ANK3 - ANK3

ANK3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4O6X
Identifikátory
Aliasy	ANK3, ANKYRIN-G, MRT37, ankyrin 3, uzel Ranvier (ankyrin G), ankyrin 3
Externí ID	OMIM: 600465 MGI: 88026 HomoloGene: 56908 Genové karty: ANK3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 10 (lidský)
Konec	60,733,490 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	70,027,438 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na bílkoviny, přemostění; • kadherinová vazba; • vazba cytoskeletálního proteinu; • strukturní složka cytoskeletu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba spektrinu; • vazba iontového kanálu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • Golgiho aparát; • buněčná projekce; • boční plazmatická membrána; • membrána; • dvoubuněčný těsný spoj; • T-tubule; • synapse; • povrch buňky; • axon; • buněčné spojení; • bazální plazmatická membrána; • bazolaterální plazmatická membrána; • endoplazmatické retikulum; • cytoskelet spojený s spektrem; • sarcolemma; • lysozom; • costamere; • cytoskelet; • dendrit; • postsynaptická membrána; • sarkoplazmatické retikulum; • neuronová projekce; • neuromuskulární spojení; • Z disk; • buněčná membrána; • vložený disk; • uzel Ranvier; • počáteční segment axonu;
Biologický proces	• regulace transportu iontů draslíku; • pozitivní regulace depolarizace membrány během akčního potenciálu buněk srdečního svalu; • vytvoření lokalizace proteinů; • mitotická cytokineze; • ER na transport zprostředkovaný vezikuly Golgi; • udržování umístění proteinu v plazmatické membráně; • pozitivní regulace genové exprese; • pozitivní regulace transportu iontů sodíku; • pozitivní regulace aktivity transmembránového transportéru sodných iontů; • pozitivní regulace membránového potenciálu; • organizace plazmatické membrány; • signální transdukce; • Transport proteinu z Golgiho plazmatické membrány; • vývoj neuromuskulárního spojení; • pozitivní regulace buněčné komunikace elektrickou vazbou; • pozitivní regulace homotypické adheze buněk k buňkám; • pozitivní regulace cílení proteinů na membránu; • sestava membrány; • pozitivní regulace aktivity kationového kanálu; • axonogeneze; • homeostáza hořečnatých iontů; • neuronový akční potenciál; • buněčná odpověď na ionty hořčíku; • lokalizace proteinu na plazmatickou membránu; • negativní regulace zpožděné aktivity draslíkového kanálu usměrňovače; • lokalizace proteinu na axon;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	288
	11735
	ENSG00000151150
	ENSMUSG00000069601
	Q12955
	G5E8K5
	NM_001149; NM_001204403; NM_001204404; NM_020987; NM_001320874
NM_009670; NM_146005; NM_170687; NM_170688; NM_170689;
	NM_170690; NM_170728; NM_170729; NM_170730
	NP_001140; NP_001191332; NP_001191333; NP_001307803; NP_066267
NP_033800; NP_666117; NP_733788; NP_733789; NP_733790;
	NP_733791; NP_733924; NP_733925; NP_733926
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Ankyrin-3 (ANK-3), také známý jako ankyrin-G, je protein z ankyrin rodina, která je u lidí kódována ANK3 gen.^[5]^[6]

Funkce

The protein kódovaný tímto genem, ankyrin-3 je imunologicky odlišný genový produkt od ankyrinů ANK1 a ANK2, a byl původně nalezen na axonální počáteční segment a uzly Ranvier z neurony v centrálním a periferním nervovém systému. Alternativně mohou být sestřižené varianty exprimovány v jiných tkáních. Přestože bylo pro tento gen nalezeno více variant transkriptu kódujících několik různých izoforem, byla charakterizována úplná povaha pouze dvou.^[5]

V nervovém systému je ankyrin-G specificky lokalizován na neuromuskulární spojení, počáteční segment axonu a Uzly Ranvier.^[7] V uzlech Ranvier kde akční potenciály jsou aktivně šířeny, ankyrin-G je již dlouho považován za zprostředkujícího vazebného partnera neurofascin a napěťově řízené sodíkové kanály.^[8] Genetická delece ankyrinu-G z více typů neuronů ukázala, že ankyrin-G je nutný pro normální shlukování napěťově řízených sodíkové kanály na Axon Hillock a pro akční potenciál palba.^[9]^[10]

Vazba nemoci

Protein ANK3 se asociuje se srdečním sodíkovým kanálem Na_proti1.5 (SCN5A ). Oba proteiny jsou vysoce exprimovány na komorových interkalačních discích a T-tubulárních membránách v kardiomyocyty. Mutace v Na_proti1,5 proteinu blokuje interakci s vazbou ANK3, a proto narušuje povrchovou expresi Na_proti1,5 v kardiomyocytech, což vede k Brugadův syndrom, druh srdce arytmie.^[11]

Do mutace mohou být zahrnuty další mutace v genu ANK3 bipolární porucha a mentální postižení.^[12]^[13]^[14]^[15]

Ankyrin rodina

Protein kódovaný genem ANK3 je členem ankyrin rodina proteinů, které spojují integrální membránové proteiny s podkladem spektrin -aktin cytoskelet. Ankyriny hrají klíčové role v činnostech, jako je buněčná motilita, aktivace, proliferace, kontakt a údržba specializovaných membránových domén. Většina ankyrinů se obvykle skládá ze tří strukturních domén: amino-terminální doména obsahující více ankyrinových opakování; centrální oblast s vysoce konzervovanou doménou vázající spektrin; a karboxy-terminální regulační doména, která je nejméně konzervovaná a podléhá variacím.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000151150 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000069601 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C „Entrez Gene: ANK2 ankyrin 3, uzel Ranvier“.
^ Kapfhamer D, Miller DE, Lambert S, Bennett V, Glover TW, Burmeister M (květen 1995). "Chromozomální lokalizace genu ankyrin-G (ANK3 / Ank3) na lidskou 10q21 a myší 10". Genomika. 27 (1): 189–91. doi:10.1006 / geno.1995.1023. PMID 7665168.
^ Lambert S, Davis JQ, Bennett V (září 1997). „Morfogeneze uzliny Ranvier: společné shluky ankyrinu a ankyrin vázající integrální proteiny definují časné vývojové meziprodukty“. J. Neurosci. 17 (18): 7025–36. doi:10.1523 / JNEUROSCI.17-18-07025.1997. PMC 6573274. PMID 9278538.
^ Srinivasan Y, Lewallen M, Angelides KJ (duben 1992). "Mapování vazebného místa na ankyrinu pro napěťově závislý sodíkový kanál z mozku". J Biol Chem. 267 (11): 7483–9. PMID 1313804.
^ Zhou D, Lambert S, Malen PL, Carpenter S, Boland LM, Bennett V (listopad 1998). „AnkyrinG je vyžadován pro shlukování napěťově řízených Na kanálů v počátečních segmentech Axonu a pro potenciální střelbu při normální akci“. J. Cell Biol. 143 (5): 1295–1304. doi:10.1083 / jcb.143.5.1295. PMC 2133082. PMID 9832557.
^ Hedstrom KL, Xu X, Ogawa Y, Frischknecht R, Seidenbecher CI, Shrager P, Rasband MN (srpen 2007). „Neurofascin sestavuje specializovanou extracelulární matrici v počátečním segmentu axonu“. J. Cell Biol. 178 (5): 875–886. doi:10.1083 / jcb.200705119. PMC 2064550. PMID 17709431.
^ Mohler PJ, Rivolta I, Napolitano C, LeMaillet G, Lambert S, Priori SG, Bennett V (prosinec 2004). „Mutace Nav1.5 E1053K způsobující Brugadův syndrom blokuje vazbu na ankyrin-G a expresi Nav1.5 na povrchu kardiomyocytů“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (50): 17533–8. doi:10.1073 / pnas.0403711101. PMC 536011. PMID 15579534.
^ „Archivovaná kopie“. Archivovány od originál dne 04.12.2014. Citováno 2014-12-01.CS1 maint: archivovaná kopie jako titul (odkaz)
^ Ferreira MA, O'Donovan MC, Meng YA a kol. (Srpen 2008). „Kolaborativní asociační analýza celého genomu podporuje roli ANK3 a CACNA1C v bipolární poruše“. Nat. Genet. 40 (9): 1056–8. doi:10,1038 / ng.209. PMC 2703780. PMID 18711365.
^ „Channeling Mental Illness: GWAS Links Ion Channels, Bipolar Disorder“. Fórum pro výzkum schizofrenie: Novinky. schizophreniaforum.org. 2008-08-19. Archivovány od originál dne 18. 12. 2010. Citováno 2008-08-21.
^ Iqbal, Zafar; Vandeweyer, Geert; van der Voet, Monique; Waryah, Ali Muhammad; Zahoor, Muhammad Yasir; Besseling, Judith A .; Roca, Laura Tomas; Vulto-van Silfhout, Anneke T .; Nijhof, Bonnie; Kramer, Jamie M .; Van der Aa, Nathalie; Ansar, Muhammad; Peeters, Hilde; Helsmoortel, Celine; Gilissen, Christian; Vissers, Lisenka; Veltman, Joris A .; de Brouwer, Arjan P. M .; Kooy, R. Frank; Riazuddin, šejk; Schenck, Annette; van Bokhoven, Hans; Rooms, Liesbeth (2013). "Homozygotní a heterozygotní narušení ANK3: na křižovatce neurodevelopmentálních a psychiatrických poruch “. Lidská molekulární genetika. 22 (10): 1960–1970. doi:10,1093 / hmg / ddt043. ISSN 0964-6906. PMID 23390136.

Další čtení

Lopez C, Métral S, Eladari D a kol. (2005). „Amonný transportér RhBG: požadavek na signál na bázi tyrosinu a ankyrin-G pro bazolaterální cílení a ukotvení membrány v polarizovaných ledvinových epiteliálních buňkách“. J. Biol. Chem. 280 (9): 8221–8. doi:10,1074 / jbc.M413351200. PMID 15611082.
Kizhatil K, Yoon W, Mohler PJ a kol. (2007). „Ankyrin-G a beta2-spektrin spolupracují v biogenezi postranní membrány lidských bronchiálních epiteliálních buněk“. J. Biol. Chem. 282 (3): 2029–37. doi:10,1074 / jbc.M608921200. PMID 17074766.
Weimer JM, Chattopadhyay S, Custer AW, Pearce DA (2005). „Zvýšení Hook1 v modelu onemocnění Battenovy choroby neovlivňuje novou interakci mezi Ankyrinem G a Hook1“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 330 (4): 1176–81. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.03.103. PMID 15823567.
Shirahata E, Iwasaki H, Takagi M a kol. (2006). „Ankyrin-G reguluje inaktivační hradlování neuronálního sodíkového kanálu, Nav1.6“. J. Neurophysiol. 96 (3): 1347–57. doi:10.1152 / jn.01264.2005. PMID 16775201.
Schulze TG, Detera-Wadleigh SD, Akula N a kol. (2009). „Dvě varianty v Ankyrinu 3 (ANK3) jsou nezávislé genetické rizikové faktory pro bipolární poruchu“. Mol. Psychiatrie. 14 (5): 487–91. doi:10.1038 / mp.2008.134. PMC 2793269. PMID 19088739.
Morgan AR, Turic D, Jehu L a kol. (2007). „Asociační studie 23 pozičních / funkčních kandidátských genů na chromozomu 10 u Alzheimerovy choroby s pozdním nástupem“. Dopoledne. J. Med. Genet. B Neuropsychiatr. Genet. 144B (6): 762–70. doi:10,1002 / ajmg.b. 30509. PMID 17373700. S2CID 26081707.
Morgan AR, Hamilton G, Turic D a kol. (2008). „Asociační analýza 528 intragenních SNP v oblasti chromozomu 10 spojená s Alzheimerovou chorobou s pozdním nástupem“. Dopoledne. J. Med. Genet. B Neuropsychiatr. Genet. 147B (6): 727–31. doi:10,1002 / ajmg.b. 30670. PMID 18163421. S2CID 13916214.
Grupe A, Li Y, Rowland C a kol. (2006). „Sken chromozomu 10 identifikuje nový zaměření zaměřený na silnou asociaci s Alzheimerovou chorobou s pozdním nástupem“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 78 (1): 78–88. doi:10.1086/498851. PMC 1380225. PMID 16385451.
Stabach PR, Devarajan P, Stankewich MC a kol. (2008). „Ankyrin usnadňuje intracelulární přenos α1-Na + -K + -ATPázy v polarizovaných buňkách“. Dopoledne. J. Physiol., Cell Physiol. 295 (5): C1202–14. doi:10.1152 / ajpcell.00273.2008. PMC 2584975. PMID 18768923.
Sohet F, Colin Y, Genetet S a kol. (2008). „Fosforylace a vazba ankyrin-G na C-terminální doménu regulují cílení a funkci amonného transportéru RhBG“. J. Biol. Chem. 283 (39): 26557–67. doi:10,1074 / jbc.M803120200. PMC 3258915. PMID 18635543.
Ignatiuk A, Quickfall JP, Hawrysh AD a kol. (2006). „Menší izoformy ankyrinu 3 se vážou na podjednotku p85 fosfatidylinositol 3'-kinázy a zvyšují down-regulaci receptoru růstového faktoru odvozeného z krevních destiček“. J. Biol. Chem. 281 (9): 5956–64. doi:10,1074 / jbc.M510032200. PMID 16377635.
Colland F, Jacq X, Trouplin V a kol. (2004). "Funkční proteomika mapující cestu lidské signalizace". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Glinsky GV, Berezovska O, Glinskii AB (2005). „Analýza Microarray identifikuje podpis smrti na rakovinu předpovídající selhání terapie u pacientů s více typy rakoviny“. J. Clin. Investovat. 115 (6): 1503–21. doi:10,1172 / JCI23412. PMC 1136989. PMID 15931389.
McEwen DP, Meadows LS, Chen C a kol. (2004). „Sodná kanálová beta1 podjednotka zprostředkovaná modulace proudů Nav1.2 a hustoty povrchu buněk závisí na interakcích s kontaktinem a ankyrinem“. J. Biol. Chem. 279 (16): 16044–9. doi:10,1074 / jbc.M400856200. PMID 14761957.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Wang J, Robinson JF, O'Neil CH a kol. (2006). „Nadměrná exprese ankyrinu G u fibroblastů se syndromem Hutchinson-Gilfordova progeria identifikovaná biologickým filtrováním profilů exprese“. J. Hum. Genet. 51 (11): 934–42. doi:10.1007 / s10038-006-0042-0. PMID 17033732.
Kizhatil K, Davis JQ, Davis L a kol. (2007). „Ankyrin-G je molekulárním partnerem E-kadherinu v epiteliálních buňkách a časných embryích“. J. Biol. Chem. 282 (36): 26552–61. doi:10,1074 / jbc.M703158200. PMID 17620337.
Kizhatil K, Bennett V (2004). „Laterální membránová biogeneze v lidských bronchiálních epiteliálních buňkách vyžaduje 190-kDa ankyrin-G“. J. Biol. Chem. 279 (16): 16706–14. doi:10,1074 / jbc.M314296200. PMID 14757759.

externí odkazy

ANK3 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Člověk ANK3 umístění genomu a ANK3 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000151150 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000069601 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez_288-5] A ^b ^C „Entrez Gene: ANK2 ankyrin 3, uzel Ranvier“.

[pmid7665168-6] Kapfhamer D, Miller DE, Lambert S, Bennett V, Glover TW, Burmeister M (květen 1995). "Chromozomální lokalizace genu ankyrin-G (ANK3 / Ank3) na lidskou 10q21 a myší 10". Genomika. 27 (1): 189–91. doi:10.1006 / geno.1995.1023. PMID 7665168.

[Ankyrin_localization-7] Lambert S, Davis JQ, Bennett V (září 1997). „Morfogeneze uzliny Ranvier: společné shluky ankyrinu a ankyrin vázající integrální proteiny definují časné vývojové meziprodukty“. J. Neurosci. 17 (18): 7025–36. doi:10.1523 / JNEUROSCI.17-18-07025.1997. PMC 6573274. PMID 9278538.

[Ankyrin_Binds_sodium_channels-8] Srinivasan Y, Lewallen M, Angelides KJ (duben 1992). "Mapování vazebného místa na ankyrinu pro napěťově závislý sodíkový kanál z mozku". J Biol Chem. 267 (11): 7483–9. PMID 1313804.

[ankyring_knockout-9] Zhou D, Lambert S, Malen PL, Carpenter S, Boland LM, Bennett V (listopad 1998). „AnkyrinG je vyžadován pro shlukování napěťově řízených Na kanálů v počátečních segmentech Axonu a pro potenciální střelbu při normální akci“. J. Cell Biol. 143 (5): 1295–1304. doi:10.1083 / jcb.143.5.1295. PMC 2133082. PMID 9832557.

[ankyrinG_knockdown-10] Hedstrom KL, Xu X, Ogawa Y, Frischknecht R, Seidenbecher CI, Shrager P, Rasband MN (srpen 2007). „Neurofascin sestavuje specializovanou extracelulární matrici v počátečním segmentu axonu“. J. Cell Biol. 178 (5): 875–886. doi:10.1083 / jcb.200705119. PMC 2064550. PMID 17709431.

[pmid15579534-11] Mohler PJ, Rivolta I, Napolitano C, LeMaillet G, Lambert S, Priori SG, Bennett V (prosinec 2004). „Mutace Nav1.5 E1053K způsobující Brugadův syndrom blokuje vazbu na ankyrin-G a expresi Nav1.5 na povrchu kardiomyocytů“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (50): 17533–8. doi:10.1073 / pnas.0403711101. PMC 536011. PMID 15579534.

[12] „Archivovaná kopie“. Archivovány od originál dne 04.12.2014. Citováno 2014-12-01.CS1 maint: archivovaná kopie jako titul (odkaz)

[pmid18711365-13] Ferreira MA, O'Donovan MC, Meng YA a kol. (Srpen 2008). „Kolaborativní asociační analýza celého genomu podporuje roli ANK3 a CACNA1C v bipolární poruše“. Nat. Genet. 40 (9): 1056–8. doi:10,1038 / ng.209. PMC 2703780. PMID 18711365.

[urlSchizophrenia_Research_Forum:_News-14] „Channeling Mental Illness: GWAS Links Ion Channels, Bipolar Disorder“. Fórum pro výzkum schizofrenie: Novinky. schizophreniaforum.org. 2008-08-19. Archivovány od originál dne 18. 12. 2010. Citováno 2008-08-21.

[Iqbal_Vandeweyer_Van_der_Voet2013-15] Iqbal, Zafar; Vandeweyer, Geert; van der Voet, Monique; Waryah, Ali Muhammad; Zahoor, Muhammad Yasir; Besseling, Judith A .; Roca, Laura Tomas; Vulto-van Silfhout, Anneke T .; Nijhof, Bonnie; Kramer, Jamie M .; Van der Aa, Nathalie; Ansar, Muhammad; Peeters, Hilde; Helsmoortel, Celine; Gilissen, Christian; Vissers, Lisenka; Veltman, Joris A .; de Brouwer, Arjan P. M .; Kooy, R. Frank; Riazuddin, šejk; Schenck, Annette; van Bokhoven, Hans; Rooms, Liesbeth (2013). "Homozygotní a heterozygotní narušení ANK3: na křižovatce neurodevelopmentálních a psychiatrických poruch “. Lidská molekulární genetika. 22 (10): 1960–1970. doi:10,1093 / hmg / ddt043. ISSN 0964-6906. PMID 23390136.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]