CCL5 - CCL5

CCL5
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1B3A, 1EQT, 1 HRJ, 1RTN, 1 RTO, 1U4L, 1U4M, 1U4P, 1U4R, 2L9H, 2VXW, 5 CMD, 5DNF, 5 COY
Identifikátory
Aliasy	CCL5, D17S136E, RANTES, SCYA5, SIS-delta, SISd, TCP228, eoCP, chemokinový ligand s motivem CC
Externí ID	OMIM: 187011 MGI: 98262 HomoloGene: 2244 Genové karty: CCL5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	35,880,793 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	83,530,518 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba na chemokinový receptor CCR5; • aktivita aktivátoru receptorového signálního proteinu tyrosinkinázy; • chemokinová aktivita; • proteinová asociace; • Vazba na chemokinový receptor CCR4; • aktivita fosfatidylinositol fosfolipázy C.; • aktivita proteinkinázy; • aktivita cytokinů; • Vazba na chemokinový receptor CCR1; • aktivita aktivátoru fosfolipázy; • vazba na chemokinový receptor; • aktivita homodimerizace proteinu; • aktivita antagonisty chemokinového receptoru; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • chemoatraktivní aktivita; • identická vazba na protein; • Vazba na chemokinový receptor CCR;
Buněčná složka	• cytoplazma; • extracelulární oblast; • extracelulární;
Biologický proces	• adheze leukocytů buňka-buňka; • pozitivní regulace buněčné adheze zprostředkované integrinem; • regulace aktivace T buněk; • pozitivní regulace migrace buněk hladkého svalstva; • aktivace aktivity fosfolipázy D.; • negativní regulace replikace virového genomu; • pozitivní regulace kaskády ERK1 a ERK2; • pozitivní regulace vrozené imunitní odpovědi; • buněčná odpověď na interferon-gama; • pozitivní regulace chemotaxe makrofágů; • transport iontů vápníku; • exocytóza; • pozitivní regulace transportu iontů vápníku; • reakce na cytokiny; • regulace sekrece inzulínu; • chemokiny zprostředkovaná signální dráha; • pozitivní regulace buněčného biosyntetického procesu; • reakce na virus; • pozitivní regulace chemotaxe monocytů; • buněčná odpověď na stimul fibroblastového růstového faktoru; • chemotaxe neutrofilů; • reakce na faktor nekrózy nádoru; • negativní regulace apoptotického procesu T buněk; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy; • negativní regulace apoptotického procesu makrofágů; • pozitivní regulace proliferace T buněk; • pozitivní regulace fosforylace; • zánětlivá reakce; • pozitivní regulace iniciace translace; • reakce na toxickou látku; • pozitivní regulace proliferace epiteliálních buněk; • pozitivní regulace fosforylace tyrosinu STAT proteinu; • buněčná odpověď na organickou cyklickou sloučeninu; • buněčná homeostáza iontů vápníku; • tetramerizace bílkovin; • chemotaxe; • pozitivní regulace homotypické adheze buněk k buňkám; • buněčná odpověď na interleukin-1; • imunitní odpověď; • pozitivní regulace replikace virového genomu; • pozitivní regulace kaskády JAK-STAT; • lipopolysacharidem zprostředkovaná signální dráha; • pozitivní regulace migrace T buněk; • regulace chronické zánětlivé odpovědi; • pozitivní regulace proliferace buněk hladkého svalstva; • aktivace neutrofilů; • signalizace protein kinázy B.; • pozitivní regulace buněčné migrace; • pozitivní regulace přirozené chemotaxe zabíječských buněk; • signalizace buňka-buňka; • eosinofilní chemotaxe; • chemotaxe dendritických buněk; • Kaskáda MAPK; • makrofágová chemotaxe; • pozitivní regulace chemotaxe T buněk; • regulace neuronové smrti; • pozitivní regulace signalizace fosfatidylinositol 3-kinázy; • negativní regulace signální dráhy receptorového proteinu spřaženého s G-proteinem; • pozitivní regulace apoptotického procesu T buněk; • pozitivní regulace buněčné adheze; • negativní regulace chemokinem zprostředkované signální dráhy; • chemotaxe monocytů; • pozitivní chemotaxe; • pozitivní regulace aktivity protein tyrosin kinázy; • buněčná odpověď na faktor nekrózy nádoru; • pozitivní regulace aktivace aktivity Janus kinázy; • regulace aktivity receptoru; • Signální dráha receptoru spřaženého s G-proteinem; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu; • chemotaxe lymfocytů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6352
	20304
	ENSG00000271503; ENSG00000274233
	ENSMUSG00000035042
	P13501
	P30882
	NM_002985; NM_001278736
	NM_013653
	NP_001265665; NP_002976
	NP_038681
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Chemokinový (motiv C-C) ligand 5 (taky CCL5) je protein který je u lidí kódován CCL5 gen.^[5] Je také známý jako RANTES (regulováno aktivací, normální T buňka exprimována a vylučována).

Funkce

CCL5 je 8kDa protein klasifikováno jako a chemotaktický cytokin nebo chemokin. CCL5 je chemotaktický pro T buňky, eosinofily, a bazofily a hraje aktivní roli při náboru leukocyty do zánětlivých míst. S pomocí zejména cytokiny (tj., IL-2 a IFN-y ), které jsou uvolněny T buňky CCL5 také indukuje proliferaci a aktivaci určitých přírodních zabijáků (NK ) buňky za vzniku buněk CHAK (zabiják aktivovaný CC-chemokiny).^[6] Je to také HIV -upresivní faktor uvolněný z CD8 + T buňky^{[Citace je zapotřebí ]}. Tento chemokin byl lokalizován chromozom 17 u lidí.^[5]

RANTES byl poprvé identifikován při hledání genů vyjádřených „pozdě“ (3–5 dní) poté T buňka aktivace. Následně bylo rozhodnuto, že bude CC chemokin a vyjádřeno u více než 100 lidských onemocnění. Exprese RANTES je regulována v T lymfocytech faktorem 13 jako Kruppel (KLF13 ).^[7]^[8]^[9]^[10] RANTES byl spolu s příbuznými chemokiny MIP-1alfa a MIP-lbeta identifikován jako přírodní faktor potlačující HIV vylučovaný aktivovanými CD8 + T buňkami a dalšími imunitními buňkami.^[11] Nedávno byl vyvinut protein RANTES in vivo Produkce bakteriemi Lactobacillus a toto řešení se vyvíjí do možného topického mikrobicidu inhibujícího vstup HIV.^[12]

Interakce

CCL5 bylo prokázáno komunikovat s CCR3, ^[13]^[14] CCR5^[14]^[15]^[16] a CCR1.^[14]^[16]

CCL5 také aktivuje receptor spojený s G-proteinem GPR75. ^[17]

Viz také

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000274233 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000271503, ENSG00000274233 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035042 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Donlon TA, Krensky AM, Wallace MR, Collins FS, Lovett M, Clayberger C (březen 1990). „Lokalizace genu specifického pro lidské T-buňky, RANTES (D17S136E), do chromozomu 17q11.2-q12“ (PDF). Genomika. 6 (3): 548–53. doi:10.1016 / 0888-7543 (90) 90485-D. hdl:2027.42/28717. PMID 1691736.
^ Maghazachi AA, Al-Aoukaty A, Schall TJ (únor 1996). „CC chemokiny indukují generaci zabijáckých buněk z buněk CD56 +“. Eur. J. Immunol. 26 (2): 315–9. doi:10.1002 / eji.1830260207. PMID 8617297.
^ Schall TJ, Jongstra J, Dyer BJ, Jorgensen J, Clayberger C, Davis MM, Krensky AM (srpen 1988). „Molekula specifická pro lidské T buňky je členem nové genové rodiny“. J. Immunol. 141 (3): 1018–25. PMID 2456327.
^ Alan M. Krensky (1995). Biologie chemokinu v Rantes (Molecular Biology Intelligence Unit). R G Landes Co. ISBN 978-1-57059-253-9.
^ Song A, Chen YF, Thamatrakoln K, Storm TA, Krensky AM (leden 1999). „RFLAT-1: nový transkripční faktor se zinkovým prstem, který aktivuje expresi genu RANTES v T lymfocytech“. Imunita. 10 (1): 93–103. doi:10.1016 / S1074-7613 (00) 80010-2. PMID 10023774.
^ Song A, Nikolcheva T, Krensky AM (říjen 2000). "Transkripční regulace exprese RANTES v T lymfocytech". Immunol. Rev. 177: 236–45. doi:10.1034 / j.1600-065X.2000.17610.x. PMID 11138780. S2CID 30184294.
^ Cocchi F, DeVico AL, Garzino-Demo A, Arya SK, Gallo RC, Lusso P (prosinec 1995). „Identifikace RANTES, MIP-1 alfa a MIP-1 beta jako hlavních faktorů potlačujících HIV produkovaných CD8 + T buňkami“. Věda. 270 (5243): 1811–5. doi:10.1126 / science.270.5243.1811. PMID 8525373. S2CID 84062618.
^ Vangelista L, Secchi M, Liu X, Bachi A, Jia L, Xu Q, Lusso P (červenec 2010). „Inženýrství Lactobacillus jensenii k vylučování RANTES a analogu antagonisty CCR5 jako živých blokátorů HIV-1“. Antimicrob. Agenti Chemother. 54 (7): 2994–3001. doi:10.1128 / AAC.01492-09. PMC 2897324. PMID 20479208. Shrnutí ležel – Věda denně.
^ Daugherty BL, Siciliano SJ, DeMartino JA, Malkowitz L, Sirotina A, Springer MS (květen 1996). "Klonování, exprese a charakterizace lidského eosinofilního eotaxinového receptoru". J. Exp. Med. 183 (5): 2349–54. doi:10.1084 / jem.183.5.2349. PMC 2192548. PMID 8642344.
^ ^A ^b ^C Struyf S, Menten P, Lenaerts JP, Put W, D'Haese A, De Clercq E, Schols D, Proost P, Van Damme J (červenec 2001). „Odlišné vazebné kapacity přirozených izoforem LD78beta makrofágového zánětlivého proteinu-1alfa na CC chemokinové receptory 1, 3 a 5 ovlivňují jejich anti-HIV-1 aktivitu a chemotaktickou účinnost pro neutrofily a eosinofily.“ Eur. J. Immunol. 31 (7): 2170–8. doi:10.1002 / 1521-4141 (200107) 31: 7 <2170 :: AID-IMMU2170> 3.0.CO; 2-D. PMID 11449371.
^ Slimani H, Charnaux N, Mbemba E, Saffar L, Vassy R, Vita C, Gattegno L (říjen 2003). "Interakce RANTES se syndekanem-1 a syndekanem-4 vyjádřeným lidskými primárními makrofágy". Biochim. Biophys. Acta. 1617 (1–2): 80–8. doi:10.1016 / j.bbamem.2003.09.006. PMID 14637022.
^ ^A ^b Proudfoot AE, Fritchley S, Borlat F, Shaw JP, Vilbois F, Zwahlen C, Trkola A, Marchant D, Clapham PR, Wells TN (duben 2001). „Motiv BBXB RANTES je hlavním místem pro vazbu heparinu a řídí selektivitu receptoru“. J. Biol. Chem. 276 (14): 10620–6. doi:10,1074 / jbc.M010867200. PMID 11116158.
^ Ignatov A, Robert J, Gregory-Evans C, Schaller HC (listopad 2006). „RANTES stimuluje mobilizaci Ca2 + a tvorbu inositol trisfosfátu (IP3) v buňkách transfektovaných receptorem spojeným s G proteinem 75“. Br. J. Pharmacol. 149 (5): 490–7. doi:10.1038 / sj.bjp.0706909. PMC 2014681. PMID 17001303.

externí odkazy

Člověk CCL5 umístění genomu a CCL5 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P13501 (C-C motiv chemokin 5) na PDBe-KB.

Další čtení

Muthumani K, Desai BM, Hwang DS, Choo AY, Laddy DJ, Thieu KP, Rao RG, Weiner DB (2004). „HIV-1 Vpr a protizánětlivá aktivita“. DNA Cell Biol. 23 (4): 239–47. doi:10.1089/104454904773819824. PMID 15142381.
Zhao RY, Elder RT (2005). „Virové infekce a regulace buněčného cyklu G2 / M“. Cell Res. 15 (3): 143–9. doi:10.1038 / sj.cr.7290279. PMID 15780175.
Zhao RY, Bukrinsky M, Elder RT (2005). „HIV-1 virový protein R (Vpr) a buněčné odpovědi hostitele“. Indian J. Med. Res. 121 (4): 270–86. PMID 15817944.
Li L, Li HS, Pauza CD, Bukrinsky M, Zhao RY (2006). "Role pomocných proteinů HIV-1 ve virové patogenezi a interakcích hostitel-patogen". Cell Res. 15 (11–12): 923–34. doi:10.1038 / sj.cr.7290370. PMID 16354571.
Ignatov A, Robert J, Gregory-Evans C, Schaller HC (listopad 2006). „RANTES stimuluje mobilizaci Ca2 + a tvorbu inositol trisfosfátu (IP3) v buňkách transfektovaných receptorem spojeným s G proteinem 75“. Br J Pharmacol. 149 (5): 490–7. doi:10.1038 / sj.bjp.0706909. PMC 2014681. PMID 17001303.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000274233 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000271503, ENSG00000274233 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035042 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1691736-5] A ^b Donlon TA, Krensky AM, Wallace MR, Collins FS, Lovett M, Clayberger C (březen 1990). „Lokalizace genu specifického pro lidské T-buňky, RANTES (D17S136E), do chromozomu 17q11.2-q12“ (PDF). Genomika. 6 (3): 548–53. doi:10.1016 / 0888-7543 (90) 90485-D. hdl:2027.42/28717. PMID 1691736.

[pmid8617297-6] Maghazachi AA, Al-Aoukaty A, Schall TJ (únor 1996). „CC chemokiny indukují generaci zabijáckých buněk z buněk CD56 +“. Eur. J. Immunol. 26 (2): 315–9. doi:10.1002 / eji.1830260207. PMID 8617297.

[pmid2456327-7] Schall TJ, Jongstra J, Dyer BJ, Jorgensen J, Clayberger C, Davis MM, Krensky AM (srpen 1988). „Molekula specifická pro lidské T buňky je členem nové genové rodiny“. J. Immunol. 141 (3): 1018–25. PMID 2456327.

[isbn1-57059-253-5-8] Alan M. Krensky (1995). Biologie chemokinu v Rantes (Molecular Biology Intelligence Unit). R G Landes Co. ISBN 978-1-57059-253-9.

[pmid10023774-9] Song A, Chen YF, Thamatrakoln K, Storm TA, Krensky AM (leden 1999). „RFLAT-1: nový transkripční faktor se zinkovým prstem, který aktivuje expresi genu RANTES v T lymfocytech“. Imunita. 10 (1): 93–103. doi:10.1016 / S1074-7613 (00) 80010-2. PMID 10023774.

[pmid11138780-10] Song A, Nikolcheva T, Krensky AM (říjen 2000). "Transkripční regulace exprese RANTES v T lymfocytech". Immunol. Rev. 177: 236–45. doi:10.1034 / j.1600-065X.2000.17610.x. PMID 11138780. S2CID 30184294.

[pmid8525373-11] Cocchi F, DeVico AL, Garzino-Demo A, Arya SK, Gallo RC, Lusso P (prosinec 1995). „Identifikace RANTES, MIP-1 alfa a MIP-1 beta jako hlavních faktorů potlačujících HIV produkovaných CD8 + T buňkami“. Věda. 270 (5243): 1811–5. doi:10.1126 / science.270.5243.1811. PMID 8525373. S2CID 84062618.

[pmid20479208-12] Vangelista L, Secchi M, Liu X, Bachi A, Jia L, Xu Q, Lusso P (červenec 2010). „Inženýrství Lactobacillus jensenii k vylučování RANTES a analogu antagonisty CCR5 jako živých blokátorů HIV-1“. Antimicrob. Agenti Chemother. 54 (7): 2994–3001. doi:10.1128 / AAC.01492-09. PMC 2897324. PMID 20479208. Shrnutí ležel – Věda denně.

[pmid8642344-13] Daugherty BL, Siciliano SJ, DeMartino JA, Malkowitz L, Sirotina A, Springer MS (květen 1996). "Klonování, exprese a charakterizace lidského eosinofilního eotaxinového receptoru". J. Exp. Med. 183 (5): 2349–54. doi:10.1084 / jem.183.5.2349. PMC 2192548. PMID 8642344.

[pmid11449371-14] A ^b ^C Struyf S, Menten P, Lenaerts JP, Put W, D'Haese A, De Clercq E, Schols D, Proost P, Van Damme J (červenec 2001). „Odlišné vazebné kapacity přirozených izoforem LD78beta makrofágového zánětlivého proteinu-1alfa na CC chemokinové receptory 1, 3 a 5 ovlivňují jejich anti-HIV-1 aktivitu a chemotaktickou účinnost pro neutrofily a eosinofily.“ Eur. J. Immunol. 31 (7): 2170–8. doi:10.1002 / 1521-4141 (200107) 31: 7 <2170 :: AID-IMMU2170> 3.0.CO; 2-D. PMID 11449371.

[pmid14637022-15] Slimani H, Charnaux N, Mbemba E, Saffar L, Vassy R, Vita C, Gattegno L (říjen 2003). "Interakce RANTES se syndekanem-1 a syndekanem-4 vyjádřeným lidskými primárními makrofágy". Biochim. Biophys. Acta. 1617 (1–2): 80–8. doi:10.1016 / j.bbamem.2003.09.006. PMID 14637022.

[pmid11116158-16] A ^b Proudfoot AE, Fritchley S, Borlat F, Shaw JP, Vilbois F, Zwahlen C, Trkola A, Marchant D, Clapham PR, Wells TN (duben 2001). „Motiv BBXB RANTES je hlavním místem pro vazbu heparinu a řídí selektivitu receptoru“. J. Biol. Chem. 276 (14): 10620–6. doi:10,1074 / jbc.M010867200. PMID 11116158.

[pmid17001303-17] Ignatov A, Robert J, Gregory-Evans C, Schaller HC (listopad 2006). „RANTES stimuluje mobilizaci Ca2 + a tvorbu inositol trisfosfátu (IP3) v buňkách transfektovaných receptorem spojeným s G proteinem 75“. Br. J. Pharmacol. 149 (5): 490–7. doi:10.1038 / sj.bjp.0706909. PMC 2014681. PMID 17001303.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]