CDC42BPA - CDC42BPA

CDC42BPA
Identifikátory
Aliasy	CDC42BPAMRCK, MRCKA, PK428, CDC42 vázající protein kináza alfa
Externí ID	OMIM: 603412 MGI: 2441841 HomoloGene: 55765 Genové karty: CDC42BPA
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	227,318,474 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	180,165,603 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • aktivita proteinové serin / threoninkinázy; • aktivita proteinkinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • vazba iontů hořčíku; • vazba kovových iontů; • identická vazba na protein; • kinázová aktivita;
Buněčná složka	• cytoplazma; • aktomyosin; • extracelulární exosom; • náběžná hrana buňky; • mezibuněčné spojení; • lamellipodium; • buněčná projekce; • cytoskelet;
Biologický proces	• fosforylace bílkovin; • organizace struktury aktomyosinu; • GO: 0007243 transdukce intracelulárního signálu; • migrace buněk; • fosforylace; • reorganizace aktinového cytoskeletu; • organizace aktinového cytoskeletu; • peptidyl-threoninová fosforylace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8476
	226751
	ENSG00000143776
	ENSMUSG00000026490
	Q5VT25
	Q3UU96
	NM_003607; NM_014826; NM_001366010; NM_001366011; NM_001366019
NM_001033285; NM_001346804; NM_001346805; NM_001359541; NM_001359542;
	NM_001359543; NM_001359544; NM_001359545; NM_001359546; NM_001359547; NM_001359548; NM_001359549
	NP_003598; NP_055641; NP_001352939; NP_001352940; NP_001352948
NP_001028457; NP_001333733; NP_001333734; NP_001346470; NP_001346471;
	NP_001346472; NP_001346473; NP_001346474; NP_001346475; NP_001346476; NP_001346477; NP_001346478
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Serin / threonin-protein kináza MRCK alfa je enzym že u lidí je kódován CDC42BPA gen.^[5]

Protein kódovaný tímto genem je členem Serine / Rodina treoninových proteinových kináz. Tato kináza obsahuje více funkčních domén. Své kináza doména je velmi podobná doméně myotonická dystrofie protein kináza (DMPK). Tato kináza také obsahuje doménu interaktivní vazby Rac (CRIB) a bylo prokázáno, že váže CDC42. Může fungovat jako downstream efektor CDC42 zprostředkující periferní zařízení indukované CDC42 aktin formování a propagace cytoskeletální reorganizace. Bylo popsáno několik alternativně sestřižených variant transkriptu a byla popsána celovečerní povaha dvou z nich.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000143776 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026490 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b "Entrez Gene: CDC42BPA CDC42 vázající protein kináza alfa (podobná DMPK)".

externí odkazy

Člověk CDC42BPA umístění genomu a CDC42BPA stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Zhao Y, Loyer P, Li H a kol. (1997). "Klonování a chromozomální umístění nového člena rodiny myotonických dystrofií proteinových kináz". J. Biol. Chem. 272 (15): 10013–20. doi:10.1074 / jbc.272.15.10013. PMID 9092543.
Leung T, Chen XQ, Tan I a kol. (1998). „Kináza vázající Cdc42 vázající se na myotonickou dystrofii působí jako Cdc42 efektor při podpoře cytoskeletální reorganizace“. Mol. Buňka. Biol. 18 (1): 130–40. doi:10.1128 / mcb.18.1.130. PMC 121465. PMID 9418861.
Seki N, Ohira M, Nagase T a kol. (1998). "Charakterizace cDNA klonů v knihovnách cDNA s frakcionací podle velikosti z lidského mozku". DNA Res. 4 (5): 345–9. doi:10.1093 / dnares / 4.5.345. PMID 9455484.
Moncrieff CL, Bailey ME, Morrison N, Johnson KJ (1999). "Klonování a chromozomální lokalizace lidské Cdc42-vázající proteinové kinázy beta". Genomika. 57 (2): 297–300. doi:10.1006 / geno.1999,5769. PMID 10198171.
Edwards DC, Sanders LC, Bokoch GM, Gill GN (1999). "Aktivace LIM-kinázy párem Pak1 spojuje signalizaci GTPázy Rac / Cdc42 k aktinové cytoskeletální dynamice". Nat. Cell Biol. 1 (5): 253–9. doi:10.1038/12963. PMID 10559936.
Ohashi K, Nagata K, Maekawa M a kol. (2000). „Rho-asociovaná kináza ROCK aktivuje LIM-kinázu 1 fosforylací na threoninu 508 v aktivační smyčce“. J. Biol. Chem. 275 (5): 3577–82. doi:10.1074 / jbc.275.5.3577. PMID 10652353.
Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, et al. (2000). "Brokovnicové sekvenování lidského transkriptomu se značkami sekvencí exprimovanými ORF". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (7): 3491–6. doi:10.1073 / pnas.97.7.3491. PMC 16267. PMID 10737800.
Nakamura N, Oshiro N, Fukata Y a kol. (2000). "Fosforylace ERM proteinů u filopodií indukovaná Cdc42". Geny buňky. 5 (7): 571–81. doi:10.1046 / j.1365-2443.2000.00348.x. PMID 10947843.
Lam LT, Pham YC, Nguyen TM, Morris GE (2000). „Charakterizace panelu monoklonálních protilátek ukazuje, že proteinová kináza myotonické dystrofie, DMPK, je exprimována téměř výlučně ve svalech a srdci“. Hučení. Mol. Genet. 9 (14): 2167–73. doi:10,1093 / hmg / 9,14 2167. PMID 10958655.
Tan I, Seow KT, Lim L, Leung T (2001). „Intermolekulární a intramolekulární interakce regulují katalytickou aktivitu kinázy alfa vázající na Cdc42 vázající se na myotonickou dystrofii“. Mol. Buňka. Biol. 21 (8): 2767–78. doi:10.1128 / MCB.21.8.2767-2778.2001. PMC 86907. PMID 11283256.
Sumi T, Matsumoto K, Shibuya A, Nakamura T (2001). „Aktivace kináz LIM pomocí kinázy alfa vázající Cdc42 spojené s myotonickou dystrofií kinázou“. J. Biol. Chem. 276 (25): 23092–6. doi:10,1074 / jbc.C100196200. PMID 11340065.
Lemercier C, Brocard MP, Puvion-Dutilleul F a kol. (2002). „Histonové deacetylázy třídy II jsou přímo přijímány transkripčním represorem BCL6“. J. Biol. Chem. 277 (24): 22045–52. doi:10,1074 / jbc.M201736200. PMID 11929873.
Dong JM, Leung T, Manser E, Lim L (2003). „Cdc42 antagonizuje indukční působení cAMP na tvar buněk prostřednictvím účinků kinázy vázající Cdc42 vázající na myotonickou dystrofii (MRCK) na fosforylaci lehkého řetězce myosinu“. Eur. J. Cell Biol. 81 (4): 231–42. doi:10.1078/0171-9335-00238. PMID 12018391.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Tan I, Cheong A, Lim L, Leung T (2003). „Genomická organizace kinázy alfa vázající se na Cdc42 vázající se na lidskou myotonickou dystrofii odhaluje řadu alternativních sestřihů a funkční rozmanitosti“. Gen. 304: 107–15. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 01185-X. PMID 12568720.
Wilkinson S, Paterson HF, Marshall CJ (2005). „Signalizace Cdc42-MRCK a Rho-ROCK spolupracují při fosforylaci myosinů a buněčné invazi“. Nat. Cell Biol. 7 (3): 255–61. doi:10.1038 / ncb1230. PMID 15723050.
Cmejla R, Petrak J, Cmejlova J (2006). "Nový prvek reagující na železo ve 3'UTR lidské MRCKalpha". Biochem. Biophys. Res. Commun. 341 (1): 158–66. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.12.155. PMID 16412980.
Gregory SG, Barlow KF, McLay KE a kol. (2006). „Sekvence DNA a biologická anotace lidského chromozomu 1“. Příroda. 441 (7091): 315–21. doi:10.1038 / nature04727. PMID 16710414.
Lefort K, Mandinova A, Ostano P a kol. (2007). „Notch1 je cílový gen p53 podílející se na potlačení nádoru lidského keratinocytů negativní regulací kináz ROCK1 / 2 a MRCKalpha“. Genes Dev. 21 (5): 562–77. doi:10.1101 / gad.1484707. PMC 1820898. PMID 17344417.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000143776 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026490 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: CDC42BPA CDC42 vázající protein kináza alfa (podobná DMPK)".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]