AP1G1 - AP1G1

AP1G1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1IU1
Identifikátory
Aliasy	AP1G1, ADTG, CLAPG1, proteinový komplex související s adaptérem 1 gama 1 podjednotka, proteinový komplex související s adaptérem 1 podjednotka gama 1
Externí ID	OMIM: 603533 MGI: 101919 HomoloGene: 47995 Genové karty: AP1G1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	71,809,201 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	109,864,204 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transportéru; • Vazba na protein závislá na GTP; • Vazba Rab GTPázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • kinesinová vazba;
Buněčná složka	• recyklace endosomu; • membrána endocytických váčků potažená klatrinem; • Golgiho aparát; • trans-Golgiho síťová membrána; • membrána; • intracelulární membránou vázaná organela; • Golgiho membrána; • lysozomální membrána; • Komplex adaptéru membránového pláště typu AP; • klatrinem obalená membrána vezikul; • membránový plášť; • cytoplazmatická vezikulární membrána; • cytoplazmatický váček; • vezikul potažený klatrinem; • komplex adaptéru clathrin; • cytoplazma; • cytosol; • Komplex adaptéru AP-1;
Biologický proces	• zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • regulace obranné reakce na virus virem; • Transport Golgiho k lysozomu; • pozitivní regulace degranulace buněk zabijáků; • melanosomová organizace; • transport endosomu do melanosomu; • transport bílkovin; • transport intracelulárních proteinů; • pozitivní regulace přirozené zabíječské buňky zprostředkované cytotoxicity; • transport zprostředkovaný vezikuly; • doprava;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	164
	11765
	ENSG00000166747
	ENSMUSG00000031731
	O43747
	P22892
	NM_001128; NM_001030007
	NM_001301211; NM_009677
	NP_001025178; NP_001119
	NP_001288140; NP_033807
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

AP-1 komplexní podjednotka gama-1 je protein že u lidí je kódován AP1G1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Adaptiny jsou důležitými složkami váčků potažených klatrinem, které přenášejí komplexy ligand-receptor z plazmatické membrány nebo ze trans-Golgiho sítě do lysozomů. Rodina proteinů adaptinu se skládá ze čtyř tříd molekul pojmenovaných alfa, beta-, beta prime- a gama-adapiny. Adaptiny společně se středními a malými podjednotkami tvoří heterotetramerický komplex zvaný adaptér, jehož úlohou je podporovat tvorbu jam a váčků potažených klatrinem. Protein kódovaný tímto genem je protein gama-adapinu a patří do rodiny velkých podjednotek adaptačních komplexů. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[7]

Interakce

AP1G1 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000166747 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031731 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Peyrard M, Parveneh S, Lagercrantz S, Ekman M, Fransson I, Sahlén S, Dumanski JP (červen 1998). "Klonování, vzor exprese a přiřazení chromozomů 16q23 lidského genu gama-adaptinu (ADTG)". Genomika. 50 (2): 275–80. doi:10.1006 / geno.1998.5289. PMID 9653655.
^ ^A ^b ^C Takatsu H, Sakurai M, Shin HW, Murakami K, Nakayama K (září 1998). „Identifikace a charakterizace nových proteinů souvisejících s klatrinovým adaptérem“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (38): 24693–700. doi:10.1074 / jbc.273.38.24693. PMID 9733768.
^ „Entrez Gene: AP1G1 adaptorový proteinový komplex 1, gama 1 podjednotka“.
^ ^A ^b ^C Fölsch H, Ohno H, Bonifacino JS, Mellman I (říjen 1999). „Nový klatrinový komplex adaptéru zprostředkovává bazolaterální cílení v polarizovaných epitelových buňkách“. Buňka. 99 (2): 189–98. doi:10.1016 / s0092-8674 (00) 81650-5. PMID 10535737. S2CID 15288582.
^ ^A ^b ^C Stránka LJ, Robinson MS (listopad 1995). "Cílové signály a interakce podjednotek v komplech adaptéru obalených vezikulů". The Journal of Cell Biology. 131 (3): 619–30. doi:10.1083 / jcb.131.3.619. PMC 2120623. PMID 7593184.
^ ^A ^b Nogi T, Shiba Y, Kawasaki M, Shiba T, Matsugaki N, Igarashi N, Suzuki M, Kato R, Takatsu H, Nakayama K, Wakatsuki S (červenec 2002). "Strukturální základ pro nábor doplňkového proteinu ušní doménou gama-adapinu". Přírodní strukturní biologie. 9 (7): 527–31. doi:10.1038 / nsb808. PMID 12042876. S2CID 42630285.
^ Takatsu H, Yoshino K, Nakayama K (květen 2000). „Adaptační doména gama ušní homologie konzervovaná v gama-adapinových a GGA proteinech, které interagují s gama-synerginem“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 271 (3): 719–25. doi:10,1006 / bbrc.2000.2700. PMID 10814529.
^ Mattera R, Ritter B, Sidhu SS, McPherson PS, Bonifacino JS (únor 2004). „Definice konsensuálního motivu rozpoznávaného doménami ucha gama-adaptinu“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (9): 8018–28. doi:10,1074 / jbc.M311873200. PMID 14665628.
^ Mattera R, Arighi CN, Lodge R, Zerial M, Bonifacino JS (leden 2003). „Divalentní interakce GGA s komplexem Rabaptin-5-Rabex-5“. Časopis EMBO. 22 (1): 78–88. doi:10.1093 / emboj / cdg015. PMC 140067. PMID 12505986.
^ Horikawa HP, Kneussel M, El Far O, Betz H (listopad 2002). "Interakce synaptophysinu s gama-adaptinem adaptorového proteinu AP-1". Molekulární a buněčné neurovědy. 21 (3): 454–62. doi:10.1006 / mcne.2002.1191. PMID 12498786. S2CID 54366866.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Berlioz-Torrent C, Shacklett BL, Erdtmann L, Delamarre L, Bouchaert I, Sonigo P, Dokhelar MC, Benarous R (únor 1999). „Interakce cytoplazmatických domén lidských a opičích retrovirových transmembránových proteinů se složkami adaptorových komplexů klathrinu modulují intracelulární a buněčnou povrchovou expresi obalových glykoproteinů“. Journal of Virology. 73 (2): 1350–61. doi:10.1128 / JVI.73.2.1350-1361.1999. PMC 103959. PMID 9882340.
Stránka LJ, Sowerby PJ, Lui WW, Robinson MS (září 1999). „Gama-synergin: protein obsahující doménu EH, který interaguje s gama-adapinem“. The Journal of Cell Biology. 146 (5): 993–1004. doi:10.1083 / jcb.146.5.993. PMC 2169493. PMID 10477754.
Fölsch H, Ohno H, Bonifacino JS, Mellman I (říjen 1999). „Nový klatrinový komplex adaptéru zprostředkovává bazolaterální cílení v polarizovaných epitelových buňkách“. Buňka. 99 (2): 189–98. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81650-5. PMID 10535737. S2CID 15288582.
Hirst J, Lui WW, Bright NA, Totty N, Seaman MN, Robinson MS (duben 2000). „Rodina proteinů s gama-adapinovými a VHS doménami, které usnadňují obchodování mezi trans-Golgiho sítí a vakuolem / lysozomem“. The Journal of Cell Biology. 149 (1): 67–80. doi:10.1083 / jcb.149.1.67. PMC 2175106. PMID 10747088.
Takatsu H, Yoshino K, Nakayama K (květen 2000). „Adaptační doména gama ušní homologie konzervovaná v gama-adapinových a GGA proteinech, které interagují s gama-synerginem“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 271 (3): 719–25. doi:10,1006 / bbrc.2000.2700. PMID 10814529.
Nakagawa T, Setou M, Seog D, Ogasawara K, Dohmae N, Takio K, Hirokawa N (listopad 2000). „Nový motor, KIF13A, transportuje receptor manózy-6-fosfátu na plazmatickou membránu přímou interakcí s komplexem AP-1“. Buňka. 103 (4): 569–81. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00161-6. PMID 11106728. S2CID 18245989.
Wyss S, Berlioz-Torrent C, Boge M, Blot G, Höning S, Benarous R, Thali M (březen 2001). „Vysoce konzervovaný C-koncový dileucinový motiv v cytosolické doméně obálky glykoproteinu viru lidské imunodeficience typu 1 je kritický pro jeho spojení s klatrinovým adaptérem AP-1 [oprava adaptéru]“. Journal of Virology. 75 (6): 2982–92. doi:10.1128 / JVI.75.6.2982-2992.2001. PMC 115924. PMID 11222723.
Crump CM, Xiang Y, Thomas L, Gu F, Austin C, Tooze SA, Thomas G (květen 2001). „Vazba PACS-1 na adaptéry je vyžadována pro přenos proteinů zprostředkovaný kyselým klastrem“. Časopis EMBO. 20 (9): 2191–201. doi:10.1093 / emboj / 20.9.2191. PMC 125242. PMID 11331585.
Takatsu H, Futatsumori M, Yoshino K, Yoshida Y, Shin HW, Nakayama K (červen 2001). "Podobné podjednotkové interakce přispívají k sestavení komplexů adaptéru clathrin a komplexu COPI: analýza pomocí kvasinkového tříhybridního systému". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 284 (4): 1083–9. doi:10.1006 / bbrc.2001.5081. PMID 11409905.
Orzech E, Livshits L, Leyt J, Okhrimenko H, Reich V, Cohen S, Weiss A, Melamed-Book N, Lebendiker M, Altschuler Y, Aroeti B (srpen 2001). „Interakce mezi adaptorovým proteinem-1 klatrinového pláště a mikrotubuly prostřednictvím proteinů asociovaných s mikrotubuly typu 1a“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (33): 31340–8. doi:10,1074 / jbc.M101054200. PMID 11418592.
Doray B, Kornfeld S (červenec 2001). „Gama podjednotka komplexu adaptéru AP-1 váže klatrin: důsledky pro kooperativní vazbu v potažené sestavě vezikul“. Molekulární biologie buňky. 12 (7): 1925–35. doi:10,1091 / mbc. 12.7.1925. PMC 55640. PMID 11451993.
Shiba Y, Takatsu H, Shin HW, Nakayama K (březen 2002). „Gamma-adapin interaguje přímo s Rabaptinem-5 prostřednictvím jeho ušní domény.“ Journal of Biochemistry. 131 (3): 327–36. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a003107. PMID 11872161.
Austin C, Boehm M, Tooze SA (duben 2002). „Site-specific crosslinking odhaluje diferenciální přímou interakci ADP-ribosylačních faktorů třídy 1, 2 a 3 s komplexy adaptorového proteinu 1 a 3“. Biochemie. 41 (14): 4669–77. doi:10.1021 / bi016064j. PMID 11926829.
Eiraku M, Hirata Y, Takeshima H, Hirano T, Kengaku M (červenec 2002). „Receptor související s deltou / vrubem podobný epidermální růstový faktor (EGF), nový protein podobný EGF jako repetice zaměřený na dendrity vyvíjejících se a neuronů centrálního nervového systému dospělých“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (28): 25400–7. doi:10,1074 / jbc.M110793200. PMID 11950833.
Nogi T, Shiba Y, Kawasaki M, Shiba T, Matsugaki N, Igarashi N, Suzuki M, Kato R, Takatsu H, Nakayama K, Wakatsuki S (červenec 2002). "Strukturální základ pro nábor doplňkového proteinu ušní doménou gama-adapinu". Přírodní strukturní biologie. 9 (7): 527–31. doi:10.1038 / nsb808. PMID 12042876. S2CID 42630285.
Kalthoff C, Groos S, Kohl R, Mahrhold S, Ungewickell EJ (listopad 2002). „Clint: nový keltrin vázající protein ENTH-domény u Golgiho“. Molekulární biologie buňky. 13 (11): 4060–73. doi:10,1091 / mbc.E02-03-0171. PMC 133614. PMID 12429846.

externí odkazy

Člověk AP1G1 umístění genomu a AP1G1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000166747 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031731 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9653655-5] Peyrard M, Parveneh S, Lagercrantz S, Ekman M, Fransson I, Sahlén S, Dumanski JP (červen 1998). "Klonování, vzor exprese a přiřazení chromozomů 16q23 lidského genu gama-adaptinu (ADTG)". Genomika. 50 (2): 275–80. doi:10.1006 / geno.1998.5289. PMID 9653655.

[pmid9733768-6] A ^b ^C Takatsu H, Sakurai M, Shin HW, Murakami K, Nakayama K (září 1998). „Identifikace a charakterizace nových proteinů souvisejících s klatrinovým adaptérem“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (38): 24693–700. doi:10.1074 / jbc.273.38.24693. PMID 9733768.

[entrez-7] „Entrez Gene: AP1G1 adaptorový proteinový komplex 1, gama 1 podjednotka“.

[pmid10535737-8] A ^b ^C Fölsch H, Ohno H, Bonifacino JS, Mellman I (říjen 1999). „Nový klatrinový komplex adaptéru zprostředkovává bazolaterální cílení v polarizovaných epitelových buňkách“. Buňka. 99 (2): 189–98. doi:10.1016 / s0092-8674 (00) 81650-5. PMID 10535737. S2CID 15288582.

[pmid7593184-9] A ^b ^C Stránka LJ, Robinson MS (listopad 1995). "Cílové signály a interakce podjednotek v komplech adaptéru obalených vezikulů". The Journal of Cell Biology. 131 (3): 619–30. doi:10.1083 / jcb.131.3.619. PMC 2120623. PMID 7593184.

[pmid12042876-10] A ^b Nogi T, Shiba Y, Kawasaki M, Shiba T, Matsugaki N, Igarashi N, Suzuki M, Kato R, Takatsu H, Nakayama K, Wakatsuki S (červenec 2002). "Strukturální základ pro nábor doplňkového proteinu ušní doménou gama-adapinu". Přírodní strukturní biologie. 9 (7): 527–31. doi:10.1038 / nsb808. PMID 12042876. S2CID 42630285.

[pmid10814529-11] Takatsu H, Yoshino K, Nakayama K (květen 2000). „Adaptační doména gama ušní homologie konzervovaná v gama-adapinových a GGA proteinech, které interagují s gama-synerginem“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 271 (3): 719–25. doi:10,1006 / bbrc.2000.2700. PMID 10814529.

[pmid14665628-12] Mattera R, Ritter B, Sidhu SS, McPherson PS, Bonifacino JS (únor 2004). „Definice konsensuálního motivu rozpoznávaného doménami ucha gama-adaptinu“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (9): 8018–28. doi:10,1074 / jbc.M311873200. PMID 14665628.

[pmid12505986-13] Mattera R, Arighi CN, Lodge R, Zerial M, Bonifacino JS (leden 2003). „Divalentní interakce GGA s komplexem Rabaptin-5-Rabex-5“. Časopis EMBO. 22 (1): 78–88. doi:10.1093 / emboj / cdg015. PMC 140067. PMID 12505986.

[pmid12498786-14] Horikawa HP, Kneussel M, El Far O, Betz H (listopad 2002). "Interakce synaptophysinu s gama-adaptinem adaptorového proteinu AP-1". Molekulární a buněčné neurovědy. 21 (3): 454–62. doi:10.1006 / mcne.2002.1191. PMID 12498786. S2CID 54366866.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]