Beta-aktin - Beta-actin
Beta-aktin (zkratka lidského genu a proteinu ACTB/ACTB) je jedním ze šesti různých aktin izoformy, které byly identifikovány u lidí. Toto je jeden ze dvou nesvalů cytoskeletální aktiny. Aktiny jsou vysoce konzervované proteiny[5][6] které se podílejí na motilitě, struktuře a integritě buněk. Alfa aktiny jsou hlavní složkou kontraktilního aparátu.[7]
Interakce
Bylo prokázáno, že beta-aktin komunikovat s SPTBN2.[8][9] Navíc, Protein vázající RNA Bylo zjištěno, že Sam68 interaguje s mRNA kódující β-aktin, který reguluje synaptickou tvorbu dendritických trnů s jeho cytoskeletálními složkami.
Ukázalo se, že beta-aktin se aktivuje eNOS, čímž se zvyšuje produkce NO. Bylo prokázáno, že zbytek s osmi aminokyselinami (326-333) v aktinu zprostředkovává interakci mezi aktinem a eNOS[10]
Klinický význam
Opakované mutace v tomto genu byly spojeny s případy difúzní velký B-buněčný lymfom.[11]
Aplikace
Beta aktin se obvykle používá jako a kontrola načítání, mimo jiné, integrita buněk, degradace bílkovin, v PCR a Western blot. Jeho molekulová hmotnost je přibližně 42 kDa.
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000075624 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029580 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Gunning PW, Ghoshdastider U, Whitaker S, Popp D, Robinson RC (červen 2015). „Vývoj kompozičně a funkčně odlišných aktinových vláken“. Journal of Cell Science. 128 (11): 2009–2019. doi:10,1242 / jcs.165563. PMID 25788699.
- ^ Hanukoglu I, Tanese N, Fuchs E (únor 1983). "Doplňková sekvence DNA lidského cytoplazmatického aktinu. Mezidruhová divergence 3 'nekódujících oblastí". Journal of Molecular Biology. 163 (4): 673–8. doi:10.1016/0022-2836(83)90117-1. PMID 6842590.
- ^ „Entrez Gene: ACTB actin, beta“.
- ^ Mao B, Wu W, Li Y, Hoppe D, Stannek P, Glinka A, Niehrs C (květen 2001). „Protein 6 související s LDL-receptorem je receptorem pro proteiny Dickkopf“. Příroda. 411 (6835): 321–5. Bibcode:2001 Natur.411..321M. doi:10.1038/35077108. PMID 11357136. S2CID 4323027.
- ^ Holleran EA, Ligon LA, Tokito M, Stankewich MC, Morrow JS, Holzbaur EL (září 2001). „spektrum beta III se váže na podjednotku Arp1 dynaktinu“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (39): 36598–605. doi:10,1074 / jbc.M104838200. PMID 11461920.
- ^ Kondrikov D, Fonseca FV, Elms S, Fulton D, Black SM, Block ER, Su Y (únor 2010). „Beta-aktinová asociace s endoteliální syntázou oxidu dusnatého moduluje tvorbu oxidu dusnatého a superoxidu z enzymu“. The Journal of Biological Chemistry. 285 (7): 4319–27. doi:10.1074 / jbc.M109.063172. PMC 2836036. PMID 19946124.
- ^ Lohr JG, Stojanov P, Lawrence MS, Auclair D, Chapuy B, Sougnez C, Cruz-Gordillo P, Knoechel B, Asmann YW, Slager SL, Novak AJ, Dogan A, Ansell SM, Link BK, Zou L, Gould J, Saksena G, Stransky N, Rangel-Escareño C, Fernandez-Lopez JC, Hidalgo-Miranda A, Melendez-Zajgla J, Hernández-Lemus E, Schwarz-Cruz y Celis A, Imaz-Rosshandler I, Ojesina AI, Jung J, Pedamallu CS, Lander ES, Habermann TM, Cerhan JR, Shipp MA, Getz G, Golub TR (březen 2012). „Objev a stanovení priorit somatických mutací v difuzním velkém B-buněčném lymfomu (DLBCL) sekvenováním celého exomu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 109 (10): 3879–84. Bibcode:2012PNAS..109,3879 L.. doi:10.1073 / pnas.1121343109. PMC 3309757. PMID 22343534.
externí odkazy
- Člověk ACTB umístění genomu a ACTB stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
- Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P60709 (Actin, cytoplazmatický 1) na PDBe-KB.
Další čtení
- Vandekerckhove J, Leavitt J, Kakunaga T, Weber K (1980). „Koexprese mutantního beta-aktinu a dvou normálních beta- a gama-cytoplazmatických aktinů ve stabilně transformované lidské buněčné linii“. Buňka. 22 (3): 893–9. doi:10.1016/0092-8674(80)90566-8. PMID 6893954. S2CID 54299848.
- Leavitt J, Gunning P, Porreca P, Ng SY, Lin CS, Kedes L (1984). "Molekulární klonování a charakterizace mutantních a divokých typů lidských beta-aktinových genů". Molekulární a buněčná biologie. 4 (10): 1961–9. doi:10.1128 / mcb.4.10.1961. PMC 369012. PMID 6095033.
- Ng SY, Gunning P, Eddy R, Ponte P, Leavitt J, Shows T, Kedes L (1985). „Vývoj funkčního lidského genu pro beta-aktin a jeho rodina multi-pseudogenů: ochrana nekódujících oblastí a chromozomální disperze pseudogenů“. Molekulární a buněčná biologie. 5 (10): 2720–32. doi:10.1128 / mcb.5.10.2720. PMC 367010. PMID 3837182.
- Snásel J, Pichová I (1997). „Štěpení proteinů hostitelské buňky proteázou HIV-1“. Folia Biologica. 42 (5): 227–30. doi:10.1007 / BF02818986. PMID 8997639. S2CID 7617882.
- Gunning P, Weinberger R, Jeffrey P (duben 1997). "Actin a tropomyosin izoformy v morfogenezi". Anatomie a embryologie. 195 (4): 311–5. doi:10,1007 / s004290050050. PMID 9108196. S2CID 9692297.
- Kimura T, Hashimoto I, Nishikawa M, Fujisawa JI (1997). „Role pro Rev ve spojení HIV-1 gag mRNA s expresí cytoskeletálního beta-aktinu a virového proteinu“. Biochimie. 78 (11–12): 1075–80. doi:10.1016 / S0300-9084 (97) 86732-6. PMID 9150887.
- Szentirmay MN, Sawadogo M (květen 2000). "Prostorová organizace transkripce RNA polymerázy II v jádru". Výzkum nukleových kyselin. 28 (10): 2019–25. doi:10.1093 / nar / 28.10.2019. PMC 105382. PMID 10773068.
- Anderson JL, Hope TJ (duben 2004). "HIV doplňkové proteiny a přežití hostitelské buňky". Aktuální zprávy o HIV / AIDS. 1 (1): 47–53. doi:10.1007 / s11904-004-0007-x. PMID 16091223. S2CID 34731265.
- Pederson T, Aebi U (listopad 2005). „Jaderný aktin se prodlužuje, bez dohledu kontrakce“. Molekulární biologie buňky. 16 (11): 5055–60. doi:10,1091 / mbc.E05-07-0656. PMC 1266405. PMID 16148048.
- Perrin BJ, Ervasti JM (říjen 2010). „Rodina genu pro aktin: funkce sleduje izoformu“. Cytoskelet. 67 (10): 630–4. doi:10,1002 / cm. 20475. PMC 2949686. PMID 20737541.
Viz také
![]() | Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |