Kolagen, typ XVI, alfa 1 - Collagen, type XVI, alpha 1

COL16A1
Identifikátory
Aliasy	COL16A1, 447AA, FP1572, kolagen typu XVI alfa 1, kolagen typu XVI alfa 1 řetězec
Externí ID	OMIM: 120326 MGI: 1095396 HomoloGene: 1397 Genové karty: COL16A1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	31,704,319 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	130,099,283 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• integrinová vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • strukturní složka extracelulární matrice; • strukturní složka extracelulární matrice udělující pevnost v tahu;
Buněčná složka	• extracelulární oblast; • zastřihovač kolagenu typu XVI; • kolagen; • lumen endoplazmatického retikula; • extracelulární matrix; • extracelulární; • extracelulární matrix obsahující kolagen;
Biologický proces	• buněčná odpověď na stimul aminokyselin; • integrinem zprostředkovaná signální dráha; • ženské těhotenství; • pozitivní regulace sestavy ohniskové adheze; • aktivace integrinu; • buněčná adheze; • organizace extracelulární matice; • buněčná adheze zprostředkovaná integrinem;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1307
	107581
	ENSG00000084636
	ENSMUSG00000040690
	Q07092
	Q8BLX7
	NM_001856
	NM_028266
	NP_001847
	NP_082542
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Kolagenový alfa-1 (XVI) řetězec je protein že u lidí je kódován COL16A1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje alfa řetězec kolagenu typu XVI, člena rodiny kolagenů FACIT (kolageny spojené s vlákny s přerušovanými helixy). Členové této rodiny kolagenů se vyskytují ve spojení s kolageny tvořícími fibrily, jako jsou typy I a II, a slouží k udržení integrity extracelulární matrix. Vysoké hladiny kolagenu typu XVI byly nalezeny v fibroblasty a keratinocyty a v hladkém svalstvu a amnion.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000084636 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040690 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Pan TC, Zhang RZ, Mattei MG, Timpl R, Chu ML (srpen 1992). „Klonování a chromozomální umístění lidského kolagenu alfa 1 (XVI)“. Proc Natl Acad Sci U S A. 89 (14): 6565–9. doi:10.1073 / pnas.89.14.6565. PMC 49542. PMID 1631157.
^ ^A ^b „Entrez Gene: COL16A1 kolagen, typ XVI, alfa 1“.

Další čtení

Yamaguchi N, Kimura S, McBride OW, Hori H, Yamada Y, Kanamori T, Yamakoshi H, Nagai Y (1993). „Molekulární klonování a částečná charakterizace nového kolagenového řetězce, alfa 1 (XVI), sestávajícího z opakujících se kolagenních domén a nekolagenních segmentů obsahujících cystein“. J. Biochem. 112 (6): 856–63. PMID 1284248.
Ratzinger S, Grässel S, Dowejko A, Reichert TE, Bauer RJ (2011). „Indukce exprese kolagenu typu XVI usnadňuje proliferaci rakovinných buněk orálně“. Matrix Biology. 30 (2): 118–25. doi:10.1016 / j.matbio.2011.01.001. PMID 21251976.
Sires UI, Dublet B, Aubert-Foucher E, van der Rest M, Welgus HG (1995). „Degradace domény COL1 kolagenu typu XIV gelatinázou 92 kDa“. J. Biol. Chem. 270 (3): 1062–7. doi:10.1074 / jbc.270.3.1062. PMID 7836360.
Tillet E, Mann K, Nischt R, Pan TC, Chu ML, Timpl R (1995). "Rekombinantní analýza lidského alfa 1 (XVI) kolagenu. Důkazy pro zpracování N-koncové globulární domény". Eur. J. Biochem. 228 (1): 160–8. doi:10.1111 / j.1432-1033.1995.tb20245.x. PMID 7882999.
Grässel S, Timpl R, Tan EM, Chu ML (1997). „Biosyntéza a zpracování kolagenu typu XVI v lidských fibroblastech a buňkách hladkého svalstva“. Eur. J. Biochem. 242 (3): 576–84. doi:10.1111 / j.1432-1033.1996.0576r.x. PMID 9022684.
Ratzinger S, Grässel S, Dowejko A, Reichert TE, Bauer RJ (březen 2011). „Indukce exprese kolagenu typu XVI usnadňuje proliferaci rakovinných buněk orálně“. Matrix Biology. 30 (2): 118–25. doi:10.1016 / j.matbio.2011.01.001. PMID 21251976.
Kassner A, Hansen U, Miosge N, Reinhardt DP, Aigner T, Bruckner-Tuderman L, Bruckner P, Grässel S (2004). "Diskrétní integrace kolagenu XVI do tkáňově specifických kolagenových fibril nebo kuličkových mikrofibril". Matrix Biol. 22 (2): 131–43. doi:10.1016 / S0945-053X (03) 00008-8. PMID 12782140.
Kassner A, Tiedemann K, Notbohm H, Ludwig T, Mörgelin M, Reinhardt DP, Chu ML, Bruckner P, Grässel S (2004). "Molekulární struktura a interakce rekombinantního lidského kolagenu typu XVI". J. Mol. Biol. 339 (4): 835–53. doi:10.1016 / j.jmb.2004.03.042. PMID 15165854.
Eble JA, Kassner A, Niland S, Mörgelin M, Grifka J, Grässel S (2006). „Kolagen XVI obsahuje ve svých C-koncových doménách rozpoznávací místo integrinu alfa1 beta1“. J. Biol. Chem. 281 (35): 25745–56. doi:10,1074 / jbc.M509942200. PMID 16754661.

externí odkazy

„COL16A1 (kolagen, typ XVI, alfa 1)“.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000084636 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040690 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1631157-5] Pan TC, Zhang RZ, Mattei MG, Timpl R, Chu ML (srpen 1992). „Klonování a chromozomální umístění lidského kolagenu alfa 1 (XVI)“. Proc Natl Acad Sci U S A. 89 (14): 6565–9. doi:10.1073 / pnas.89.14.6565. PMC 49542. PMID 1631157.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: COL16A1 kolagen, typ XVI, alfa 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]