Lymphotoxin beta - Lymphotoxin beta

LTB
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4MXW
Identifikátory
Aliasy	LTB, TNFC, TNFSF3, p33, lymfotoxin beta, TNLG1C
Externí ID	OMIM: 600978 MGI: 104796 HomoloGene: 1752 Genové karty: LTB
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	31,582,522 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	35,196,320 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na receptor faktoru nekrotizující nádory; • aktivita cytokinů; • vazba na receptory;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • buněčná membrána; • membrána; • extracelulární; • buněčná složka;
Biologický proces	• signalizace buňka-buňka; • signální dráha zprostředkovaná faktorem nekrózy nádorů; • vývoj lymfatických uzlin; • genová exprese; • imunitní odpověď; • signální transdukce; • vývoj kůže; • regulace aktivity receptoru;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4050
	16994
ENSG00000223448; ENSG00000238114; ENSG00000236925; ENSG00000231314; ENSG00000204487;
	ENSG00000236237; ENSG00000227507; ENSG00000206437
	ENSMUSG00000024399
	Q06643
	P41155
	NM_009588; NM_002341
	NM_008518
	NP_002332; NP_033666
	NP_032544
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Lymfotoxin-beta (LT-beta) také známý jako faktor nekrózy nádorů C. (TNF-C) je a protein že u lidí je kódován LTB gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Lymphotoxin beta je membránový protein typu II Rodina TNF. Ukotví to lymfotoxin-alfa na buněčný povrch tvorbou heterotrimeru. Převládající forma na lymfocyt povrch je komplex lymfotoxin-alfa 1 / beta 2 (např. 1 molekula alfa / 2 molekuly beta) a tento komplex je primárním ligandem pro receptor lymfotoxinu-beta. Vedlejším komplexem je lymfotoxin-alfa 2 / beta 1. LTB je induktorem systému zánětlivé odpovědi a podílí se na normálním vývoji lymfoidní tkáně. Izoforma b lymfotoxinu-beta není schopna komplexu s lymfotoxinem-alfa, což naznačuje funkci pro lymfotoxin-beta, která je nezávislá na lymfotoxinu-alfa. Výsledkem alternativního sestřihu je více variant transkriptu kódujících různé izoformy.^[7]

Pro-tumorigenní funkce membránového LT je jasně stanovena: myši s nadměrnou expresí LTα nebo LTp vykazovaly zvýšený růst nádoru a metastázy u několika modelů rakoviny. Tyto studie však využívaly myši s úplným nedostatkem genu LTa, které neumožňovaly rozlišit účinky rozpustného a membránového LT.^[8]

Interakce

Bylo prokázáno, že LTB komunikovat s Lymfotoxin alfa.^[9]^[10]^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000238114, ENSG00000236925, ENSG00000231314, ENSG00000204487, ENSG00000236237, ENSG00000227507, ENSG00000206437 GRCh38: Ensembl uvolnění 89: ENSG00000223448, ENSG00000238114, ENSG00000236925, ENSG00000231314, ENSG00000204487, ENSG00000236237, ENSG00000227507, ENSG00000206437 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024399 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Browning JL, Ngam-ek A, Lawton P, DeMarinis J, Tizard R, Chow EP, Hession C, O'Brine-Greco B, Foley SF, Ware CF (březen 1993). „Lymphotoxin beta, nový člen rodiny TNF, který tvoří heteromerní komplex s lymfhotoxinem na buněčném povrchu“. Buňka. 72 (6): 847–56. doi:10.1016 / 0092-8674 (93) 90574-A. PMID 7916655. S2CID 28961163.
^ Browning JL, Androlewicz MJ, Ware CF (srpen 1991). „Lymphotoxin a přidružený 33-kDa glykoprotein jsou exprimovány na povrchu aktivovaného hybridomu lidských T buněk“. Journal of Immunology. 147 (4): 1230–7. PMID 1714477.
^ ^A ^b „Entrez Gene: LTB lymphotoxin beta (TNF superfamily, member 3)“.
^ Korneev, KV; Atretkhany, KN; Drutskaya, MS; Grivennikov, SI; Kuprash, DV; Nedospasov, SA (leden 2017). „TLR-signální a prozánětlivé cytokiny jako hybné síly tumorigeneze“. Cytokin. 89: 127–135. doi:10.1016 / j.cyto.2016.01.021. PMID 26854213.
^ Williams-Abbott L, Walter BN, Cheung TC, Goh CR, Porter AG, Ware CF (srpen 1997). „Podjednotka lymfhotoxin-alfa (LTalpha) je nezbytná pro sestavení, ale ne pro specifičnost receptoru, heterotrimerního ligandu LTalpha1beta2 zakotveného v membráně.“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (31): 19451–6. doi:10.1074 / jbc.272.31.19451. PMID 9235946.
^ Browning JL, Sizing ID, Lawton P, Bourdon PR, Rennert PD, Majeau GR, Ambrose CM, Hession C, Miatkowski K, Griffiths DA, Ngam-ek A, Meier W, Benjamin CD, Hochman PS (říjen 1997). "Charakterizace komplexů lymfhotoxin-alfa beta na povrchu myších lymfocytů". Journal of Immunology. 159 (7): 3288–98. PMID 9317127.
^ Browning JL, Dougas I, Ngam-ek A, Bourdon PR, Ehrenfels BN, Miatkowski K, Zafari M, Yampaglia AM, Lawton P, Meier W (leden 1995). „Charakterizace povrchových forem lymfotoxinu. Použití specifických monoklonálních protilátek a rozpustných receptorů“. Journal of Immunology. 154 (1): 33–46. PMID 7995952.

Další čtení

Messer G, Spengler U, Jung MC, Honold G, Blömer K, Pape GR, Riethmüller G, Weiss EH (leden 1991). „Polymorfní struktura lokusu faktoru nekrotizujícího nádory (TNF): polymorfismus Ncol v prvním intronu lidského genu TNF-beta koreluje s variantní aminokyselinou v pozici 26 a sníženou úrovní produkce TNF-beta“. The Journal of Experimental Medicine. 173 (1): 209–19. doi:10.1084 / jem.173.1.209. PMC 2118757. PMID 1670638.
Abraham LJ, Du DC, Zahedi K, Dawkins RL, Whitehead AS (1991). "Haplotypické polymorfismy genu TNFB". Imunogenetika. 33 (1): 50–3. doi:10.1007 / BF00211695. PMID 1671667. S2CID 38756894.
Nedwin GE, Naylor SL, Sakaguchi AY, Smith D, Jarrett-Nedwin J, Pennica D, Goeddel DV, Gray PW (září 1985). „Geny pro lidský lymfotoxin a faktor nekrotizující nádory: struktura, homologie a chromozomální lokalizace“. Výzkum nukleových kyselin. 13 (17): 6361–73. doi:10.1093 / nar / 13.17.6361. PMC 321958. PMID 2995927.
Holzinger I, de Baey A, Messer G, Kick G, Zwierzina H, Weiss EH (1995). "Klonování a genomová charakterizace LST1: nový gen v lidské oblasti TNF". Imunogenetika. 42 (5): 315–22. doi:10.1007 / BF00179392. PMID 7590964. S2CID 19916860.
Peelman LJ, Chardon P, Nunes M, Renard C, Geffrotin C, Vaiman M, Van Zeveren A, Coppieters W, van de Weghe A, Bouquet Y (březen 1995). „Gen BAT1 v MHC kóduje evolučně konzervativní domnělou domnělou nukleovou RNA helikázu rodiny DEAD“. Genomika. 26 (2): 210–8. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80203-X. PMID 7601445.
Browning JL, Dougas I, Ngam-ek A, Bourdon PR, Ehrenfels BN, Miatkowski K, Zafari M, Yampaglia AM, Lawton P, Meier W (leden 1995). „Charakterizace povrchových forem lymfotoxinu. Použití specifických monoklonálních protilátek a rozpustných receptorů“. Journal of Immunology. 154 (1): 33–46. PMID 7995952.
Albertella MR, Campbell RD (květen 1994). „Charakterizace nového genu v lidském hlavním histokompatibilním komplexu, který kóduje potenciálního nového člena rodiny proteinů I kappa B“. Lidská molekulární genetika. 3 (5): 793–9. doi:10,1093 / hmg / 3,5,793. PMID 8081366.
Iris FJ, Bougueleret L, Prieur S, Caterina D, Primas G, Perrot V, Jurka J, Rodriguez-Tome P, Claverie JM, Dausset J (únor 1993). "Husté Alu shlukování a potenciální nový člen rodiny NF kappa B v rámci 90kbase HLA třídy III segmentu". Genetika přírody. 3 (2): 137–45. doi:10.1038 / ng0293-137. PMID 8499947. S2CID 33041319.
Nakamura T, Tashiro K, Nazarea M, Nakano T, Sasayama S, Honjo T (listopad 1995). „Myší lymfotoxin-beta receptorová cDNA: izolace zachycovačem signální sekvence a chromozomální mapování“. Genomika. 30 (2): 312–9. doi:10.1006 / geno.1995,9872. hdl:2433/202166. PMID 8586432.
Utans U, Quist WC, McManus BM, Wilson JE, Arceci RJ, Wallace AF, Russell ME (květen 1996). "Aloimplantát zánětlivá továrna-1. Molekula makrofága reagující na cytokiny exprimovaná v transplantovaných lidských srdcích". Transplantace. 61 (9): 1387–92. doi:10.1097/00007890-199605150-00018. PMID 8629302.
Nalabolu SR, Shukla H, Nallur G, Parimoo S, Weissman SM (leden 1996). "Geny v oblasti 220 kb překlenující klastr TNF v lidském MHC". Genomika. 31 (2): 215–22. doi:10.1006 / geno.1996.0034. PMID 8824804.
Laham N, Van Dunné F, Abraham LJ, Farrugia W, Bendtzen K, Brennecke SP, Rice GE (duben 1997). „Faktor beta nekrózy nádoru v těhotenství a při porodu“. Journal of Reproductive Immunology. 33 (1): 53–69. doi:10.1016 / S0165-0378 (97) 01012-7. PMID 9185077.
Warzocha K, Renard N, Charlot C, Bienvenu J, Coiffier B, Salles G (září 1997). "Identifikace dvou izoforem lymfotoxinu beta exprimovaných v lidských lymfoidních buněčných liniích a nehodgkinských lymfomech". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 238 (2): 273–6. doi:10.1006 / bbrc.1997.7277. PMID 9299492.
Browning JL, Sizing ID, Lawton P, Bourdon PR, Rennert PD, Majeau GR, Ambrose CM, Hession C, Miatkowski K, Griffiths DA, Ngam-ek A, Meier W, Benjamin CD, Hochman PS (říjen 1997). "Charakterizace komplexů lymfhotoxin-alfa beta na povrchu myších lymfocytů". Journal of Immunology. 159 (7): 3288–98. PMID 9317127.
de Baey A, Fellerhoff B, Maier S, Martinozzi S, Weidle U, Weiss EH (listopad 1997). "Složitý vzor exprese genu pro oblast TNF LST1 prostřednictvím diferenciální regulace, iniciace a alternativního sestřihu". Genomika. 45 (3): 591–600. doi:10.1006 / geno.1997.4963. PMID 9367684.
Shiina T, Tamiya G, Oka A, Yamagata T, Yamagata N, Kikkawa E, Goto K, Mizuki N, Watanabe K, Fukuzumi Y, Taguchi S, Sugawara C, Ono A, Chen L, Yamazaki M, Tashiro H, Ando A , Ikemura T, Kimura M, Inoko H (únor 1998). „Nukleotidová sekvenční analýza segmentu 146 kilobáz kolem genů IkBL a MICA na centromerickém konci oblasti HLA třídy I“. Genomika. 47 (3): 372–82. doi:10.1006 / geno.1997.5114. PMID 9480751.
Bodor J, Habener JF (duben 1998). „Role transkripčního represoru ICER v cyklickém zeslabení exprese genu pro cytokiny v lidských thymocytech zprostředkovaném AMP“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (16): 9544–51. doi:10.1074 / jbc.273.16.9544. PMID 9545284.
Neville MJ, Campbell RD (duben 1999). „Nový člen nadrodiny Ig a podjednotka V-ATPázy G patří mezi predikované produkty nových genů blízkých lokusu TNF v humánním MHC.“ Journal of Immunology. 162 (8): 4745–54. PMID 10202016.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000238114, ENSG00000236925, ENSG00000231314, ENSG00000204487, ENSG00000236237, ENSG00000227507, ENSG00000206437 GRCh38: Ensembl uvolnění 89: ENSG00000223448, ENSG00000238114, ENSG00000236925, ENSG00000231314, ENSG00000204487, ENSG00000236237, ENSG00000227507, ENSG00000206437 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024399 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7916655-5] Browning JL, Ngam-ek A, Lawton P, DeMarinis J, Tizard R, Chow EP, Hession C, O'Brine-Greco B, Foley SF, Ware CF (březen 1993). „Lymphotoxin beta, nový člen rodiny TNF, který tvoří heteromerní komplex s lymfhotoxinem na buněčném povrchu“. Buňka. 72 (6): 847–56. doi:10.1016 / 0092-8674 (93) 90574-A. PMID 7916655. S2CID 28961163.

[pmid1714477-6] Browning JL, Androlewicz MJ, Ware CF (srpen 1991). „Lymphotoxin a přidružený 33-kDa glykoprotein jsou exprimovány na povrchu aktivovaného hybridomu lidských T buněk“. Journal of Immunology. 147 (4): 1230–7. PMID 1714477.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: LTB lymphotoxin beta (TNF superfamily, member 3)“.

[8] Korneev, KV; Atretkhany, KN; Drutskaya, MS; Grivennikov, SI; Kuprash, DV; Nedospasov, SA (leden 2017). „TLR-signální a prozánětlivé cytokiny jako hybné síly tumorigeneze“. Cytokin. 89: 127–135. doi:10.1016 / j.cyto.2016.01.021. PMID 26854213.

[pmid9235946-9] Williams-Abbott L, Walter BN, Cheung TC, Goh CR, Porter AG, Ware CF (srpen 1997). „Podjednotka lymfhotoxin-alfa (LTalpha) je nezbytná pro sestavení, ale ne pro specifičnost receptoru, heterotrimerního ligandu LTalpha1beta2 zakotveného v membráně.“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (31): 19451–6. doi:10.1074 / jbc.272.31.19451. PMID 9235946.

[pmid9317127-10] Browning JL, Sizing ID, Lawton P, Bourdon PR, Rennert PD, Majeau GR, Ambrose CM, Hession C, Miatkowski K, Griffiths DA, Ngam-ek A, Meier W, Benjamin CD, Hochman PS (říjen 1997). "Charakterizace komplexů lymfhotoxin-alfa beta na povrchu myších lymfocytů". Journal of Immunology. 159 (7): 3288–98. PMID 9317127.

[pmid7995952-11] Browning JL, Dougas I, Ngam-ek A, Bourdon PR, Ehrenfels BN, Miatkowski K, Zafari M, Yampaglia AM, Lawton P, Meier W (leden 1995). „Charakterizace povrchových forem lymfotoxinu. Použití specifických monoklonálních protilátek a rozpustných receptorů“. Journal of Immunology. 154 (1): 33–46. PMID 7995952.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]