CCL17 - CCL17

CCL17
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1NR2, 1NR4
Identifikátory
Aliasy	CCL17, A-152E5.3, ABCD-2, SCYA17, TARC, C-C motiv chemokinový ligand 17
Externí ID	OMIM: 601520 MGI: 1329039 HomoloGene: 2246 Genové karty: CCL17
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	57,416,063 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	94,812,036 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita cytokinů; • Vazba na chemokinový receptor CCR; • vazba na receptory; • chemokinová aktivita; • Vazba na chemokinový receptor CCR4; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• extracelulární oblast; • extracelulární;
Biologický proces	• Signální dráha receptoru spřaženého s G-proteinem; • negativní regulace diferenciace myoblastů; • chemotaxe monocytů; • chemokiny zprostředkovaná signální dráha; • buněčná odpověď na faktor nekrózy nádoru; • signalizace buňka-buňka; • chemotaxe neutrofilů; • vývoj mnohobuněčných organismů; • chemotaxe; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy; • buněčná odpověď na interleukin-1; • imunitní odpověď; • pozitivní regulace kaskády ERK1 a ERK2; • buněčná odpověď na interferon-gama; • chemotaxe lymfocytů; • zánětlivá reakce; • antimikrobiální humorální imunitní odpověď zprostředkovaná antimikrobiálním peptidem; • regulace aktivity receptoru;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6361
	20295
	ENSG00000102970
	ENSMUSG00000031780
	Q92583
	n / a
	NM_002987
	NM_011332
	NP_002978
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Chemokinový ligand (motiv C-C) 17 (CCL17) (také známý jako TARC) je malý cytokin patřící do CC chemokin rodina je také známá jako brzlík a aktivací regulovaný chemokin (TARC). CCL17 je konstitutivně exprimován v brzlíku, ale pouze přechodně v fytohemaglutinin -stimulováno mononukleární buňky periferní krve.^[5] Tento chemokin se specificky váže a indukuje chemotaxe v T buňky a vyvolává jeho účinky interakcí s chemokinovým receptorem CCR4.^[5]^[6] Gen pro CCL17 je lokalizován na chromozom 16, u lidí, spolu s dalšími chemokiny zvanými CCL22 a CX3CL1.^[7]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000102970 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031780 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Imai T, Yoshida T, Baba M, Nishimura M, Kakizaki M, Yoshie O (1996). "Molekulární klonování nového CC chemokinu zaměřeného na T buňky exprimovaného v brzlíku pomocí zachycení signální sekvence pomocí vektoru viru Epstein-Barr". J. Biol. Chem. 271 (35): 21514–21. doi:10.1074 / jbc.271.35.21514. PMID 8702936.
^ Imai T, Baba M, Nishimura M, Kakizaki M, Takagi S, Yoshie O (1997). „CC chemokin TARC zaměřený na T buňky je vysoce specifický biologický ligand pro CC chemokinový receptor 4“. J. Biol. Chem. 272 (23): 15036–42. doi:10.1074 / jbc.272.23.15036. PMID 9169480.
^ Nomiyama H, Imai T, Kusuda J, Miura R, Callen DF, Yoshie O (1997). "Přiřazení humánního CC chemokinového genu TARC (SCYA17) k chromozomu 16q13". Genomika. 40 (1): 211–3. doi:10.1006 / geno.1996.4552. PMID 9070951.
^ Nomiyama H, Imai T, Kusuda J, Miura R, Callen DF, Yoshie O (1998). „Lidské chemokiny, fraktalkin (SCYD1), MDC (SCYA22) a TARC (SCYA17), jsou seskupeny na chromozomu 16q13“. Cytogenet. Cell Genet. 81 (1): 10–1. doi:10.1159/000015000. PMID 9691168. S2CID 46851784.

Další čtení

Saeki H, Tamaki K (2006). "Brzlík a aktivací regulovaný chemokin (TARC) / CCL17 a kožní onemocnění". J. Dermatol. Sci. 43 (2): 75–84. doi:10.1016 / j.jdermsci.2006.06.002. PMID 16859899.
Imai T, Yoshida T, Baba M a kol. (1996). "Molekulární klonování nového CC chemokinu zaměřeného na T buňky exprimovaného v brzlíku pomocí zachycení signální sekvence pomocí vektoru viru Epstein-Barr". J. Biol. Chem. 271 (35): 21514–21. doi:10.1074 / jbc.271.35.21514. PMID 8702936.
Nomiyama H, Imai T, Kusuda J a kol. (1997). "Přiřazení humánního CC chemokinového genu TARC (SCYA17) k chromozomu 16q13". Genomika. 40 (1): 211–3. doi:10.1006 / geno.1996.4552. PMID 9070951.
Imai T, Baba M, Nishimura M a kol. (1997). „CC chemokin TARC zaměřený na T buňky je vysoce specifický biologický ligand pro CC chemokinový receptor 4“. J. Biol. Chem. 272 (23): 15036–42. doi:10.1074 / jbc.272.23.15036. PMID 9169480.
Imai T, Chantry D, Raport CJ a kol. (1998). „Chemokin odvozený od makrofágů je funkční ligand pro CC chemokinový receptor 4“. J. Biol. Chem. 273 (3): 1764–8. doi:10.1074 / jbc.273.3.1764. PMID 9430724.
Bernardini G, Hedrick J, Sozzani S a kol. (1998). „Identifikace CC chemokinů TARC a makrofágového zánětlivého proteinu-1 beta jako nových funkčních ligandů pro receptor CCR8“. Eur. J. Immunol. 28 (2): 582–8. doi:10.1002 / (SICI) 1521-4141 (199802) 28:02 <582 :: AID-IMMU582> 3.0.CO; 2-A. PMID 9521068.
Nomiyama H, Imai T, Kusuda J a kol. (1998). „Lidské chemokiny, fraktalkin (SCYD1), MDC (SCYA22) a TARC (SCYA17), jsou seskupeny na chromozomu 16q13“. Cytogenet. Cell Genet. 81 (1): 10–1. doi:10.1159/000015000. PMID 9691168. S2CID 46851784.
Struyf S, Proost P, Sozzani S a kol. (1998). „Zvýšená aktivita anti-HIV-1 a změněná chemotaktická účinnost NH2-terminálně zpracovaného chemokinu odvozeného z makrofágů (MDC) znamenají další MDC receptor“. J. Immunol. 161 (6): 2672–5. PMID 9743322.
Loftus BJ, Kim UJ, Sneddon VP a kol. (1999). "Duplikace genomu a další vlastnosti ve 12 Mb sekvence DNA z lidského chromozomu 16p a 16q". Genomika. 60 (3): 295–308. doi:10.1006 / geno.1999.5927. PMID 10493829.
Garlisi CG, Xiao H, Tian F a kol. (1999). „Přiřazení párů chemokin-chemokinový receptor: TARC a MIP-1 beta nejsou ligandy pro lidský CC-chemokinový receptor 8“. Eur. J. Immunol. 29 (10): 3210–5. doi:10.1002 / (SICI) 1521-4141 (199910) 29:10 <3210 :: AID-IMMU3210> 3.0.CO; 2-W. PMID 10540332.
Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, et al. (2000). "Brokovnicové sekvenování lidského transkriptomu se značkami sekvencí exprimovanými ORF". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (7): 3491–6. doi:10.1073 / pnas.97.7.3491. PMC 16267. PMID 10737800.
Ghia P, Transidico P, Veiga JP a kol. (2001). „Chemoatraktanty MDC a TARC jsou vylučovány maligními prekurzory B-buněk po ligaci CD40 a podporují migraci T-buněk specifických pro leukémii.“. Krev. 98 (3): 533–40. doi:10.1182 / krev. V98.3.533. PMID 11468146.
Morita A, Kikuoka S, Horikawa T a kol. (2002). "Hodnocení lidského brzlíku a aktivací regulovaných koncentrací chemokinů v krvi pomocí nového sendvičového testu ELISA založeného na monoklonálních protilátkách". Clin. Chim. Acta. 322 (1–2): 67–75. doi:10.1016 / S0009-8981 (02) 00131-6. PMID 12104083.
Basu S, Schaefer TM, Ghosh M a kol. (2003). „Molekulární klonování a sekvenování 25 různých cDNA chemokinů makaků rhesus odhaluje evoluční konzervaci mezi rodinami chemokinů C, CC, CXC a CX3C“. Cytokin. 18 (3): 140–8. doi:10.1006 / cyto.2002.0875. PMID 12126650.
D'Ambrosio D, Albanesi C, Lang R a kol. (2002). „Kvantitativní rozdíly v zapojení chemokinových receptorů generují diverzitu v adhezi lymfocytů závislou na integrinu“. J. Immunol. 169 (5): 2303–12. doi:10,4049 / jimmunol.169.5.2303. PMID 12193695.
Matsumoto N, Mukae H, Nakamura-Uchiyama F a kol. (2002). "Zvýšené hladiny brzlíku a aktivací regulovaného chemokinu (TARC) ve vzorcích pleurálního výpotku od pacientů zamořených Paragonimus westermani". Clin. Exp. Immunol. 130 (2): 314–8. doi:10.1046 / j.1365-2249.2002.01985.x. PMC 1906524. PMID 12390321.
Zheng X, Nakamura K, Tojo M a kol. (2003). „Regulace brzlíku zprostředkovaná TGF-beta1 a syntéza a sekrece chemokinů regulovaných aktivací (TARC / CCL17) buňkami HaCaT ko-stimulovanými TNF-alfa a IFN-gama“. J. Dermatol. Sci. 30 (2): 154–60. doi:10.1016 / S0923-1811 (02) 00071-3. PMID 12413771.
Kakinuma T, Nakamura K, Wakugawa M a kol. (2003). „IL-4, ale ne IL-13, moduluje uvolňování TARC (brzlík a aktivací regulovaný chemokin) / CCL17 a IP-10 (interferonem indukovaný protein 10 kDA) / CXCL10 TNF-alfa a IFN-gama v buněčné linii HaCaT ". Cytokin. 20 (1): 1–6. doi:10.1006 / cyto.2002.1965. PMID 12441140.
Uchida T, Suto H, Ra C a kol. (2003). "Preferenční exprese chemokinu typu T (h) 2 a jeho receptoru při atopické dermatitidě". Int. Immunol. 14 (12): 1431–8. doi:10.1093 / intimm / dxf109. PMID 12456591.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Jones, K (1. února 2013). „Sérum CD163 a TARC jako biomarkery reakce na onemocnění u klasického Hodgkinova lymfomu“. Clin Cancer Res. 19 (3): 731–42. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-12-2693. PMID 23224400.

externí odkazy

Člověk CCL17 umístění genomu a CCL17 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000102970 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031780 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8702936-5] A ^b Imai T, Yoshida T, Baba M, Nishimura M, Kakizaki M, Yoshie O (1996). "Molekulární klonování nového CC chemokinu zaměřeného na T buňky exprimovaného v brzlíku pomocí zachycení signální sekvence pomocí vektoru viru Epstein-Barr". J. Biol. Chem. 271 (35): 21514–21. doi:10.1074 / jbc.271.35.21514. PMID 8702936.

[pmid9169480-6] Imai T, Baba M, Nishimura M, Kakizaki M, Takagi S, Yoshie O (1997). „CC chemokin TARC zaměřený na T buňky je vysoce specifický biologický ligand pro CC chemokinový receptor 4“. J. Biol. Chem. 272 (23): 15036–42. doi:10.1074 / jbc.272.23.15036. PMID 9169480.

[pmid9070951-7] Nomiyama H, Imai T, Kusuda J, Miura R, Callen DF, Yoshie O (1997). "Přiřazení humánního CC chemokinového genu TARC (SCYA17) k chromozomu 16q13". Genomika. 40 (1): 211–3. doi:10.1006 / geno.1996.4552. PMID 9070951.

[pmid9691168-8] Nomiyama H, Imai T, Kusuda J, Miura R, Callen DF, Yoshie O (1998). „Lidské chemokiny, fraktalkin (SCYD1), MDC (SCYA22) a TARC (SCYA17), jsou seskupeny na chromozomu 16q13“. Cytogenet. Cell Genet. 81 (1): 10–1. doi:10.1159/000015000. PMID 9691168. S2CID 46851784.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]