Ankyrin - Ankyrin
ANK1, erytrocytární | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() Ribbonový diagram fragmentu vazebné domény membrány ankyrinu R.[1] | |||||||
Identifikátory | |||||||
Symbol | ANK1 | ||||||
Alt. symboly | AnkyrinR, Band 2.1 | ||||||
Gen NCBI | 286 | ||||||
HGNC | 492 | ||||||
OMIM | 182900 | ||||||
PDB | 1N11 | ||||||
RefSeq | NM_000037 | ||||||
UniProt | P16157 | ||||||
Další údaje | |||||||
Místo | Chr. 8 p21.1-11.2 | ||||||
|
Ankyrin se opakuje | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||||
Symbol | Ank | ||||||||
Pfam | PF00023 | ||||||||
InterPro | IPR002110 | ||||||||
CHYTRÝ | SM00248 | ||||||||
STRÁNKA | PDOC50088 | ||||||||
SCOP2 | 1awc / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
|
ANK2, neuronální | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||
Symbol | ANK2 | ||||||
Alt. symboly | AnkyrinB | ||||||
Gen NCBI | 287 | ||||||
HGNC | 493 | ||||||
OMIM | 106410 | ||||||
RefSeq | NM_001148 | ||||||
UniProt | Q01484 | ||||||
Další údaje | |||||||
Místo | Chr. 4 q25-q27 | ||||||
|
ANK3, uzel Ranvier | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||
Symbol | ANK3 | ||||||
Alt. symboly | AnkyrinG | ||||||
Gen NCBI | 288 | ||||||
HGNC | 494 | ||||||
OMIM | 600465 | ||||||
RefSeq | NM_020987 | ||||||
UniProt | Q12955 | ||||||
Další údaje | |||||||
Místo | Chr. 10 q21 | ||||||
|
Ankyriny jsou rodina proteinů, které zprostředkovávají připojení integrální membránové proteiny do spektrin -aktin na bázi membránového cytoskeletu.[2] Ankyriny mají vazebná místa pro beta podjednotku spektrinu a alespoň 12 rodin integrálních membránových proteinů. Toto propojení je nutné k zachování integrity protokolu plazmatické membrány a zakotvit konkrétně iontové kanály, iontoměniče a iontové transportéry v plazmatické membráně. Název je odvozen z řeckého slova pro „fused“.[Citace je zapotřebí ]
Struktura
Ankyriny obsahují čtyři funkční domén: N-terminální doména, která obsahuje 24 tandemů ankyrin se opakuje, centrální doména, na kterou se váže spektrin, smrtící doména, která se váže na proteiny zapojené do apoptóza a C-koncová regulační doména, která je vysoce variabilní mezi různými ankyrinovými proteiny.[2]
Rozpoznávání membránových proteinů
24 tandemových ankyrinových repeticí je zodpovědných za rozpoznání široké škály membránových proteinů. Těchto 24 opakování obsahuje 3 strukturně odlišná vazebná místa v rozmezí od opakování 1-14. Tato vazebná místa jsou na sobě kvazi nezávislá a lze je použít v kombinaci. Interakce, které stránky používají k vazbě na membránové proteiny, jsou nespecifické a skládají se z: vodíkových vazeb, hydrofobních interakcí a elektrostatických interakcí. Tyto nespecifické interakce dávají ankyrinu vlastnost rozpoznávat širokou škálu proteinů, protože sekvence nemusí být konzervována, pouze vlastnosti aminokyseliny. Kvazi nezávislost znamená, že pokud se vazebné místo nepoužívá, nebude to mít velký vliv na celkovou vazbu. Tyto dvě vlastnosti v kombinaci vedou k velkému repertoáru proteinů, které ankyrin dokáže rozpoznat.
Podtypy
Ankyriny jsou kódovány třemi geny (ANK1, ANK2 a ANK3 ) u savců. Každý gen zase produkuje více proteinů alternativní sestřih.
ANK1
The ANK1 gen kóduje AnkyrinR proteiny. AnkyrinR byl poprvé charakterizován v lidských erytrocytech, kde byl tento ankyrin označován jako erytrocytový ankyrin nebo skupina 2.1.[3] AnkyrinR umožňuje erytrocytům odolávat střihovým silám v oběhu. Jedinci se sníženou nebo vadnou ankyrinR mají formu hemolytická anémie nazval dědičná sférocytóza.[4] V erytrocytech spojuje AnkyrinR membránový skelet s Cl−/ HCO3− anexový výměník.[5]
Ankyrin 1 spojuje membránový receptor CD44 do inositol trifosfátový receptor a cytoskelet.[6]
Bylo navrženo, aby Ankyrin 1 interagoval s KAHRP (zobrazeno prostřednictvím selektivních rozevíracích nabídek, SPR a ELISA ).[7]
ANK2

Následně ankyrinB proteiny (produkty z ANK2 gen[8]) byly identifikovány v mozku a svalu. Proteiny AnkyrinB a AnkyrinG jsou vyžadovány pro polarizovanou distribuci mnoha membránových proteinů včetně Na+/ K.+ ATPáza, napětí řízené Na+ kanál a Na+/ Ca2+ výměník.
ANK3
AnkyrinG proteiny (produkty z ANK3 gen[9]) byly identifikovány v epiteliálních buňkách a neuronech. Rozsáhlá genetická analýza provedená v roce 2008 ukazuje na tuto možnost ANK3 je zapojen do bipolární porucha.[10][11]
Viz také
- DARPin (navržený protein s ankyrinovým opakováním), inženýrsky vytvořené mimetické protilátky založené na struktuře ankyrinových opakování
Reference
- ^ PDB: 1N11; Michaely P, Tomchick DR, Machius M, Anderson RG (prosinec 2002). „Krystalová struktura opakovaného zásobníku 12 ANK z lidského ankyrinuR“. Časopis EMBO. 21 (23): 6387–96. doi:10.1093 / emboj / cdf651. PMC 136955. PMID 12456646.
- ^ A b Bennett V, Baines AJ (červenec 2001). „Dráhy založené na spektrinu a ankyrinu: vynálezy metazoanů pro integraci buněk do tkání“. Fyziologické recenze. 81 (3): 1353–92. doi:10.1152 / physrev.2001.81.3.1353. PMID 11427698.
- ^ Bennett V, Stenbuck PJ (duben 1979). „Identifikace a částečné čištění ankyrinu, vysoce afinitního místa pro připojení membrány pro lidský spektrum erytrocytů“. The Journal of Biological Chemistry. 254 (7): 2533–41. PMID 372182.
- ^ Lux SE, Tse WT, Menninger JC, John KM, Harris P, Shalev O, Chilcote RR, Marchesi SL, Watkins PC, Bennett V (červen 1990). „Dědičná sférocytóza spojená s delecí genu lidského erytrocytového ankyrinu na chromozomu 8“. Příroda. 345 (6277): 736–9. Bibcode:1990 Natur.345..736L. doi:10.1038 / 345736a0. PMID 2141669. S2CID 4334791.
- ^ Bennett V, Stenbuck PJ (srpen 1979). „Membránový připojovací protein pro spektrin je spojen s pásem 3 v lidských erytrocytových membránách.“ Příroda. 280 (5722): 468–73. Bibcode:1979 Natur.280..468B. doi:10.1038 / 280468a0. PMID 379653. S2CID 4268702.
- ^ Singleton PA, Bourguignon LY (duben 2004). „Interakce CD44 s ankyrinem a receptorem IP3 v lipidových raftech podporuje signalizaci Ca2 + zprostředkovanou hyaluronanem, což vede k produkci oxidu dusnatého a adhezi a proliferaci endoteliálních buněk“. Experimentální výzkum buněk. 295 (1): 102–18. doi:10.1016 / j.yexcr.2003.12.025. PMID 15051494.
- ^ Weng H, Guo X, Papoin J, Wang J, Coppel R, Mohandas N, An X (leden 2014). „Interakce proteinu bohatého na histidiny (KAHRP) s Plasmodium falciparum s erytrocytovým ankyrinem R je nutná pro jeho připojení k membráně erytrocytů“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - biomembrány. 1838 (1 Pt B): 185–92. doi:10.1016 / j.bbemem.2013.09.014. PMC 4403245. PMID 24090929.
- ^ Schott JJ, Charpentier F, Peltier S, Foley P, Drouin E, Bouhour JB, Donnelly P, Vergnaud G, Bachner L, Moisan JP (listopad 1995). "Mapování genu pro syndrom dlouhého QT na chromozom 4q25-27". American Journal of Human Genetics. 57 (5): 1114–22. PMC 1801360. PMID 7485162.
- ^ Kapfhamer D, Miller DE, Lambert S, Bennett V, Glover TW, Burmeister M (květen 1995). "Chromozomální lokalizace genu ankyrinG (ANK3 / Ank3) na lidskou 10q21 a myší 10". Genomika. 27 (1): 189–91. doi:10.1006 / geno.1995.1023. PMID 7665168.
- ^ Ferreira MA, O'Donovan MC, Meng YA, Jones IR, Ruderfer DM, Jones L a kol. (Září 2008). „Kolaborativní asociační analýza celého genomu podporuje roli ANK3 a CACNA1C v bipolární poruše“. Genetika přírody. 40 (9): 1056–8. doi:10,1038 / ng.209. PMC 2703780. PMID 18711365.
- ^ „Channeling Mental Illness: GWAS Links Ion Channels, Bipolar Disorder“. Fórum pro výzkum schizofrenie: Novinky. schizophreniaforum.org. 2008-08-19. Archivovány od originál dne 18. 12. 2010. Citováno 2008-08-21.
externí odkazy
- Ankyriny v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
- Proteopedia 1n11 Ankyrin-R