SEC23A - SEC23A

SEC23A
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2NUP, 2MATICE, 2RC, 2RR, 3EFO, 3EG9, 3EGD, 3EGX
Identifikátory
Aliasy	SEC23A, CLSD, homolog A Sec23 A, složka nátěrového komplexu II, hSec23A, Sec23 homolog A, složka nátěrového komplexu COPII
Externí ID	OMIM: 610511 MGI: 1349635 HomoloGene: 4642 Genové karty: SEC23A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	39,109,646 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	59,012,017 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba iontů zinku; • vazba kovových iontů; • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Aktivátor aktivity GTPázy;
Buněčná složka	• membrána; • Golgiho membrána; • perinukleární oblast cytoplazmy; • ER potažený COPII na Golgiho transportní váček; • endoplazmatické retikulum; • vnější složka membrány; • Kabát vezikuly COPII; • místo výstupu endoplazmatického retikula; • cytoplazma; • membrána endoplazmatického retikula; • cytosol; • ER na Golgiho transportní membránu vezikul; • cytoplazmatický váček;
Biologický proces	• zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy II; • zpracování antigenu a prezentace peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy I.; • ER na transport zprostředkovaný vezikuly Golgi; • Povlak vezikul COPII; • transport bílkovin; • transport intracelulárních proteinů; • transport zprostředkovaný vezikuly; • nakládání nákladu do vezikuly potažené COPII; • Pučící vezikuly potažené COPII; • regulace potahování vezikul COPII; • Golgiho organizace; • regulace tvaru buňky; • makroautofagie; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy; • lokalizace proteinu na plazmatickou membránu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10484
	20334
	ENSG00000100934
	ENSMUSG00000020986
	Q15436
	Q01405
	NM_006364
	NM_009147; NM_001361956
	NP_006355
	NP_033173; NP_001348885
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Sec23 homolog A (S. cerevisiae), také známý jako SEC23A, je protein který je u lidí kódován SEC23A gen.^[5]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je členem podrodiny SEC23 rodiny SEC23 / SEC24. Obsahuje a gelsolin doména.^[6] Je součástí proteinového komplexu a nachází se v ribozom - bezplatná přechodná tvář endoplazmatické retikulum (ER) a související vezikuly. Tento protein má podobnost s kvasinkovou složkou Sec23p COPII. COPII je komplex obalových proteinů odpovědný za váček nadějné z ER. Předpokládá se, že kódovaný protein hraje roli v ER-Golgi obchodování s bílkovinami.^[5]

SEC23 interaguje s oběma SEC16A a SEC16B.^{[Citace je zapotřebí ]}

Interakce

SEC23A bylo prokázáno komunikovat s SEC24C,^[7] Sec16A / p250 a iPLA₁β / p125.^[8]

Sec23 bylo také prokázáno komunikovat s TRAPPⅠ, Grh1p také známý jako GRASP65 a Dynactin. Protože jsou zapojeny do anterográdního transportu vezikul z ER do Golgi, Sec23 je zapojen do transportu vezikul.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100934 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020986 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SEC23A Sec23 homolog A (S. cerevisiae)“.
^ Ghoshdastider, U; Popp, D; Burtnick, L. D .; Robinson, R. C. (2013). "Rozšiřující se nadrodina proteinů homologické domény gelsolinové". Cytoskelet. 70 (11): 775–95. doi:10,1002 / cm. 21149. PMID 24155256.
^ Pagano A, Letourneur F, Garcia-Estefania D, Carpentier JL, Orci L, Paccaud JP (březen 1999). "Proteiny Sec24 a třídění na endoplazmatickém retikulu". J. Biol. Chem. 274 (12): 7833–40. doi:10.1074 / jbc.274.12.7833. PMID 10075675.
^ p125 je lokalizován v místech výstupu endoplazmatického retikula a podílí se na jejich organizaci.
^ Koordinace obchodování s vezikuly COPII podle Sec23.

Další čtení

Paccaud JP, Reith W, Carpentier JL, Ravazzola M, Amherdt M, Schekman R, Orci L (1996). "Klonování a funkční charakterizace savčích homologů COPII složky Sec23". Mol. Biol. Buňka. 7 (10): 1535–46. doi:10,1091 / mbc.7.10.1535. PMC 276004. PMID 8898360.
Pagano A, Letourneur F, Garcia-Estefania D, Carpentier JL, Orci L, Paccaud JP (1999). "Proteiny Sec24 a třídění na endoplazmatickém retikulu". J. Biol. Chem. 274 (12): 7833–40. doi:10.1074 / jbc.274.12.7833. PMID 10075675.
Tang BL, Kausalya J, Low DY, Lock ML, Hong W (1999). "Rodina savčích proteinů homologních s kvasinkami Sec24p". Biochem. Biophys. Res. Commun. 258 (3): 679–84. doi:10.1006 / bbrc.1999.0574. PMID 10329445.
Boyadjiev SA, Justice CM, Eyaid W, McKusick VA, Lachman RS, Chowdry AB, Jabak M, Zwaan J, Wilson AF, Jabs EW (2003). „Nový dysmorfický syndrom s otevřenými kalvariálními stehy a suturální kataraktou se mapuje na chromozom 14q13-q21“. Hučení. Genet. 113 (1): 1–9. doi:10.1007 / s00439-003-0932-6. PMID 12677423.
Dudognon P, Maeder-Garavaglia C, Carpentier JL, Paccaud JP (2004). "Regulace COPII složky cytosolickou O-glykosylací během mitózy". FEBS Lett. 561 (1–3): 44–50. doi:10.1016 / S0014-5793 (04) 00109-7. PMID 15013749.
Watson P, Forster R, Palmer KJ, Pepperkok R, Stephens DJ (2005). „Spojení výstupu ER s mikrotubuly přímou interakcí COPII s dynaktinem“. Nat. Cell Biol. 7 (1): 48–55. doi:10.1038 / ncb1206. PMC 1592520. PMID 15580264.
Palmer KJ, Konkel JE, Stephens DJ (2005). „Proteinové kinázy PCTAIRE interagují přímo s komplexem COPII a modulují sekreční transport nákladu“. J. Cell Sci. 118 (Pt 17): 3839–47. doi:10.1242 / jcs.02496. PMID 16091426.
Boyadjiev SA, Fromme JC, Ben J, Chong SS, Nauta C, Hur DJ, Zhang G, Hamamoto S, Schekman R, Ravazzola M, Orci L, Eyaid W (2006). „Cranio-lenticulo-suturální dysplazie je způsobena mutací SEC23A vedoucí k abnormálnímu obchodování s endoplazmatickým retikulem-Golgiho“. Nat. Genet. 38 (10): 1192–7. doi:10.1038 / ng1876. PMID 16980979.
Tu LC, Yan X, Hood L, Lin B (2007). „Proteomická analýza internomomu N-myc downstream regulovaného genu 1 a jeho interakcí s programem androgenní odpovědi v buňkách rakoviny prostaty“. Mol. Buňka. Proteomika. 6 (4): 575–88. doi:10,1074 / mcp.M600249-MCP200. PMID 17220478.

externí odkazy

PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro transportní protein lidského proteinu Sec23A

Tento článek o gen na lidský chromozom 14 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100934 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020986 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: SEC23A Sec23 homolog A (S. cerevisiae)“.

[6] Ghoshdastider, U; Popp, D; Burtnick, L. D .; Robinson, R. C. (2013). "Rozšiřující se nadrodina proteinů homologické domény gelsolinové". Cytoskelet. 70 (11): 775–95. doi:10,1002 / cm. 21149. PMID 24155256.

[pmid10075675-7] Pagano A, Letourneur F, Garcia-Estefania D, Carpentier JL, Orci L, Paccaud JP (březen 1999). "Proteiny Sec24 a třídění na endoplazmatickém retikulu". J. Biol. Chem. 274 (12): 7833–40. doi:10.1074 / jbc.274.12.7833. PMID 10075675.

[8] 125 je lokalizován v místech výstupu endoplazmatického retikula a podílí se na jejich organizaci.

[9] Koordinace obchodování s vezikuly COPII podle Sec23.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]