Laminin, alfa 4 - Laminin, alpha 4
Lamininová podjednotka alfa-4 je protein že u lidí je kódován LAMA4 gen.[5][6]
Funkce
Lamininy, rodina extracelulární matrice glykoproteiny, jsou hlavní nonkolagenní složka bazální membrány. Byly zapojeny do široké škály biologických procesů včetně buněčná adheze, diferenciace, migrace, signalizace, růst neuritů a metastáza.
Lamininy se skládají ze 3 neidentických řetězců: laminin alfa, beta a gama (dříve A, B1 a B2) a tvoří křížovou strukturu skládající se ze 3 krátkých ramen, z nichž každé je tvořeno jiným řetězcem, a dlouhého ramene složeného všech 3 řetězců. Každý lamininový řetězec je multidoménový protein kódovaný odlišným genem. Bylo popsáno několik izoforem každého řetězce. Různé alfa, beta a gama řetězce izomery kombinovat, aby vznikly různé heterotrimerický lamininové izoformy, které jsou označeny arabskými číslicemi v pořadí podle jejich objevu, tj. heterotrimer alfa1beta1gamma1 je laminin 1. Biologické funkce různých řetězců a trimerových molekul jsou z velké části neznámé, ale ukázalo se, že některé řetězce se liší vzhledem k jejich distribuce tkání, pravděpodobně odrážející různé funkce in vivo.
Tento gen kóduje izoformu lamininu alfa řetězce alfa 4 doména Struktura alfa 4 je podobná struktuře alfa 3, obě se podobají zkráceným verzím alfa 1 a alfa 2, v tom, že přibližně 1200 zbytků na N-konec (domény IV, V a VI) byly ztraceny. Laminin, alfa 4 obsahuje C-terminál G doména, která odlišuje všechny alfa řetězce od beta a gama řetězců. The RNA analýza z dospělých a fetálních tkání odhalila vývojovou regulaci exprese, avšak přesná funkce lamininu, alfa 4 není známa.[6]
Gen
Tkáňově specifické využití alternativního polyA-signálu bylo popsáno v literatuře. Také alternativní sestřih zahrnující první intron v 5 'UTR a byly pozorovány izoformy podobné lamininu alfa 4, nicméně není známa úplná povaha těchto produktů.[6]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112769 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000019846 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Richards AJ, al-Imara L, Carter NP, Lloyd JC, Leversha MA, Pope FM (červenec 1994). "Lokalizace genu (LAMA4) na chromozom 6q21 a izolace částečné cDNA kódující alternativní řetězec lamininu A". Genomika. 22 (1): 237–9. doi:10.1006 / geno.1994.1372. PMID 7959779.
- ^ A b C „Entrez Gene: LAMA4 laminin, alfa 4“.
Další čtení
- Ljubimova JY, Fujita M, Khazenzon NM, Ljubimov AV, Black KL (2006). „Změny v izoformách lamininu spojené s invazí mozkových nádorů a angiogenezí“. Frontiers in Bioscience. 11 (1): 81–8. doi:10.2741/1781. PMC 3506377. PMID 16146715.
- Iivanainen A, Sainio K, Sariola H, Tryggvason K (květen 1995). "Primární struktura a exprese nového řetězce alfa 4 lidského lamininu". FEBS Dopisy. 365 (2–3): 183–8. doi:10.1016 / 0014-5793 (95) 00462-I. PMID 7781776. S2CID 83904114.
- Burgeson RE, Chiquet M, Deutzmann R, Ekblom P, Engel J, Kleinman H, Martin GR, Meneguzzi G, Paulsson M, Sanes J (duben 1994). "Nová nomenklatura pro lamininy". Matrix Biology. 14 (3): 209–11. doi:10.1016 / 0945-053X (94) 90184-8. PMID 7921537.
- Ryan MC, Tizard R, VanDevanter DR, Carter WG (září 1994). "Klonování genu LamA3 kódujícího řetězec alfa 3 adhezivního ligandu epiligrin. Exprese v hojení ran". The Journal of Biological Chemistry. 269 (36): 22779–87. PMID 8077230.
- Richards A, Al-Imara L, Pope FM (červen 1996). "Kompletní cDNA sekvence lamininu alfa 4 a jeho vztah k ostatním lidským lamininovým alfa řetězcům". European Journal of Biochemistry / FEBS. 238 (3): 813–21. doi:10.1111 / j.1432-1033.1996.0813w.x. PMID 8706685.
- Xiao S, Lux ML, Reeves R, Hudson TJ, Fletcher JA (březen 1997). "Aktivace HMGI (Y) chromozomovými přesmyky 6p21 v multilineárních mezenchymálních buňkách z plicního hamartomu". American Journal of Pathology. 150 (3): 901–10. PMC 1857887. PMID 9060828.
- Durkin ME, Loechel F, Mattei MG, Gilpin BJ, Albrechtsen R, Wewer UM (červenec 1997). „Tkáňově specifická exprese řetězce alfa5 lidského lamininu a mapování genu na lidský chromozom 20q13.2-13.3 a na distální myší chromozom 2 v blízkosti lokusu pro otrhanou (Ra) mutaci“. FEBS Dopisy. 411 (2–3): 296–300. doi:10.1016 / S0014-5793 (97) 00686-8. PMID 9271224. S2CID 45286880.
- Richards A, Luccarini C, Pope FM (srpen 1997). "Strukturální organizace LAMA4, genu kódujícího laminin alfa4". European Journal of Biochemistry / FEBS. 248 (1): 15–23. doi:10.1111 / j.1432-1033.1997.t01-1-00015.x. PMID 9310354.
- Mrowiec T, Melchar C, Górski A (1998). „Změny v interakcích T buněk s proteiny extracelulární matrix a endotelem zprostředkované HIV-proteiny“. Archivum Immunologiae et Therapiae Experimentalis. 45 (2–3): 255–9. PMID 9597096.
- Talts JF, Sasaki T, Miosge N, Göhring W, Mann K, Mayne R, Timpl R (listopad 2000). „Strukturální a funkční analýza rekombinantní G domény řetězce lamininu alfa4 a její proteolytické zpracování v tkáních“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (45): 35192–9. doi:10,1074 / jbc.M003261200. PMID 10934193.
- Fleischmajer R, Kuroda K, Utani A, Douglas MacDonald E, Perlish JS, Arikawa-Hirasawa E, Sekiguchi K, Sanzen N, Timpl R, Yamada Y (prosinec 2000). "Diferenciální exprese lamininových alfa řetězců během proliferačních a diferenciačních stadií v modelu morfogeneze kůže". Matrix Biology. 19 (7): 637–47. doi:10.1016 / S0945-053X (00) 00092-5. PMID 11102753.
- McArthur CP, Wang Y, Heruth D, Gustafson S (červen 2001). „Amplifikace extracelulární matrice a onkogenů v buněčných liniích lidských slinných žláz s transfektací s expresí lamininu, fibronektinu, kolagenů I, III, IV, c-myc a p53“. Archivy orální biologie. 46 (6): 545–55. doi:10.1016 / S0003-9969 (01) 00014-0. PMID 11311202.
- Petäjäniemi N, Korhonen M, Kortesmaa J, Tryggvason K, Sekiguchi K, Fujiwara H, Sorokin L, Thornell LE, Wondimu Z, Assefa D, Patarroyo M, Virtanen I (srpen 2002). "Lokalizace řetězce lamininu alfa4 ve vývojových a dospělých lidských tkáních". The Journal of Histochemistry and Cytochemistry. 50 (8): 1113–30. doi:10.1177/002215540205000813. PMID 12133914.
- Gu YC, Kortesmaa J, Tryggvason K, Persson J, Ekblom P, Jacobsen SE, Ekblom M (únor 2003). "Lamininová izoforma specifická podpora adheze a migrace lidských progenitorových buněk kostní dřeně". Krev. 101 (3): 877–85. doi:10.1182 / krev-2002-03-0796. PMID 12393739.
- Hayashi Y, Kim KH, Fujiwara H, Shimono C, Yamashita M, Sanzen N, Futaki S, Sekiguchi K (prosinec 2002). "Identifikace a rekombinantní produkce sestřihových variant podjednotky lidského lamininu alfa4". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 299 (3): 498–504. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02642-6. PMID 12445830.
- Gonzalez AM, Gonzales M, Herron GS, Nagavarapu U, Hopkinson SB, Tsuruta D, Jones JC (prosinec 2002). „Složité interakce mezi lamininovou alfa 4 podjednotkou a integriny regulují chování endoteliálních buněk in vitro a angiogenezi in vivo“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (25): 16075–80. doi:10.1073 / pnas.252649399. PMC 138567. PMID 12454288.
- DeHahn KC, Gonzales M, Gonzalez AM, Hopkinson SB, Chandel NS, Brunelle JK, Jones JC (březen 2004). "Podjednotka alfa4 lamininu reguluje přežití endoteliálních buněk". Experimentální výzkum buněk. 294 (1): 281–9. doi:10.1016 / j.yexcr.2003.11.006. PMID 14980521.