Kolagen, typ XIX, alfa 1 - Collagen, type XIX, alpha 1

COL19A1
Identifikátory
Aliasy	COL19A1, COL9A1L, D6S228E, kolagen typu XIX alfa 1, řetězec kolagenu typu XIX alfa 1
Externí ID	OMIM: 120165 MGI: 1095415 HomoloGene: 55608 Genové karty: COL19A1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	70,212,468 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	24,587,472 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na bílkoviny, přemostění; • strukturní složka extracelulární matrice; • strukturní složka extracelulární matrice udělující pevnost v tahu;
Buněčná složka	• lumen endoplazmatického retikula; • kolagen; • extracelulární oblast; • extracelulární matrix; • extracelulární; • extracelulární matrix obsahující kolagen;
Biologický proces	• kolagenový katabolický proces; • vývoj mnohobuněčných organismů; • vývoj kosterního systému; • diferenciace buněk; • vývoj svalových orgánů; • vývoj tkáně kosterního svalstva; • organizace extracelulární matice; • buněčná adheze; • buněčná adheze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1310
	12823
	ENSG00000082293
	ENSMUSG00000026141
	Q14993
	Q0VF58
	NM_001858
	NM_007733
	NP_001849
	NP_031759
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Kolagenový alfa-1 (XIX) řetězec je protein že u lidí je kódován COL19A1 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen kóduje alfa řetězec kolagenu typu XIX, člena rodiny kolagenů FACIT (kolageny spojené s vlákny s přerušovanými helixy). I když funkce tohoto kolagenu není známa, nacházejí se další členové této rodiny kolagenů ve spojení s kolageny tvořícími fibrily, jako jsou typy I a II, a slouží k udržení integrity extracelulární matrice. Transkript produkovaný z tohoto genu má neobvykle velký 3 'UTR, který nebyl zcela sekvenován.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000082293 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026141 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Myers JC, Sun MJ, D'Ippolito JA, Jabs EW, Neilson EG, Dion AS (březen 1993). „Lidské cDNA klony transkribované z neobvykle vysoké molekulové hmotnosti RNA kódují nový kolagenový řetězec“. Gen. 123 (2): 211–7. doi:10.1016 / 0378-1119 (93) 90126-N. PMID 7916703.
^ Gerecke DR, Olson PF, Koch M, Knoll JH, Taylor R, Hudson DL, Champliaud MF, Olsen BR, Burgeson RE (červenec 1997). „Kompletní primární struktura dvou variant sestřihu kolagenu XII a přiřazení kolagenu alfa 1 (XII) (COL12A1), kolagenu alfa 1 (IX) (COL9A1) a kolagenu alfa 1 (XIX) (COL19A1) k lidskému chromozomu 6q12- q13 ". Genomika. 41 (2): 236–42. doi:10.1006 / geno.1997.4638. PMID 9143499.
^ ^A ^b „Entrez Gene: COL19A1 kolagen, typ XIX, alfa 1“.

Další čtení

Yoshioka H, Zhang H, Ramirez F a kol. (1992). „Synteny mezi lokusy pro nový kolagenový lokus podobný FACIT (D6S228E) a alfa 1 (IX) kolagen (COL9A1) na 6q12-q14 u lidí“. Genomika. 13 (3): 884–6. doi:10.1016 / 0888-7543 (92) 90176-S. PMID 1639419.
Inoguchi K, Yoshioka H, Khaleduzzaman M, Ninomiya Y (1995). „MRNA pro kolagenový řetězec alfa 1 (XIX), nový člen FACIT, obsahuje dlouhou neobvyklou 3 'nepřeloženou oblast a zobrazuje mnoho jedinečných variant sestřihu“. J. Biochem. 117 (1): 137–46. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a124700. PMID 7775380.
Myers JC, Yang H, D'Ippolito JA a kol. (1994). „Tříšroubovicová oblast kolagenu lidského typu XIX se skládá z několika kolagenních subdomén a vykazuje omezenou sekvenční homologii k alfa 1 (XVI)“. J. Biol. Chem. 269 (28): 18549–57. PMID 8034603.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Sumiyoshi H, Inoguchi K, Khaleduzzaman M a kol. (1997). „Všudypřítomná exprese genu pro kolagen alfa1 (XIX) (Col19a1) během myší embryogeneze je omezena na několik tkání v dospělém organismu“. J. Biol. Chem. 272 (27): 17104–11. doi:10.1074 / jbc.272.27.17104. PMID 9202028.
Khaleduzzaman M, Sumiyoshi H, Ueki Y a kol. (1998). „Struktura genu kolagenu lidského typu XIX (COL19A1), který naznačuje, že vznikl z genu předků rodiny FACIT“. Genomika. 45 (2): 304–12. doi:10.1006 / geno.1997.4921. PMID 9344653.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Myers JC, Li D, Amenta PS a kol. (2003). „Kolagen typu XIX purifikovaný z lidské pupeční šňůry je charakterizován několika ostrými zlomy vymezujícími kolagenní subdomény a intermolekulárními agregáty prostřednictvím globulárních, disulfidově vázaných a heparin vázajících amino konců“. J. Biol. Chem. 278 (34): 32047–57. doi:10,1074 / jbc.M304629200. PMID 12788917.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK a kol. (2003). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 6“. Příroda. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003 Natur.425..805M. doi:10.1038 / nature02055. PMID 14574404.
Käpylä J, Jäälinoja J, Tulla M a kol. (2005). „Kolagen IX spojený s vlákny poskytuje nový mechanismus adheze buněk k chrupavkové matrici“. J. Biol. Chem. 279 (49): 51677–87. doi:10,1074 / jbc.M409412200. PMID 15383545.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000082293 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026141 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7916703-5] Myers JC, Sun MJ, D'Ippolito JA, Jabs EW, Neilson EG, Dion AS (březen 1993). „Lidské cDNA klony transkribované z neobvykle vysoké molekulové hmotnosti RNA kódují nový kolagenový řetězec“. Gen. 123 (2): 211–7. doi:10.1016 / 0378-1119 (93) 90126-N. PMID 7916703.

[pmid9143499-6] Gerecke DR, Olson PF, Koch M, Knoll JH, Taylor R, Hudson DL, Champliaud MF, Olsen BR, Burgeson RE (červenec 1997). „Kompletní primární struktura dvou variant sestřihu kolagenu XII a přiřazení kolagenu alfa 1 (XII) (COL12A1), kolagenu alfa 1 (IX) (COL9A1) a kolagenu alfa 1 (XIX) (COL19A1) k lidskému chromozomu 6q12- q13 ". Genomika. 41 (2): 236–42. doi:10.1006 / geno.1997.4638. PMID 9143499.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: COL19A1 kolagen, typ XIX, alfa 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]