Channelome - Channelome

The channelome, někdy nazývané „iontový kanál", je kompletní sada iontové kanály[1] a poriny[2] vyjádřeno v a biologický tkáň nebo organismus.[3] Je to analogické s genom, metabolome (popisující metabolity), proteom (popisující obecně protein výraz) a mikrobiom. Charakterizace iontového kanálku, označovaného jako channelomics, je pobočkou fyziologie, biofyzika, neurovědy, a farmakologie, se zvláštní pozorností věnovanou genová exprese.[4][5][6] Může být provedeno různými technikami, včetně svorka elektrofyziologie, PCR, a imunohistochemie.[4][7] Channelomics se používá k screeningu a objevování nových léků.[4][8]

Funkční studie

Struktura a funkce membránové kanály jsou úzce spjaty,[9][10] ale možná nejslavnější práce studující strukturu iontové kanály je papír od Doyla et al. 1998, který vedl k Nobelova cena za chemii pro Roderick MacKinnon.[1] Abnormality struktury kanálu následně vedou k jejich fyziologické nesprávné funkci. Channelomické studie zahrnují systematické studium nemocí vyplývajících z těchto nesprávných funkcí. Taková nemoc se nazývá a channelopathy.[4][8] Kromě toho channelomické studie skrínují vazebné afinity kandidátních sloučenin léčiv k potencionální účinnosti léčiv při channelopatiích.[4][8]

Reference

  1. ^ A b Doyle, D. A., Morais-Cabral, J., Pfuetzner, R. A., Kuo, A, Gulbis, JM, Cohen, SL, Chait, BT, MacKinnon, R (1998) Struktura draslíkového kanálu: molekulární základ K+ vedení a selektivita. Věda 280:69–77.
  2. ^ Preston GM, Carroll TP, Guggino WB, Agre P (1992). Vzhled vodních kanálů v oocytech Xenopus exprimujících protein CHIP28 červených krvinek. Věda 256(5055): 385–387
  3. ^ Barrett-Jolley, R., R. Lewis a kol. (2010). Vznikající chondrocyt channelome: Frontiers in Membrane Physiology and Biofhysics. doi:10.3389 / fphys.2010.00135
  4. ^ A b C d E Lehmann-Horn, F .; Jurkat-Rott, K. (2003). „Nanotechnologie pro neuronové iontové kanály“. Časopis neurologie, neurochirurgie a psychiatrie. 74 (11): 1466–1475. doi:10.1136 / jnnp.74.11.1466. PMC  1738249. PMID  14617700.
  5. ^ Jurkat-Rott, K .; Lehmann-Horn, F. (2004). "Technika svorek Patch ve výzkumu Ion Channel". Současná farmaceutická biotechnologie. 5 (4): 387–395. doi:10.2174/1389201043376715. PMID  15320769.
  6. ^ Gabashvili, S .; Sokolowski, H .; Morton, C .; Giersch, B. (září 2007). "Genová exprese iontového kanálu ve vnitřním uchu". Časopis Asociace pro výzkum v otolaryngologii. 8 (3): 305–328. doi:10.1007 / s10162-007-0082-r. ISSN  1525-3961. PMC  2538437. PMID  17541769.
  7. ^ Perraud, A. L .; Schmitz, C .; Scharenberg, A. M. (2006). Recenze a protokoly ve výzkumu DT40. Subcelulární biochemie. 40. 257–270. doi:10.1007/978-1-4020-4896-8_15. ISBN  978-1-4020-4895-1.
  8. ^ A b C Camerino, D. C .; Tricarico, D .; Desaphy, J. F. (duben 2007). „Farmakologie iontových kanálů“. Neuroterapeutika. 4 (2): 184–198. doi:10.1016 / j.nurt.2007.01.013. PMID  17395128.
  9. ^ Cohen, B. E .; Grabe, M .; Jan, L. Y. (2003). "Odpovědi a otázky ze struktur KvAP". Neuron. 39 (3): 395–400. doi:10.1016 / S0896-6273 (03) 00472-0. PMID  12895415.
  10. ^ Randall, A .; Mcnaughton, N .; Green, P. (srpen 2006). "Vlastnosti napěťově řízeného Na+ kanály v buněčné linii lidského rhabdomyosarkomu SJ-RH30: konvenční a automatizovaná analýza svorkových patchů ". Farmakologický výzkum. 54 (2): 118–128. doi:10.1016 / j.phrs.2006.03.005. ISSN  1043-6618. PMID  16675265.