CCL19 - CCL19

CCL19
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2MP1
Identifikátory
Aliasy	CCL19, CKb11, ELC, MIP-3b, MIP3B, SCYA19, C-C motiv chemokinový ligand 19
Externí ID	OMIM: 602227 MGI: 5434459 HomoloGene: 4569 Genové karty: CCL19
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	34,691,276 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	42,072,779 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba na chemokinový receptor CCR10; • aktivita cytokinů; • vazba na chemokinový receptor; • Vazba na chemokinový receptor CCR7; • chemokinová aktivita; • Vazba na chemokinový receptor CCR; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• extracelulární oblast; • intracelulární; • extracelulární;
Biologický proces	• uvolňování sekvestrovaného iontu vápníku do cytosolu; • pozitivní regulace receptorem zprostředkované endocytózy; • pozitivní regulace signalizace proteinkinázy B.; • pozitivní regulace motility buněk; • pozitivní regulace sestavy dendritických buněk; • aktivace aktivity JUN kinázy; • pozitivní regulace produkce interleukinu-12; • regulace sestavy projekce buněk; • chemotaxe monocytů; • pozitivní regulace diferenciace buněk T-pomocníka 1; • chemokiny zprostředkovaná signální dráha; • reakce na oxid dusnatý; • buněčná odpověď na faktor nekrózy nádoru; • Kostimulace T buněk; • reakce na virus; • buněčná homeostáza iontů vápníku; • zrání buněk; • chemotaxe myeloidních dendritických buněk; • pozitivní regulace JNK kaskády; • chemotaxe dendritických buněk; • pozitivní regulace aktivity 3-kinázy fosfatidylinositolu; • chemotaxe; • buněčná komunikace; • pozitivní regulace endocytózy; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy; • reakce na prostaglandin E.; • pozitivní regulace zpracování a prezentace antigenu dendritických buněk; • pozitivní regulace chemotaxe; • buněčná odpověď na interleukin-1; • pozitivní regulace proliferace T buněk; • imunitní odpověď; • pozitivní regulace kaskády ERK1 a ERK2; • stanovení polarity T buněk; • pozitivní regulace procesu biosyntézy glykoproteinů; • buněčná odpověď na interferon-gama; • pozitivní regulace produkce faktoru nekrózy nádorů; • pozitivní regulace signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • chemotaxe lymfocytů; • pozitivní regulace chemotaxe neutrofilů; • zánětlivá reakce; • tvorba imunologických synapsí; • zralá konvenční diferenciace dendritických buněk; • pozitivní regulace aktivity proteinkinázy; • antimikrobiální humorální imunitní odpověď zprostředkovaná antimikrobiálním peptidem; • regulace aktivity receptoru; • Signální dráha receptoru spřaženého s G-proteinem; • negativní regulace apoptotického procesu dendritických buněk; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu; • pozitivní regulace signalizace NIK / NF-kappaB; • chemotaxe neutrofilů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6363
	100861647
	ENSG00000172724
	ENSMUSG00000118633
	Q99731
	n / a
	NM_006274
	XM_006538413
	NP_006265
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Chemokinový ligand (motiv C-C) (CCL19) je a protein že u lidí je kódován CCL19 gen.^[5]^[6]

Tento gen je jedním z několika genů CC cytokinů seskupených na p-rameni chromozomu 9. Cytokiny jsou rodinou vylučovaných proteinů zapojených do imunoregulačních a zánětlivých procesů. CC cytokiny jsou proteiny charakterizované dvěma sousedícími cysteiny. Cytokin kódovaný tímto genem může hrát roli v normální recirkulaci lymfocytů a jejich navádění. Hraje také důležitou roli při obchodování T buněk v brzlíku a při migraci T buněk a B buněk do sekundárních lymfoidních orgánů. Specificky se váže na chemokinový receptor CCR7.^[6]

Chemokinový (motiv C-C) ligand 19 (CCL19) je malý cytokin patřící do CC chemokin rodina, která je také známá jako Chemokin ligandu EBI1 (ELC) a makrofágový zánětlivý protein-3-beta (MIP-3-beta). CCL19 je hojně exprimován v brzlík a lymfatické uzliny, se střední úrovní v průdušnice a dvojtečka a nízké hladiny v žaludku, tenké střevo, plíce, ledviny a slezina.^[7] Gen pro CCL19 je lokalizován na člověku chromozom 9.^[8] Tento chemokin vyvolává své účinky na své cílové buňky vazbou na chemokinový receptor chemokinový receptor CCR7.^[7] Přitahuje určité buňky imunitní systém, počítaje v to dendritické buňky a antigeny B buňky,^[9]^[10] CCR7 + T-buňky s centrální pamětí.^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000172724 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000118633 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Yoshida R, Imai T, Hieshima K, Kusuda J, Baba M, Kitaura M, Nishimura M, Kakizaki M, Nomiyama H, Yoshie O (červenec 1997). „Molekulární klonování nového chemokinu EBI1-ligand lidského CC chemokinu, který je specifickým funkčním ligandem pro EBI1, CCR7“. J Biol Chem. 272 (21): 13803–9. doi:10.1074 / jbc.272.21.13803. PMID 9153236.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CCL19 chemokin (motiv C-C) ligand 19“.
^ ^A ^b Yoshida R, Imai T, Hieshima K, Kusuda J, Baba M, Kitaura M, Nishimura M, Kakizaki M, Nomiyama H, Yoshie O (1997). „Molekulární klonování nového chemokinu EBI1-ligand lidského CC chemokinu, který je specifickým funkčním ligandem pro EBI1, CCR7“. J. Biol. Chem. 272 (21): 13803–9. doi:10.1074 / jbc.272.21.13803. PMID 9153236.
^ Rossi DL, Vicari AP, Franz-Bacon K, McClanahan TK, Zlotnik A (1997). „Identifikace dvou nových prozánětlivých lidských chemokinů makrofágy prostřednictvím bioinformatiky: MIP-3alfa a MIP-3beta“. J. Immunol. 158 (3): 1033–6. PMID 9013939.
^ Robbiani DF, Finch RA, Jäger D, Muller WA, Sartorelli AC, Randolph GJ (2000). „Transportér leukotrienu C (4) MRP1 reguluje mobilizaci dendritických buněk do lymfatických uzlin závislou na CCL19 (MIP-3beta, ELC)“. Buňka. 103 (5): 757–68. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00179-3. PMID 11114332. S2CID 15592251.
^ Reif K, Ekland EH, Ohl L, Nakano H, Lipp M, Förster R, Cyster JG (2002). "Vyvážená odezva na chemoatraktanty ze sousedních zón určuje polohu B-buněk". Příroda. 416 (6876): 94–9. doi:10.1038 / 416094a. PMID 11882900. S2CID 4403093.
^ Bromley SK, Thomas SY, Luster AD (2005). „Chemokinový receptor CCR7 vede výstup T buněk z periferních tkání a vstup do aferentních lymfatických uzlin“. Nat. Immunol. 6 (9): 895–901. doi:10.1038 / ni1240. PMID 16116469. S2CID 443455.

Další čtení

Weber C, Koenen RR (2006). „Vyladění leukocytových odpovědí: směrem k interkomomu chemokinů'". Trends Immunol. 27 (6): 268–73. doi:10.1016 / j.it.2006.04.002. PMID 16678487.
Rossi DL, Vicari AP, Franz-Bacon K a kol. (1997). "Identifikace dvou nových makrofágových prozánětlivých lidských chemokinů prostřednictvím bioinformatiky: MIP-3alfa a MIP-3beta". J. Immunol. 158 (3): 1033–6. PMID 9013939.
Nagira M, Imai T, Hieshima K a kol. (1997). „Molekulární klonování nového chemokinu sekundární lymfokidové tkáně lidského CC chemokinu, který je silným chemoatraktantem pro lymfocyty a mapován na chromozom 9p13“. J. Biol. Chem. 272 (31): 19518–24. doi:10.1074 / jbc.272.31.19518. PMID 9235955.
Kim CH, Pelus LM, White JR a kol. (1998). „Chemokin CK beta-11 / makrofágový zánětlivý protein-3 beta / EBI1-ligand je účinným chemoatraktantem pro T a B buňky“. J. Immunol. 160 (5): 2418–24. PMID 9498785.
Yanagihara S, Komura E, Nagafune J a kol. (1998). „EBI1 / CCR7 je novým členem chemokinového receptoru dendritických buněk, který je po zrání regulován up-up.“ J. Immunol. 161 (6): 3096–102. PMID 9743376.
Gosling J, Dairaghi DJ, Wang Y a kol. (2000). „Špička: identifikace nového chemokinového receptoru, který váže chemokiny aktivní na dendritické buňky a T buňky, včetně ELC, SLC a TECK“. J. Immunol. 164 (6): 2851–6. doi:10,4049 / jimmunol.164.6.2851. PMID 10706668.
Annunziato F, Romagnani P, Cosmi L a kol. (2000). „Chemokiny odvozené z makrofágů a chemokiny z ligandu EBI1 přitahují lidské thymocyty v různém stádiu vývoje a jsou produkovány odlišnými podskupinami dřeňových epitelových buněk: možné důsledky pro negativní selekci“. J. Immunol. 165 (1): 238–46. doi:10,4049 / jimmunol.165.1.238. PMID 10861057.
Ueno T, Hara K, Willis MS a kol. (2002). "Role pro CCR7 ligandy při emigraci nově generovaných T lymfocytů z novorozeneckého brzlíku". Imunita. 16 (2): 205–18. doi:10.1016 / S1074-7613 (02) 00267-4. PMID 11869682.
Phillips R, Ager A (2002). „Aktivace receptorů CXCL12 (SDF-1) citlivých na toxin pertussis zprostředkovává transendoteliální migraci T lymfocytů přes vysoko endoteliální buňky lymfatických uzlin“. Eur. J. Immunol. 32 (3): 837–47. doi:10.1002 / 1521-4141 (200203) 32: 3 <837 :: AID-IMMU837> 3.0.CO; 2-Q. PMID 11870628.
Till KJ, Lin K, Zuzel M, Cawley JC (2002). „Chemokinový receptor CCR7 a alfa4 integrin jsou důležité pro migraci buněk chronické lymfocytární leukémie do lymfatických uzlin“. Krev. 99 (8): 2977–84. doi:10,1182 / krev. V99.8.2977. PMID 11929789.
Townson JR, Nibbs RJ (2002). „Charakterizace myšího CCX-CKR, receptoru pro chemokiny přitahující lymfocyty TECK / mCCL25, SLC / mCCL21 a MIP-3beta / mCCL19: srovnání s lidským CCX-CKR“. Eur. J. Immunol. 32 (5): 1230–41. doi:10.1002 / 1521-4141 (200205) 32: 5 <1230 :: AID-IMMU1230> 3.0.CO; 2-L. PMID 11981810.
Strana G, Lebecque S, Miossec P (2002). „Anatomická lokalizace nezralých a zralých dendritických buněk v ektopickém lymfoidním orgánu: korelace se selektivní expresí chemokinů v revmatoidním synoviu“. J. Immunol. 168 (10): 5333–41. doi:10,4049 / jimmunol.168.10.5333. PMID 11994492.
Katou F, Ohtani H, Nakayama T a kol. (2003). "Diferenciální exprese CCL19 pomocí DC-Lamp + zralých dendritických buněk v lidské lymfatické uzlině versus chronicky zanícená kůže". J. Pathol. 199 (1): 98–106. doi:10,1002 / cesta. 1255. PMID 12474232. S2CID 25424987.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Scandella E, Men Y, Legler DF a kol. (2004). „Přenos signálu a migrace dendritických buněk spouštěný CCL19 / CCL21 vyžaduje prostaglandin E2“. Krev. 103 (5): 1595–601. doi:10.1182 / krev-2003-05-1643. PMID 14592837.
Corcione A, Arduino N, Ferretti E a kol. (2004). „CCL19 a CXCL12 spouští in vitro chemotaxi B lymfomů z lidských plášťových buněk“. Clin. Cancer Res. 10 (3): 964–71. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-1182-3. PMID 14871974.
Daikoku N, Kitaya K, Nakayama T a kol. (2004). "Exprese makrofágového zánětlivého proteinu-3beta v lidském endometriu během menstruačního cyklu". Plod Sterilní. 81 Suppl 1: 876–81. doi:10.1016 / j.fertnstert.2003.09.036. PMID 15019823.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Paoletti S, Petkovic V, Sebastiani S a kol. (2005). „Bohaté prostředí chemokinů silně zvyšuje migraci a aktivity leukocytů“. Krev. 105 (9): 3405–12. doi:10.1182 / krev-2004-04-1648. PMID 15546958.

externí odkazy

Člověk CCL19 umístění genomu a CCL19 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000172724 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000118633 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9153236-5] Yoshida R, Imai T, Hieshima K, Kusuda J, Baba M, Kitaura M, Nishimura M, Kakizaki M, Nomiyama H, Yoshie O (červenec 1997). „Molekulární klonování nového chemokinu EBI1-ligand lidského CC chemokinu, který je specifickým funkčním ligandem pro EBI1, CCR7“. J Biol Chem. 272 (21): 13803–9. doi:10.1074 / jbc.272.21.13803. PMID 9153236.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: CCL19 chemokin (motiv C-C) ligand 19“.

[Yoshida_1997-7] A ^b Yoshida R, Imai T, Hieshima K, Kusuda J, Baba M, Kitaura M, Nishimura M, Kakizaki M, Nomiyama H, Yoshie O (1997). „Molekulární klonování nového chemokinu EBI1-ligand lidského CC chemokinu, který je specifickým funkčním ligandem pro EBI1, CCR7“. J. Biol. Chem. 272 (21): 13803–9. doi:10.1074 / jbc.272.21.13803. PMID 9153236.

[pmid9013939-8] Rossi DL, Vicari AP, Franz-Bacon K, McClanahan TK, Zlotnik A (1997). „Identifikace dvou nových prozánětlivých lidských chemokinů makrofágy prostřednictvím bioinformatiky: MIP-3alfa a MIP-3beta“. J. Immunol. 158 (3): 1033–6. PMID 9013939.

[pmid11114332-9] Robbiani DF, Finch RA, Jäger D, Muller WA, Sartorelli AC, Randolph GJ (2000). „Transportér leukotrienu C (4) MRP1 reguluje mobilizaci dendritických buněk do lymfatických uzlin závislou na CCL19 (MIP-3beta, ELC)“. Buňka. 103 (5): 757–68. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00179-3. PMID 11114332. S2CID 15592251.

[pmid11882900-10] Reif K, Ekland EH, Ohl L, Nakano H, Lipp M, Förster R, Cyster JG (2002). "Vyvážená odezva na chemoatraktanty ze sousedních zón určuje polohu B-buněk". Příroda. 416 (6876): 94–9. doi:10.1038 / 416094a. PMID 11882900. S2CID 4403093.

[pmid16116469-11] Bromley SK, Thomas SY, Luster AD (2005). „Chemokinový receptor CCR7 vede výstup T buněk z periferních tkání a vstup do aferentních lymfatických uzlin“. Nat. Immunol. 6 (9): 895–901. doi:10.1038 / ni1240. PMID 16116469. S2CID 443455.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]