ITPR1 - ITPR1

ITPR1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1N4K, 1XZZ
Identifikátory
Aliasy	ITPR1, ACV, CLA4, INSP3R1, IP3R, IP3R1, PPP1R94, SCA15, SCA16, SCA29, inositol 1,4,5-trisfosfátový receptor typu 1
Externí ID	OMIM: 147265 MGI: 96623 HomoloGene: 1673 Genové karty: ITPR1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	4,847,840 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	108,551,109 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita inhibitoru kalciového kanálu; • aktivita vápníkového kanálu; • aktivita kanálu uvolňování vápníku citlivého na inositol 1,4,5-trisfosfát; • aktivita transmembránového transportéru iontů vápníku; • aktivita iontového kanálu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba fosfatidylinositolu; • aktivita kanálu uvolňujícího vápník; • vazba iontů vápníku; • vazba inositol 1,4,5 trisfosfátu; • aktivita receptoru inositol 1,4,5-trisfosfátu podílející se na regulaci postsynaptických hladin vápníku v cytosolu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • integrální součást membrány; • destičková hustá trubicová síť; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota; • jaderný obal; • komplex kalcineurin; • sarkoplazmatické retikulum; • jaderná vnitřní membrána; • destičková hustá granulární membrána; • jádro; • destičková hustá trubicová síťová membrána; • buněčná membrána; • transportní vezikulární membrána; • cytoplazmatický váček; • perinukleární oblast cytoplazmy; • endoplazmatické retikulum; • cytoplazmatická vezikulární membrána; • sekreční granulovaná membrána; • makromolekulární komplex; • Schafferův kolaterál - CA1 synapse;
Biologický proces	• uvolňování sekvestrovaného iontu vápníku do cytosolu; • regulace srdečního vedení; • reakce na hypoxii; • dobrovolný pohybový aparát; • regulace sekrece inzulínu; • transport epiteliální tekutiny; • iontový transport; • post-embryonální vývoj; • endoplazmatické retikulum homeostáza vápenatých iontů; • aktivace krevních destiček; • vnitřní apoptotická signální dráha v reakci na stres endoplazmatického retikula; • regulace autofagie; • transmembránová doprava; • transmembránový transport vápenatých iontů; • negativní regulace vápníkem zprostředkované signalizace; • signalizace zprostředkovaná inositol fosfátem; • transport iontů vápníku; • apoptotický proces; • signální transdukce; • regulace molekulární funkce; • doprava; • regulace postsynaptické koncentrace cytosolického vápníkového iontu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3708
	16438
	ENSG00000150995
	ENSMUSG00000030102
	Q14643
	P11881
	NM_001099952; NM_001168272; NM_002222; NM_001378452
	NM_010585
	NP_001093422; NP_001161744; NP_002213
	NP_034715
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Inositol 1,4,5-trisfosfátový receptor typu 1 je protein že u lidí je kódován ITPR1 gen.^[5]^[6]^[7]^[8]^[9]

Interakce

Bylo prokázáno, že ITPR1 komunikovat s:

Viz také

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000150995 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030102 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Yamada N, Makino Y, Clark RA, Pearson DW, Mattei MG, Guénet JL, Ohama E, Fujino I, Miyawaki A, Furuichi T (září 1994). „Lidský inositol 1,4,5-trisfosfátový receptor typu 1, InsP3R1: struktura, funkce, regulace exprese a chromozomální lokalizace“. The Biochemical Journal. 302 (Pt 3): 781–90. doi:10.1042 / bj3020781. PMC 1137299. PMID 7945203.
^ Nucifora FC, Li SH, Danoff S, Ullrich A, Ross CA (září 1995). "Molekulární klonování cDNA pro lidský inositol 1,4,5-trisfosfátový receptor typu 1 a identifikace třetí alternativně sestříhané varianty". Výzkum mozku. Molekulární výzkum mozku. 32 (2): 291–6. doi:10.1016 / 0169-328X (95) 00089-B. PMID 7500840.
^ van de Leemput J, Chandran J, Knight MA, Holtzclaw LA, Scholz S, Cookson MR, Houlden H, Gwinn-Hardy K, Fung HC, Lin X, Hernandez D, Simon-Sanchez J, Wood NW, Giunti P, Rafferty I , Hardy J, Storey E, Gardner RJ, Forrest SM, Fisher EM, Russell JT, Cai H, Singleton AB (červen 2007). „Delece na ITPR1 je základem ataxie u myší a spinocerebelární ataxie 15 u lidí“. Genetika PLOS. 3 (6): e108. doi:10.1371 / journal.pgen.0030108. PMC 1892049. PMID 17590087.
^ Iwaki A, Kawano Y, Miura S, Shibata H, Matsuse D, Li W, Furuya H, Ohyagi Y, Taniwaki T, Kira J, Fukumaki Y (leden 2008). "Heterozygotní delece ITPR1, ale nikoli SUMF1, u spinocerebelární ataxie typu 16". Journal of Medical Genetics. 45 (1): 32–5. doi:10.1136 / jmg.2007.053942. PMID 17932120. S2CID 7730102.
^ „Entrez Gene: ITPR1 inositol 1,4,5-trifosfátový receptor, typ 1“.
^ Ando H, Mizutani A, Matsu-ura T, Mikoshiba K (březen 2003). „IRBIT, nový protein vázající receptor inositol 1,4,5-trisfosfát (IP3), se uvolňuje z receptoru IP3 po vazbě IP3 na receptor“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (12): 10602–12. doi:10,1074 / jbc.M210119200. PMID 12525476.
^ Hirota J, Ando H, Hamada K, Mikoshiba K (červen 2003). „Protein související s karboanhydrázou je nový vazebný protein pro inositol 1,4,5-trisfosfátový receptor typu 1“. The Biochemical Journal. 372 (Pt 2): 435–41. doi:10.1042 / BJ20030110. PMC 1223404. PMID 12611586.
^ Maximov A, Tang TS, Bezprozvanny I (únor 2003). „Sdružení inositol (1,4,5) -trisfosfátového receptoru typu 1 s 4,1 N proteinem v neuronech“. Molekulární a buněčné neurovědy. 22 (2): 271–83. doi:10.1016 / s1044-7431 (02) 00027-1. PMID 12676536. S2CID 2317354.
^ MacMillan D, Currie S, Bradley KN, Muir TC, McCarron JG (prosinec 2005). „V hladkém svalu moduluje protein vázající FK506 uvolňování Ca2 + vyvolané receptorem IP3 mTOR a kalcineurinem“. Journal of Cell Science. 118 (Pt 23): 5443–51. doi:10.1242 / jcs.02657. PMID 16278292.
^ Cameron AM, Nucifora FC, Fung ET, Livingston DJ, Aldape RA, Ross CA, Snyder SH (říjen 1997). „FKBP12 váže inositol 1,4,5-trisfosfátový receptor na leucin-prolin (1400-1401) a ukotví kalcineurin k této doméně podobné FK506“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (44): 27582–8. doi:10.1074 / jbc.272.44.27582. PMID 9346894.
^ ^A ^b Schlossmann J, Ammendola A, Ashman K, Zong X, Huber A, Neubauer G, Wang GX, Allescher HD, Korth M, Wilm M, Hofmann F, Ruth P (březen 2000). "Regulace intracelulárního vápníku signalizačním komplexem IRAG, IP3 receptoru a cGMP kinázy Ibeta". Příroda. 404 (6774): 197–201. doi:10.1038/35004606. PMID 10724174. S2CID 205004996.
^ Mehta D, Ahmmed GU, Paria BC, Holinstat M, Voyno-Yasenetskaya T, Tiruppathi C, Minshall RD, Malik AB (srpen 2003). "RhoA interakce s inositol 1,4,5-trisfosfátovým receptorem a přechodným receptorovým potenciálním kanálem-1 reguluje vstup Ca2 +. Role v signalizaci zvyšuje endoteliální propustnost". The Journal of Biological Chemistry. 278 (35): 33492–500. doi:10,1074 / jbc.M302401200. PMID 12766172.
^ Yuan JP, Kiselyov K, Shin DM, Chen J, Shcheynikov N, Kang SH, Dehoff MH, Schwarz MK, Seeburg PH, Muallem S, Worley PF (září 2003). "Homer váže kanály rodiny TRPC a je vyžadován pro navádění TRPC1 na receptory IP3". Buňka. 114 (6): 777–89. doi:10.1016 / s0092-8674 (03) 00716-5. PMID 14505576. S2CID 10552676.
^ Mery L, Magnino F, Schmidt K, Krause KH, Dufour JF (leden 2001). „Alternativní sestřihové varianty hTrp4 rozdílně interagují s C-koncovou částí inositol 1,4,5-trisfosfátových receptorů“. FEBS Dopisy. 487 (3): 377–83. doi:10.1016 / s0014-5793 (00) 02362-0. PMID 11163362. S2CID 44945442.

Další čtení

Sporák V, Verhasselt B (leden 2006). "Modelování brzlíkových účinků HIV-1 Nef". Současný výzkum HIV. 4 (1): 57–64. doi:10.2174/157016206775197583. PMID 16454711.
Joseph SK, Lin C, Pierson S, Thomas AP, Maranto AR (říjen 1995). "Heteroligomery receptorů inositol trifosfátu typu I a typu III v epiteliálních buňkách jater potkana WB". The Journal of Biological Chemistry. 270 (40): 23310–6. doi:10.1074 / jbc.270.40.23310. PMID 7559486.
Harnick DJ, Jayaraman T, Ma Y, Mulieri P, Go LO, Marks AR (únor 1995). „Lidský inositol 1,4,5-trisfosfátový receptor typu 1 z T lymfocytů. Struktura, lokalizace a fosforylace tyrosinu“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (6): 2833–40. doi:10.1074 / jbc.270.6.2833. PMID 7852357.
Wojcikiewicz RJ, Furuichi T, Nakade S, Mikoshiba K, Nahorski SR (březen 1994). „Aktivace muskarinového receptoru down-reguluje inositol 1,4,5-trisfosfátový receptor typu I urychlením jeho degradace“. The Journal of Biological Chemistry. 269 (11): 7963–9. PMID 8132516.
Komalavilas P, Lincoln TM (březen 1994). "Fosforylace inositol 1,4,5-trisfosfátového receptoru cyklickou GMP-dependentní proteinovou kinázou". The Journal of Biological Chemistry. 269 (12): 8701–7. PMID 8132598.
Cameron AM, Steiner JP, Roskams AJ, Ali SM, Ronnett GV, Snyder SH (listopad 1995). „Kalcineurin spojený s komplexem inositol 1,4,5-trisfosfátový receptor-FKBP12 moduluje tok Ca2 +“. Buňka. 83 (3): 463–72. doi:10.1016/0092-8674(95)90124-8. PMID 8521476. S2CID 11594556.
Yan J, Khanna KK, Lavin MF (květen 1996). "Indukce genů receptoru inositol 1,4,5 trisfosfátu ionizujícím zářením". International Journal of Radiation Biology. 69 (5): 539–46. doi:10.1080/095530096145544. PMID 8648241.
Quinton TM, Dean WL (červenec 1996). „V krevních destičkách je přítomno více izoforem inositol 1,4,5-trisfosfátového receptoru. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 224 (3): 740–6. doi:10.1006 / bbrc.1996.1093. PMID 8713116.
Cameron AM, Nucifora FC, Fung ET, Livingston DJ, Aldape RA, Ross CA, Snyder SH (říjen 1997). „FKBP12 váže inositol 1,4,5-trisfosfátový receptor na leucin-prolin (1400-1401) a ukotví kalcineurin k této doméně podobné FK506“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (44): 27582–8. doi:10.1074 / jbc.272.44.27582. PMID 9346894.
Deelman LE, Jonk LJ, Henning RH (leden 1998). "Izolace a charakterizace promotoru lidského inositol 1,4,5-trisfosfátového receptoru typu 1". Gen. 207 (2): 219–25. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00630-6. PMID 9511764.
Martin C, Chapman KE, Seckl JR, Ashley RH (červenec 1998). „Částečné klonování a diferenciální exprese genů kanálu pro uvolňování ryanodinového kanálu / vápníku v lidských tkáních, včetně hipokampu a mozečku“. Neurovědy. 85 (1): 205–16. doi:10.1016 / S0306-4522 (97) 00612-X. PMID 9607712. S2CID 25634042.
Tu JC, Xiao B, Yuan JP, Lanahan AA, Leoffert K, Li M, Linden DJ, Worley PF (říjen 1998). „Homer váže nový motiv bohatý na prolin a spojuje metabotropní glutamátové receptory skupiny 1 s receptory IP3“. Neuron. 21 (4): 717–26. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80589-9. PMID 9808459. S2CID 2851554.
Kiselyov K, Xu X, Mozhayeva G, Kuo T, Pessah I, Mignery G, Zhu X, Birnbaumer L, Muallem S (prosinec 1998). "Funkční interakce mezi receptory InsP3 a kanály Htrp3 provozovanými v obchodě". Příroda. 396 (6710): 478–82. doi:10.1038/24890. PMID 9853757. S2CID 4423316.
Lin P, Yao Y, Hofmeister R, Tsien RY, Farquhar MG (duben 1999). „Nadměrná exprese CALNUC (nukleobindin) zvyšuje agonistu a thapsigargin uvolnitelné ukládání Ca2 + v Golgi“. The Journal of Cell Biology. 145 (2): 279–89. doi:10.1083 / jcb.145.2.279. PMC 2133108. PMID 10209024.
Schlossmann J, Ammendola A, Ashman K, Zong X, Huber A, Neubauer G, Wang GX, Allescher HD, Korth M, Wilm M, Hofmann F, Ruth P (březen 2000). "Regulace intracelulárního vápníku signalizačním komplexem IRAG, IP3 receptoru a cGMP kinázy Ibeta". Příroda. 404 (6774): 197–201. doi:10.1038/35004606. PMID 10724174. S2CID 205004996.
Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, Briones MR, Nagai MA, da Silva W, Zago MA, Bordin S, Costa FF, Goldman GH, Carvalho AF, Matsukuma A, Baia GS, Simpson DH, Brunstein A, de Oliveira PS, Bucher P, Jongeneel CV, O'Hare MJ, Soares F, Brentani RR, Reis LF, de Souza SJ, Simpson AJ (březen 2000). "Brokovnicové sekvenování lidského transkriptomu se značkami sekvencí exprimovanými ORF". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (7): 3491–6. doi:10.1073 / pnas.97.7.3491. PMC 16267. PMID 10737800.
Mayne M, Holden CP, Nath A, Geiger JD (červen 2000). „Uvolňování vápníku z zásob regulovaných receptorem inositol 1,4,5-trisfosfátu pomocí HIV-1 Tat reguluje produkci TNF-alfa v lidských makrofágech“. Journal of Immunology. 164 (12): 6538–42. doi:10,4049 / jimmunol.164.12.6538. PMID 10843712.
Tanimura A, Tojyo Y, Turner RJ (září 2000). „Důkazy, že inositol 1,4,5-trisfosfátové receptory typu I, II a III se mohou objevit jako integrální proteiny plazmatické membrány“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (35): 27488–93. doi:10,1074 / jbc.M004495200. PMID 10874040.

externí odkazy

ITPR1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
GeneReviews / NCBI / NIH / UW vstup na Spinocerebellar Ataxia Type 15

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000150995 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030102 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7945203-5] Yamada N, Makino Y, Clark RA, Pearson DW, Mattei MG, Guénet JL, Ohama E, Fujino I, Miyawaki A, Furuichi T (září 1994). „Lidský inositol 1,4,5-trisfosfátový receptor typu 1, InsP3R1: struktura, funkce, regulace exprese a chromozomální lokalizace“. The Biochemical Journal. 302 (Pt 3): 781–90. doi:10.1042 / bj3020781. PMC 1137299. PMID 7945203.

[pmid7500840-6] Nucifora FC, Li SH, Danoff S, Ullrich A, Ross CA (září 1995). "Molekulární klonování cDNA pro lidský inositol 1,4,5-trisfosfátový receptor typu 1 a identifikace třetí alternativně sestříhané varianty". Výzkum mozku. Molekulární výzkum mozku. 32 (2): 291–6. doi:10.1016 / 0169-328X (95) 00089-B. PMID 7500840.

[pmid17590087-7] van de Leemput J, Chandran J, Knight MA, Holtzclaw LA, Scholz S, Cookson MR, Houlden H, Gwinn-Hardy K, Fung HC, Lin X, Hernandez D, Simon-Sanchez J, Wood NW, Giunti P, Rafferty I , Hardy J, Storey E, Gardner RJ, Forrest SM, Fisher EM, Russell JT, Cai H, Singleton AB (červen 2007). „Delece na ITPR1 je základem ataxie u myší a spinocerebelární ataxie 15 u lidí“. Genetika PLOS. 3 (6): e108. doi:10.1371 / journal.pgen.0030108. PMC 1892049. PMID 17590087.

[pmid17932120-8] Iwaki A, Kawano Y, Miura S, Shibata H, Matsuse D, Li W, Furuya H, Ohyagi Y, Taniwaki T, Kira J, Fukumaki Y (leden 2008). "Heterozygotní delece ITPR1, ale nikoli SUMF1, u spinocerebelární ataxie typu 16". Journal of Medical Genetics. 45 (1): 32–5. doi:10.1136 / jmg.2007.053942. PMID 17932120. S2CID 7730102.

[entrez-9] „Entrez Gene: ITPR1 inositol 1,4,5-trifosfátový receptor, typ 1“.

[pmid12525476-10] Ando H, Mizutani A, Matsu-ura T, Mikoshiba K (březen 2003). „IRBIT, nový protein vázající receptor inositol 1,4,5-trisfosfát (IP3), se uvolňuje z receptoru IP3 po vazbě IP3 na receptor“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (12): 10602–12. doi:10,1074 / jbc.M210119200. PMID 12525476.

[pmid12611586-11] Hirota J, Ando H, Hamada K, Mikoshiba K (červen 2003). „Protein související s karboanhydrázou je nový vazebný protein pro inositol 1,4,5-trisfosfátový receptor typu 1“. The Biochemical Journal. 372 (Pt 2): 435–41. doi:10.1042 / BJ20030110. PMC 1223404. PMID 12611586.

[pmid12676536-12] Maximov A, Tang TS, Bezprozvanny I (únor 2003). „Sdružení inositol (1,4,5) -trisfosfátového receptoru typu 1 s 4,1 N proteinem v neuronech“. Molekulární a buněčné neurovědy. 22 (2): 271–83. doi:10.1016 / s1044-7431 (02) 00027-1. PMID 12676536. S2CID 2317354.

[pmid16278292-13] MacMillan D, Currie S, Bradley KN, Muir TC, McCarron JG (prosinec 2005). „V hladkém svalu moduluje protein vázající FK506 uvolňování Ca2 + vyvolané receptorem IP3 mTOR a kalcineurinem“. Journal of Cell Science. 118 (Pt 23): 5443–51. doi:10.1242 / jcs.02657. PMID 16278292.

[pmid9346894-14] Cameron AM, Nucifora FC, Fung ET, Livingston DJ, Aldape RA, Ross CA, Snyder SH (říjen 1997). „FKBP12 váže inositol 1,4,5-trisfosfátový receptor na leucin-prolin (1400-1401) a ukotví kalcineurin k této doméně podobné FK506“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (44): 27582–8. doi:10.1074 / jbc.272.44.27582. PMID 9346894.

[pmid10724174-15] A ^b Schlossmann J, Ammendola A, Ashman K, Zong X, Huber A, Neubauer G, Wang GX, Allescher HD, Korth M, Wilm M, Hofmann F, Ruth P (březen 2000). "Regulace intracelulárního vápníku signalizačním komplexem IRAG, IP3 receptoru a cGMP kinázy Ibeta". Příroda. 404 (6774): 197–201. doi:10.1038/35004606. PMID 10724174. S2CID 205004996.

[pmid12766172-16] Mehta D, Ahmmed GU, Paria BC, Holinstat M, Voyno-Yasenetskaya T, Tiruppathi C, Minshall RD, Malik AB (srpen 2003). "RhoA interakce s inositol 1,4,5-trisfosfátovým receptorem a přechodným receptorovým potenciálním kanálem-1 reguluje vstup Ca2 +. Role v signalizaci zvyšuje endoteliální propustnost". The Journal of Biological Chemistry. 278 (35): 33492–500. doi:10,1074 / jbc.M302401200. PMID 12766172.

[pmid14505576-17] Yuan JP, Kiselyov K, Shin DM, Chen J, Shcheynikov N, Kang SH, Dehoff MH, Schwarz MK, Seeburg PH, Muallem S, Worley PF (září 2003). "Homer váže kanály rodiny TRPC a je vyžadován pro navádění TRPC1 na receptory IP3". Buňka. 114 (6): 777–89. doi:10.1016 / s0092-8674 (03) 00716-5. PMID 14505576. S2CID 10552676.

[pmid11163362-18] Mery L, Magnino F, Schmidt K, Krause KH, Dufour JF (leden 2001). „Alternativní sestřihové varianty hTrp4 rozdílně interagují s C-koncovou částí inositol 1,4,5-trisfosfátových receptorů“. FEBS Dopisy. 487 (3): 377–83. doi:10.1016 / s0014-5793 (00) 02362-0. PMID 11163362. S2CID 44945442.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]