Kolagen, typ XV, alfa 1 - Collagen, type XV, alpha 1

COL15A1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3N3F
Identifikátory
Aliasy	COL15A1řetězec kolagenu typu XV alfa 1
Externí ID	OMIM: 120325 MGI: 88449 HomoloGene: 1396 Genové karty: COL15A1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	99,070,792 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	47,313,167 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• strukturní složka extracelulární matrice; • aktivita strukturních molekul; • strukturní složka extracelulární matrice udělující pevnost v tahu;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • bazální membrána; • kolagen; • lumen endoplazmatického retikula; • extracelulární exosom; • zastřihovač kolagenu typu XV; • extracelulární oblast; • extracelulární matrix; • extracelulární; • extracelulární matrix obsahující kolagen;
Biologický proces	• kolagenový katabolický proces; • vývoj mnohobuněčných organismů; • diferenciace buněk; • angiogeneze; • signální transdukce; • buněčná adheze; • organizace extracelulární matice;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1306
	12819
	ENSG00000204291
	ENSMUSG00000028339
	P39059
	O35206
	NM_001855
	NM_009928
	NP_001846
	NP_034058
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Kolagenový alfa-1 (XV) řetězec je protein že u lidí je kódován COL15A1 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje alfa řetězec kolagenu typu XV, člena rodiny kolagenů FACIT (kolageny spojené s vlákny s přerušovanými šroubovicemi). Kolagen typu XV má širokou tkáňovou distribuci, ale nejsilnější exprese je lokalizována do zón bazální membrány, takže může fungovat k adhezi bazálních membrán k podkladovému stromatu pojivové tkáně. Studie na myších ukázaly, že nedostatek kolagenu XV je spojen se zhoršením svalů a mikrociev.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000204291 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028339 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Huebner K, Cannizzaro LA, Jabs EW, Kivirikko S, Manzone H, Pihlajaniemi T, Myers JC (prosinec 1992). "Chromozomální přiřazení genu kódujícího nový typ kolagenu (COL15A1) k 9q21 -> q22". Genomika. 14 (2): 220–4. doi:10.1016 / S0888-7543 (05) 80209-5. PMID 1427836.
^ ^A ^b „Entrez Gene: COL15A1 kolagen, typ XV, alfa 1“.

Další čtení

Myers JC, Kivirikko S, Gordon MK a kol. (1992). „Identifikace dříve neznámého lidského kolagenového řetězce, alfa 1 (XV), charakterizovaného rozsáhlými přerušeními v trojšnekové oblasti“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89 (21): 10144–8. doi:10.1073 / pnas.89.21.10144. PMC 50294. PMID 1279671.
Kivirikko S, Heinämäki P, Rehn M a kol. (1994). "Primární struktura řetězce alfa 1 kolagenu lidského typu XV a organizace exon-intron ve 3 'oblasti odpovídajícího genu". J. Biol. Chem. 269 (7): 4773–9. PMID 8106446.
Muragaki Y, Abe N, Ninomiya Y a kol. (1994). „Lidský kolagenový řetězec alfa 1 (XV) obsahuje velkou amino-koncovou ne-trojitou šroubovicovou doménu se strukturou tandemového opakování a homologií s kolagenem alfa 1 (XVIII)“. J. Biol. Chem. 269 (6): 4042–6. PMID 8307960.
Myers JC, Dion AS, Abraham V, Amenta PS (1997). „Kolagen typu XV vykazuje rozsáhlou distribuci v lidských tkáních, ale odlišnou lokalizaci v zónách bazální membrány“. Cell Tissue Res. 286 (3): 493–505. doi:10,1007 / s004410050719. PMID 8929352. S2CID 37769206.
Hägg PM, Hägg PO, Peltonen S, et al. (1997). "Umístění kolagenu typu XV v lidských tkáních a jeho akumulace v intersticiální matrici fibrotické ledviny". Dopoledne. J. Pathol. 150 (6): 2075–86. PMC 1858337. PMID 9176399.
Hägg PM, Muona A, Liétard J a kol. (1998). „Kompletní exon-intronová organizace lidského genu pro řetězec alfa1 kolagenu typu XV (COL15A1) a srovnání s homologním genem COL18A1“. J. Biol. Chem. 273 (28): 17824–31. doi:10.1074 / jbc.273.28.17824. PMID 9651385.
Ramchandran R, Dhanabal M, Volk R a kol. (1999). „Antiangiogenní aktivita restinu, NC10 doména lidského kolagenu XV: srovnání s endostatinem“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 255 (3): 735–9. doi:10.1006 / bbrc.1999.0248. PMID 10049780.
Li D, Clark CC, Myers JC (2000). „Kolagen bazální membrány zóny XV je disulfidově vázaný chondroitinsulfát proteoglykan v lidských tkáních a kultivovaných buňkách“. J. Biol. Chem. 275 (29): 22339–47. doi:10,1074 / jbc.M000519200. PMID 10791950.
Nishi M, Mizushima A, Nakagawara K, Takeshima H (2000). "Charakterizace genů podtypu lidského junktofilinu". Biochem. Biophys. Res. Commun. 273 (3): 920–7. doi:10.1006 / bbrc.2000.3011. PMID 10891348.
Eklund L, Muona A, Liétard J, Pihlajaniemi T (2001). „Struktura myšího kolagenového genu typu XV, Col15a1, srovnání s lidským genem COL15A1 a funkční analýza promotorů obou genů“. Matrix Biol. 19 (6): 489–500. doi:10.1016 / S0945-053X (00) 00090-1. PMID 11068203.
Tomono Y, Naito I, Ando K a kol. (2002). „Epitopem definované monoklonální protilátky proti multiplexinovým kolagenům ukazují, že kolageny typu XV a XVIII jsou exprimovány ve specializovaných bazálních membránách“. Struktura buněk. Funct. 27 (1): 9–20. doi:10.1247 / csf.27.9. PMID 11937714.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Humphray SJ, Oliver K, Hunt AR a kol. (2004). "DNA sekvence a analýza lidského chromozomu 9". Příroda. 429 (6990): 369–74. doi:10.1038 / nature02465. PMC 2734081. PMID 15164053.
Myers JC, Amenta PS, Dion AS a kol. (2007). „Molekulární struktura lidské tkáně typu XV představuje jedinečnou konformaci mezi kolageny“. Biochem. J. 404 (3): 535–44. doi:10.1042 / BJ20070201. PMC 1896284. PMID 17355226.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000204291 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028339 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1427836-5] Huebner K, Cannizzaro LA, Jabs EW, Kivirikko S, Manzone H, Pihlajaniemi T, Myers JC (prosinec 1992). "Chromozomální přiřazení genu kódujícího nový typ kolagenu (COL15A1) k 9q21 -> q22". Genomika. 14 (2): 220–4. doi:10.1016 / S0888-7543 (05) 80209-5. PMID 1427836.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: COL15A1 kolagen, typ XV, alfa 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]