SYT7 - SYT7

SYT7
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2D8K
Identifikátory
Aliasy	SYT7, IPCA-7, IPCA7, PCANAP7, SYT-VII, SYTVII, synaptotagmin 7
Externí ID	OMIM: 604146 MGI: 1859545 HomoloGene: 20889 Genové karty: SYT7
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	61,581,148 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 19 (myš)
Konec	10,453,180 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • SNARE vazba; • syntaxinová vazba; • clathrinová vazba; • vazba fosfatidylinositol-4,5-bisfosfátu; • vazba fosfolipidů závislá na vápníku; • kalmodulinová vazba; • vazba fosfatidylserinu;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • synapse; • synaptická vezikulární membrána; • buněčné spojení; • terminální tlačítko; • hustá granule jádra; • extracelulární exosom; • cytoplazmatický váček; • transportní vezikulární membrána; • cytosol; • synaptický váček; • presynaptická membrána; • lysozom; • peroxisom; • peroxisomální membrána; • membrána fagocytických vezikul; • buněčná membrána; • lysozomální membrána; • časný fagozom; • dendrit; • tělo neuronových buněk; • axonový konec; • axon; • neuronová projekce; • exocytový váček; • hipokampální mechové vlákno na CA3 synapse; • glutamátergická synapse; • GABA-ergická synapse; • integrální součást presynaptické membrány;
Biologický proces	• regulace sekrece inzulínu; • pozitivní regulace exocytózy závislé na iontech vápníku; • exocytóza; • regulace remodelace kostí; • oprava plazmatické membrány; • exocytóza regulovaná ionty vápníku; • regulace exocytózy závislé na iontech vápníku; • exocytóza regulovaná ionty vápníku neurotransmiteru; • regulace sekrece glukagonu; • fúze fagozom-lysozom; • recyklace synaptických vezikul; • transport cholesterolu zprostředkovaný vezikuly; • regulace fagocytózy; • fúze vezikul; • exocytóza regulovaná ionty vápníku; • fagocytóza; • regulace sekrece dopaminu; • krátkodobá synaptická potenciace; • transport zprostředkovaný vezikuly; • buněčná odpověď na iont vápníku; • na vápníku závislá aktivace fúze synaptických vezikul; • regulace endocytózy synaptických vezikul;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9066
	54525
	ENSG00000011347
	ENSMUSG00000024743
	O43581
	Q9R0N7
NM_001252065; NM_001300773; NM_004200; NM_001365809; NM_001370210;
	NM_001370211
	NM_018801; NM_173067; NM_173068; NM_001373944
NP_001238994; NP_001287702; NP_004191; NP_001352738; NP_001357139;
	NP_001357140
	NP_061271; NP_775090; NP_775091
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Synaptotagmin-7 je protein že u lidí je kódován SYT7 gen.^[5]^[6]

Funkce

Synaptotagminy, jako je SYT7, jsou mozkově specifické proteiny vázající fosfolipidy závislé na vápníku, které hrají roli při synaptické exocytóze a uvolňování neurotransmiterů. Viz MIM 600782. [dodává OMIM]^[6]

Interakce

SYT7 bylo prokázáno komunikovat s SYNCRIP.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000011347 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024743 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Cooper PR, Nowak NJ, Higgins MJ, Church DM, Show TB (květen 1998). „Transkriptové mapování oblasti bohaté na geny lidského chromozomu 11q12-q13.1 identifikuje několik nově popsaných konzervovaných genů“. Genomika. 49 (3): 419–29. doi:10.1006 / geno.1998.5291. PMID 9615227.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SYT7 synaptotagmin VII“.
^ Mizutani A, Fukuda M, Ibata K, Shiraishi Y, Mikoshiba K (březen 2000). „SYNCRIP, cytoplazmatický protějšek heterogenního nukleárního ribonukleoproteinu R, interaguje s všudypřítomnými izoformami synaptotagminu“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (13): 9823–31. doi:10.1074 / jbc.275.13.9823. PMID 10734137.

Další čtení

Li C, Ullrich B, Zhang JZ, Anderson RG, Brose N, Südhof TC (červen 1995). „Ca (2 +) - závislé a nezávislé činnosti nervových a neurálních synaptotagminů“. Příroda. 375 (6532): 594–9. doi:10.1038 / 375594a0. PMID 7791877. S2CID 4265549.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Perin MS (říjen 1996). "Zrcadlové obrazové motivy zprostředkovávají interakci COOH konce více synaptotagminů s neurexiny a kalmodulinem". Biochemie. 35 (43): 13808–16. doi:10.1021 / bi960853x. PMID 8901523.
Craxton M, Goedert M (listopad 1999). "Alternativní sestřih synaptotagminů zahrnující přeskočení transmembránového exonu". FEBS Dopisy. 460 (3): 417–22. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01382-4. PMID 10556508. S2CID 19207631.
Walker MG, Volkmuth W, Sprinzak E, Hodgson D, Klingler T (prosinec 1999). „Predikce genové funkce analýzou exprese v měřítku genomu: geny spojené s rakovinou prostaty“. Výzkum genomu. 9 (12): 1198–203. doi:10,1101 / gr. 9.12.1198. PMC 310991. PMID 10613842.
Mizutani A, Fukuda M, Ibata K, Shiraishi Y, Mikoshiba K (březen 2000). „SYNCRIP, cytoplazmatický protějšek heterogenního nukleárního ribonukleoproteinu R, interaguje s všudypřítomnými izoformami synaptotagminu“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (13): 9823–31. doi:10.1074 / jbc.275.13.9823. PMID 10734137.
Caler EV, Chakrabarti S, Fowler KT, Rao S, Andrews NW (květen 2001). "Exaptický regulační protein synaptotagmin VII zprostředkovává buněčnou invazi Trypanosoma cruzi". The Journal of Experimental Medicine. 193 (9): 1097–104. doi:10.1084 / jem.193.9.1097. PMC 2193425. PMID 11342594.
Fukuda M, Ogata Y, Saegusa C, Kanno E, Mikoshiba K (červenec 2002). „Alternativní sestřihové izoformy synaptotagminu VII u myší, potkanů a lidí“. The Biochemical Journal. 365 (Pt 1): 173–80. doi:10.1042 / BJ20011877. PMC 1222667. PMID 12071850.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: O43581 (Human Synaptotagmin-7) na PDBe-KB.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9R0N7 (Myš Synaptotagmin-7) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000011347 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024743 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9615227-5] Cooper PR, Nowak NJ, Higgins MJ, Church DM, Show TB (květen 1998). „Transkriptové mapování oblasti bohaté na geny lidského chromozomu 11q12-q13.1 identifikuje několik nově popsaných konzervovaných genů“. Genomika. 49 (3): 419–29. doi:10.1006 / geno.1998.5291. PMID 9615227.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: SYT7 synaptotagmin VII“.

[pmid10734137-7] Mizutani A, Fukuda M, Ibata K, Shiraishi Y, Mikoshiba K (březen 2000). „SYNCRIP, cytoplazmatický protějšek heterogenního nukleárního ribonukleoproteinu R, interaguje s všudypřítomnými izoformami synaptotagminu“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (13): 9823–31. doi:10.1074 / jbc.275.13.9823. PMID 10734137.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]