Keratin 19 - Keratin 19

KRT19
Identifikátory
Aliasy	KRT19, CK19, K19, K1CS, keratin 19
Externí ID	OMIM: 148020 MGI: 96693 HomoloGene: 1713 Genové karty: KRT19
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	41,528,308 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu; • strukturní složka svalu; • strukturní složka cytoskeletu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita strukturních molekul;
Buněčná složka	• web terminálu; • buněčná membrána; • sarcolemma; • costamere; • komplex glykoproteinů spojený s dystrofinem; • Z disk; • extracelulární exosom; • střední vlákno; • periferní buňka; • cytosol; • apikolaterální plazmatická membrána;
Biologický proces	• Signální dráha zářezu; • GO: virový proces 0022415; • organizace sarkomér; • buněčná diferenciace podílející se na vývoji embryonální placenty; • reakce na estrogen; • keratinizace; • zrohovatění;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3880
	16669
	ENSG00000171345
	ENSMUSG00000020911
	P08727
	P19001
	NM_002276
	NM_008471; NM_001313963
	NP_002267
	NP_001300892; NP_032497
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Keratin, cytoskeletální typ 19 také známý jako cytokeratin-19 (CK-19) nebo keratin-19 (K19) je 40 kDa protein že u lidí je kódován KRT19 gen.^[4]^[5] Keratin 19 je a keratin typu I..

Funkce

Keratin 19 je členem keratin rodina. Keratiny jsou proteiny intermediárního vlákna odpovědné za strukturní integritu epiteliálních buněk a jsou dále rozděleny na cytokeratiny a vlasové keratiny.

Keratin 19 je a keratin typu I.. Cytokeratiny typu I se skládají z kyselých proteinů, které jsou uspořádány v párech heterotypických keratinových řetězců. Na rozdíl od příbuzných členů rodiny je tento nejmenší známý kyselý cytokeratin není spárován se základním cytokeratinem v epitelové buňky. Konkrétně se nachází v periderm, přechodně povrchová vrstva, která obklopuje vyvíjející se pokožka. Cytokeratiny typu I jsou seskupeny v oblasti chromozomu 17q12-q21.^[5]

Použít jako biomarker

KRT19 je také známý jako Cyfra 21-1.^[6]
Díky své vysoké citlivosti je KRT19 nejpoužívanějším markerem pro RT-PCR zprostředkovaná detekce nádorových buněk šířených v lymfatické uzliny, periferní krev, a kostní dřeň z rakovina prsu pacientů. V závislosti na testech se ukázalo, že KRT19 je jak specifickým, tak nespecifickým markerem. Falešná pozitivita v takových studiích KRT19 RT-PCR zahrnuje: nelegitimní transkripci (exprese malého množství mRNA KRT19 tkáními, ve kterých nemá skutečnou fyziologickou roli), hematologické poruchy (indukce KRT19 v buňkách periferní krve cytokiny a růstové faktory, které cirkulují při vyšších koncentracích při zánětlivých stavech a neutropenii), přítomnost pseudogeny (Byly identifikovány dva pseudogeny KRT19, KRT19a a KRT19b, které mají významnou sekvenční homologii s KRT19 mRNA. Následné pokusy o detekci exprese autentického KRT19 mohou vést k detekci jednoho nebo obou těchto pseudogenů), kontaminace vzorku ( zavedení kontaminujících epitelových buněk během odběru periferní krve pro následnou analýzu RT-PCR).^[7] Kromě toho je Ck-19 široce používán jako pooperační diagnostický marker papilárního karcinomu štítné žlázy.^[8]

Keratin 19 se často používá společně s keratin 8 a keratin 18 diferencovat buňky epiteliálního původu od krvetvorných buněk v testech, které vyjmenovávají cirkulující nádorové buňky v krvi.^[9]

Interakce

Keratin 19 bylo prokázáno komunikovat s Pinin.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000171345 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Schweizer J, Bowden PE, Coulombe PA, Langbein L, Lane EB, Magin TM, Maltais L, Omary MB, Parry DA, Rogers MA, Wright MW (červenec 2006). „Nová konsenzuální nomenklatura pro savčí keratiny“. The Journal of Cell Biology. 174 (2): 169–74. doi:10.1083 / jcb.200603161. PMC 2064177. PMID 16831889.
^ ^A ^b „Entrez Gene: KRT19 keratin 19“.
^ Nakata B, Takashima T, Ogawa Y, Ishikawa T, Hirakawa K (2004). „Sérum CYFRA 21-1 (fragmenty cytokeratinu-19) je užitečný nádorový marker pro detekci relapsu onemocnění a hodnocení účinnosti léčby u rakoviny prsu“. Br J Cancer. 91 (5): 873–8. doi:10.1038 / sj.bjc.6602074. PMC 2409884. PMID 15280913.
^ Lacroix M (prosinec 2006). „Význam, detekce a markery diseminovaných buněk rakoviny prsu“. Rakovina související s endokrinním systémem. 13 (4): 1033–67. doi:10.1677 / ERC-06-0001. PMID 17158753.
^ Dinets A, Pernemalm M, Kjellin H, Sviatoha V, Sofiadis A, Juhlin CC, Zedenius J, Larsson C, Lehtiö J, Höög A (květen 2015). „Diferenciální profily exprese proteinu cystové tekutiny z papilárního karcinomu štítné žlázy a benigních lézí štítné žlázy“. PLOS ONE. 10 (5): e0126472. doi:10.1371 / journal.pone.0126472. PMC 4433121. PMID 25978681.
^ Allard WJ, Matera J, Miller MC, Repollet M, Connelly MC, Rao C, Tibbe AG, Uhr JW, Terstappen LW (říjen 2004). „Nádorové buňky cirkulují v periferní krvi všech hlavních karcinomů, ale ne u zdravých subjektů nebo pacientů s nezhoubnými chorobami“. Klinický výzkum rakoviny. 10 (20): 6897–904. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-04-0378. PMID 15501967.
^ Shi J, Sugrue SP (květen 2000). „Disekce proteinové vazby mezi keratiny a pininem, proteinem s dvojím umístěním v komplexu desmosom-intermediálních vláken a v jádře“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (20): 14910–5. doi:10.1074 / jbc.275.20.14910. PMID 10809736.

Další čtení

Otsuka Y, Ichikawa Y, Kunisaki C, Matsuda G, Akiyama H, Nomura M, Togo S, Hayashizaki Y, Shimada H (2007). "Korelační čistota mikrodisekcí s genovou expresí v tkáni rakoviny žaludku". Scandinavian Journal of Clinical and Laboratory Investigation. 67 (4): 367–79. doi:10.1080/00365510601046334. PMID 17558891. S2CID 36635804.
Rasmussen HH, van Damme J, Puype M, Gesser B, Celis JE, Vandekerckhove J (prosinec 1992). „Mikrosekvence 145 proteinů zaznamenané v databázi dvourozměrných gelových proteinů normálních lidských epidermálních keratinocytů“. Elektroforéza. 13 (12): 960–9. doi:10,1002 / elps.11501301199. PMID 1286667. S2CID 41855774.
Bader BL, Magin TM, Hatzfeld M, Franke WW (srpen 1986). „Aminokyselinová sekvence a genová organizace cytokeratinu č. 19, výjimečný protein mezi vlákny bez ocasu“. Časopis EMBO. 5 (8): 1865–75. doi:10.1002 / j.1460-2075.1986.tb04438.x. PMC 1167052. PMID 2428612.
Stasiak PC, Lane EB (prosinec 1987). "Sekvence kódování cDNA pro lidský keratin 19". Výzkum nukleových kyselin. 15 (23): 10058. doi:10.1093 / nar / 15.23.10058. PMC 306562. PMID 2447559.
Eckert RL (únor 1988). „Sekvence lidského 40-kDa keratinu odhaluje neobvyklou strukturu s velmi vysokou sekvenční identitou s odpovídajícím bovinním keratinem“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 85 (4): 1114–8. doi:10.1073 / pnas.85.4.1114. PMC 279716. PMID 2448790.
Blumenberg M (1988). "Sloučené genové duplikace ve dvou rodinách keratinových genů". Journal of Molecular Evolution. 27 (3): 203–11. doi:10.1007 / BF02100075. PMID 2458477. S2CID 5606956.
Bader BL, Jahn L, Franke WW (prosinec 1988). „Nízká úroveň exprese cytokeratinů 8, 18 a 19 v buňkách hladkého svalstva cév lidské pupeční šňůry a v kultivovaných buňkách z nich odvozených, s analýzou chromozomálního lokusu obsahujícího gen cytokeratinu 19“. European Journal of Cell Biology. 47 (2): 300–19. PMID 2468493.
Stasiak PC, Purkis PE, Leigh IM, Lane EB (květen 1989). „Keratin 19: předpokládaná sekvence aminokyselin a široká distribuce v tkáních naznačují, že se vyvinul z keratinocytových keratinů“. The Journal of Investigative Dermatology. 92 (5): 707–16. doi:10.1111 / 1523-1747.ep12721500. PMID 2469734.
Shezen E, Okon E, Ben-Hur H, Abramsky O (leden 1995). "Exprese cytokeratinu v lidském brzlíku: imunohistochemické mapování". Výzkum buněk a tkání. 279 (1): 221–31. doi:10.1007 / BF00300707. PMID 7534649. S2CID 23434233.
Milisavljevic V, Freedberg IM, Blumenberg M (květen 1996). "Úzká vazba dvou klastrů genu pro keratin v lidském genomu". Genomika. 34 (1): 134–8. doi:10.1006 / geno.1996.0252. PMID 8661035.
Ceratto N, Dobkin C, Carter M, Jenkins E, Yao XL, Cassiman JJ, Aly MS, Bosco P, Leube R, Langbein L, Feo S, Romano V (1997). "Lidské geny pro cytokeratin typu I jsou kompaktní shluky". Cytogenetika a genetika buněk. 77 (3–4): 169–74. doi:10.1159/000134566. PMID 9284906.
Kucharzik T, Lügering N, Schmid KW, Schmidt MA, Stoll R, Domschke W (leden 1998). „Lidské střevní M buňky vykazují enterocytová intermediální vlákna“. Střevo. 42 (1): 54–62. doi:10,1136 / střeva. 42.1.54. PMC 1726964. PMID 9505886.
Yang GP, Ross DT, Kuang WW, Brown PO, Weigel RJ (březen 1999). „Kombinace mikročipů SSH a cDNA pro rychlou identifikaci odlišně exprimovaných genů“. Výzkum nukleových kyselin. 27 (6): 1517–23. doi:10.1093 / nar / 27.6.1517. PMC 148347. PMID 10037815.
Zhou X, Liao J, Hu L, Feng L, Omary MB (duben 1999). „Charakterizace hlavního fyziologického fosforylačního místa lidského keratinu 19 a jeho role v organizaci vláken“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (18): 12861–6. doi:10.1074 / jbc.274.18.12861. PMID 10212274.
Salas PJ (srpen 1999). „Nerozpustné struktury obsahující gama-tubulin jsou ukotveny k apikální síti intermediálních vláken v polarizovaných epiteliálních buňkách CACO-2“. The Journal of Cell Biology. 146 (3): 645–58. doi:10.1083 / jcb.146.3.645. PMC 2150552. PMID 10444072.
Whittock NV, Eady RA, McGrath JA (leden 2000). "Genomická organizace a amplifikace genů lidského keratinu 15 a keratinu 19". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 267 (1): 462–5. doi:10.1006 / bbrc.1999.1966. PMID 10623642.
Shi J, Sugrue SP (květen 2000). „Disekce proteinové vazby mezi keratiny a pininem, proteinem s dvojím umístěním v komplexu desmosom-intermediálních vláken a v jádře“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (20): 14910–5. doi:10.1074 / jbc.275.20.14910. PMID 10809736.
Brembeck FH, Rustgi AK (září 2000). „Transkripce genu keratinu 19 závislá na tkáních je regulována GKLF / KLF4 a Sp1“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (36): 28230–9. doi:10,1074 / jbc.M004013200. PMID 10859317.
Kagaya M, Kaneko S, Ohno H, Inamura K, Kobayashi K (říjen 2001). "Klonování a charakterizace 5'-ohraničující oblasti genu lidského cytokeratinu 19 v buněčné linii lidského cholangiokarcinomu". Journal of Hepatology. 35 (4): 504–11. doi:10.1016 / S0168-8278 (01) 00167-2. hdl:2297/15681. PMID 11682035.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000171345 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid16831889-4] Schweizer J, Bowden PE, Coulombe PA, Langbein L, Lane EB, Magin TM, Maltais L, Omary MB, Parry DA, Rogers MA, Wright MW (červenec 2006). „Nová konsenzuální nomenklatura pro savčí keratiny“. The Journal of Cell Biology. 174 (2): 169–74. doi:10.1083 / jcb.200603161. PMC 2064177. PMID 16831889.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: KRT19 keratin 19“.

[6] Nakata B, Takashima T, Ogawa Y, Ishikawa T, Hirakawa K (2004). „Sérum CYFRA 21-1 (fragmenty cytokeratinu-19) je užitečný nádorový marker pro detekci relapsu onemocnění a hodnocení účinnosti léčby u rakoviny prsu“. Br J Cancer. 91 (5): 873–8. doi:10.1038 / sj.bjc.6602074. PMC 2409884. PMID 15280913.

[Lacroix06-7] Lacroix M (prosinec 2006). „Význam, detekce a markery diseminovaných buněk rakoviny prsu“. Rakovina související s endokrinním systémem. 13 (4): 1033–67. doi:10.1677 / ERC-06-0001. PMID 17158753.

[pmid25978681-8] Dinets A, Pernemalm M, Kjellin H, Sviatoha V, Sofiadis A, Juhlin CC, Zedenius J, Larsson C, Lehtiö J, Höög A (květen 2015). „Diferenciální profily exprese proteinu cystové tekutiny z papilárního karcinomu štítné žlázy a benigních lézí štítné žlázy“. PLOS ONE. 10 (5): e0126472. doi:10.1371 / journal.pone.0126472. PMC 4433121. PMID 25978681.

[9] Allard WJ, Matera J, Miller MC, Repollet M, Connelly MC, Rao C, Tibbe AG, Uhr JW, Terstappen LW (říjen 2004). „Nádorové buňky cirkulují v periferní krvi všech hlavních karcinomů, ale ne u zdravých subjektů nebo pacientů s nezhoubnými chorobami“. Klinický výzkum rakoviny. 10 (20): 6897–904. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-04-0378. PMID 15501967.

[pmid10809736-10] Shi J, Sugrue SP (květen 2000). „Disekce proteinové vazby mezi keratiny a pininem, proteinem s dvojím umístěním v komplexu desmosom-intermediálních vláken a v jádře“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (20): 14910–5. doi:10.1074 / jbc.275.20.14910. PMID 10809736.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]