RhoD - RhoD

RHOD
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2J1L
Identifikátory
Aliasy	RHOD, ARHD, RHOHP1, RHOM, Rho, RhoD, ras člen rodiny homolog D
Externí ID	OMIM: 605781 MGI: 108446 HomoloGene: 22409 Genové karty: RHOD
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	67,072,017 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 19 (myš)
Konec	4,439,432 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • vazba protein kinázy; • Vazba GTP; • Aktivita GTPázy;
Buněčná složka	• časný endosom; • endosomová membrána; • endozom; • membrána; • cytosol; • buněčná membrána; • intracelulární; • cytoplazma; • buněčná kůra; • místo buněčného dělení; • intracelulární membránou vázaná organela;
Biologický proces	• pozitivní regulace buněčné adheze; • sestava ohniskové adheze; • sestava svazku aktinových vláken; • regulace reorganizace aktinového cytoskeletu; • pozitivní regulace buněčné migrace; • sestava lamellipodium; • Rho proteinová signální transdukce; • regulace sestavy ohniskové adheze; • cílení na bílkoviny; • regulace přenosu signálu zprostředkovaného malou GTPázou; • malá transdukce signálu zprostředkovaná GTPázou; • organizace aktinových vláken; • regulace tvaru buňky; • migrace buněk; • regulace buněčné migrace; • vytvoření nebo udržení polarity aktinového cytoskeletu; • regulace organizace aktinového cytoskeletu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	29984
	11854
	ENSG00000173156
	ENSMUSG00000041845
	O00212
	P97348
	NM_014578; NM_001300886
	NM_007485; NM_001329989
	NP_001287815; NP_055393
	NP_001316918; NP_031511
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

RhoD (Ras homolog genová rodina, člen D) je malá (~ 21 kDa) signalizace G protein (konkrétněji a GTPáza ) a je členem Rac podčeleď rodiny Rodina Rho GTPas.^[5] Je kódován genem RHOD.^[6]

Váže GTP a podílí se na dynamice a reorganizaci aktinového cytoskeletu a může koordinovat membránový transport s funkcí cytoskeletu.^[6]

Interakce

RhoD bylo prokázáno komunikovat s CNKSR1^[7] a DIAPH2.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000173156 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041845 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ridley A. (2006). "Rho GTPasy a dynamika aktinů v membránových výčnělcích a obchodování vezikul". Trends Cell Biol. 16 (10): 522–9. doi:10.1016 / j.tcb.2006.08.006. ISSN 0962-8924. PMID 16949823.
^ ^A ^b "Entrez Gene: RHOD ras homolog genová rodina, člen D".
^ Jaffe, Aron B; Aspenström Pontus; Hall Alan (únor 2004). „Lidská CNK1 působí jako lešenový protein, který spojuje cesty přenosu signálu Rho a Ras“. Mol. Buňka. Biol. Spojené státy. 24 (4): 1736–46. doi:10.1128 / MCB.24.4.1736-1746.2004. ISSN 0270-7306. PMC 344169. PMID 14749388.
^ Gasman, Stéphane; Kalaidzidis Yannis; Zerial Marino (březen 2003). „RhoD reguluje dynamiku endozomů prostřednictvím diafanózní tyrozinkinázy související s Formin a Src“. Nat. Cell Biol. Anglie. 5 (3): 195–204. doi:10.1038 / ncb935. ISSN 1465-7392. PMID 12577064. S2CID 17891748.

Další čtení

Ridley AJ (2001). "Rho proteiny: propojení signalizace s membránovým přenosem". Provoz. 2 (5): 303–10. doi:10.1034 / j.1600-0854.2001.002005303.x. PMID 11350626. S2CID 37763952.
Shimizu F, Watanabe TK, Okuno S a kol. (1997). "Izolace nové lidské cDNA (rhoHP1) homologní s geny rho". Biochim. Biophys. Acta. 1351 (1–2): 13–6. doi:10.1016 / s0167-4781 (97) 00008-0. PMID 9116026.
Kim HS, Choi JY, Jung AR a kol. (2000). "Přiřazení lidského genu RhoHP1 (ARHD) k chromozomu 11q14.3 radiačním hybridním mapováním". Cytogenet. Cell Genet. 89 (1–2): 53. doi:10.1159/000015562. PMID 10894936. S2CID 84584317.
Murphy C, Saffrich R, Olivo-Marin JC a kol. (2001). "Duální funkce rhoD ve vezikulárním pohybu a motilitě buněk". Eur. J. Cell Biol. 80 (6): 391–8. doi:10.1078/0171-9335-00173. PMID 11484930.
Zanata SM, Hovatta I, Rohm B, Püschel AW (2002). „Antagonistické účinky Rnd1 a RhoD GTPáz regulují aktivitu receptoru v cytoskeletálním kolapsu vyvolaném semaforinem 3A“. J. Neurosci. 22 (2): 471–7. doi:10.1523 / JNEUROSCI.22-02-00471.2002. PMC 6758682. PMID 11784792.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gasman S, Kalaidzidis Y, Zerial M (2003). „RhoD reguluje dynamiku endozomů prostřednictvím diafanózní tyrozinkinázy související s Formin a Src“. Nat. Cell Biol. 5 (3): 195–204. doi:10.1038 / ncb935. PMID 12577064. S2CID 17891748.
Jaffe AB, Aspenström P, hala A (2004). „Lidská CNK1 působí jako lešenový protein, který spojuje cesty přenosu signálu Rho a Ras“. Mol. Buňka. Biol. 24 (4): 1736–46. doi:10.1128 / MCB.24.4.1736-1746.2004. PMC 344169. PMID 14749388.
Flaxenburg JA, Melter M, Lapchak PH a kol. (2004). „Signální dráha indukovaná CD40 v endoteliálních buňkách vedoucí k nadměrné expresi vaskulárního endoteliálního růstového faktoru zahrnuje Ras a fosfatidylinositol 3-kinázu“. J. Immunol. 172 (12): 7503–9. doi:10,4049 / jimmunol.172.12.7503. PMID 15187129.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B a kol. (2005). "Vysoce výkonné mapování dynamické signalizační sítě v savčích buňkách". Věda. 307 (5715): 1621–5. Bibcode:2005Sci ... 307.1621B. doi:10.1126 / science.1105776. PMID 15761153. S2CID 39457788.
Birukova AA, Chatchavalvanich S, Rios A, et al. (2006). „Diferenciální regulace integrity plicní endoteliální monovrstvy různými stupni cyklického roztažení“. Dopoledne. J. Pathol. 168 (5): 1749–61. doi:10.2353 / ajpath.2006.050431. PMC 1606576. PMID 16651639.
Ito Y, Kanamaru A, Tada A (2007). „Nové činidlo, methylofiopogonanon B, podporuje aktivaci Rho a depolymerizaci tubulinu“. Mol. Buňka. Biochem. 297 (1–2): 121–9. doi:10.1007 / s11010-006-9336-r. PMID 17029007. S2CID 33688226.
Tan W, Martin D, Gutkind JS (2007). „Signální osa Galpha13-Rho je nutná pro migraci vyvolanou SDF-1 přes CXCR4“. J. Biol. Chem. 281 (51): 39542–9. doi:10,1074 / jbc.M609062200. PMID 17056591.
Lakshman N, Kim A, Bayless KJ a kol. (2007). „Rho hraje ústřední roli v regulaci lokálních mechanických interakcí buněčné matice v 3D kultuře“. Cell Motil. Cytoskelet. 64 (6): 434–45. doi:10,1002 / cm. 2019. PMID 17342762.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000173156 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041845 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[Ridley-5] Ridley A. (2006). "Rho GTPasy a dynamika aktinů v membránových výčnělcích a obchodování vezikul". Trends Cell Biol. 16 (10): 522–9. doi:10.1016 / j.tcb.2006.08.006. ISSN 0962-8924. PMID 16949823.

[entrezd-6] A ^b "Entrez Gene: RHOD ras homolog genová rodina, člen D".

[pmid14749388-7] Jaffe, Aron B; Aspenström Pontus; Hall Alan (únor 2004). „Lidská CNK1 působí jako lešenový protein, který spojuje cesty přenosu signálu Rho a Ras“. Mol. Buňka. Biol. Spojené státy. 24 (4): 1736–46. doi:10.1128 / MCB.24.4.1736-1746.2004. ISSN 0270-7306. PMC 344169. PMID 14749388.

[pmid12577064-8] Gasman, Stéphane; Kalaidzidis Yannis; Zerial Marino (březen 2003). „RhoD reguluje dynamiku endozomů prostřednictvím diafanózní tyrozinkinázy související s Formin a Src“. Nat. Cell Biol. Anglie. 5 (3): 195–204. doi:10.1038 / ncb935. ISSN 1465-7392. PMID 12577064. S2CID 17891748.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]