FKBP1A - FKBP1A - Wikipedia
Peptidyl-prolyl cis-trans izomeráza FKBP1A je enzym že u lidí je kódován FKBP1A gen.[5]
Funkce
Protein kódovaný tímto genem je členem imunofilin rodina proteinů, které hrají roli v imunoregulaci a základních buněčných procesech zahrnujících skládání a obchodování s proteiny. Tímto kódovaným proteinem je cis-trans prolyl izomeráza, která se váže na imunosupresiva FK506 (takrolimus) a rapamycin (sirolimus). Interaguje s několika proteiny intracelulární signální transdukce, včetně receptoru TGF-beta typu I. Interaguje také s několika intracelulárními kanály pro uvolňování vápníku, včetně tetramerického receptoru ryanodinu v kosterním svalu. U myší delece tohoto homologního genu způsobuje vrozenou srdeční poruchu známou jako nekompakce myokardu levé komory. Existují důkazy o mnoha alternativně sestříhaných variantách transkriptu pro tento gen, ale u některých variant nebyla stanovena celá délka.[6]
Interakce
Bylo prokázáno, že FKBP1A komunikovat s:
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000088832 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032966 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ DiLella AG (září 1991). "Chromozomální přiřazení genu lidského imunofilinu FKBP-12". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 179 (3): 1427–33. doi:10.1016 / 0006-291X (91) 91732-R. PMID 1930186.
- ^ „Entrez Gene: FKBP1A FK506 binding protein 1A, 12kDa“.
- ^ Chambraud B, Radanyi C, Camonis JH, Shazand K, Rajkowski K, Baulieu EE (prosinec 1996). "FAP48, nový protein, který tvoří specifické komplexy s oběma imunofiliny FKBP59 a FKBP12. Prevence pomocí imunosupresiv FK506 a rapamycinu". The Journal of Biological Chemistry. 271 (51): 32923–9. doi:10.1074 / jbc.271.51.32923. PMID 8955134.
- ^ Neye H (březen 2001). „Mutace proteinu 48 asociovaného s FKBP (FAP48) na prolin 219 narušuje interakci s FKBP12 a FKBP52“. Regulační peptidy. 97 (2–3): 147–52. doi:10.1016 / s0167-0115 (00) 00206-8. PMID 11164950. S2CID 20617551.
- ^ MacMillan D, Currie S, Bradley KN, Muir TC, McCarron JG (prosinec 2005). „V hladkém svalu moduluje protein vázající FK506 uvolňování Ca2 + vyvolané receptorem IP3 mTOR a kalcineurinem“. Journal of Cell Science. 118 (Pt 23): 5443–51. doi:10.1242 / jcs.02657. PMID 16278292.
- ^ Cameron AM, Nucifora FC, Fung ET, Livingston DJ, Aldape RA, Ross CA, Snyder SH (říjen 1997). „FKBP12 váže inositol 1,4,5-trisfosfátový receptor na leucin-prolin (1400-1401) a ukotví kalcineurin k této doméně podobné FK506“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (44): 27582–8. doi:10.1074 / jbc.272.44.27582. PMID 9346894.
- ^ A b Jacinto E, Loewith R, Schmidt A, Lin S, Rüegg MA, hala A, hala MN (listopad 2004). „Savčí komplex TOR 2 řídí cytoskelet aktinů a je necitlivý na rapamycin.“ Přírodní buněčná biologie. 6 (11): 1122–8. doi:10.1038 / ncb1183. PMID 15467718. S2CID 13831153.
- ^ A b Sarbassov DD, Ali SM, Kim DH, Guertin DA, Latek RR, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Sabatini DM (červenec 2004). „Rictor, nový vazebný partner mTOR, definuje cestu citlivou na rapamycin a nezávislou na raptoru, která reguluje cytoskeleton“. Aktuální biologie. 14 (14): 1296–302. doi:10.1016 / j.cub.2004.06.054. PMID 15268862. S2CID 4658268.
- ^ Choi J, Chen J, Schreiber SL, Clardy J (červenec 1996). "Struktura komplexu FKBP12-rapamycin interagující s vazebnou doménou lidského FRAP". Věda. 273 (5272): 239–42. doi:10.1126 / science.273.5272.239. PMID 8662507. S2CID 27706675.
- ^ Luker KE, Smith MC, Luker GD, Gammon ST, Piwnica-Worms H, Piwnica-Worms D (srpen 2004). „Kinetika regulovaných interakcí protein-protein odhalena pomocí zobrazení komplementu luciferázy světlušky v buňkách a živých zvířatech“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 101 (33): 12288–93. doi:10.1073 / pnas.0404041101. PMC 514471. PMID 15284440.
- ^ Banaszynski LA, Liu CW, Wandless TJ (duben 2005). "Charakterizace ternárního komplexu FKBP.rapamycin.FRB". Journal of the American Chemical Society. 127 (13): 4715–21. doi:10.1021 / ja043277y. PMID 15796538.
- ^ Sabres CJ, Martin MM, Brunn GJ, Williams JM, Dumont FJ, Wiederrecht G, Abraham RT (leden 1995). "Izolace proteinového cíle komplexu FKBP12-rapamycin v savčích buňkách". The Journal of Biological Chemistry. 270 (2): 815–22. doi:10.1074 / jbc.270.2.815. PMID 7822316.
- ^ Avila G, Lee EH, Perez CF, Allen PD, Dirksen RT (červen 2003). „Vazba FKBP12 na RyR1 moduluje vazbu excitace-kontrakce v myotubech myších kostí“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (25): 22600–8. doi:10,1074 / jbc.M205866200. PMID 12704193.
- ^ Bultynck G, De Smet P, Rossi D, Callewaert G, Missiaen L, Sorrentino V, De Smedt H, Parys JB (březen 2001). "Charakterizace a mapování 12 kDa vazebného místa pro protein FK506 (FKBP12) na různých izoformách receptoru ryanodinu a receptoru inositol 1,4,5-trisfosfátu". The Biochemical Journal. 354 (Pt 2): 413–22. doi:10.1042 / bj3540413. PMC 1221670. PMID 11171121.
- ^ Gaburjakova M, Gaburjakova J, Reiken S, Huang F, Marx SO, Rosemblit N, Marks AR (květen 2001). „Vazba FKBP12 moduluje hradlování kanálu receptoru ryanodinu“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (20): 16931–5. doi:10,1074 / jbc.M100856200. PMID 11279144.
- ^ Wang T, Donahoe PK, Zervos AS (červenec 1994). „Specifická interakce receptorů typu I rodiny TGF-beta s imunofilinem FKBP-12“. Věda. 265 (5172): 674–6. doi:10.1126 / science.7518616. PMID 7518616.
- ^ Liu F, Ventura F, Doody J, Massagué J (červenec 1995). „Lidský receptor typu II pro kostní morfogenní proteiny (BMP): rozšíření modelu receptoru dvou kináz na BMP“. Molekulární a buněčná biologie. 15 (7): 3479–86. doi:10,1128 / mcb.15.7.3479. PMC 230584. PMID 7791754.
Další čtení
- Schiene-Fischer C, Yu C (duben 2001). "Pomocné enzymy skládání pomocných enzymů: funkční role peptidyl prolyl cis / trans izomeráz". FEBS Dopisy. 495 (1–2): 1–6. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 02326-2. PMID 11322937. S2CID 42263861.
- DiLella AG, Hawkins A, Craig RJ, Schreiber SL, Griffin CA (prosinec 1992). "Přiřazení chromozomálních pásem genů kódujících lidský FKBP12 a FKBP13". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 189 (2): 819–23. doi:10.1016 / 0006-291X (92) 92276-4. PMID 1281998.
- Jayaraman T, Brillantes AM, Timerman AP, Fleischer S, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Marks AR (květen 1992). „FK506 vazebný protein spojený s kanálem uvolňujícím vápník (ryanodinový receptor)“. The Journal of Biological Chemistry. 267 (14): 9474–7. PMID 1374404.
- Lepre CA, Thomson JA, Moore JM (květen 1992). "Struktura řešení FK506 navázaná na FKBP-12". FEBS Dopisy. 302 (1): 89–96. doi:10.1016 / 0014-5793 (92) 80292-O. PMID 1375171. S2CID 41469360.
- Maki N, Sekiguchi F, Nishimaki J, Miwa K, Hayano T, Takahashi N, Suzuki M (červenec 1990). „Doplňková DNA kódující lidský T-buněčný protein vázající FK506, peptidylprolyl cis-trans izomeráza odlišná od cyklofilinu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 87 (14): 5440–3. doi:10.1073 / pnas.87.14.5440. PMC 54340. PMID 1695378.
- Standaert RF, Galat A, Verdine GL, Schreiber SL (srpen 1990). "Molekulární klonování a nadměrná exprese lidského FK506-vázajícího proteinu FKBP". Příroda. 346 (6285): 671–4. doi:10.1038 / 346671a0. PMID 1696686. S2CID 4368221.
- Siekierka JJ, Wiederrecht G, Greulich H, Boulton D, Hung SH, Cryan J, Hodges PJ, Sigal NH (prosinec 1990). „Cytosolický vazebný protein pro imunosupresivum FK-506 je jak všudypřítomný, tak vysoce konzervovaný peptidyl-prolyl cis-trans izomeráza.“ The Journal of Biological Chemistry. 265 (34): 21011–5. PMID 1701173.
- Michnick SW, Rosen MK, Wandless TJ, Karplus M, Schreiber SL (květen 1991). "Struktura roztoku FKBP, rotamázového enzymu a receptoru pro FK506 a rapamycin". Věda. 252 (5007): 836–9. doi:10.1126 / science.1709301. PMID 1709301. S2CID 28289138.
- Van Duyne GD, Standaert RF, Karplus PA, Schreiber SL, Clardy J (květen 1991). „Atomová struktura FKBP-FK506, komplexu imunofilin-imunosupresivum“. Věda. 252 (5007): 839–42. doi:10.1126 / science.1709302. PMID 1709302. S2CID 32539611.
- Rosen MK, Michnick SW, Karplus M, Schreiber SL (květen 1991). "Sekvenční přiřazení protonu a dusíku a stanovení sekundární struktury lidského proteinu vázajícího FK506 a rapamycin". Biochemie. 30 (19): 4774–89. CiteSeerX 10.1.1.559.2890. doi:10.1021 / bi00233a020. PMID 1709363.
- Jin YJ, Albers MW, Lane WS, Bierer BE, Schreiber SL, Burakoff SJ (srpen 1991). "Molekulární klonování membránově asociovaného lidského proteinu vázajícího FK506 a rapamycin, FKBP-13". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 88 (15): 6677–81. doi:10.1073 / pnas.88.15.6677. PMC 52151. PMID 1713687.
- DiLella AG, Craig RJ (září 1991). "Exonová organizace lidského genu FKBP-12: korelace se strukturálními a funkčními proteinovými doménami". Biochemie. 30 (35): 8512–7. doi:10.1021 / bi00099a002. PMID 1716149.
- Harding MW, Galat A, Uehling DE, Schreiber SL (říjen 1989). „Receptorem pro imunosupresivum FK506 je cis-trans peptidyl-prolyl izomeráza.“ Příroda. 341 (6244): 758–60. doi:10.1038 / 341758a0. PMID 2477715. S2CID 4349152.
- Wang T, Donahoe PK, Zervos AS (červenec 1994). „Specifická interakce receptorů typu I rodiny TGF-beta s imunofilinem FKBP-12“. Věda. 265 (5172): 674–6. doi:10.1126 / science.7518616. PMID 7518616.
- Peattie DA, Hsiao K, Benasutti M, Lippke JA (prosinec 1994). „Tři odlišné messengerové RNA mohou kódovat lidský protein vázající imunosupresivum FKBP12.“ Gen. 150 (2): 251–7. doi:10.1016/0378-1119(94)90434-0. PMID 7529739.
- Yang WM, Inouye CJ, Seto E (červen 1995). „Cyklofilin A a FKBP12 interagují s YY1 a mění jeho transkripční aktivitu.“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (25): 15187–93. doi:10.1074 / jbc.270.25.15187. PMID 7541038.
- Kawamura A, Su MS (červen 1995). "Interakce FKBP12-FK506 s kalcineurinem A v doméně vázající podjednotku B". The Journal of Biological Chemistry. 270 (26): 15463–6. doi:10.1074 / jbc.270.26.15463. PMID 7541044.
- Griffith JP, Kim JL, Kim EE, Sintchak MD, Thomson JA, Fitzgibbon MJ, Fleming MA, Caron PR, Hsiao K, Navia MA (srpen 1995). „Rentgenová struktura kalcineurinu inhibovaná komplexem imunofilin-imunosupresivum FKBP12-FK506“. Buňka. 82 (3): 507–22. doi:10.1016/0092-8674(95)90439-5. PMID 7543369. S2CID 15502270.
- Van Duyne GD, Standaert RF, Karplus PA, Schreiber SL, Clardy J (leden 1993). „Atomové struktury komplexů lidského imunofilinu FKBP-12 s FK506 a rapamycinem“. Journal of Molecular Biology. 229 (1): 105–24. doi:10.1006 / jmbi.1993.1012. PMID 7678431.