FLNC (gen) - FLNC (gene)

FLNC
Protein FLNC PDB 1v05.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyFLNC, ABP-280, ABP280A, ABPA, ABPL, FLN2, MFM5, MPD4, filamin C, RCM5, CMH26
Externí IDOMIM: 102565 MGI: 95557 HomoloGene: 37481 Genové karty: FLNC
Umístění genu (člověk)
Chromozom 7 (lidský)
Chr.Chromozom 7 (lidský)[1]
Chromozom 7 (lidský)
Genomic location for FLNC
Genomic location for FLNC
Kapela7q32.1Start128,830,377 bp[1]
Konec128,859,274 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE FLNC 207876 s at fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

2318

68794

Ensembl

ENSG00000128591

ENSMUSG00000068699

UniProt

Q14315

Q8VHX6

RefSeq (mRNA)

NM_001458
NM_001127487

NM_001081185
NM_001311074
NM_026839

RefSeq (protein)

NP_001120959
NP_001449

NP_001074654
NP_001298003

Místo (UCSC)Chr 7: 128,83 - 128,86 MbChr 6: 29,43 - 29,46 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Filamin-C (FLN-C) také známý jako protein podobný vazbě na aktin (ABPL) nebo filamin-2 (FLN2) je protein že u lidí je kódován FLNC gen.[5][6][7] Filamin-C je exprimován hlavně v srdečních a kosterních svalech a funguje na Z-disky a v subsarcolemmal regionech.

Struktura

Filamin-C je protein 290,8 kDa složený z 2725 aminokyselin.[8][9] Filamin-C, jako všudypřítomně exprimovaná izoforma Filamin-A, mít N-terminál vláknitá aktinová vazebná doména, následovaná zdlouhavým C-terminál doména s vlastním přidružením obsahující řadu imunoglobulin podobné domény a membrána glykoprotein -vázací doména.[10] Filamin-C interaguje s y-sarkoglykan a 5-sarkoglykan u sarkolemmy;[11][12] myotilin a FATZ / kalsarcin / myozenin na Z-řádcích,[13][14][15][16] stejně jako LL5β.[17] Filamin-C se také prokázal komunikovat s INPPL1,[18] KCND2,[19] a MAP2K4.[20]

Funkce

Rodina filaminových proteinů se zesíťuje aktin vlákna do ortogonálních sítí v kortikální cytoplazmě a podílet se na ukotvení membránových proteinů pro aktin cytoskelet. Přesná funkce izoformy Filamin-C je však stále předmětem šetření. Protože je Filamin-C lokalizován hlavně do příčně pruhovaného svalu, jeho funkce jsou pravděpodobně specifické pro odborníka sarkomér cytoskelet ve svalech. Protože se Filamin-C nachází v obou subarkolemálních oblastech a na Z-liniích, jednou věrohodnou funkcí Filamin-C by bylo působit jako způsob komunikace mezi membránou a sarkomérou. V kosterním svalu se Filamin-C nachází v místech tvorby jádra v kostních myopatiích,[21] a změny v subcelulární lokalizaci filaminu-C byly vystaveny u svalové dystrofie končetinového pletence a u Duchennovy svalové dystrofie.[22]

Klinický význam

Mutace ve filaminu C byly spojeny s člověkem Hypertrofické kardiomyopatie, omezující kardiomyopatie[23] a vyšší výskyt náhlá srdeční smrt.[24] Exprese mutantního proteinu v srdečních buňkách krysy prokázala, že mutantní filamin C tvoří agregáty, které mohou poskytnout mechanickou vazbu na pozorovanou srdeční dysfunkci.[24] Nedostatek tohoto proteinu je spojován se svalovou slabostí.[25]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000128591 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000068699 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Maestrini E, Patrosso C, Mancini M, Rivella S, Rocchi M, Repetto M, Villa A, Frattini A, Zoppè M, Vezzoni P (červen 1993). „Mapování dvou genů kódujících izoformy proteinu vázajícího aktin ABP-280, proteinu podobného dystrofinu, na Xq28 a na chromozom 7“. Lidská molekulární genetika. 2 (6): 761–6. doi:10,1093 / hmg / 2,6,761. PMID  7689010.
  6. ^ Gariboldi M, Maestrini E, Canzian F, Manenti G, De Gregorio L, Rivella S, Chatterjee A, Herman GE, Archidiacono N, Antonacci R (květen 1994). "Srovnávací mapování 280 genů proteinu vázajícího aktin u člověka a myši". Genomika. 21 (2): 428–30. doi:10.1006 / geno.1994.1288. PMID  8088838.
  7. ^ "Entrez Gene: FLNC filamin C, gama (aktin vázající protein 280)".
  8. ^ „Informace o proteinu“. © COPaKB. Archivovány od originál dne 04.03.2016. Citováno 2015-03-26.
  9. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC  4076475. PMID  23965338.
  10. ^ van der Flier A, Sonnenberg A (duben 2001). "Strukturální a funkční aspekty filaminů". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - výzkum molekulárních buněk. 1538 (2–3): 99–117. doi:10.1016 / s0167-4889 (01) 00072-6. PMID  11336782.
  11. ^ Guyon JR, Kudryashova E, Potts A, Dalkilic I, Brosius MA, Thompson TG, Beckmann JS, Kunkel LM, Spencer MJ (říjen 2003). „Calpain 3 štěpí filamin C a reguluje jeho schopnost interakce s gama- a delta-sarkoglykany“. Muscle & Nerve. 28 (4): 472–83. doi:10,1002 / mus.10465. PMID  14506720. S2CID  86353802.
  12. ^ Thompson TG, Chan YM, Hack AA, Brosius M, Rajala M, Lidov HG, McNally EM, Watkins S, Kunkel LM (leden 2000). „Filamin 2 (FLN2): Svalově specifický protein interagující sarkoglykanem“. The Journal of Cell Biology. 148 (1): 115–26. doi:10.1083 / jcb.148.1.115. PMC  3207142. PMID  10629222.
  13. ^ van der Ven PF, Wiesner S, Salmikangas P, Auerbach D, Himmel M, Kempa S, Hayess K, Pacholsky D, Taivainen A, Schröder R, Carpén O, Fürst DO (říjen 2000). „Indikace pro novou cestu svalové dystrofie. Gama-filamin, svalová specifická filaminová izoforma, interaguje s myotilinem“. The Journal of Cell Biology. 151 (2): 235–48. doi:10.1083 / jcb.151.2.235. PMC  2192634. PMID  11038172.
  14. ^ Takada F, Vander Woude DL, Tong HQ, Thompson TG, Watkins SC, Kunkel LM, Beggs AH (únor 2001). "Myozenin: alfa-aktinin a gama-filamin vázající protein Z linií kosterního svalu". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (4): 1595–600. doi:10.1073 / pnas.041609698. PMC  29302. PMID  11171996.
  15. ^ Frey N, Olson EN (duben 2002). „Calsarcin-3, nový člen rodiny kalsarcinů specifický pro kosterní sval, interaguje s více proteiny Z-disku“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (16): 13998–4004. doi:10,1074 / jbc.M200712200. PMID  11842093.
  16. ^ Faulkner G, Pallavicini A, Comelli A, Salamon M, Bortoletto G, Ievolella C, Trevisan S, Kojic 'S, Dalla Vecchia F, Laveder P, Valle G, Lanfranchi G (prosinec 2000). „FATZ, protein vázající filamin, aktinin a telethonin na Z-disk kosterního svalu“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (52): 41234–42. doi:10,1074 / jbc.M007493200. PMID  10984498.
  17. ^ Paranavitane V, Coadwell WJ, Eguinoa A, Hawkins PT, Stephens L (leden 2003). „LL5beta je fosfatidylinositol (3,4,5) -trisfosfátový senzor, který může vázat cytoskeletální adaptér, gama-filamin“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (2): 1328–35. doi:10,1074 / jbc.M208352200. PMID  12376540.
  18. ^ Dyson JM, O'Malley CJ, Becanovic J, Munday AD, Berndt MC, Coghill ID, Nandurkar HH, Ooms LM, Mitchell CA (prosinec 2001). „Inositol polyfosfát 5-fosfatáza obsahující SH2, SHIP-2, váže filamin a reguluje submembranózní aktin“. The Journal of Cell Biology. 155 (6): 1065–79. doi:10.1083 / jcb.200104005. PMC  2150887. PMID  11739414.
  19. ^ Petrecca K, Miller DM, Shrier A (prosinec 2000). „Lokalizace a zvýšená proudová hustota draselného kanálu Kv4.2 interakcí s aktin-vazebným proteinovým filaminem“. The Journal of Neuroscience. 20 (23): 8736–44. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-23-08736.2000. PMC  6773047. PMID  11102480.
  20. ^ Marti A, Luo Z, Cunningham C, Ohta Y, Hartwig J, Stossel TP, Kyriakis JM, Avruch J (leden 1997). „Aktin-vazebný protein-280 váže stresově aktivovaný protein kinázový (SAPK) aktivátor SEK-1 a je nezbytný pro aktivaci SAPK v nádorových nekrotických faktorech alfa v melanomových buňkách.“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (5): 2620–8. doi:10.1074 / jbc.272.5.2620. PMID  9006895.
  21. ^ Bönnemann CG, Thompson TG, van der Ven PF, Goebel HH, Warlo I, Vollmers B, Reimann J, Herms J, Gautel M, Takada F, Beggs AH, Fürst DO, Kunkel LM, Hanefeld F, Schröder R (leden 2003) . "Filamin C akumulace je silný, ale nespecifický imunohistochemický marker tvorby jádra ve svalu". Časopis neurologických věd. 206 (1): 71–8. doi:10.1016 / s0022-510x (02) 00341-6. PMID  12480088. S2CID  15662067.
  22. ^ Thompson TG, Chan YM, Hack AA, Brosius M, Rajala M, Lidov HG, McNally EM, Watkins S, Kunkel LM (leden 2000). „Filamin 2 (FLN2): Svalově specifický protein interagující sarkoglykanem“. The Journal of Cell Biology. 148 (1): 115–26. doi:10.1083 / jcb.148.1.115. PMC  3207142. PMID  10629222.
  23. ^ Brodehl A, Ferrier RA, Hamilton SJ, Greenway SC, Brundler MA, Yu W, Gibson WT, McKinnon ML, McGillivray B, Alvarez N, Giuffre M, Schwartzentruber J, Gerull B, FORGE Canada Consortium (2016). "Mutace ve FLNC jsou spojeny s familiární restrikční kardiomyopatií". Lidská mutace. 37 (3): 269–79. doi:10,1002 / humu.22942. PMID  26666891. S2CID  35455240.
  24. ^ A b Valdés-Mas R, Gutiérrez-Fernández A, Gómez J, Coto E, Astudillo A, Puente DA, Reguero JR, Álvarez V, Morís C, León D, Martín M, Puente XS, López-Otín C (říjen 2014). „Mutace ve filaminu C způsobují novou formu familiární hypertrofické kardiomyopatie“ (PDF). Příroda komunikace. 5: 5326. doi:10.1038 / ncomms6326. PMID  25351925.
  25. ^ Guergueltcheva V, Peeters K, Baets J, Ceuterick-de Groote C, Martin JJ, Suls A, De Vriendt E, Mihaylova V, Chamova T, Almeida-Souza L, Ydens E, Tzekov C, Hadjidekov G, Gospodinova M, Storm K Reyniers E, Bichev S, van der Ven PF, Fürst DO, Mitev V, Lochmüller H, Timmerman V, Tournev I, De Jonghe P, Jordanova A (prosinec 2011). „Distální myopatie s převahou horních končetin způsobená haploinsufficiencí filaminu C“. Neurologie. 77 (24): 2105–14. doi:10.1212 / WNL.0b013e31823dc51e. PMID  22131542. S2CID  10733187.

Další čtení

externí odkazy