Kolagen, typ XXV, alfa 1 - Collagen, type XXV, alpha 1

COL25A1
Identifikátory
Aliasy	COL25A1, AMY, CLAC, CLAC-P, CLACP, CFEOM5, kolagen, typ XXV, alfa 1, kolagen typu XXV alfa 1, kolagen typu XXV alfa 1 řetězec
Externí ID	OMIM: 610004 MGI: 1924268 HomoloGene: 57111 Genové karty: COL25A1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	109,302,752 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	130,599,877 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na heparin; • vazba amyloid-beta; • strukturní složka extracelulární matrice; • strukturní složka extracelulární matrice udělující pevnost v tahu;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • extracelulární oblast; • buněčná membrána; • kolagen; • lumen endoplazmatického retikula; • membrána; • extracelulární; • integrální součást plazmatické membrány; • extracelulární matrix; • extracelulární matrix obsahující kolagen;
Biologický proces	• axonogeneze podílející se na inervaci; • organizace extracelulární matice;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	84570
	77018
	ENSG00000188517
	ENSMUSG00000058897
	Q9BXS0
	Q99MQ5
	NM_001256074; NM_032518; NM_198721
	NM_001244952; NM_029838; NM_198711
	NP_001243003; NP_115907; NP_942014
	NP_001231881; NP_084114; NP_942004
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Kolagenový alfa-1 (XXV) řetězec je protein že u lidí je kódován COL25A1 gen.^[5]^[6]

COL25A1 je na mozek specifický kolagen vázaný na membránu. Proteolytické zpracování uvolňuje CLAC, rozpustnou formu COL25A1 obsahující extracelulární kolagenové domény, které se sdružují se senilními plaky u mozků Alzheimerovy choroby (AD; MIM 104300) (Osada et al., 2005). [Dodáno společností OMIM]^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že kolagen typu XXV, alfa 1 komunikovat s Amyloidní prekurzorový protein.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000188517 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000058897 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Hashimoto T, Wakabayashi T, Watanabe A, Kowa H, Hosoda R, Nakamura A, Kanazawa I, Arai T, Takio K, Mann DM, Iwatsubo T (duben 2002). „CLAC: nová složka amyloidního plaku Alzheimerovy choroby odvozená od transmembránového prekurzoru CLAC-P / kolagen typu XXV“. EMBO J.. 21 (7): 1524–34. doi:10.1093 / emboj / 21.7.1524. PMC 125364. PMID 11927537.
^ ^A ^b „Entrez Gene: COL25A1 kolagen, typ XXV, alfa 1“.

Další čtení

Kakuyama H, Söderberg L, Horigome K a kol. (2006). "CLAC se váže na agregované fragmenty Abeta a Abeta a oslabuje prodloužení fibril". Biochemie. 44 (47): 15602–9. doi:10.1021 / bi051263e. PMID 16300410.
Söderberg L, Dahlqvist C, Kakuyama H a kol. (2005). „Kolagenní složka amyloidního plaku s Alzheimerovou chorobou sestavuje amyloidní fibrily do agregátů rezistentních na proteázy“. FEBS J. 272 (9): 2231–6. doi:10.1111 / j.1742-4658.2005.04647.x. hdl:10616/39314. PMID 15853808. S2CID 26505595.
Osada Y, Hashimoto T, Nishimura A a kol. (2005). „CLAC se váže na amyloidní beta peptidy prostřednictvím kladně nabitého klastru aminokyselin v kolagenní doméně 1 a inhibuje tvorbu amyloidních fibril“. J. Biol. Chem. 280 (9): 8596–605. doi:10,1074 / jbc.M413340200. PMID 15615705.
Söderberg L, Kakuyama H, Möller A a kol. (2005). „Charakterizace proteinu CLAC spojeného s Alzheimerovou chorobou a identifikace vazebného místa pro amyloid beta-peptid“. J. Biol. Chem. 280 (2): 1007–15. doi:10,1074 / jbc.M403628200. PMID 15522881.
Kowa H, Sakakura T, Matsuura Y a kol. (2004). „Většinou oddělené distribuce CLAC- oproti Abeta40- nebo thioflavinovým S-reaktivitám v senilních placích odhalují dvě odlišné subpopulace depozitů beta-amyloidu“. Dopoledne. J. Pathol. 165 (1): 273–81. doi:10.1016 / s0002-9440 (10) 63295-6. PMC 1618534. PMID 15215182.
Söderberg L, Zhukareva V, Bogdanovic N, et al. (2004). „Molekulární identifikace AMY, proteinu spojeného s amyloidy Alzheimerovy choroby“. J. Neuropathol. Exp. Neurol. 62 (11): 1108–17. doi:10.1093 / jnen / 62.11.1108. PMID 14656069.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000188517 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000058897 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11927537-5] A ^b Hashimoto T, Wakabayashi T, Watanabe A, Kowa H, Hosoda R, Nakamura A, Kanazawa I, Arai T, Takio K, Mann DM, Iwatsubo T (duben 2002). „CLAC: nová složka amyloidního plaku Alzheimerovy choroby odvozená od transmembránového prekurzoru CLAC-P / kolagen typu XXV“. EMBO J.. 21 (7): 1524–34. doi:10.1093 / emboj / 21.7.1524. PMC 125364. PMID 11927537.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: COL25A1 kolagen, typ XXV, alfa 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]