Brevican - Brevican

BCAN
Identifikátory
Aliasy	BCAN, BEHAB, CSPG7, Brevican
Externí ID	OMIM: 600347 MGI: 1096385 HomoloGene: 7244 Genové karty: BCAN
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	156,659,532 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	88,000,230 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vázání kyseliny hyaluronové; • vázání sacharidů; • strukturní složka extracelulární matrice;
Buněčná složka	• membrána; • extracelulární oblast; • lysozomální lumen; • Golgiho lumen; • ukotvená součást membrány; • extracelulární matrix; • glutamátergická synapse;
Biologický proces	• vývoj kosterního systému; • proces biosyntézy chondroitin sulfátu; • organizace extracelulární matice; • vývoj centrálního nervového systému; • katabolický proces chondroitin sulfátu; • proces biosyntézy dermatansulfátu; • vývoj hipokampu; • buněčná adheze; • zrání synapsí;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	63827
	12032
	ENSG00000132692
	ENSMUSG00000004892
	Q96GW7
	Q61361
	NM_021948; NM_198427
	NM_001109758; NM_007529
	NP_068767; NP_940819
	NP_001103228; NP_031555
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Brevican core protein je protein že u lidí je kódován BCAN gen.^[5]^[6]^[7] Brevican je členem lektikan rodina bílkovin.

Brevican je lokalizován na povrchu neurony v mozek.^[8] V melanocytických buňkách může být exprese genu BCAN regulována pomocí MITF.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000132692 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000004892 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Gary SC, Zerillo CA, Chiang VL, Gaw JU, Gray G, Hockfield S (říjen 2000). „cDNA klonování, chromozomální lokalizace a analýza exprese lidského BEHAB / brevikanu, mozkového specifického proteoglykanu regulovaného během kortikálního vývoje a v gliomu“. Gen. 256 (1–2): 139–47. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00362-0. PMID 11054543.
^ Nomoto H, Oohashi T, Hirakawa S, Ueki Y, Ohtsuki H, Ninomiya Y (únor 2002). „Lidské geny BRAL1 a BCAN, které patří do nadrodiny spojovacích modulů, jsou tandemově uspořádány na chromozomu 1q21-23.“ Acta Medica Okayama. 56 (1): 25–9. PMID 11873941.
^ „Entrez Gene: BCAN brevican“.
^ Frischknecht R, Seidenbecher CI (červenec 2012). "Brevican: klíčový proteoglykan v perisynaptické extracelulární matrici mozku". International Journal of Biochemistry & Cell Biology. 44 (7): 1051–4. doi:10.1016 / j.biocel.2012.03.022. PMID 22537913.
^ Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, Widmer DS, Praetorius C, Einarsson SO, Valgeirsdottir S, Bergsteinsdottir K, Schepsky A, Dummer R, Steingrimsson E (prosinec 2008). "Nové cíle MITF identifikované pomocí dvoustupňové strategie DNA microarray". Výzkum pigmentových buněk a melanomu. 21 (6): 665–76. doi:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID 19067971.

externí odkazy

Člověk BCAN umístění genomu a BCAN stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Hu B, Kong LL, Matthews RT, Viapiano MS (září 2008). „Proteoglykan brevican se váže na fibronektin po proteolytickém štěpení a podporuje motilitu gliomových buněk“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (36): 24848–59. doi:10,1074 / jbc.M801433200. PMC 3259830. PMID 18611854.
Seidenbecher CI, Richter K, Rauch U, Fässler R, Garner CC, Gundelfinger ED (listopad 1995). „Brevican, chondroitinsulfátový proteoglykan mozku potkanů, se vyskytuje jako vylučovaný a na povrchu ukotvený izoforma glykosylfosfatidylinositolu“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (45): 27206–12. doi:10.1074 / jbc.270.45.27206. PMID 7592978.
Aspberg A, Miura R, Bourdoulous S, Shimonaka M, Heinegârd D, Schachner M, Ruoslahti E, Yamaguchi Y (září 1997). „Lektinové domény lektikanu typu C, rodina agregujících proteoglykanů chondroitinsulfátu, váží tenascin-R prostřednictvím interakcí protein-protein nezávisle na sacharidové části.“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 94 (19): 10116–21. doi:10.1073 / pnas.94.19.10116. PMC 23322. PMID 9294172.
Nakamura H, Fujii Y, Inoki I, Sugimoto K, Tanzawa K, Matsuki H, Miura R, Yamaguchi Y, Okada Y (prosinec 2000). „Brevican je degradován matricovými metaloproteinázami a agrekanázou-1 (ADAMTS4) na různých místech“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (49): 38885–90. doi:10,1074 / jbc.M003875200. PMID 10986281.
Olin AI, Mörgelin M, Sasaki T, Timpl R, Heinegård D, Aspberg A (leden 2001). „Proteoglykany agrekan a Versican vytvářejí sítě s fibulinem-2 prostřednictvím vazby na lektinovou doménu“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (2): 1253–61. doi:10,1074 / jbc.M006783200. PMID 11038354.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E, Baker K, Baldwin D, Brush J, Chen J, Chow B, Chui C, Crowley C, Currell B, Deuel B, Dowd P, Eaton D, Foster J, Grimaldi C, Gu Q , Hass PE, Heldens S, Huang A, Kim HS, Klimowski L, Jin Y, Johnson S, Lee J, Lewis L, Liao D, Mark M, Robbie E, Sanchez C, Schoenfeld J, Seshagiri S, Simmons L, Singh J, Smith V, Stinson J, Vagts A, Vandlen R, Watanabe C, Wieand D, Woods K, Xie MH, Yansura D, Yi S, Yu G, Yuan J, Zhang M, Zhang Z, Goddard A, Wood WI, Godowski P, Gray A (říjen 2003). „Iniciativa pro objevování sekretovaných proteinů (SPDI), rozsáhlé úsilí o identifikaci nových lidských sekretovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Výzkum genomu. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Xu XM, Chen Y, Chen J, Yang S, Gao F, Underhill CB, Creswell K, Zhang L (září 2003). „Peptid se třemi hyaluronanovými vazebnými motivy inhibuje růst nádoru a indukuje apoptózu“. Výzkum rakoviny. 63 (18): 5685–90. PMID 14522884.
Bekku Y, Su WD, Hirakawa S, Fässler R, Ohtsuka A, Kang JS, Sanders J, Murakami T, Ninomiya Y, Oohashi T (září 2003). „Molekulární klonování Bral2, nového mozkového specifického vazebného proteinu, a imunohistochemická kolokalizace pomocí brevikanu v perineuronálních sítích“. Molekulární a buněčné neurovědy. 24 (1): 148–59. doi:10.1016 / S1044-7431 (03) 00133-7. PMID 14550776.
Dong Y, Han X, Xue Y, Dong B, Guo X, Hu G, Zhu C, Lu Y (únor 2004). "Vylučovaná brevikanová mRNA je exprimována v hypofýze dospělých potkanů." Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 314 (3): 745–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2003.12.151. PMID 14741698.
Viapiano MS, Bi WL, Piepmeier J, Hockfield S, Matthews RT (srpen 2005). "Nové nádorové specifické izoformy BEHAB / brevican identifikované v lidských maligních gliomech". Výzkum rakoviny. 65 (15): 6726–33. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-0585. PMID 16061654.
Nakada M, Miyamori H, Kita D, Takahashi T, Yamashita J, Sato H, Miura R, Yamaguchi Y, Okada Y (září 2005). „Lidské glioblastomy nadměrně exprimují ADAMTS-5, který degraduje brevican“. Acta Neuropathologica. 110 (3): 239–46. doi:10.1007 / s00401-005-1032-6. PMID 16133547.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000132692 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000004892 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11054543-5] Gary SC, Zerillo CA, Chiang VL, Gaw JU, Gray G, Hockfield S (říjen 2000). „cDNA klonování, chromozomální lokalizace a analýza exprese lidského BEHAB / brevikanu, mozkového specifického proteoglykanu regulovaného během kortikálního vývoje a v gliomu“. Gen. 256 (1–2): 139–47. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00362-0. PMID 11054543.

[pmid11873941-6] Nomoto H, Oohashi T, Hirakawa S, Ueki Y, Ohtsuki H, Ninomiya Y (únor 2002). „Lidské geny BRAL1 a BCAN, které patří do nadrodiny spojovacích modulů, jsou tandemově uspořádány na chromozomu 1q21-23.“ Acta Medica Okayama. 56 (1): 25–9. PMID 11873941.

[entrez-7] „Entrez Gene: BCAN brevican“.

[pmid22537913-8] Frischknecht R, Seidenbecher CI (červenec 2012). "Brevican: klíčový proteoglykan v perisynaptické extracelulární matrici mozku". International Journal of Biochemistry & Cell Biology. 44 (7): 1051–4. doi:10.1016 / j.biocel.2012.03.022. PMID 22537913.

[pmid19067971-9] Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, Widmer DS, Praetorius C, Einarsson SO, Valgeirsdottir S, Bergsteinsdottir K, Schepsky A, Dummer R, Steingrimsson E (prosinec 2008). "Nové cíle MITF identifikované pomocí dvoustupňové strategie DNA microarray". Výzkum pigmentových buněk a melanomu. 21 (6): 665–76. doi:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID 19067971.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]