LIN7C - LIN7C

LIN7C

Protein LIN7C PDB 2dkr.png

Dostupné struktury

Hledání ortologu: PDBe RCSB

Seznam id kódů PDB
3LRA

Identifikátory

LIN7C, LIN-7-C, LIN-7C, MALS-3, MALS3, VELI3, lin-7 homolog C, drobky komplexní složka polarity buněk

Externí ID

OMIM: 612332 MGI: 1330839 HomoloGene: 22649 Genové karty: LIN7C

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 11 (lidský)^[1]

Kapela	11p14.1	Start	27,494,418 bp^[1]
Kapela	11p14.1	Konec	27,506,769 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 2 (myš)^[2]

Kapela	2 E3 \| 2 56,65 cM	Start	109,890,853 bp^[2]
Kapela	2 E3 \| 2 56,65 cM	Konec	109,901,003 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• specifické vazby na proteinovou doménu • vazba cytoskeletálního proteinu • Vazba domény L27 • Vazba domény PDZ
Buněčná složka	• cytoplazma • postsynaptická membrána • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota • membrána • mezibuněčné spojení • dvoubuněčný těsný spoj • buněčná membrána • Komplex MPP7-DLG1-LIN7 • buněčné spojení • bazolaterální plazmatická membrána • neuronová projekce • presynapse • synapse • glutamátergická synapse
Biologický proces	• lokalizace proteinu na bazolaterální plazmatickou membránu • udržování apikální / bazální polarity epiteliálních buněk • transport bílkovin • morfogeneze epiteliální vrstvy • GO: Sekrece neurotransmiteru 0010554 • exocytóza
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


55327


22343


ENSG00000148943


ENSMUSG00000027162


Q9NUP9


O88952

RefSeq (mRNA)


NM_018362


NM_011699

RefSeq (protein)


NP_060832


NP_035829

Místo (UCSC)

Chr 11: 27,49 - 27,51 Mb

Chr 2: 109,89 - 109,9 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Lin-7 homolog C. je protein že u lidí je kódován LIN7C gen.^[5]^[6]

Interakce

LIN7C bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000148943 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027162 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Jo K, Derin R, Li M, Bredt DS (červen 1999). „Charakterizace MALS / Velis-1, -2 a -3: rodina savčích LIN-7 homologů obohacených o mozkové synapse ve spojení s postsynaptickým hustotním 95 / NMDA receptorovým postsynaptickým komplexem“. J. Neurosci. 19 (11): 4189–99. doi:10.1523 / JNEUROSCI.19-11-04189.1999. PMC 6782594. PMID 10341223.
^ „Entrez Gene: LIN7C lin-7 homolog C (C. elegans)“.
^ ^A ^b ^C Leonoudakis D, Conti LR, Radeke CM, McGuire LM, Vandenberg CA (duben 2004). „Komplex obchodování s více proteiny složený z SAP97, CASK, Veli a Mint1 je spojen s draslíkovými kanály Kir2 směrem dovnitř“. J. Biol. Chem. 279 (18): 19051–63. doi:10,1074 / jbc.M400284200. PMID 14960569.
^ ^A ^b Leonoudakis D, Conti LR, Anderson S, Radeke CM, McGuire LM, Adams ME, Froehner SC, Yates JR, Vandenberg CA (květen 2004). "Komplexy transportu a ukotvení proteinů odhalené proteomickou analýzou proteinů asociovaných s vnitřním usměrňovačem draslíkového kanálu (Kir2.x)". J. Biol. Chem. 279 (21): 22331–46. doi:10,1074 / jbc.M400285200. PMID 15024025.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Bécamel C, Alonso G, Galéotti N, Demey E, Jouin P, Ullmer C, Dumuis A, Bockaert J, Marin P (2002). „Synaptické multiproteinové komplexy spojené s 5-HT (2C) receptory: proteomický přístup“. EMBO J.. 21 (10): 2332–42. doi:10.1093 / emboj / 21.10.2332. PMC 126011. PMID 12006486.
Hori K, Konno D, Maruoka H, Sobue K (2003). "MALS je vazebným partnerem IRSp53 při kontaktech mezi buňkami". FEBS Lett. 554 (1–2): 30–4. doi:10.1016 / S0014-5793 (03) 01074-3. PMID 14596909. S2CID 30329043.
Leonoudakis D, Conti LR, Radeke CM, McGuire LM, Vandenberg CA (2004). „Komplex obchodování s více proteiny složený z SAP97, CASK, Veli a Mint1 je spojen s draslíkovými kanály Kir2 směrem dovnitř“. J. Biol. Chem. 279 (18): 19051–63. doi:10,1074 / jbc.M400284200. PMID 14960569.
Leonoudakis D, Conti LR, Anderson S, Radeke CM, McGuire LM, Adams ME, Froehner SC, Yates JR, Vandenberg CA (2004). "Komplexy transportu a ukotvení proteinů odhalené proteomickou analýzou proteinů asociovaných s vnitřním usměrňovačem draslíkového kanálu (Kir2.x)". J. Biol. Chem. 279 (21): 22331–46. doi:10,1074 / jbc.M400285200. PMID 15024025.
Petrosky KY, Ou HD, Löhr F, Dötsch V, Lim WA (2006). „Obecný model preferenční hetero-oligomerizace domén LIN-2/7: mechanismus, který je podkladem pro řízené sestavení supramolekulárních signálních komplexů“. J. Biol. Chem. 280 (46): 38528–36. doi:10,1074 / jbc.M506536200. PMID 16147993.
Mendes CC, Gomes DA, Thompson M, Souto NC, Goes TS, Goes AM, Rodrigues MA, Gomez MV, Nathanson MH, Leite MF (2006). „Inositol 1,4,5-trisfosfátový receptor typu III přednostně přenáší apoptotické signály Ca2 + do mitochondrií.“. J. Biol. Chem. 280 (49): 40892–900. doi:10,1074 / jbc.M506623200. PMID 16192275.
Bohl J, Brimer N, Lyons C, Vande Pol SB (2007). „Protein rodiny stardust MPP7 tvoří tripartitní komplex s LIN7 a DLG1, který reguluje stabilitu a lokalizaci DLG1 na buněčné spoje“. J. Biol. Chem. 282 (13): 9392–400. doi:10,1074 / jbc.M610002200. PMID 17237226.
Onda T, Uzawa K, Nakashima D, Saito K, Iwadate Y, Seki N, Shibahara T, Tanzawa H (2007). „Lin-7C / VELI3 / MALS-3: základní složka při metastázování lidského spinocelulárního karcinomu“ (PDF). Cancer Res. 67 (20): 9643–8. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-1911. PMID 17942893.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.