SORBS2 - SORBS2

SORBS2
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasySORBS2, ARGBP2, PRO0618, doména sorbinu a SH3 obsahující 2
Externí IDOMIM: 616349 MGI: 1924574 HomoloGene: 83295 Genové karty: SORBS2
Umístění genu (člověk)
Chromozom 4 (lidský)
Chr.Chromozom 4 (lidský)[1]
Chromozom 4 (lidský)
Genomic location for SORBS2
Genomic location for SORBS2
Kapela4q35.1Start185,585,444 bp[1]
Konec185,956,652 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE SORBS2 204288 s at fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

8470

234214

Ensembl

ENSG00000154556

ENSMUSG00000031626

UniProt

O94875

Q3UTJ2

RefSeq (mRNA)

NM_001205219
NM_172752
NM_001310707
NM_001310708

RefSeq (protein)

NP_001192148
NP_001297636
NP_001297637
NP_766340

Místo (UCSC)Chr 4: 185,59 - 185,96 MbChr 8: 45,51 - 45,83 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

ArgBP2 protein, označovaný také jako Sorbin a protein obsahující SH3 doménu 2 je protein že u lidí je kódován SORBS2 gen.[5][6] ArgBP2 patří do malé rodiny adaptorových proteinů, které mají domény homologie sorbinu (SOHO). ArgBP2 je velmi bohatý na srdeční sval buňky v sarkomérní Z-disk struktur a je exprimován v jiných buňkách v aktin stresová vlákna a jádro.

Struktura

ArgBP2 může existovat až v 9 jedinečných izoformách v rozmezí od 52 kDa do 117 kDa (492 až 1100 aminokyselin).[6] ArgBP2 patří do malé rodiny adaptorových proteinů s doménami homologie sorbinu (SOHO) a třemi SH3 domény, které regulují buněčnou adhezi, cytoskeletální organizaci a signalizaci růstového faktoru; mezi další členy patří CAP / ponsin a vinexin.[7] Strom SH3 domény jsou C-terminál, doména bohatá na serin-threonin[8] je umístěn uprostřed a doména sorbinové homologie (SoHo) je N-terminál. Domény SH3 interagují s Arg / Abl, vinkulinem.[7] SOHO doména interaguje s flotillin nachází se v lipidových raftech.[9]

Funkce

Subcelulární lokalizace tohoto proteinu v epitelových a srdečních svalových buňkách naznačuje, že ArgBP2 funguje jako adaptační protein pro sestavení signálních komplexů ve stresových vláknech a že je potenciálním spojením mezi kinázami rodiny Abl a aktinovým cytoskeletem. ArgBP2 obsahuje několik potenciálních míst fosforylace Abl;[8] Arg a c-Abl představují savčí členy rodiny Abelsonů nereceptorových protein-tyrosin kináz. V nesvalových buňkách draží ArgBP2 Cbl což zvyšuje degradaci c-Abl;[10] a také Pyk2 který podporuje cytoskeletální remodelaci.[11] Vazba ArgBP2 s flotillin na lipidových raftech může naznačovat roli ArgBP2 při obchodování vezikul a signální transdukci. flotillin v kosterní sval buňky vykazují pruhovaný vzor[12] navrhuje lokalizaci na T-tubuly nebo sarkoplazmatická retikulární cisternae, ačkoli nebyla stanovena žádná přesná role srdeční buňky. V buňkách srdečního svalu objevily stahovací experimenty ArgBP2 v komplexu s alfa aktinin-2, vinkulin, spektrin, paxillin, Pyk2 a flotillin, což naznačuje, že ArgBP2 může být zapojen do myofibril montáž a Z-pásmo signalizace v kardiomyocytech,[13] ačkoli k objasnění konkrétních mechanismů jsou nezbytné funkční studie. ArgBP2 byl spojen s hyertrofickou signalizací, protože účinná parakrinně působící molekula RNA, o níž je prokázáno, srdeční hypertrofie u myší miR-21 působí jak na ArgBP2, tak na PDLIM5 spustit hypertrofický Odezva.[14]

Klinický význam

Zvýšené hladiny sérového ArgBP2 a pokles koordinátů v ArgBP2 v myokard tkáně byly detekovány ve velmi rané fázi od pacientů poinfarkt myokardu který zemřel do 7 hodin od urážky.[15] Chromozom 4 pericentrická inverze byla pozorována u 10 pacientů, s přidruženými srdeční vady spojené s odstraněním terminálu 4q35.1, které mohou ovlivnit SORBS2.[16]

Interakce

Bylo prokázáno, že ArgBP2 komunikovat s:

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000154556 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031626 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b C Wang B, Golemis EA, Kruh GD (červenec 1997). „ArgBP2, vícenásobný Src homologie obsahující 3 domény, protein interagující s Arg / Abl, je fosforylován v buňkách transformovaných v-Abl a lokalizován ve stresových vláknech a Z-discích kardiocytů“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (28): 17542–50. doi:10.1074 / jbc.272.28.17542. PMID  9211900.
  6. ^ A b „Entrez Gene: SORBS2 sorbin a SH3 doména obsahující 2“.
  7. ^ A b Kioka N, Ueda K, Amachi T (únor 2002). „Vinexin, CAP / ponsin, ArgBP2: nová rodina adaptorových proteinů regulujících cytoskeletální organizaci a signální transdukci“. Struktura a funkce buněk. 27 (1): 1–7. doi:10.1247 / csf.27.1. PMID  11937713.
  8. ^ A b Wang B, Golemis EA, Kruh GD (červenec 1997). „ArgBP2, vícenásobný Src homologie obsahující 3 domény, protein interagující s Arg / Abl, je fosforylován v buňkách transformovaných v-Abl a lokalizován ve stresových vláknech a Z-discích kardiocytů“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (28): 17542–50. doi:10.1074 / jbc.272.28.17542. PMID  9211900.
  9. ^ Kimura A, Baumann CA, Chiang SH, Saltiel AR (červenec 2001). „Doména homologie sorbinu: motiv pro cílení proteinů na lipidové rafty“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (16): 9098–103. doi:10.1073 / pnas.151252898. PMC  55379. PMID  11481476.
  10. ^ Soubeyran P, Barac A, Szymkiewicz I, Dikic I (únor 2003). „Komplex Cbl-ArgBP2 zprostředkovává ubikvitinaci a degradaci c-Abl“. The Biochemical Journal. 370 (Pt 1): 29–34. doi:10.1042 / BJ20021539. PMC  1223168. PMID  12475393.
  11. ^ Haglund K, Ivankovic-Dikic I, Shimokawa N, Kruh GD, Dikic I (květen 2004). „Nábor Pyk2 a Cbl na lipidové rafty zprostředkovává signály důležité pro reorganizaci aktinu v rostoucích neuritech“. Journal of Cell Science. 117 (Pt 12): 2557–68. doi:10.1242 / jcs.01148. PMID  15128873.
  12. ^ Voldstedlund M, Vinten J, Tranum-Jensen J (listopad 2001). "exprese cav-p60 ve svalových tkáních krys. Distribuce jeskynních proteinů". Výzkum buněk a tkání. 306 (2): 265–76. doi:10,1007 / s004410100439. PMID  11702238. S2CID  7420385.
  13. ^ A b C Sanger JM, Wang J, Gleason LM, Chowrashi P, Dube DK, Mittal B, Zhukareva V, Sanger JW (prosinec 2010). „Arg / Abl-binding protein, Z-body and Z-band protein, binds sarcomeric, costameric, and signaling addresses“. Cytoskelet. 67 (12): 808–23. doi:10,1002 / cm. 20490. PMC  3019100. PMID  20886612.
  14. ^ Bang C, Batkai S, Dangwal S, Gupta SK, Foinquinos A, Holzmann A, Just A, Remke J, Zimmer K, Zeug A, Ponimaskin E, Schmiedl A, Yin X, Mayr M, Halder R, Fischer A, Engelhardt S „Wei Y, Schober A, Fiedler J, Thum T (květen 2014). „Srdeční fibroblasty odvozené z mikroRNA exozomů obohacených o osobní řetězec zprostředkují hypertrofii kardiomyocytů“. The Journal of Clinical Investigation. 124 (5): 2136–46. doi:10,1172 / JCI70577. PMC  4001534. PMID  24743145.
  15. ^ Kakimoto Y, Ito S, Abiru H, Kotani H, Ozeki M, Tamaki K, Tsuruyama T (2013). „Sorbin a protein 2 obsahující doménu SH3 se uvolňují z infarktu srdce ve velmi rané fázi: proteomická analýza srdečních tkání pacientů“. Journal of the American Heart Association. 2 (6): e000565. doi:10.1161 / JAHA.113.000565. PMC  3886759. PMID  24342996.
  16. ^ Maurin ML, Labrune P, Brisset S, Le Lorc'h M, Pineau D, Castel C, Romana S, Tachdjian G (únor 2009). "Molekulární cytogenetická charakterizace duplikace 4p15.1-pter a delece 4q35.1-qter v rekombinanci pericentrické inverze chromozomu 4". American Journal of Medical Genetics Part A. 149A (2): 226–31. doi:10,1002 / ajmg.a.32603. PMID  19161154. S2CID  205310317.
  17. ^ A b Soubeyran P, Barac A, Szymkiewicz I, Dikic I (únor 2003). „Komplex Cbl-ArgBP2 zprostředkovává ubikvitinaci a degradaci c-Abl“. Biochem. J. 370 (Pt 1): 29–34. doi:10.1042 / BJ20021539. PMC  1223168. PMID  12475393.
  18. ^ Sanger JM, Wang J, Gleason LM, Chowrashi P, Dube DK, Mittal B, Zhukareva V, Sanger JW (prosinec 2010). „Arg / Abl-binding protein, Z-body and Z-band protein, binds sarcomeric, costameric, and signaling addresses“. Cytoskelet. 67 (12): 808–23. doi:10,1002 / cm. 20490. PMC  3019100. PMID  20886612.
  19. ^ A b Haglund K, Ivankovic-Dikic I, Shimokawa N, Kruh GD, Dikic I (květen 2004). „Nábor Pyk2 a Cbl na lipidové rafty zprostředkovává signály důležité pro reorganizaci aktinu v rostoucích neuritech“. J. Cell Sci. 117 (Pt 12): 2557–68. doi:10.1242 / jcs.01148. PMID  15128873.
  20. ^ Kimura A, Baumann CA, Chiang SH, Saltiel AR (červenec 2001). „Doména homologie sorbinu: motiv pro cílení proteinů na lipidové rafty“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (16): 9098–103. doi:10.1073 / pnas.151252898. PMC  55379. PMID  11481476.
  21. ^ Rönty M, Taivainen A, Moza M, Kruh GD, Ehler E, Carpen O (říjen 2005). "Podíl palladinu a alfa-aktininu na cílení adaptéru kinázy Abl / Arg ArgBP2 na aktinový cytoskeleton". Exp. Cell Res. 310 (1): 88–98. doi:10.1016 / j.yexcr.2005.06.026. PMID  16125169.
  22. ^ Kioka N, Ueda K, Amachi T (únor 2002). „Vinexin, CAP / ponsin, ArgBP2: nová rodina adaptorových proteinů regulujících cytoskeletální organizaci a signální transdukci“. Struktura buněk. Funct. 27 (1): 1–7. doi:10.1247 / csf.27.1. PMID  11937713.

Další čtení