EHD1 - EHD1

EHD1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2JQ6, 2 KFF, 2KFG, 2 KFH, 2KSP
Identifikátory
Aliasy	EHD1, H-PAST, HPAST1, PAST, PAST1, EH doména obsahující 1
Externí ID	OMIM: 605888 MGI: 1341878 HomoloGene: 81678 Genové karty: EHD1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	64,888,296 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • vazba iontů vápníku; • Vazba GTP; • vazba kovových iontů; • Vazba Rab GTPázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • kadherinová vazba; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• endozom; • buněčná projekce; • časná endosomová membrána; • membrána; • lipidová kapička; • buněčná membrána; • cilium; • recyklace endosomové membrány; • destičková hustá trubicová síťová membrána; • ciliární membrána; • ciliární kapesní membrána; • endosomová membrána; • extracelulární exosom;
Biologický proces	• buněčná odpověď na stimul nervového růstového faktoru; • endocytóza; • clearance lipoproteinů s nízkou hustotou; • pozitivní regulace ukládání cholesterolu; • srážení krve; • pozitivní regulace fúze myoblastů; • organizace projekce buněk; • lokalizace proteinu do cilium; • pozitivní regulace endocytické recyklace; • homeostáza cholesterolu; • transport intracelulárních proteinů; • homooligomerizace bílkovin; • vývoj neuronové projekce; • transport bílkovin; • endocytická recyklace; • cilium morfogeneze; • doprava;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10938
	13660
	ENSG00000110047
	ENSMUSG00000024772
	Q9H4M9
	Q9WVK4
	NM_001282444; NM_001282445; NM_006795
	NM_010119
	NP_001269373; NP_001269374; NP_006786
	NP_034249
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein obsahující EH doménu 1, také známý jako testilin nebo MINULÝ homolog 1 (MINULOST 1), je protein že u lidí je kódován EHD1 gen^[4] patřící k Rodina proteinů EHD.

Funkce

Tento gen patří do vysoce konzervované genové rodiny kódující proteiny obsahující doménu EPS15 homologie (EH). EH doména vázající protein byla poprvé zaznamenána v EPS15, substrát pro receptor epidermálního růstového faktoru. Ukázalo se, že EH doména je důležitým motivem v proteinech zapojených do interakcí protein-protein a v intracelulárním třídění. Předpokládá se, že protein kódovaný tímto genem hraje roli v endocytóze IGF1 receptory.^[4]

Interakce

Bylo prokázáno, že EHD1 komunikovat s Receptor růstového faktoru 1 podobný inzulínu^[5] a SNAP29.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000110047 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: EHD1 EH-doména obsahující 1“.
^ ^A ^b Rotem-Yehudar, R; Galperin E; Horowitz M (srpen 2001). „Sdružení receptoru růstového faktoru 1 podobného inzulínu s EHD1 a SNAP29“. J. Biol. Chem. Spojené státy. 276 (35): 33054–60. doi:10,1074 / jbc.M009913200. ISSN 0021-9258. PMID 11423532.

Další čtení

Di Fiore PP, Pelicci PG, Sorkin A (1998). „EH: nová doména interakce protein-protein potenciálně zapojená do intracelulárního třídění“. Trends Biochem. Sci. 22 (11): 411–3. doi:10.1016 / S0968-0004 (97) 01127-4. PMID 9397678.
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY a kol. (1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anální. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC a kol. (1997). "Sekvenování cDNA ve velkém měřítku". Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Guru SC, Agarwal SK, Manickam P a kol. (1997). „Mapa přepisu pro oblast 2,8 Mb obsahující lokus typu endokrinní neoplázie typu 1“. Genome Res. 7 (7): 725–35. doi:10,1101 / gr. 7.7.725. PMC 310681. PMID 9253601.
Mintz L, Galperin E, Pasmanik-Chor M a kol. (1999). "EHD1 - protein obsahující doménu EH se specifickým vzorem exprese". Genomika. 59 (1): 66–76. doi:10.1006 / geno.1999.5800. PMID 10395801.
Haider NB, Searby C, Galperin E a kol. (2000). "Hodnocení a molekulární charakterizace EHD1, kandidátského genu pro Bardet-Biedlův syndrom 1 (BBS1)". Gen. 240 (1): 227–32. doi:10.1016 / S0378-1119 (99) 00395-9. PMID 10564830.
Pohl U, Smith JS, Tachibana I a kol. (2000). „EHD2, EHD3 a EHD4 kódují nové členy vysoce konzervované rodiny proteinů obsahujících doménu EH“. Genomika. 63 (2): 255–62. doi:10.1006 / geno.1999,6087. PMID 10673336.
Rotem-Yehudar R, Galperin E, Horowitz M (2001). „Sdružení receptoru růstového faktoru 1 podobného inzulínu s EHD1 a SNAP29“. J. Biol. Chem. 276 (35): 33054–60. doi:10,1074 / jbc.M009913200. PMID 11423532.
Caplan S, Naslavsky N, Hartnell LM a kol. (2002). „Trubkový oddíl obsahující EHD1 zapojený do recyklace hlavních molekul histokompatibilního komplexu třídy I do plazmatické membrány“. EMBO J.. 21 (11): 2557–67. doi:10.1093 / emboj / 21.11.2557. PMC 126039. PMID 12032069.
Galperin E, Benjamin S, Rapaport D a kol. (2003). „EHD3: protein, který spočívá v recyklaci struktur tubulárních a vezikulárních membrán a interaguje s EHD1“. Provoz. 3 (8): 575–89. doi:10.1034 / j.1600-0854.2002.30807.x. PMID 12121420. S2CID 5998465.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gevaert K, Goethals M, Martens L a kol. (2004). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Naslavsky N, Boehm M, Backlund PS, Caplan S (2005). „Rabenosyn-5 a EHD1 interagují a sekvenčně regulují recyklaci bílkovin do plazmatické membrány“. Mol. Biol. Buňka. 15 (5): 2410–22. doi:10,1091 / mbc.E03-10-0733. PMC 404033. PMID 15020713.
Guilherme A, Soriano NA, Furcinitti PS, český poslanec (2004). „Role EHD1 a EHBP1 v perinukleárním třídění a inzulínem regulovaná recyklace GLUT4 v adipocytech 3T3-L1“. J. Biol. Chem. 279 (38): 40062–75. doi:10,1074 / jbc.M401918200. PMID 15247266.
Xu Y, Shi H, Wei S a kol. (2005). "Vzájemně se vylučující interakce EHD1 s GS32 a syndapinem II". Mol. Membr. Biol. 21 (4): 269–77. doi:10.1080/09687680410001716871. PMID 15371016. S2CID 22820496.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Lee DW, Zhao X, Scarselletta S, et al. (2005). „Vazba ATP reguluje oligomerizaci a endozomální asociaci proteinů rodiny RME-1“. J. Biol. Chem. 280 (17): 17213–20. doi:10,1074 / jbc.M412751200. PMID 15710626.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000110047 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-4] A ^b „Entrez Gene: EHD1 EH-doména obsahující 1“.

[pmid11423532-5] A ^b Rotem-Yehudar, R; Galperin E; Horowitz M (srpen 2001). „Sdružení receptoru růstového faktoru 1 podobného inzulínu s EHD1 a SNAP29“. J. Biol. Chem. Spojené státy. 276 (35): 33054–60. doi:10,1074 / jbc.M009913200. ISSN 0021-9258. PMID 11423532.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]