Laminin, alfa 5 - Laminin, alpha 5 - Wikipedia

LAMA5
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2R38
Identifikátory
Aliasy	LAMA5, Laminin, alfa 5, lamininová podjednotka alfa 5
Externí ID	OMIM: 601033 MGI: 105382 HomoloGene: 4060 Genové karty: LAMA5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	62,367,312 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	180,225,859 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita strukturních molekul; • integrinová vazba; • vazba na receptory; • strukturní složka extracelulární matrice;
Buněčná složka	• extracelulární matrix; • komplex laminin-5; • extracelulární oblast; • bazální membrána; • komplex laminin-10; • komplex laminin-11; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • extracelulární; • synaptická štěrbina; • neuromuskulární spojení; • extracelulární matrix obsahující kolagen;
Biologický proces	• vývoj vlasového folikulu; • diferenciace buněk; • regulace embryonálního vývoje; • regulace buněčné migrace; • rozpoznávání buněk; • vývoj embryí; • vývoj plic; • vývoj svalových orgánů; • organizace extracelulární matice; • morfogeneze polarizovaného epitelu; • odontogeneze zubu obsahujícího dentin; • sestava ohniskové adheze; • větvení zapojené do morfogeneze ureterálních pupenů; • regulace buněčné adheze; • buněčná adheze; • regulace buněčné proliferace; • organizace cytoskeletu; • angiogeneze; • migrace buněk neurální lišty; • morfogeneze zvířecích orgánů; • integrinem zprostředkovaná signální dráha; • diferenciace endotelových buněk; • šíření buněk závislé na adhezi; • morfogeneze embryonálního epitelu; • buněčná proliferace; • migrace buněk; • rozvětvená morfogeneze epiteliální trubice; • větvení účastnící se morfogeneze slinných žláz; • cilium morfogeneze; • lokalizace proteinu na plazmatickou membránu; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu; • histogeneze; • buněčná adheze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3911
	16776
	ENSG00000130702
	ENSMUSG00000015647
	O15230
	Q61001
	NM_005560
	NM_001081171
	NP_005551
	NP_001074640
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Lamininová podjednotka alfa-5 je protein že u lidí je kódován LAMA5 gen.^[5]^[6]

Funkce

Složky extracelulární matrice mají nesčetné účinky na tkáně v celém těle. Zejména lamininy, rodina heterotrimerních extracelulárních glykoproteinů, ovlivňují vývoj a integritu tkání v takových různých orgánech, jako jsou ledviny, plíce, kůže a nervový systém. Předpokládá se, že lamininy zprostředkovávají připojení, migraci a organizaci buněk do tkání během embryonálního vývoje interakcí s dalšími složkami extracelulární matrice. Lamininy fungují jako heterotrimerické komplexy alfa, beta a gama řetězců, přičemž každý typ řetězce představuje jinou podrodinu proteinů. Protein kódovaný tímto genem patří do alfa podrodiny lamininových řetězců a je hlavní složkou bazálních membrán. Byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy pro tento gen, ale úplná povaha jedné z nich nebyla stanovena.^[6]

Interakce

Ukázalo se, že laminin, alfa 5 komunikovat s BCAM.^[7]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000130702 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000015647 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Durkin ME, Loechel F, Mattei MG, Gilpin BJ, Albrechtsen R, Wewer UM (červenec 1997). „Tkáňově specifická exprese řetězce alfa5 lidského lamininu a mapování genu na lidský chromozom 20q13.2-13.3 a na distální myší chromozom 2 v blízkosti lokusu pro otrhanou (Ra) mutaci“. FEBS Dopisy. 411 (2–3): 296–300. doi:10.1016 / S0014-5793 (97) 00686-8. PMID 9271224. S2CID 45286880.
^ ^A ^b „Entrez Gene: LAMA5 laminin, alpha 5“.
^ Parsons SF, Lee G, Spring FA, Willig TN, Peters LL, Gimm JA, Tanner MJ, Mohandas N, Anstee DJ, Chasis JA (leden 2001). „Lutheran krevní skupina glykoprotein a jeho nově charakterizovaný myší homolog specificky váží lidský laminin obsahující alfa5 řetězec s vysokou afinitou“. Krev. 97 (1): 312–20. doi:10.1182 / krev.V97.1.312. PMID 11133776.
^ Kikkawa Y, Moulson CL, Virtanen I, Miner JH (listopad 2002). „Identifikace vazebného místa pro glykoprotein luteránské krevní skupiny na lamininu alfa 5 prostřednictvím exprese chimérických lamininových řetězců in vivo“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (47): 44864–9. doi:10,1074 / jbc.M208731200. PMID 12244066.

Další čtení

Utani A, Nomizu M, Yamada Y (leden 1997). „Fibulin-2 se váže na krátká ramena lamininu-5 a lamininu-1 prostřednictvím konzervovaných aminokyselinových sekvencí“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (5): 2814–20. doi:10.1074 / jbc.272.5.2814. PMID 9006922.
Rousselle P, Keene DR, Ruggiero F, Champliaud MF, Rest M, Burgeson RE (srpen 1997). „Laminin 5 váže doménu NC-1 kolagenu typu VII“. The Journal of Cell Biology. 138 (3): 719–28. doi:10.1083 / jcb.138.3.719. PMC 2141627. PMID 9245798.
Tiger CF, Champliaud MF, Pedrosa-Domellof F, Thornell LE, Ekblom P, Gullberg D (listopad 1997). „Přítomnost řetězce lamininu alfa5 a nedostatek řetězce lamininu alfa1 během vývoje lidských svalů a ve svalových dystrofiích“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (45): 28590–5. doi:10.1074 / jbc.272.45.28590. PMID 9353324.
Mrowiec T, Melchar C, Górski A (1998). „Změny v interakcích T buněk s proteiny extracelulární matrix a endotelem zprostředkované HIV-proteiny“. Archivum Immunologiae et Therapiae Experimentalis. 45 (2–3): 255–9. PMID 9597096.
Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (únor 1998). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. IX. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro". Výzkum DNA. 5 (1): 31–9. doi:10.1093 / dnares / 5.1.31. PMID 9628581.
Shimizu H, Hosokawa H, Ninomiya H, Miner JH, Masaki T (duben 1999). „Adheze kultivovaných bovinních aortálních endoteliálních buněk k lamininu-1 zprostředkovaná dystroglykanem“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (17): 11995–2000. doi:10.1074 / jbc.274.17.11995. PMID 10207021.
Syn YJ, Scranton TW, Sunderland WJ, Baek SJ, Miner JH, Sanes JR, Carlson SS (leden 2000). „Synaptický vezikulární protein SV2 je komplexován s lamininem obsahujícím alfa5 na povrchu terminálu nervu“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (1): 451–60. doi:10.1074 / jbc.275.1.451. PMID 10617638.
Köhler D, Kruse M, Stöcker W, Sterchi EE (leden 2000). „Heterologicky nadměrně exprimovaný, afinitně čištěný lidský meprin alfa je funkčně aktivní a štěpí složky bazální membrány in vitro“. FEBS Dopisy. 465 (1): 2–7. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01712-3. PMID 10620696. S2CID 22895580.
Kikkawa Y, Sanzen N, Fujiwara H, Sonnenberg A, Sekiguchi K (březen 2000). „Integrinová vazebná specificita lamininu-10/11: laminin-10/11 je rozpoznáván alfa 3 beta 1, alfa 6 beta 1 a alfa 6 beta 4 integriny“. Journal of Cell Science. 113 (Pt 5) (5): 869–76. PMID 10671376.
Champliaud MF, Virtanen I, Tiger CF, Korhonen M, Burgeson R, Gullberg D (září 2000). „Posttranslační modifikace a asociace beta / gama řetězce řetězců lidského lamininu alfa1 a lamininu alfa5: čištění lamininu-3 z placenty“. Experimentální výzkum buněk. 259 (2): 326–35. doi:10,1006 / excr. 2000,4980. PMID 10964500.
Libby RT, Champliaud MF, Claudepierre T, Xu Y, Gibbons EP, Koch M, Burgeson RE, Hunter DD, Brunken WJ (září 2000). „Lamininová exprese u dospělých a vyvíjející se sítnice: důkazy o dvou nových lamininách CNS“. The Journal of Neuroscience. 20 (17): 6517–28. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-17-06517.2000. PMC 2924637. PMID 10964957.
Pierce RA, Griffin GL, Miner JH, Senior RM (prosinec 2000). "Expresní vzorce lamininu alfa1 a alfa5 v lidských plicích během vývoje". American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology. 23 (6): 742–7. doi:10.1165 / ajrcmb.23.6.4202. PMID 11104726.
Parsons SF, Lee G, Spring FA, Willig TN, Peters LL, Gimm JA, Tanner MJ, Mohandas N, Anstee DJ, Chasis JA (leden 2001). „Lutheran krevní skupina glykoprotein a jeho nově charakterizovaný myší homolog specificky váží lidský laminin obsahující alfa5 řetězec s vysokou afinitou“. Krev. 97 (1): 312–20. doi:10.1182 / krev.V97.1.312. PMID 11133776.
Saghizadeh M, Brown DJ, Castellon R, Chwa M, Huang GH, Ljubimova JY, Rosenberg S, Spirin KS, Stolitenko RB, Adachi W, Kinoshita S, Murphy G, Windsor LJ, Kenney MC, Ljubimov AV (únor 2001). „Nadexprese matrix metaloproteinázy-10 a matrix metaloproteinázy-3 v lidských diabetických rohovkách: možný mechanismus alterací bazální membrány a integrinu“. American Journal of Pathology. 158 (2): 723–34. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 64015-1. PMC 1850323. PMID 11159210.
McArthur CP, Wang Y, Heruth D, Gustafson S (červen 2001). „Amplifikace extracelulární matrice a onkogenů v buněčných liniích lidských slinných žláz s transfektací s expresí lamininu, fibronektinu, kolagenů I, III, IV, c-myc a p53“. Archivy orální biologie. 46 (6): 545–55. doi:10.1016 / S0003-9969 (01) 00014-0. PMID 11311202.
Gagnoux-Palacios L, Allegra M, Spirito F, Pommeret O, Romero C, Ortonne JP, Meneguzzi G (květen 2001). „Krátké rameno řetězce lamininu gama2 hraje klíčovou roli při zabudování lamininu 5 do extracelulární matrice a při adhezi buněk“. The Journal of Cell Biology. 153 (4): 835–50. doi:10.1083 / jcb.153.4.835. PMC 2192378. PMID 11352943.
Nagase T, Kikuno R, Ohara O (srpen 2001). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XXI. Kompletní sekvence 60 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny“. Výzkum DNA. 8 (4): 179–87. doi:10.1093 / dnares / 8.4.179. PMID 11572484.
Doi M, Thyboll J, Kortesmaa J, Jansson K, Iivanainen A, Parvardeh M, Timpl R, Hedin U, Swedenborg J, Tryggvason K (duben 2002). "Rekombinantní lidský laminin-10 (alfa5beta1gamma1). Produkce, čištění a aktivita podporující migraci na vaskulární endoteliální buňky". The Journal of Biological Chemistry. 277 (15): 12741–8. doi:10,1074 / jbc.M111228200. PMID 11821406.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000130702 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000015647 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9271224-5] Durkin ME, Loechel F, Mattei MG, Gilpin BJ, Albrechtsen R, Wewer UM (červenec 1997). „Tkáňově specifická exprese řetězce alfa5 lidského lamininu a mapování genu na lidský chromozom 20q13.2-13.3 a na distální myší chromozom 2 v blízkosti lokusu pro otrhanou (Ra) mutaci“. FEBS Dopisy. 411 (2–3): 296–300. doi:10.1016 / S0014-5793 (97) 00686-8. PMID 9271224. S2CID 45286880.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: LAMA5 laminin, alpha 5“.

[pmid11133776-7] Parsons SF, Lee G, Spring FA, Willig TN, Peters LL, Gimm JA, Tanner MJ, Mohandas N, Anstee DJ, Chasis JA (leden 2001). „Lutheran krevní skupina glykoprotein a jeho nově charakterizovaný myší homolog specificky váží lidský laminin obsahující alfa5 řetězec s vysokou afinitou“. Krev. 97 (1): 312–20. doi:10.1182 / krev.V97.1.312. PMID 11133776.

[pmid12244066-8] Kikkawa Y, Moulson CL, Virtanen I, Miner JH (listopad 2002). „Identifikace vazebného místa pro glykoprotein luteránské krevní skupiny na lamininu alfa 5 prostřednictvím exprese chimérických lamininových řetězců in vivo“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (47): 44864–9. doi:10,1074 / jbc.M208731200. PMID 12244066.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]