrána; • cytoplazmatický váček; • komplex adaptéru clathrin; • Golgiho aparát; • cytosol; • intracelulární membránou vázaná organela;
Biologický proces	• zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • regulace obranné reakce na virus virem; • vývoj srdce; • stanovení levé / pravé symetrie; • transport bílkovin; • transport intracelulárních proteinů; • transport zprostředkovaný vezikuly;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	162
	11764
	ENSG00000100280
	ENSMUSG00000009090
	Q10567
	O35643
	NM_145730; NM_001127; NM_001166019
	NM_001243043; NM_001243044; NM_007454; NM_001355659; NM_001355660
NP_001118; NP_001159491; NP_663782; NP_001365491; NP_001365492;
	NP_001365493; NP_001365494; NP_001365495
	NP_001229972; NP_001229973; NP_031480; NP_001342588; NP_001342589
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

AP-1 komplexní podjednotka beta-1 je protein že u lidí je kódován AP1B1 gen.^[5]^[6]^[7]

Komplex adaptéru 1 se nachází na cytoplazmatické ploše potažených vezikul umístěných v komplexu Golgi, kde zprostředkovává jak nábor klatrinu na membránu, tak rozpoznávání třídících signálů v cytosolických koncích transmembránových receptorů. Tento komplex je heterotetramer složený ze dvou velkých, jedné střední a jedné malé podjednotky adapinu. Protein kódovaný tímto genem slouží jako jedna z velkých podjednotek tohoto komplexu a je členem rodiny proteinů adapinu. Tento gen je kandidátem meningiom gen. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy a existují varianty využívající alternativní polyadenylační signály.^[7]

Interakce

AP1B1 bylo prokázáno komunikovat s KIF13A^[8] a AP1G1.^[9]^[10]^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100280 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000009090 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Peyrard M, Fransson I, Xie YG, Han FY, Ruttledge MH, Swahn S, Collins JE, Dunham I, Collins VP, Dumanski JP (leden 1995). "Charakterizace nového člena rodiny genů lidského beta-adapinu z chromozomu 22q12, kandidátského genu pro meningiom". Hum Mol Genet. 3 (8): 1393–9. doi:10,1093 / hmg / 3,8,1393. PMID 7987321.
^ Peyrard M, Pan HQ, Kedra D, Fransson I, Swahn S, Hartman K, Clifton SW, Roe BA, Dumanski JP (únor 1997). „Struktura promotoru a genomová organizace genu pro lidský beta'-adapin (BAM22) z chromozomu 22q12“. Genomika. 36 (1): 112–7. doi:10.1006 / geno.1996.0431. PMID 8812422.
^ ^A ^b „Entrez Gene: AP1B1 proteinový komplex související s adaptérem 1, beta 1 podjednotka“.
^ Nakagawa, T; Setou M; Seog D; Ogasawara K; Dohmae N; Takio K; Hirokawa N (listopad 2000). „Nový motor, KIF13A, transportuje receptor manózy-6-fosfátu na plazmatickou membránu přímou interakcí s komplexem AP-1“. Buňka. SPOJENÉ STÁTY. 103 (4): 569–81. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00161-6. ISSN 0092-8674. PMID 11106728.
^ Takatsu, H; Sakurai M; Shin H W; Murakami K; Nakayama K (září 1998). „Identifikace a charakterizace nových proteinů souvisejících s klatrinovým adaptérem“. J. Biol. Chem. SPOJENÉ STÁTY. 273 (38): 24693–700. doi:10.1074 / jbc.273.38.24693. ISSN 0021-9258. PMID 9733768.
^ Fölsch, H; Ohno H; Bonifacino JS; Mellman I (říjen 1999). „Nový klatrinový komplex adaptéru zprostředkovává bazolaterální cílení v polarizovaných epitelových buňkách“. Buňka. SPOJENÉ STÁTY. 99 (2): 189–98. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81650-5. ISSN 0092-8674. PMID 10535737.
^ Page, L J; Robinson MS (listopad 1995). „Cílové signály a interakce podjednotek v komplexech komprimovaného adaptéru vezikul. J. Cell Biol. SPOJENÉ STÁTY. 131 (3): 619–30. doi:10.1083 / jcb.131.3.619. ISSN 0021-9525. PMC 2120623. PMID 7593184.

Další čtení

Kirchhausen T (2000). „Clathrin“. Annu. Biochem. 69: 699–727. doi:10,1146 / annurev.biochem. 69.1.699. PMID 10966473.
Geyer M, Fackler OT, Peterlin BM (2001). "Struktura - funkční vztahy v HIV-1 Nef". EMBO Rep. 2 (7): 580–5. doi:10.1093 / embo-reports / kve141. PMC 1083955. PMID 11463741.
Bénichou S, Benmerah A (2003). „[Proteiny HIV nef a proteiny K3 / K5 spojené s virem Kaposiho sarkomu:„ paraziti “dráhy endocytózy]“. Med Sci (Paříž). 19 (1): 100–6. doi:10.1051 / medsci / 2003191100. PMID 12836198.
Lim DS, Kirsch DG, Canman CE a kol. (1998). „ATM se váže na beta-adapin v cytoplazmatických váčcích“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (17): 10146–51. doi:10.1073 / pnas.95.17.10146. PMC 21476. PMID 9707615.
Takatsu H, Sakurai M, Shin HW a kol. (1998). „Identifikace a charakterizace nových proteinů souvisejících s klatrinovým adaptérem“. J. Biol. Chem. 273 (38): 24693–700. doi:10.1074 / jbc.273.38.24693. PMID 9733768.
Craig HM, Pandori MW, Guatelli JC (1998). „Interakce HIV-1 Nef s buněčnou cestou třídění na bázi dileucinu je nutná pro down-regulaci CD4 a optimální virovou infekčnost.“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (19): 11229–34. doi:10.1073 / pnas.95.19.11229. PMC 21624. PMID 9736718.
Bresnahan PA, Yonemoto W, Ferrell S a kol. (1999). „Dileucinový motiv v HIV-1 Nef působí jako internalizační signál pro downregulaci CD4 a váže klatrinový adaptér AP-1“. Curr. Biol. 8 (22): 1235–8. doi:10.1016 / S0960-9822 (07) 00517-9. PMID 9811606.
Greenberg M, DeTulleo L, Rapoport I a kol. (1999). „Dileucinový motiv v HIV-1 Nef je nezbytný pro třídění na jamky potažené klatrinem a pro downregulaci CD4.“ Curr. Biol. 8 (22): 1239–42. doi:10.1016 / S0960-9822 (07) 00518-0. PMID 9811611.
Laporte SA, Oakley RH, Zhang J a kol. (1999). „Komplex beta2-adrenergního receptoru / betaarrestinu rekrutuje klatrinový adaptér AP-2 během endocytózy“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 96 (7): 3712–7. doi:10.1073 / pnas.96.7.3712. PMC 22359. PMID 10097102.
Fölsch H, Ohno H, Bonifacino JS, Mellman I (1999). „Nový klatrinový komplex adaptéru zprostředkovává bazolaterální cílení v polarizovaných epitelových buňkách“. Buňka. 99 (2): 189–98. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81650-5. PMID 10535737.
Kim ST, Lim DS, Canman CE, Kastan MB (2000). "Specifičnost substrátu a identifikace domnělých substrátů členů rodiny ATM kináz". J. Biol. Chem. 274 (53): 37538–43. doi:10.1074 / jbc.274.53.37538. PMID 10608806.
Lai MM, Luo HR, Burnett PE a kol. (2000). "Protein vázající na kalcineurin je negativní regulátor synaptické vesikulární endocytózy". J. Biol. Chem. 275 (44): 34017–20. doi:10.1074 / jbc.C000429200. PMID 10931822.
Nakagawa T, Setou M, Seog D a kol. (2001). „Nový motor, KIF13A, transportuje receptor manózy-6-fosfátu na plazmatickou membránu přímou interakcí s komplexem AP-1“. Buňka. 103 (4): 569–81. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00161-6. PMID 11106728.
Takatsu H, Futatsumori M, Yoshino K a kol. (2001). "Podobné podjednotkové interakce přispívají k sestavení komplexů adaptéru clathrin a komplexu COPI: analýza pomocí kvasinkového tříhybridního systému". Biochem. Biophys. Res. Commun. 284 (4): 1083–9. doi:10.1006 / bbrc.2001.5081. PMID 11409905.
Doray B, Kornfeld S (2001). „Gama podjednotka komplexu adaptéru AP-1 váže klatrin: důsledky pro kooperativní vazbu v potažené sestavě vezikul“. Mol. Biol. Buňka. 12 (7): 1925–35. doi:10,1091 / mbc. 12.7.1925. PMC 55640. PMID 11451993.
Jardine H, MacNee W, Donaldson K, Rahman I (2002). "Molekulární mechanismus transformace růstového faktoru (TGF) -beta1 indukovaného vyčerpání glutathionu v alveolárních epiteliálních buňkách. Zapojení AP-1 / ARE a Fra-1". J. Biol. Chem. 277 (24): 21158–66. doi:10,1074 / jbc.M112145200. PMID 11912197.

externí odkazy

Člověk AP1B1 umístění genomu a AP1B1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 22 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100280 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000009090 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7987321-5] Peyrard M, Fransson I, Xie YG, Han FY, Ruttledge MH, Swahn S, Collins JE, Dunham I, Collins VP, Dumanski JP (leden 1995). "Charakterizace nového člena rodiny genů lidského beta-adapinu z chromozomu 22q12, kandidátského genu pro meningiom". Hum Mol Genet. 3 (8): 1393–9. doi:10,1093 / hmg / 3,8,1393. PMID 7987321.

[pmid8812422-6] Peyrard M, Pan HQ, Kedra D, Fransson I, Swahn S, Hartman K, Clifton SW, Roe BA, Dumanski JP (únor 1997). „Struktura promotoru a genomová organizace genu pro lidský beta'-adapin (BAM22) z chromozomu 22q12“. Genomika. 36 (1): 112–7. doi:10.1006 / geno.1996.0431. PMID 8812422.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: AP1B1 proteinový komplex související s adaptérem 1, beta 1 podjednotka“.

[pmid11106728-8] Nakagawa, T; Setou M; Seog D; Ogasawara K; Dohmae N; Takio K; Hirokawa N (listopad 2000). „Nový motor, KIF13A, transportuje receptor manózy-6-fosfátu na plazmatickou membránu přímou interakcí s komplexem AP-1“. Buňka. SPOJENÉ STÁTY. 103 (4): 569–81. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00161-6. ISSN 0092-8674. PMID 11106728.

[pmid9733768-9] Takatsu, H; Sakurai M; Shin H W; Murakami K; Nakayama K (září 1998). „Identifikace a charakterizace nových proteinů souvisejících s klatrinovým adaptérem“. J. Biol. Chem. SPOJENÉ STÁTY. 273 (38): 24693–700. doi:10.1074 / jbc.273.38.24693. ISSN 0021-9258. PMID 9733768.

[pmid10535737-10] Fölsch, H; Ohno H; Bonifacino JS; Mellman I (říjen 1999). „Nový klatrinový komplex adaptéru zprostředkovává bazolaterální cílení v polarizovaných epitelových buňkách“. Buňka. SPOJENÉ STÁTY. 99 (2): 189–98. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81650-5. ISSN 0092-8674. PMID 10535737.

[pmid7593184-11] Page, L J; Robinson MS (listopad 1995). „Cílové signály a interakce podjednotek v komplexech komprimovaného adaptéru vezikul. J. Cell Biol. SPOJENÉ STÁTY. 131 (3): 619–30. doi:10.1083 / jcb.131.3.619. ISSN 0021-9525. PMC 2120623. PMID 7593184.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]