IFNK - IFNK

IFNK
Identifikátory
Aliasy	IFNK, IFNT1, INFE1, interferon kappa
Externí ID	OMIM: 615326 MGI: 2683287 HomoloGene: 36384 Genové karty: IFNK
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	27,526,498 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	35,154,005 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita cytokinů; • vazba interferonového receptoru typu I; • vazba na cytokinový receptor;
Buněčná složka	• extracelulární oblast; • extracelulární;
Biologický proces	• přirozená aktivace zabijáckých buněk zapojená do imunitní odpovědi; • Diferenciace B buněk; • obranná reakce; • reakce na virus; • aktivace přirozených zabijáckých buněk; • Proliferace B buněk; • regulace transkripce, DNA-šablony; • humorální imunitní odpověď; • adaptivní imunitní odpověď; • pozitivní regulace peptidyl-serinové fosforylace proteinu STAT; • obranná reakce na virus; • reakce na exogenní dsRNA; • negativní regulace buněčné proliferace; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu; • pozitivní regulace vrozené imunitní odpovědi; • Aktivace T buněk zapojená do imunitní odpovědi; • regulace aktivity receptoru;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	56832
	387510
	ENSG00000147896
	ENSMUSG00000042993
	Q9P0W0
	Q7TSL0
	NM_020124
	NM_199157
	NP_064509
	NP_954608
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Interferon kappa, také známý jako IFN-kappa, je protein že u lidí je kódován IFNK gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

IFN-kappa je členem typu I. interferon rodina. Interferony typu I jsou skupinou příbuzných glykoproteinů, které hrají důležitou roli v obraně hostitele proti virovým infekcím. Tento protein je exprimován v keratinocyty a gen se nachází na chromozomu 9, v sousedství interferonového shluku typu I.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000147896 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000042993 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: interferon“.
^ LaFleur DW, Nardelli B, Tsareva T, Mather D, Feng P, Semenuk M, Taylor K, Buergin M, Chinchilla D, Roshke V, Chen G, Ruben SM, Pitha PM, Coleman TA, Moore PA (říjen 2001). „Interferon-kappa, nový interferon typu I exprimovaný v lidských keratinocytech“. J. Biol. Chem. 276 (43): 39765–71. doi:10,1074 / jbc.M102502200. PMID 11514542.
^ Nardelli B, Zaritskaya L, Semenuk M, Cho YH, LaFleur DW, Shah D, Ullrich S, Girolomoni G, Albanesi C, Moore PA (listopad 2002). „Regulační účinek IFN-kappa, nového IFN typu I, na produkci cytokinů buňkami vrozeného imunitního systému“. J. Immunol. 169 (9): 4822–30. doi:10,4049 / jimmunol. 169,9,4822. PMID 12391192.

3. Antivirová aktivita přechodně exprimovaného IFN-kappa je spojená s buňkami. Buontempo, P.J., Jubin, R.G., Buontempo, C.A., Wagner, N.E., Reyes, G.R., Baroudy, B.M. J. Interferon Cytokine Res. (2006) [Pubmed]

Další čtení

Liu C, Batliwalla F, Li W a kol. (2008). „Genetický asociační sken identifikuje kandidátské polymorfismy spojené s diferenciální odpovědí na léčbu anti-TNF u revmatoidní artritidy“. Mol. Med. 14 (9–10): 575–81. doi:10.2119 / 2008-00056.Liu. PMC 2443997. PMID 18615156.
DeCarlo CA, Severini A, Edler L a kol. (2010). „IFN-Îº, nový IFN typu I, je nedetekovatelný v HPV-pozitivních lidských cervikálních keratinocytech“. Laboratoř. Investovat. 90 (10): 1482–91. doi:10.1038 / labinvest.2010.95. PMID 20479716.
Silva LK, Blanton RE, Parrado AR a kol. (2010). „Hemoragická horečka dengue je spojena s polymorfismy v JAK1“. Eur. J. Hum. Genet. 18 (11): 1221–7. doi:10.1038 / ejhg.2010.98. PMC 2950898. PMID 20588308.
Yang XR, Liang X, Pfeiffer RM a kol. (2010). „Sdružení variant 9p21 s kožním maligním melanomem, névy a pigmentačními fenotypy v rodinách náchylných k melanomu s mutacemi CDKN2A a bez nich“. Fam. Rakovina. 9 (4): 625–33. doi:10.1007 / s10689-010-9356-3. PMC 3233727. PMID 20574843.
Ferreira RC, Pan-Hammarström Q, Graham RR a kol. (2010). „Sdružení IFIH1 a dalších autoimunitních rizikových alel se selektivním nedostatkem IgA“. Nat. Genet. 42 (9): 777–80. doi:10,1038 / ng.644. PMID 20694011. S2CID 205356843.
Laaksovirta H, Peuralinna T, Schymick JC a kol. (2010). „Chromozom 9p21 v amyotrofické laterální skleróze ve Finsku: celostátní asociační studie“. Lancet Neurol. 9 (10): 978–85. doi:10.1016 / S1474-4422 (10) 70184-8. PMC 2965392. PMID 20801718.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E a kol. (2003). „Iniciativa pro objevování sekretovaných proteinů (SPDI), rozsáhlé úsilí o identifikaci nových lidských sekretovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Rincon-Orozco B, Halec G, Rosenberger S a kol. (2009). "Epigenetické umlčení interferonu-kappa v buňkách pozitivních na lidský papilomavirus typu 16". Cancer Res. 69 (22): 8718–25. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-09-0550. PMID 19887612.
Humphray SJ, Oliver K, Hunt AR a kol. (2004). "DNA sekvence a analýza lidského chromozomu 9". Příroda. 429 (6990): 369–74. doi:10.1038 / nature02465. PMC 2734081. PMID 15164053.
Zhang Z, Henzel WJ (2004). „Predikce signálního peptidu na základě analýzy experimentálně ověřených štěpných míst“. Protein Sci. 13 (10): 2819–24. doi:10.1110 / ps.04682504. PMC 2286551. PMID 15340161.
van Es MA, Veldink JH, Saris CG a kol. (2009). „Celomanomová asociační studie identifikuje 19p13.3 (UNC13A) a 9p21.2 jako lokusy citlivosti na sporadickou amyotrofickou laterální sklerózu“. Nat. Genet. 41 (10): 1083–7. doi:10,1038 / ng.442. PMID 19734901. S2CID 8659710.
Harley IT, Niewold TB, Stormont RM a kol. (2010). „Role genetické variace poblíž interferonu-kappa v systémovém lupus erythematodes“. J. Biomed. Biotechnol. 2010: 1–11. doi:10.1155/2010/706825. PMC 2914299. PMID 20706608.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000147896 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000042993 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: interferon“.

[pmid11514542-6] LaFleur DW, Nardelli B, Tsareva T, Mather D, Feng P, Semenuk M, Taylor K, Buergin M, Chinchilla D, Roshke V, Chen G, Ruben SM, Pitha PM, Coleman TA, Moore PA (říjen 2001). „Interferon-kappa, nový interferon typu I exprimovaný v lidských keratinocytech“. J. Biol. Chem. 276 (43): 39765–71. doi:10,1074 / jbc.M102502200. PMID 11514542.

[pmid12391192-7] Nardelli B, Zaritskaya L, Semenuk M, Cho YH, LaFleur DW, Shah D, Ullrich S, Girolomoni G, Albanesi C, Moore PA (listopad 2002). „Regulační účinek IFN-kappa, nového IFN typu I, na produkci cytokinů buňkami vrozeného imunitního systému“. J. Immunol. 169 (9): 4822–30. doi:10,4049 / jimmunol. 169,9,4822. PMID 12391192.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]