XCL1 - XCL1
Chemokinový (C motiv) ligand (XCL1) je malý cytokin patřící do C. chemokin rodina, která je také známá jako lymfotaktin. Chemokiny jsou známé svou funkcí při zánětlivých a imunologických reakcích. Tato rodina C chemokinů se liší strukturou a funkcí od většiny chemokinů.[5][6] V této rodině jsou pouze dva chemokiny a od ostatních chemokinů je odděluje to, že mají pouze dva cysteiny; jeden N-terminální cystein a jeden cystein po proudu. Tito oba se nazývají lymphotactin, alfa a beta forma, a požadují speciální vlastnosti, které se nacházejí pouze mezi těmito dvěma. Lymfotaktiny mohou projít reverzibilní konformační změnou, která mění její vazebné posuny.[7]
V normálních tkáních se XCL1 nachází ve vysokých hladinách v slezina, brzlík, tenké střevo a periferní krev leukocyty, a na nižších úrovních v plíce, prostaty a vaječník. Sekrece XCL1 je zodpovědná za zvýšení intracelulárního vápníku v lymfocytech periferní krve.[8] Buněčné zdroje pro XCL1 zahrnují aktivovanou CD8 + thymové a periferní krve T buňky.[9][10][11] NK buňky také vylučují XCL1 spolu s dalšími chemokiny na počátku infekcí.[12] Vyjadřování XCR1 dendritické buňky (DC) jsou hlavním cílem XCL1.[12]
U lidí je XCL1 úzce spjat s jiným chemokinem zvaným XCL2, jehož gen se nachází současně místo na chromozom 1.[11] Oba tyto chemokiny mají mnoho genetických a funkčních podobností; je však známo, že XCL2 byl pozorován pouze u lidí, a nikoli u myší.[12] XCL1 indukuje chemotaktickou funkci vazbou na a chemokinový receptor volala XCR1.[13] XCL1 je vyjádřen na makrofágy, fibroblasty a konkrétní lymfocyty.[6]
LTN se nachází ve dvou stavech: monomer při 10 ° C, LTN10 a dimer při 40 ° C, LTN40.[14]
Genomika
Gen XCL1 se nachází na dlouhém rameni chromozomu 1, které se nachází na cytogenetickém pásu q24.2, jak je vidět na infoboxu. Kódující gen je vyroben z 6 017 DNA bází pro kódování proteinu XCL1.[15] Tento gen obsahuje tři exony a dva introny a také několik iniciačních míst transkripce.[8] Tento gen kóduje 114-aminokyselinový protein zvaný XCL1, který je podobný jiným chemokinům kromě toho, že postrádá první a třetí cysteinové vlastnosti. To znamená, že XCL1 obsahuje pouze jeden cystein vytvářející disulfidovou vazbu místo dvou nebo tří jako ostatní chemokiny.[5]
Genetické rozdíly mezi XCL1 a XCL2 jsou velmi malé. Oba proteiny jsou ze stejné rodiny obsahující strukturu C motivu obsahující jednu disulfidovou vazbu a mají téměř identické terciární struktury.[8] Tyto C chemokiny mají také stejné přilehlé oblasti, což znamená oblasti genu včetně promotér a další místa vázání proteinů, která nepřispívají k RNA transkribovanému genu.[8] Genové mapování této rodiny chemokinů ukazuje jejich podobnosti intron a exon umístění pouze s jedním odlišným rozdílem. XCL1 má ve svém prvním intronu, který kóduje velký, pouze jeden rozdíl ribozomální podjednotka s názvem L7a. V XCL2 je oblast kódování pro L7a oříznuta.[8] Jediným dalším genetickým rozdílem mezi dvěma zralými proteiny jsou různé aminokyseliny v pozicích 7 a 8.[8][12] Tento rozdíl aminokyselin může odpovídat za některé biologické rozdíly. Některé potíže se srovnáváním těchto dvou chemokinů spočívají v tom, že XCL2 nebyl nikdy pozorován u myší.[12]
Struktura
Jedna věc, která odlišuje XCL1 od ostatních cytokiny je jeho struktura.[7] Zatímco většina chemokinů má dvě disulfidové vazby, které spojují N-konec s jádrem struktury, XCL1 má pouze jednu.[5] Tento jednoduchý rozdíl v disulfidových vazbách mění celkovou terciární strukturu XCL1 od jiných chemokinů. Existují dvě části proteinu lymfotaktinu, struktury Ltn10 a Ltn40, které se skládají do sebe, což z něj dělá biologicky aktivní.[7] Tato konformační změna mění vazebné struktury na chemokinu. Toto chápání vzájemného skládání poskytuje více základu pro porozumění lymfotaktin kinetika.[7]
Biologický význam
Většina vylučovaného XCL1 pochází ze specifického druhu dendritické buňky, která se podílí na antigenu vzájemná prezentace.[12] To znamená, že XCL1 se podílí na aktivaci cytotoxických T buněk dendritickou buňkou. XCL1 může být také vylučován NK buňky spolu s dalšími chemokiny na začátku infekce. To bylo spojeno s obranou T pomocné buňky typu 1.[12] Bylo také pozorováno, že tato sekrece usnadňuje NK buňkám komunikaci s DC obsahujícím XCR1 na jejich povrchu. Stejným způsobem sekrece XCL1 povzbuzuje cytotoxické T buňky, aby také komunikovaly s DC obsahujícím SCR1.[12]
Dvojice XCL1 a XCR1 je známo, že jsou zapojeni do vzájemná prezentace, příjem antigenu a indukce vrozené i adaptivní cytotoxické imunity.[12]
Je také známo, že XCL1 zvyšuje T buňky v kloubech, které jsou ovlivňovány revmatoidní artritida.[6] Jsou také exprimovány na RA synoviálních lymfocytech.[6]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000143184 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026573 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b C Wang X, Sharp JS, Handel TM, Prestegard JH (2013). "Oligomerizace chemokinů v buněčné signalizaci a migraci". V Giraldo J, Ciruela F (eds.). Pokrok v molekulární biologii a translační vědě. 117. 531–578. doi:10.1016 / B978-0-12-386931-9,00020-9. ISBN 978-0-12-386931-9. PMC 3937849. PMID 23663982.
- ^ A b C d Szekanecz Z, Koch AE (2017). "Nábor buněk a angiogeneze". Ve Firestein GS, Budd RC, Gabriel SE, McInnes IB, O'Dell JR (eds.). Kelly a Firesteinova učebnice revmatologie. Elsevier. 384–395. doi:10.1016 / B978-0-323-31696-5.00025-5. ISBN 978-0-323-31696-5.
- ^ A b C d Hundeiker M (2009). „[Klinický obraz účinků záření na kůži]“. Strahlenschutz in Forschung Und Praxis. 28: 160–4. doi:10.1016 / S0076-6879 (09) 05403-2. PMC 3686570. PMID 19480914.
- ^ A b C d E F Yoshida T, Imai T, Takagi S, Nishimura M, Ishikawa I, Yaoi T, Yoshie O (14. října 1996). "Struktura a exprese dvou vysoce příbuzných genů kódujících SCM-1 / lidský lymfotaktin". FEBS Dopisy. 395 (1): 82–88. doi:10.1016/0014-5793(96)01004-6. PMID 8849694.
- ^ Kelner GS, Kennedy J, Bacon KB, Kleyensteuber S, Largaespada DA, Jenkins NA, Copeland NG, Bazan JF, Moore KW, Schall TJ (listopad 1994). "Lymphotactin: cytokin, který představuje novou třídu chemokinů". Věda. 266 (5189): 1395–9. doi:10.1126 / science.7973732. PMID 7973732.
- ^ Kennedy J, Kelner GS, Kleyensteuber S, Schall TJ, Weiss MC, Yssel H, Schneider PV, Cocks BG, Bacon KB, Zlotnik A (červenec 1995). "Molekulární klonování a funkční charakterizace lidského lymfotaktinu". Journal of Immunology. 155 (1): 203–9. PMID 7602097.
- ^ A b Yoshida T, Imai T, Takagi S, Nishimura M, Ishikawa I, Yaoi T, Yoshie O (říjen 1996). "Struktura a exprese dvou vysoce příbuzných genů kódujících SCM-1 / lidský lymfotaktin". FEBS Dopisy. 395 (1): 82–8. doi:10.1016/0014-5793(96)01004-6. PMID 8849694.
- ^ A b C d E F G h i Kroczek RA, Henn V (10. února 2012). „Role XCR1 a jeho ligandu XCL1 při křížové prezentaci antigenu myšími a lidskými dendritickými buňkami“. Přední. Immunol. 3 (14). doi:10.3389 / fimmu.2012.00014. PMC 3342032. PMID 22566900.
- ^ Yoshida T, Imai T, Kakizaki M, Nishimura M, Takagi S, Yoshie O (červen 1998). "Identifikace jediného C motivu-1 / receptoru lymfotaktinu XCR1". The Journal of Biological Chemistry. 273 (26): 16551–4. doi:10.1074 / jbc.273.26.16551. PMID 9632725.
- ^ Tyler RC, Murray NJ, Peterson FC, Volkman BF (srpen 2011). „Interkonverze metamorfního proteinu v nativním stavu vyžaduje globální vývoj“. Biochemie. 50 (33): 7077–9. doi:10.1021 / bi200750k. PMC 3160782. PMID 21776971.
- ^ „Gen XCL1 (kódování bílkovin)“. Databáze lidských genů GeneCards.