LIMK2 - LIMK2 - Wikipedia

LIMK2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1X6A, 4TPT
Identifikátory
Aliasy	LIMK2Kináza LIM domény 2
Externí ID	OMIM: 601988 MGI: 1197517 HomoloGene: 55911 Genové karty: LIMK2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	31,280,080 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	3,409,189 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita proteinové serin / threoninkinázy; • ATP vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita heterodimerizace proteinu; • vazba nukleotidů; • kinázová aktivita; • vazba kovových iontů; • aktivita proteinkinázy; • aktivita transferázy; • aktivita převodníku signálu;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • cytoplazma; • síť cis-Golgi;
Biologický proces	• fosforylace bílkovin; • spermatogeneze; • fosforylace; • GO: 0007243 transdukce intracelulárního signálu; • vývoj hlavy; • vývoj rohovky v oku kamerového typu; • organizace aktinového cytoskeletu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3985
	16886
	ENSG00000182541
	ENSMUSG00000020451
	P53671
	O54785
	NM_016733; NM_001031801; NM_005569
	NM_001034030; NM_010718; NM_173053; NM_001361623
	NP_001026971; NP_005560; NP_057952
	NP_001029202; NP_034848; NP_774958; NP_001348552
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Kináza LIM domény 2 je enzym že u lidí je kódován LIMK2 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Existuje přibližně 40 známých eukaryotických proteinů LIM, tak pojmenovaných pro LIM domén obsahují. LIM domény jsou vysoce konzervované struktury bohaté na cystein obsahující 2 zinkové prsty. Ačkoli zinkové prsty obvykle fungují vazbou na DNA nebo RNA, motiv LIM pravděpodobně zprostředkovává interakce protein-protein. LIM kináza-1 a LIM kináza-2 patří do malé podrodiny s jedinečnou kombinací 2 N-koncových LIM motivů a C-terminální proteinové kinázové domény. Protein kódovaný tímto genem je fosforylován a aktivován ROCK, následným efektorem Rho, a kódovaný protein zase fosforyluje kofilin, čímž inhibuje jeho aktin-depolymerizační aktivitu. Předpokládá se, že tato cesta přispívá k Rho indukované reorganizaci aktinového cytoskeletu. Pro tento gen byly nalezeny alespoň tři varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000182541 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020451 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Okano I, Hiraoka J, Otera H, Nunoue K, Ohashi K, Iwashita S, Hirai M, Mizuno K (prosinec 1995). „Identifikace a charakterizace nové rodiny serin / threoninových kináz obsahujících dva N-koncové LIM motivy“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (52): 31321–30. doi:10.1074 / jbc.270.52.31321. PMID 8537403.
^ Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN „Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (prosinec 1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
^ ^A ^b „Entrez Gene: LIMK2 LIM doména kináza 2“.

Další čtení

Scott RW, Olson MF (červen 2007). "LIM kinázy: funkce, regulace a asociace s lidskými chorobami". Journal of Molecular Medicine. 85 (6): 555–68. doi:10.1007 / s00109-007-0165-6. PMID 17294230.
Osada H, Hasada K, Inazawa J, Uchida K, Ueda R, Takahashi T, Takahashi T (13. prosince 1996). „Subcelulární lokalizace a proteinová interakce lidského genu LIMK2 exprimujícího alternativní transkripty s tkáňově specifickou regulací“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 229 (2): 582–9. doi:10.1006 / bbrc.1996.1847. PMID 8954941.
Hiraoka J, Okano I, Higuchi O, Yang N, Mizuno K (9. prosince 1996). "Samo-asociace LIM-kinázy 1 zprostředkovaná interakcí mezi N-koncovou LIM doménou a C-koncovou kinázovou doménou". FEBS Dopisy. 399 (1–2): 117–21. doi:10.1016 / S0014-5793 (96) 01303-8. PMID 8980133.
Yang N, Higuchi O, Ohashi K, Nagata K, Wada A, Kangawa K, Nishida E, Mizuno K (červen 1998). „Fosforylace cofilinu pomocí LIM-kinázy 1 a její role v reorganizaci aktinu zprostředkované Racem“. Příroda. 393 (6687): 809–12. doi:10.1038/31735. PMID 9655398.
Nomoto S, Tatematsu Y, Takahashi T, Osada H (srpen 1999). "Klonování a charakterizace alternativních promotorových oblastí lidského genu LIMK2 odpovědných za alternativní transkripty s tkáňově specifickou expresí". Gen. 236 (2): 259–71. doi:10.1016 / S0378-1119 (99) 00280-2. PMID 10452946.
Sumi T, Matsumoto K, Takai Y, Nakamura T (27. prosince 1999). „Fosforylace kofilinu a cytoskeletální dynamika aktinu regulovaná LIM-kinázou 2 aktivovanou rho a Cdc42“. The Journal of Cell Biology. 147 (7): 1519–32. doi:10.1083 / jcb.147.7.1519. PMC 2174243. PMID 10613909.
Sumi T, Matsumoto K, Nakamura T (leden 2001). „Specifická aktivace LIM kinázy 2 prostřednictvím fosforylace threoninu 505 pomocí ROCK, proteinové kinázy závislé na Rho“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (1): 670–6. doi:10,1074 / jbc.M007074200. PMID 11018042.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Amano T, Tanabe K, Eto T, Narumiya S, Mizuno K (únor 2001). „LIM-kináza 2 indukuje tvorbu stresových vláken, fokálních adhezí a membránových skvrn v závislosti na její aktivaci fosforylací katalyzovanou Rho asociovanou s kinázou na threoninu-505“. The Biochemical Journal. 354 (Pt 1): 149–59. doi:10.1042/0264-6021:3540149. PMC 1221639. PMID 11171090.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Výzkum genomu. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Sumi T, Matsumoto K, Shibuya A, Nakamura T (červen 2001). „Aktivace kináz LIM pomocí kinázy alfa vázající Cdc42 spojené s myotonickou dystrofií kinázou“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (25): 23092–6. doi:10,1074 / jbc.C100196200. PMID 11340065.
Toshima J, Toshima JY, Takeuchi K, Mori R, Mizuno K (srpen 2001). „Fosforylace kofilinu a reorganizace aktinu u testikulární protein kinázy 2 a její převažující exprese v testikulárních Sertoliho buňkách“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (33): 31449–58. doi:10,1074 / jbc.M102988200. PMID 11418599.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (červenec 2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Výzkum genomu. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, Goward ME, Aguado B, Mallya M, Mokrab Y, Huckle EJ, Beare DM, Dunham I (2005). „Přístup ke klonování lidského ORFeome založený na anotaci genomu“. Genome Biology. 5 (10): R84. doi:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (říjen 2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Výzkum genomu. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Vardouli L, Moustakas A, Stournaras C (březen 2005). „LIM-kináza 2 a fosforylace cofilinu zprostředkovávají reorganizaci aktinového cytoskeletu indukovanou transformací růstového faktoru-beta“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (12): 11448–57. doi:10,1074 / jbc.M402651200. PMID 15647284.

externí odkazy

LIMK2 Informace s odkazy v Brána pro migraci buněk

Tento článek o gen na lidský chromozom 22 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000182541 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020451 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8537403-5] Okano I, Hiraoka J, Otera H, Nunoue K, Ohashi K, Iwashita S, Hirai M, Mizuno K (prosinec 1995). „Identifikace a charakterizace nové rodiny serin / threoninových kináz obsahujících dva N-koncové LIM motivy“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (52): 31321–30. doi:10.1074 / jbc.270.52.31321. PMID 8537403.

[pmid10591208-6] Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN „Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (prosinec 1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: LIMK2 LIM doména kináza 2“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]