CXCL10 - CXCL10

CXCL10
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1O80, 1LV9, 1O7Y, 1O7Z
Identifikátory
Aliasy	CXCL10, C7, IFI10, INP10, IP-10, SCYB10, crg-2, gIP-10, mob-1, chemokinový ligand s motivem C-X-C, chemokin s motivem C-X-C 10
Externí ID	OMIM: 147310 MGI: 1352450 HomoloGene: 1203 Genové karty: CXCL10
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	76,023,497 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	92,348,889 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita cytokinů; • vazba na heparin; • Vazba na chemokinový receptor CXCR3; • chemokinová aktivita; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita regulátoru proteinkinázy závislá na cAMP; • vazba na receptory; • chemoatraktivní aktivita;
Buněčná složka	• extracelulární oblast; • vnější strana plazmatické membrány; • extracelulární; • intracelulární;
Biologický proces	• regulace morfogeneze endotelové trubice; • negativní regulace diferenciace myoblastů; • buněčná reakce na teplo; • reakce na vitamin D.; • pozitivní regulace buněčné migrace; • Chemotaxe T buněk; • chemokiny zprostředkovaná signální dráha; • signalizace buňka-buňka; • reakce na virus; • vývoj svalových orgánů; • pozitivní regulace chemotaxe monocytů; • pozitivní regulace uvolňování sekvestrovaného iontu vápníku do cytosolu; • aktivace endoteliálních buněk; • pozitivní regulace signalizace zprostředkované cAMP; • regulace chemotaxe T buněk; • krevní oběh; • chemotaxe; • pozitivní regulace chemotaxe leukocytů; • signální dráha receptoru buněčného povrchu; • reakce na lipopolysacharid; • negativní regulace fúze myoblastů; • obranná reakce na virus; • regulace buněčné proliferace; • imunitní odpověď; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • reakce na sluchový podnět; • negativní regulace angiogeneze; • reakce na chlad; • buněčná odpověď na lipopolysacharid; • reakce na gama záření; • pozitivní regulace migrace T buněk; • signální transdukce; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace aktivity proteinkinázy; • obranná reakce; • zánětlivá reakce; • antimikrobiální humorální imunitní odpověď zprostředkovaná antimikrobiálním peptidem; • regulace aktivity receptoru; • Signální dráha receptoru spřaženého s G-proteinem; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu; • signální dráha receptoru spřaženého s adenylátcyklázou spojenou s G-proteinem; • reakce na bakterii; • chemotaxe neutrofilů; • chemotaxe leukocytů; • pozitivní chemotaxe; • regulace apoptotického procesu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3627
	15945
	ENSG00000169245
	ENSMUSG00000034855
	P02778
	P17515
	NM_001565
	NM_021274
	NP_001556
	NP_067249
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Chemikinový ligand motivu C-X-C 10 (CXCL10) také známý jako Interferon gama indukovaný protein 10 (IP-10) nebo malý indukovatelný cytokin B10 je 8,7 kDa protein že u lidí je kódován CXCL10 gen.^[5]^[6] Chemokin 10 s motivem C-X-C je malý cytokin patřící k CXC chemokin rodina.

Gen

Gen pro CXCL10 je lokalizován na člověku chromozom 4 v klastru mezi několika dalšími chemokiny CXC.^[7]

Funkce

CXCL10 je vylučován několika typy buněk v reakci na IFN-y. Mezi tyto typy buněk patří monocyty, endoteliální buňky a fibroblasty.^[5] CXCL10 byl přidělen několika rolím, například chemoatrakci pro monocyty /makrofágy, T buňky, NK buňky, a dendritické buňky, propagace T buňka přilnavost k endoteliální buňky, protinádorová aktivita a inhibice kostní dřeň tvorba kolonií a angiogeneze.^[8]^[9]

Tento chemokin vyvolává své účinky vazbou na povrch buněk chemokinový receptor CXCR3.^[10]

Struktura

Trojrozměrná krystalová struktura tohoto chemokinu byla stanovena za 3 různých podmínek s rozlišením až 1,92 Á.^[11] The Proteinová datová banka přístupové kódy pro struktury CXCL10 jsou 1lv9, 1o7yA 1o80.

Biomarkery

CXCL9, CXCL10 a CXCL11 se ukázaly jako platné biomarkery pro rozvoj srdečního selhání a dysfunkce levé komory, což naznačuje podtržený patofyziologický vztah mezi hladinami těchto chemokinů a vývojem nežádoucí srdeční remodelace.^[12]^[13]

Klinický význam

Výchozí plazmatické hladiny před léčbou CXCL10 jsou zvýšené u pacientů chronicky infikovaných virem hepatitidy C (HCV) genotypů 1 nebo 4, kteří po ukončení antivirové léčby nedosahují trvalé virové odpovědi (SVR).^[14]^[15] CXCL10 v plazmě se zrcadlí intrahepatální mRNA CXCL10 a oba nápadně předpovídají první dny eliminace HCV RNA („pokles první fáze“) během léčby interferonem / ribavirinem pro všechny genotypy HCV.^[16] To platí také pro pacienty koinfikované HIV, u nichž předúpravní hladiny IP-10 pod 150 pg / ml predikují příznivou odpověď, a mohou tak být užitečné při povzbuzení těchto jinak obtížně léčitelných pacientů k zahájení léčby.^[17] Patogen Leishmania hlavní, důležitý využívá proteázu, GP63, která štěpí CXCL10, což implikuje CXCL10 v obranných mechanismech hostitele určitých intracelulárních patogenů, jako je Leishmania.^[18]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169245 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034855 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Luster AD, Unkeless JC, Ravetch JV (1985). „Gama-interferon transkripčně reguluje gen s časnou odezvou obsahující homologii s bílkovinami krevních destiček“. Příroda. 315 (6021): 672–6. doi:10.1038 / 315672a0. PMID 3925348. S2CID 4358066.
^ Luster AD, Jhanwar SC, Chaganti RS, Kersey JH, Ravetch JV (květen 1987). "Interferonem indukovatelné genové mapy na chromozomální pás spojený s (4; 11) translokací v buňkách akutní leukémie". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 84 (9): 2868–71. doi:10.1073 / pnas.84.9.2868. PMC 304761. PMID 2437586.
^ O'Donovan N, Galvin M, Morgan JG (1999). "Fyzické mapování chemokinového lokusu CXC na lidském chromozomu 4". Cytogenetika a genetika buněk. 84 (1–2): 39–42. doi:10.1159/000015209. PMID 10343098. S2CID 8087808.
^ Dufour JH, Dziejman M, Liu MT, Leung JH, Lane TE, Luster AD (duben 2002). „IFN-gama-indukovatelný protein 10 (IP-10; CXCL10) -deficitní myši odhalují roli IP-10 při generování a obchodování efektorových T buněk“. Journal of Immunology. 168 (7): 3195–204. doi:10,4049 / jimmunol.168.7.3195. PMID 11907072.
^ Angiolillo AL, Sgadari C, Taub DD, Liao F, Farber JM, Maheshwari S a kol. (Červenec 1995). „Lidský interferonem indukovatelný protein 10 je silným inhibitorem angiogeneze in vivo“. The Journal of Experimental Medicine. 182 (1): 155–62. doi:10.1084 / jem.182.1.155. PMC 2192108. PMID 7540647.
^ Booth V, Keizer DW, Kamphuis MB, Clark-Lewis I, Sykes BD (srpen 2002). "Chemokin vázající se na CXCR3 IP-10 / CXCL10: struktura a interakce s receptory". Biochemie. 41 (33): 10418–25. doi:10.1021 / bi026020q. PMID 12173928.
^ Swaminathan GJ, Holloway DE, Colvin RA, Campanella GK, Papageorgiou AC, Luster AD, Acharya KR (květen 2003). "Krystalové struktury oligomerních forem chemokinu IP-10 / CXCL10". Struktura. 11 (5): 521–32. doi:10.1016 / S0969-2126 (03) 00070-4. PMID 12737818.
^ Altara R, Gu YM, Struijker-Boudier HA, Thijs L, Staessen JA, Blankesteijn WM (2015). „Dysfunkce levé komory a ligandy CXCR3 v hypertenzi: od experimentů na zvířatech po pilotní studii založenou na populaci“. PLOS ONE. 10 (10): e0141394. doi:10.1371 / journal.pone.0141394. PMC 4624781. PMID 26506526.
^ Altara R, Manca M, Hessel MH, Gu Y, van Vark LC, Akkerhuis KM a kol. (Srpen 2016). „CXCL10 je cirkulující zánětlivý marker u pacientů s pokročilým srdečním selháním: pilotní studie“. Journal of Cardiovascular Translational Research. 9 (4): 302–14. doi:10.1007 / s12265-016-9703-3. PMID 27271043. S2CID 41188765.
^ Romero AI, Lagging M, Westin J, Dhillon AP, Dustin LB, Pawlotsky JM, et al. (Říjen 2006). „Interferon (IFN) -gama indukovatelný protein-10: asociace s histologickými výsledky, virovou kinetikou a výsledkem během léčby pegylovaným IFN-alfa 2a a ribavirinem pro chronickou infekci virem hepatitidy C“. The Journal of Infectious Diseases. 194 (7): 895–903. doi:10.1086/507307. PMID 16960776.
^ Lagging M, Romero AI, Westin J, Norkrans G, Dhillon AP, Pawlotsky JM, et al. (Prosinec 2006). „IP-10 předpovídá virovou odpověď a terapeutický výsledek u obtížně léčitelných pacientů s infekcí HCV genotypu 1“. Hepatologie. 44 (6): 1617–25. doi:10,1002 / hep. 21407. PMID 17133471. S2CID 27733803.
^ Askarieh G, Alsiö A, Pugnale P, Negro F, Ferrari C, Neumann AU a kol. (Květen 2010). „Systémový a intrahepatický protein indukovaný interferonem gama 10 kDa předpovídá pokles první fáze RNA viru hepatitidy C a celkovou virovou odpověď na léčbu chronické hepatitidy C“. Hepatologie. 51 (5): 1523–30. doi:10,1002 / hep. 23509. PMID 20186843. S2CID 205873437.
^ Falconer K, Askarieh G, Weis N, Hellstrand K, Alaeus A, Lagging M (prosinec 2010). „IP-10 předpovídá pokles první fáze HCV RNA a celkovou virovou odpověď na terapii u pacientů současně infikovaných chronickou infekcí virem hepatitidy C a HIV“. Skandinávský žurnál infekčních nemocí. 42 (11–12): 896–901. doi:10.3109/00365548.2010.498019. PMID 20608766. S2CID 28542340.
^ Antonia AL, Gibbs KD, Trahair ED, Pittman KJ, Martin AT, Schott BH a kol. (2019). „Únik patogenu při reakci na chemokiny potlačením CXCL10“. Hranice v buněčné a infekční mikrobiologii. 9: 280. doi:10.3389 / fcimb.2019.00280. PMC 6693555. PMID 31440475.

externí odkazy

Člověk C7 umístění genomu a C7 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Člověk CXCL10 umístění genomu a CXCL10 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P02778 (C-X-C motiv chemokin 10) na PDBe-KB.

Další čtení

Farber JM (březen 1997). „Mig and IP-10: CXC chemokines that target lymphocytes“. Journal of Leukocyte Biology. 61 (3): 246–57. doi:10.1002 / jlb.61.3.246. PMID 9060447. S2CID 14935171.
Neville LF, Mathiak G, Bagasra O (září 1997). „Imunobiologie interferonu-gama indukovatelného proteinu 10 kD (IP-10): nový pleiotropní člen nadrodiny chemokinů C-X-C“. Hodnocení cytokinů a růstových faktorů. 8 (3): 207–19. doi:10.1016 / S1359-6101 (97) 00015-4. PMID 9462486.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169245 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034855 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid3925348-5] A ^b Luster AD, Unkeless JC, Ravetch JV (1985). „Gama-interferon transkripčně reguluje gen s časnou odezvou obsahující homologii s bílkovinami krevních destiček“. Příroda. 315 (6021): 672–6. doi:10.1038 / 315672a0. PMID 3925348. S2CID 4358066.

[pmid2437586-6] Luster AD, Jhanwar SC, Chaganti RS, Kersey JH, Ravetch JV (květen 1987). "Interferonem indukovatelné genové mapy na chromozomální pás spojený s (4; 11) translokací v buňkách akutní leukémie". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 84 (9): 2868–71. doi:10.1073 / pnas.84.9.2868. PMC 304761. PMID 2437586.

[pmid10343098-7] O'Donovan N, Galvin M, Morgan JG (1999). "Fyzické mapování chemokinového lokusu CXC na lidském chromozomu 4". Cytogenetika a genetika buněk. 84 (1–2): 39–42. doi:10.1159/000015209. PMID 10343098. S2CID 8087808.

[pmid11907072-8] Dufour JH, Dziejman M, Liu MT, Leung JH, Lane TE, Luster AD (duben 2002). „IFN-gama-indukovatelný protein 10 (IP-10; CXCL10) -deficitní myši odhalují roli IP-10 při generování a obchodování efektorových T buněk“. Journal of Immunology. 168 (7): 3195–204. doi:10,4049 / jimmunol.168.7.3195. PMID 11907072.

[pmid7540647-9] Angiolillo AL, Sgadari C, Taub DD, Liao F, Farber JM, Maheshwari S a kol. (Červenec 1995). „Lidský interferonem indukovatelný protein 10 je silným inhibitorem angiogeneze in vivo“. The Journal of Experimental Medicine. 182 (1): 155–62. doi:10.1084 / jem.182.1.155. PMC 2192108. PMID 7540647.

[pmid12173928-10] Booth V, Keizer DW, Kamphuis MB, Clark-Lewis I, Sykes BD (srpen 2002). "Chemokin vázající se na CXCR3 IP-10 / CXCL10: struktura a interakce s receptory". Biochemie. 41 (33): 10418–25. doi:10.1021 / bi026020q. PMID 12173928.

[pmid12737818-11] Swaminathan GJ, Holloway DE, Colvin RA, Campanella GK, Papageorgiou AC, Luster AD, Acharya KR (květen 2003). "Krystalové struktury oligomerních forem chemokinu IP-10 / CXCL10". Struktura. 11 (5): 521–32. doi:10.1016 / S0969-2126 (03) 00070-4. PMID 12737818.

[12] Altara R, Gu YM, Struijker-Boudier HA, Thijs L, Staessen JA, Blankesteijn WM (2015). „Dysfunkce levé komory a ligandy CXCR3 v hypertenzi: od experimentů na zvířatech po pilotní studii založenou na populaci“. PLOS ONE. 10 (10): e0141394. doi:10.1371 / journal.pone.0141394. PMC 4624781. PMID 26506526.

[13] Altara R, Manca M, Hessel MH, Gu Y, van Vark LC, Akkerhuis KM a kol. (Srpen 2016). „CXCL10 je cirkulující zánětlivý marker u pacientů s pokročilým srdečním selháním: pilotní studie“. Journal of Cardiovascular Translational Research. 9 (4): 302–14. doi:10.1007 / s12265-016-9703-3. PMID 27271043. S2CID 41188765.

[pmid16960776-14] Romero AI, Lagging M, Westin J, Dhillon AP, Dustin LB, Pawlotsky JM, et al. (Říjen 2006). „Interferon (IFN) -gama indukovatelný protein-10: asociace s histologickými výsledky, virovou kinetikou a výsledkem během léčby pegylovaným IFN-alfa 2a a ribavirinem pro chronickou infekci virem hepatitidy C“. The Journal of Infectious Diseases. 194 (7): 895–903. doi:10.1086/507307. PMID 16960776.

[pmid17133471-15] Lagging M, Romero AI, Westin J, Norkrans G, Dhillon AP, Pawlotsky JM, et al. (Prosinec 2006). „IP-10 předpovídá virovou odpověď a terapeutický výsledek u obtížně léčitelných pacientů s infekcí HCV genotypu 1“. Hepatologie. 44 (6): 1617–25. doi:10,1002 / hep. 21407. PMID 17133471. S2CID 27733803.

[pmid20186843-16] Askarieh G, Alsiö A, Pugnale P, Negro F, Ferrari C, Neumann AU a kol. (Květen 2010). „Systémový a intrahepatický protein indukovaný interferonem gama 10 kDa předpovídá pokles první fáze RNA viru hepatitidy C a celkovou virovou odpověď na léčbu chronické hepatitidy C“. Hepatologie. 51 (5): 1523–30. doi:10,1002 / hep. 23509. PMID 20186843. S2CID 205873437.

[pmid20608766-17] Falconer K, Askarieh G, Weis N, Hellstrand K, Alaeus A, Lagging M (prosinec 2010). „IP-10 předpovídá pokles první fáze HCV RNA a celkovou virovou odpověď na terapii u pacientů současně infikovaných chronickou infekcí virem hepatitidy C a HIV“. Skandinávský žurnál infekčních nemocí. 42 (11–12): 896–901. doi:10.3109/00365548.2010.498019. PMID 20608766. S2CID 28542340.

[18] Antonia AL, Gibbs KD, Trahair ED, Pittman KJ, Martin AT, Schott BH a kol. (2019). „Únik patogenu při reakci na chemokiny potlačením CXCL10“. Hranice v buněčné a infekční mikrobiologii. 9: 280. doi:10.3389 / fcimb.2019.00280. PMC 6693555. PMID 31440475.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]