DYNLRB1 - DYNLRB1

DYNLRB1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1Z09, 2B95, 2E8J, 2HZ5
Identifikátory
Aliasy	DYNLRB1, BITH, BLP, DNCL2A, DNLC2A, ROBLD1, blokování lehkého řetězce dynein typu 1
Externí ID	OMIM: 607167 MGI: 1914318 HomoloGene: 69161 Genové karty: DYNLRB1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	34,540,958 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	155,250,277 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita mikrotubulů; • buněčná motorická aktivita; • dyneinová vazba mezi řetězci;
Buněčná složka	• centrosome; • řasnatý hrot; • cytoskelet; • membrána; • cytoplazma; • mikrotubuly; • cilium; • komplex cytoplazmatického dyneinu; • dyneinový komplex; • vnější dyneinové rameno;
Biologický proces	• vizuální chování; • pohyb založený na mikrotubulích; • intraciliary transport zapojený do shromáždění cilium; • doprava; • reakce na světelný podnět;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	83658
	67068
	ENSG00000125971
	ENSMUSG00000047459
	Q9NP97
	P62627
NM_001281727; NM_001281728; NM_001281729; NM_014183; NM_177953;
	NM_001319157
	NM_001291108; NM_025947
	NP_001306086; NP_054902; NP_001369294; NP_001369295; NP_001369296
	NP_001278037; NP_080223
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Silniční blok Dynein s lehkým řetězcem typu 1 je protein že u lidí je kódován DYNLRB1 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen je členem zátarasu dynein rodina lehkých řetězců a kóduje a cytoplazmatický protein, který je schopen vázat proteiny s mezilehlým řetězcem. Upregulace tohoto genu bylo spojeno s hepatocelulární karcinomy, což naznačuje, že tento gen může být zapojen do progrese nádoru.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000125971 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000047459 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Jiang J, Yu L, Huang X, Chen X, Li D, Zhang Y, Tang L, Zhao S (prosinec 2001). „Identifikace dvou nových genů lehkého řetězce lidského dyneinu, DNLC2A a DNLC2B, a jejich změny exprese v tkáních hepatocelulárního karcinomu od 68 čínských pacientů“. Gen. 281 (1–2): 103–13. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00787-9. PMID 11750132.
^ Pfister KK, Fisher EM, Gibbons IR, Hays TS, Holzbaur EL, McIntosh JR, Porter ME, Schroer TA, Vaughan KT, Witman GB, King SM, Vallee RB (listopad 2005). „Nomenklatura cytoplazmatického dyneinu“. J Cell Biol. 171 (3): 411–3. doi:10.1083 / jcb.200508078. PMC 2171247. PMID 16260502.
^ ^A ^b „Entrez Gene: DYNLRB1 dynein, lehký řetězec, blokování typu 1“.

Další čtení

Zhang QH, Ye M, Wu XY a kol. (2001). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámečky pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v buňkách hematopoetických kmenových / progenitorových buněk CD34 +“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J a kol. (2002). „Sekvence DNA a komparativní analýza lidského chromozomu 20“. Příroda. 414 (6866): 865–71. doi:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.
Susalka SJ, Nikulina K, Salata MW a kol. (2002). „Lehký řetězec blokující zácpy váže novou oblast cytoplazmatického mezilehlého řetězce dyneinu“. J. Biol. Chem. 277 (36): 32939–46. doi:10,1074 / jbc.M205510200. PMID 12077152.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Huang YS, Carson JH, Barbarese E, Richter JD (2003). „Usnadnění transportu dendritické mRNA pomocí CPEB“. Genes Dev. 17 (5): 638–53. doi:10.1101 / gad.1053003. PMC 196011. PMID 12629046.
Gevaert K, Goethals M, Martens L a kol. (2004). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Saito Y, Doi K, Yamagishi N a kol. (2004). "Screening Hsp105alpha-binding proteinů pomocí kvasinek a bakteriálních dvouhybridních systémů". Biochem. Biophys. Res. Commun. 314 (2): 396–402. doi:10.1016 / j.bbrc.2003.12.108. PMID 14733918.
Lehner B, Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Campbell IG, Phillips WA, Choong DY (2006). „Genetická a epigenetická analýza domnělého tumor supresoru km23 u primárních karcinomů vaječníků, prsu a kolorektálního karcinomu“. Clin. Cancer Res. 12 (12): 3713–5. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-06-0800. PMID 16778097.
Pérez-González A, Rodriguez A, Huarte M a kol. (2007). „hCLE / CGI-99, lidský protein, který interaguje s polymerázou viru chřipky, je modulátor transkripce mRNA“. J. Mol. Biol. 362 (5): 887–900. doi:10.1016 / j.jmb.2006.07.085. PMID 16950395.
Liu JF, Wang ZX, Wang XQ a kol. (2006). "Krystalová struktura lehkého řetězce lidského dyneinu Dnlc2A: strukturální pohledy na interakci s IC74". Biochem. Biophys. Res. Commun. 349 (3): 1125–9. doi:10.1016 / j.bbrc.2006.08.161. PMID 16970917.
Kang HC, Kim IJ, Kim K a kol. (2007). „km23, signální složka transformujícího růstového faktoru-beta, je zřídka mutována v lidských kolorektálních a žaludečních rakovinách“. Genetika rakoviny. Cytogenet. 175 (2): 173–4. doi:10.1016 / j.cancergencyto.2007.02.004. PMID 17556076.
Wanschers B, van de Vorstenbosch R, Fransen J a kol. (2008). „Proteiny rodiny Rab6 interagují s proteinem dyneinového lehkého řetězce DYNLRB1“. Cell Motil. Cytoskelet. 65 (3): 183–96. doi:10,1002 / cm. 20254. PMID 18044744.