Pinin - Pinin

PNN
Identifikátory
Aliasy	PNN, DRS, DRSP, SDK3, memA, Pinin, pinin, desmosom asociovaný protein
Externí ID	OMIM: 603154 MGI: 1100514 HomoloGene: 37656 Genové karty: PNN
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	39,183,220 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	59,073,998 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita strukturních molekul; • Vazba DNA; • Vazba RNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• střední vlákno; • buněčné spojení; • buněčné jádro; • mezibuněčné spojení; • membrána; • desmosome; • komplex spojení exon-exon; • buněčná membrána; • katalytický krok 2 spliceosom; • spliceosomální komplex; • jaderná skvrna;
Biologický proces	• Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • transkripce, chráněná DNA; • Sestřih RNA; • Zpracování mRNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • buněčná adheze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5411
	18949
	ENSG00000100941
	ENSMUSG00000020994
	Q9H307
	O35691
	NM_002687
	NM_008891
	NP_002678
	NP_032917
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Pinin je protein že u lidí je kódován PNN gen.^[5]^[6]

Interakce

Pinin byl prokázán komunikovat s Keratin 8,^[7] Keratin 18,^[7] Keratin 19,^[7] CTBP1,^[8] RNPS1,^[9]^[10] PRPF4B,^[11] SFRS4,^[12] PPIG,^[13] SRRM2^[12] a SFRS18.^[12]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100941 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020994 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ouyang P, Sugrue SP (leden 1997). „Charakterizace pininu, nového proteinu spojeného s komplexem desmosom-intermediálních vláken“. J Cell Biol. 135 (4): 1027–42. doi:10.1083 / jcb.135.4.1027. PMC 2133386. PMID 8922384.
^ „Entrez Gene: PNN pinin, protein spojený s desmosomem“.
^ ^A ^b ^C Shi, J; Sugrue SP (květen 2000). „Disekce proteinové vazby mezi keratiny a pininem, proteinem s dvojím umístěním v komplexu desmosom-intermediálních vláken a v jádře“. J. Biol. Chem. 275 (20): 14910–5. doi:10.1074 / jbc.275.20.14910. ISSN 0021-9258. PMID 10809736.
^ Alpatov, Roman; Munguba Gustavo Costa; Caton Paul; Joo Jeong Hoon; Shi Yang; Shi Yujiang; Hunt Marguerite E; Sugrue Stephen P (prosinec 2004). „Protein Pnn / DRS spojený s jadernou skvrnou se váže na transkripční corepresor CtBP a zmírňuje CtBP zprostředkovanou represi genu E-kadherinu“. Mol. Buňka. Biol. 24 (23): 10223–35. doi:10.1128 / MCB.24.23.10223-10235.2004. ISSN 0270-7306. PMC 529029. PMID 15542832.
^ Ewing, Rob M; Chu Peter; Elisma Fred; Li Hongyan; Taylor Paul; Climie Shane; McBroom-Cerajewski Linda; Robinson Mark D; O'Connor Liam; Li Michael; Taylor Rod; Dharsee Moyez; Ho Yuen; Heilbut Adrian; Moore Lynda; Zhang Shudong; Ornatsky Olga; Bukhman Yury V; Ethier Martin; Sheng Yinglun; Vasilescu Julian; Abu-Farha Mohamed; Lambert Jean-Philippe; Duewel Henry S; Stewart Ian I; Kuehl Bonnie; Hogue Kelly; Colwill Karen; Gladwish Katharine; Muskat Brenda; Kinach Robert; Adams Sally-Lin; Moran Michael F; Morin Gregg B; Topaloglou Thodoros; Figeys Daniel (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
^ Li, Chin; Lin Ru-Inn; Lai Ming-Chih; Ouyang Pin; Tarn Woan-Yuh (říjen 2003). „Nukleární Pnn / DRS protein se váže na sestříhané mRNP a podílí se na zpracování a exportu mRNA prostřednictvím interakce s RNPS1“. Mol. Buňka. Biol. 23 (20): 7363–76. doi:10.1128 / MCB.23.20.7363-7376.2003. ISSN 0270-7306. PMC 230327. PMID 14517304.
^ Dellaire, Graham; Makarov Evgeny M; Cowger Jeff J M; Longman Dasa; Sutherland Heidi G E; Lührmann Reinhard; Torchia Joseph; Bickmore Wendy A (červenec 2002). „Savčí PRP4 kináza kopurifikuje a interaguje se složkami komplexů U5 snRNP a N-CoR deacetylázy“. Mol. Buňka. Biol. 22 (14): 5141–56. doi:10.1128 / MCB.22.14.5141-5156.2002. ISSN 0270-7306. PMC 139773. PMID 12077342.
^ ^A ^b ^C Zimowska, Grazyna; Shi Jia; Munguba Gustavo; Jackson Moira R; Alpatov Roman; Simmons Matthew N; Shi Yujiang; Sugrue Stephen P (listopad 2003). „Pinin / DRS / memA interaguje s SRp75, SRm300 a SRrp130 v epitelových buňkách rohovky“. Investovat. Oftalmol. Vis. Sci. 44 (11): 4715–23. doi:10.1167 / iovs.03-0240. ISSN 0146-0404. PMID 14578391.
^ Lin, Chun Lun; Leu Steve; Lu Ming Chu; Ouyang Pin (srpen 2004). „Nadměrná exprese SR-cyklofilinu, partnera interakce jaderného pininu, uvolňuje spojovací faktory rodiny SR z jaderných skvrn“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 321 (3): 638–47. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.07.013. ISSN 0006-291X. PMID 15358154.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Brandner JM, Reidenbach S, Franke WW (1998). „Důkaz, že„ pinin “, údajně diferenciačně specifický desmosomální protein, je ve skutečnosti rozšířený jaderný protein.“ Diferenciace. 62 (3): 119–27. doi:10.1046 / j.1432-0436.1997.6230119.x. PMID 9447706.
Degen WG, Agterbos MA, Muyrers JP a kol. (1999). „memA / DRS, domnělý mediátor multiproteinových komplexů, je nadměrně exprimován v metastazujících lidských melanomových buněčných liniích BLM a MV3“. Biochim. Biophys. Acta. 1444 (3): 384–94. doi:10.1016 / s0167-4781 (99) 00012-3. PMID 10095061.
Ouyang P (1999). „Protilátky diferencují desinomomovou formu a pininovou formu pininu: důkazy, že pinin je protein s měsíčním svitem s dvojím umístěním v desmosomu a uvnitř jádra. Biochem. Biophys. Res. Commun. 263 (1): 192–200. doi:10.1006 / bbrc.1999.1353. PMID 10486276.
Shi Y, Ouyang P, Sugrue SP (2000). „Charakterizace genu kódujícího pinin / DRS / memA a důkazy o jeho potenciální supresorové funkci“. Onkogen. 19 (2): 289–97. doi:10.1038 / sj.onc.1203328. PMID 10645008.
Shi J, Sugrue SP (2000). „Disekce proteinové vazby mezi keratiny a pininem, proteinem s dvojím umístěním v komplexu desmosom-intermediálních vláken a v jádře“. J. Biol. Chem. 275 (20): 14910–5. doi:10.1074 / jbc.275.20.14910. PMID 10809736.
Hu RM, Han ZG, Song HD a kol. (2000). "Profilování genové exprese v ose lidského hypotalamu - hypofýzy - nadledvin a klonování cDNA plné délky". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (17): 9543–8. Bibcode:2000PNAS ... 97,9543H. doi:10.1073 / pnas.160270997. PMC 16901. PMID 10931946.
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR a kol. (2002). „Čištění a charakterizace nativních spliceosomů vhodných pro trojrozměrnou strukturní analýzu“. RNA. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
Wang P, Lou PJ, Leu S, Ouyang P (2002). "Modulace alternativního sestřihu pre-mRNA in vivo pomocí pininu". Biochem. Biophys. Res. Commun. 294 (2): 448–55. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00495-3. PMID 12051732.
Dellaire G, Makarov EM, Cowger JJ a kol. (2002). „Savčí PRP4 kináza kopurifikuje a interaguje se složkami komplexů U5 snRNP a N-CoR deacetylázy“. Mol. Buňka. Biol. 22 (14): 5141–56. doi:10.1128 / MCB.22.14.5141-5156.2002. PMC 139773. PMID 12077342.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Chang WL, Lee DC, Leu S a kol. (2003). "Molekulární charakterizace nového nukleolárního proteinu, pNO40". Biochem. Biophys. Res. Commun. 307 (3): 569–77. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 01208-7. PMID 12893261.
Li C, Lin RI, Lai MC a kol. (2003). „Nukleární Pnn / DRS protein se váže na sestříhané mRNP a podílí se na zpracování a exportu mRNA prostřednictvím interakce s RNPS1“. Mol. Buňka. Biol. 23 (20): 7363–76. doi:10.1128 / MCB.23.20.7363-7376.2003. PMC 230327. PMID 14517304.
Zimowska G, Shi J, Munguba G a kol. (2003). „Pinin / DRS / memA interaguje s SRp75, SRm300 a SRrp130 v epitelových buňkách rohovky“. Investovat. Oftalmol. Vis. Sci. 44 (11): 4715–23. doi:10.1167 / iovs.03-0240. PMID 14578391.
Sakashita E, Tatsumi S, Werner D a kol. (2004). „Lidský RNPS1 a související faktory: univerzální alternativní regulátor sestřihu pre-mRNA in vivo“. Mol. Buňka. Biol. 24 (3): 1174–87. doi:10.1128 / MCB.24.3.1174-1187.2004. PMC 321435. PMID 14729963.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Jin J, Smith FD, Stark C a kol. (2004). "Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace". Curr. Biol. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660.
Lin CL, Leu S, Lu MC, Ouyang P (2004). „Nadměrná exprese SR-cyklofilinu, partnera interakce jaderného pininu, uvolňuje spojovací faktory rodiny SR z jaderných skvrn“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 321 (3): 638–47. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.07.013. PMID 15358154.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100941 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020994 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8922384-5] Ouyang P, Sugrue SP (leden 1997). „Charakterizace pininu, nového proteinu spojeného s komplexem desmosom-intermediálních vláken“. J Cell Biol. 135 (4): 1027–42. doi:10.1083 / jcb.135.4.1027. PMC 2133386. PMID 8922384.

[entrez-6] „Entrez Gene: PNN pinin, protein spojený s desmosomem“.

[pmid10809736-7] A ^b ^C Shi, J; Sugrue SP (květen 2000). „Disekce proteinové vazby mezi keratiny a pininem, proteinem s dvojím umístěním v komplexu desmosom-intermediálních vláken a v jádře“. J. Biol. Chem. 275 (20): 14910–5. doi:10.1074 / jbc.275.20.14910. ISSN 0021-9258. PMID 10809736.

[pmid15542832-8] Alpatov, Roman; Munguba Gustavo Costa; Caton Paul; Joo Jeong Hoon; Shi Yang; Shi Yujiang; Hunt Marguerite E; Sugrue Stephen P (prosinec 2004). „Protein Pnn / DRS spojený s jadernou skvrnou se váže na transkripční corepresor CtBP a zmírňuje CtBP zprostředkovanou represi genu E-kadherinu“. Mol. Buňka. Biol. 24 (23): 10223–35. doi:10.1128 / MCB.24.23.10223-10235.2004. ISSN 0270-7306. PMC 529029. PMID 15542832.

[pmid17353931-9] Ewing, Rob M; Chu Peter; Elisma Fred; Li Hongyan; Taylor Paul; Climie Shane; McBroom-Cerajewski Linda; Robinson Mark D; O'Connor Liam; Li Michael; Taylor Rod; Dharsee Moyez; Ho Yuen; Heilbut Adrian; Moore Lynda; Zhang Shudong; Ornatsky Olga; Bukhman Yury V; Ethier Martin; Sheng Yinglun; Vasilescu Julian; Abu-Farha Mohamed; Lambert Jean-Philippe; Duewel Henry S; Stewart Ian I; Kuehl Bonnie; Hogue Kelly; Colwill Karen; Gladwish Katharine; Muskat Brenda; Kinach Robert; Adams Sally-Lin; Moran Michael F; Morin Gregg B; Topaloglou Thodoros; Figeys Daniel (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[pmid14517304-10] Li, Chin; Lin Ru-Inn; Lai Ming-Chih; Ouyang Pin; Tarn Woan-Yuh (říjen 2003). „Nukleární Pnn / DRS protein se váže na sestříhané mRNP a podílí se na zpracování a exportu mRNA prostřednictvím interakce s RNPS1“. Mol. Buňka. Biol. 23 (20): 7363–76. doi:10.1128 / MCB.23.20.7363-7376.2003. ISSN 0270-7306. PMC 230327. PMID 14517304.

[pmid12077342-11] Dellaire, Graham; Makarov Evgeny M; Cowger Jeff J M; Longman Dasa; Sutherland Heidi G E; Lührmann Reinhard; Torchia Joseph; Bickmore Wendy A (červenec 2002). „Savčí PRP4 kináza kopurifikuje a interaguje se složkami komplexů U5 snRNP a N-CoR deacetylázy“. Mol. Buňka. Biol. 22 (14): 5141–56. doi:10.1128 / MCB.22.14.5141-5156.2002. ISSN 0270-7306. PMC 139773. PMID 12077342.

[pmid14578391-12] A ^b ^C Zimowska, Grazyna; Shi Jia; Munguba Gustavo; Jackson Moira R; Alpatov Roman; Simmons Matthew N; Shi Yujiang; Sugrue Stephen P (listopad 2003). „Pinin / DRS / memA interaguje s SRp75, SRm300 a SRrp130 v epitelových buňkách rohovky“. Investovat. Oftalmol. Vis. Sci. 44 (11): 4715–23. doi:10.1167 / iovs.03-0240. ISSN 0146-0404. PMID 14578391.

[pmid15358154-13] Lin, Chun Lun; Leu Steve; Lu Ming Chu; Ouyang Pin (srpen 2004). „Nadměrná exprese SR-cyklofilinu, partnera interakce jaderného pininu, uvolňuje spojovací faktory rodiny SR z jaderných skvrn“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 321 (3): 638–47. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.07.013. ISSN 0006-291X. PMID 15358154.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]