Laminin, gama 1 - Laminin, gamma 1

LAMC1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1KLO, 1NPE, 1TLE, 4AQT
Identifikátory
Aliasy	LAMC1, LAMB2, Laminin, gama 1, lamininová podjednotka gama 1
Externí ID	OMIM: 150290 MGI: 99914 HomoloGene: 1724 Genové karty: LAMC1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	183,145,592 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	153,332,786 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• strukturní složka extracelulární matrice; • složka extracelulární matrice udělující pružnost;
Buněčná složka	• extracelulární matrix; • extracelulární oblast; • bazální membrána; • komplex laminin-1; • extracelulární exosom; • komplex laminin-10; • komplex laminin-11; • extracelulární; • lumen endoplazmatického retikula; • extracelulární matrix obsahující kolagen;
Biologický proces	• sestava hemidesmosomu; • šíření buněk závislé na adhezi; • vývoj endodermu; • buněčná adheze; • organizace extracelulární matice; • migrace buněk; • pozitivní regulace proliferace epiteliálních buněk; • demontáž extracelulární matice; • posttranslační modifikace; • buněčný proteinový metabolický proces; • sestava makromolekulárního komplexu; • morfogeneze zvířecích orgánů; • histogeneze; • vývoj systému; • sestava bazální membrány;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3915
	226519
	ENSG00000135862
	ENSMUSG00000026478
	P11047
	P02468
	NM_002293
	NM_010683
	NP_002284
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Lamininová podjednotka gama-1 je protein že u lidí je kódován LAMC1 gen.^[5]^[6]

Lamininy, rodina extracelulární matrice glykoproteiny, jsou hlavní nekolagenní složkou bazální membrány. Byly zapojeny do široké škály biologických procesů, včetně buněčné adheze, diferenciace, migrace, signalizace, růstu neuritů a metastáz. Lamininy se skládají ze 3 neidentických řetězců: laminin alfa, beta a gama (dříve A, B1 a B2) a tvoří křížovou strukturu skládající se ze 3 krátkých ramen, z nichž každé je tvořeno jiným řetězcem, a dlouhého ramene složeného všech 3 řetězců. Každý lamininový řetězec je vícedoménový protein kódovaný odlišným gen. Několik izoformy každého řetězce byly popsány. Kombinace různých izomerů alfa, beta a gama řetězce vede k vzniku různých heterotrimerních izoforem lamininu, které jsou označeny arabskými číslicemi v pořadí podle jejich objevu, tj. Heterotrimer alfa1beta1gamma1 je laminin 1. Biologické funkce různých řetězců a molekul trimeru jsou z velké části neznámé Ukázalo se však, že některé z řetězců se liší vzhledem k jejich tkáňové distribuci, což pravděpodobně odráží různé funkce in vivo. Tento gen kóduje izoformu lamininu gama řetězce laminin, gama 1. Řetězec gama 1, dříve považovaný za beta řetězec, obsahuje strukturní domény podobné beta řetězcům, postrádá však krátké oblasti alfa oddělující domény I a II. Strukturální organizace tohoto genu také naznačuje, že se značně lišil od genů beta řetězce. Embrya transgenních myší, ve kterých byly obě alely genu genu 1 řetězce inaktivovány homologní rekombinací, postrádaly bazální membrány, což naznačuje, že laminin, gama 1 řetězec je nezbytný pro sestavení heterotrimeru lamininu. Bylo to odvozeno analogicky s nápadně podobnou 3 'UTR sekvencí v myším lamininu gama 1 cDNA, že u člověka se používá více polyadenylačních míst ke generování 2 různě velkých mRNA (5,5 a 7,5 kb) pozorovaných při Northern analýze.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000135862 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000026478 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Fukushima Y, Pikkarainen T, Kallunki T, Eddy RL, Byers MG, Haley LL, Henry WM, Tryggvason K, Shows TB (květen 1989). „Izolace klonu cDNA lidského lamininu B2 (LAMB2) a přiřazení genu k oblasti chromozomu 1q25 ---- q31“. Cytogenet Cell Genet. 48 (3): 137–41. doi:10.1159/000132610. PMID 3234037.
^ ^A ^b „Entrez Gene: LAMC1 laminin, gama 1 (dříve LAMB2)“.

Další čtení

Ljubimova JY, Fujita M, Khazenzon NM a kol. (2006). „Změny v izoformách lamininu spojené s invazí mozkových nádorů a angiogenezí“. Přední. Biosci. 11 (1): 81–8. doi:10.2741/1781. PMC 3506377. PMID 16146715.
Santos CL, Sabbaga J, Brentani R (1992). "Rozdíly v sekvencích lidského lamininu B2". DNA sekv. 1 (4): 275–7. doi:10.3109/10425179109020782. PMID 1806043.
Kallunki T, Ikonen J, Chow LT a kol. (1991). „Struktura lidského genu řetězce lamininu B2 odhaluje rozsáhlé odchylky od genu řetězce lamininu B1“. J. Biol. Chem. 266 (1): 221–8. PMID 1985895.
Hunter DD, Shah V, Merlie JP, Sanes JR (1989). „Adhezivní protein podobný lamininu koncentrovaný v synaptické štěrbině neuromuskulárního spojení“. Příroda. 338 (6212): 229–34. doi:10.1038 / 338229a0. PMID 2922051. S2CID 4313384.
Pikkarainen T, Kallunki T, Tryggvason K (1988). "Řetězec B2 lidského lamininu. Porovnání kompletní aminokyselinové sekvence s řetězcem B1 odhaluje variabilitu v sekvenční homologii mezi různými strukturálními doménami". J. Biol. Chem. 263 (14): 6751–8. PMID 3360804.
Mattei MG, Weil D, Pribula-Conway D a kol. (1988). "klonování cDNA, exprese a mapování genu lidského lamininu B2 na chromozom 1q31". Hučení. Genet. 79 (3): 235–41. doi:10.1007 / BF00366243. PMID 3402995. S2CID 8075171.
Davis JM, Narachi MA, Alton NK, Arakawa T (1987). "Struktura lidského nádorového nekrotického faktoru alfa odvozeného z rekombinantní DNA". Biochemie. 26 (5): 1322–6. doi:10.1021 / bi00379a018. PMID 3552045.
Wewer UM, Gerecke DR, Durkin ME a kol. (1995). "Lidský beta 2 řetězec lamininu (dříve S řetězec): klonování cDNA, chromozomální lokalizace a exprese v karcinomech". Genomika. 24 (2): 243–52. doi:10.1006 / geno.1994.1612. PMID 7698745.
Burgeson RE, Chiquet M, Deutzmann R, et al. (1994). "Nová nomenklatura pro lamininy". Matrix Biol. 14 (3): 209–11. doi:10.1016 / 0945-053X (94) 90184-8. PMID 7921537.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
O'Grady P, Thai TC, Saito H (1998). „Komplex laminin-nidogen je ligandem pro specifickou sestřihovou izoformu transmembránového proteinu tyrosin fosfatázy LAR“. J. Cell Biol. 141 (7): 1675–84. doi:10.1083 / jcb.141.7.1675. PMC 2133008. PMID 9647658.
Kohfeldt E, Sasaki T, Göhring W, Timpl R (1998). „Nidogen-2: nový protein bazální membrány s různými vazebnými vlastnostmi“. J. Mol. Biol. 282 (1): 99–109. doi:10.1006 / jmbi.1998.2004. PMID 9733643.
Suzuki H, Denisenko ON, Suzuki Y a kol. (1998). „Indukovatelná transkripční aktivita prvku bcn-1 z promotoru genu řetězce laminin gama1 v ledvinových a nerenálních buňkách“. Dopoledne. J. Physiol. 275 (4 Pt 2): F518–26. doi:10.1152 / ajprenal.1998.275.4.F518. PMID 9755123.
Smyth N, Vatansever HS, Murray P a kol. (1999). „Absence bazálních membrán po cílení na gen LAMC1 vede k embryonální letalitě v důsledku selhání diferenciace endodermu“. J. Cell Biol. 144 (1): 151–60. doi:10.1083 / jcb.144.1.151. PMC 2148127. PMID 9885251.
Kikkawa Y, Sanzen N, Fujiwara H a kol. (2000). „Integrinová vazebná specificita lamininu-10/11: laminin-10/11 je rozpoznáván alfa 3 beta 1, alfa 6 beta 1 a alfa 6 beta 4 integriny“. J. Cell Sci. 113. (Pt 5): 869–76. PMID 10671376.
Champliaud MF, Virtanen I, Tiger CF a kol. (2000). „Posttranslační modifikace a asociace beta / gama řetězce řetězců lidského lamininu alfa1 a lamininu alfa5: čištění lamininu-3 z placenty“. Exp. Cell Res. 259 (2): 326–35. doi:10,1006 / excr. 2000,4980. PMID 10964500.
Pedraza C, Geberhiwot T, Ingerpuu S a kol. (2000). „Monocytické buňky syntetizují, adherují a migrují na laminin-8 (alfa 4 beta 1 gama 1)“. J. Immunol. 165 (10): 5831–8. doi:10,4049 / jimmunol.165.10.5831. PMID 11067943.
Parsons SF, Lee G, Spring FA a kol. (2001). „Lutheran krevní skupina glykoprotein a jeho nově charakterizovaný myší homolog specificky váže lidský laminin obsahující alfa5 řetězec s vysokou afinitou“. Krev. 97 (1): 312–20. doi:10.1182 / krev.V97.1.312. PMID 11133776.
McArthur CP, Wang Y, Heruth D, Gustafson S (2001). „Amplifikace extracelulární matrice a onkogenů v buněčných liniích lidských slinných žláz s transfektací s expresí lamininu, fibronektinu, kolagenů I, III, IV, c-myc a p53“. Oblouk. Oral Biol. 46 (6): 545–55. doi:10.1016 / S0003-9969 (01) 00014-0. PMID 11311202.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000135862 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000026478 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid3234037-5] Fukushima Y, Pikkarainen T, Kallunki T, Eddy RL, Byers MG, Haley LL, Henry WM, Tryggvason K, Shows TB (květen 1989). „Izolace klonu cDNA lidského lamininu B2 (LAMB2) a přiřazení genu k oblasti chromozomu 1q25 ---- q31“. Cytogenet Cell Genet. 48 (3): 137–41. doi:10.1159/000132610. PMID 3234037.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: LAMC1 laminin, gama 1 (dříve LAMB2)“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]