IL1RL1 - IL1RL1

IL1RL1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4KC3
Identifikátory
Aliasy	IL1RL1, DER4, FIT-1, IL33R, ST2, ST2L, ST2V, T1, receptor interleukinu 1 jako 1
Externí ID	OMIM: 601203 MGI: 98427 HomoloGene: 2862 Genové karty: IL1RL1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	102,352,037 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	40,465,415 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita receptoru interleukinu-33; • aktivita receptoru interleukinu-1; • aktivita cytokinových receptorů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba interleukinu-33;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • vnější strana plazmatické membrány; • membrána; • extracelulární oblast; • buněčná membrána; • extracelulární matrix;
Biologický proces	• negativní regulace imunitní odpovědi typu T-pomocník 1; • pozitivní regulace zánětlivé reakce; • negativní regulace produkce interferonu-gama; • pozitivní regulace aktivace makrofágů; • negativní regulace signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • signální transdukce; • imunitní odpověď; • pozitivní regulace produkce interleukinu-5; • interleukin-33 zprostředkovaná signální dráha;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9173
	17082
	ENSG00000115602
	ENSMUSG00000026069
	Q01638
	P14719
	NM_001282408; NM_003856; NM_016232; NM_173459
	NM_001025602; NM_001294171; NM_010743
	NP_001269337; NP_003847; NP_057316
	NP_001020773; NP_001281100; NP_034873
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Interleukin 1 podobný receptoru 1, také známý jako IL1RL1 a ST2, je protein že u lidí je kódován IL1RL1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

IL1RL1 je členem Mýtný receptor superrodina založená na funkci její intracelulární TIR domény, ale její extracelulární oblast je složena z imunoglobulinových domén. Na rozdíl od jiných členů rodiny IL1RL1 neindukuje zánětlivou reakci aktivací NF-kB, i když se aktivuje MAP kinázy.^[8]

ST2 je členem rodiny receptorů interleukinu 1. Protein ST2 má dvě izoformy a přímo se podílí na progresi srdečního onemocnění: rozpustná forma (označovaná jako rozpustná ST2 nebo sST2) a forma receptoru vázaného na membránu (označovaná jako receptor ST2 nebo ST2L). Když je myokard roztažen, je ST2 gen upregulován, což zvyšuje koncentraci cirkulujícího rozpustného ST2.^[9] Ligandem pro ST2 je cytokin Interleukin-33 (IL-33). Vazba IL-33 na receptor ST2 v reakci na srdeční onemocnění nebo poranění, jako je ischemická příhoda, vyvolává kardioprotektivní účinek vedoucí k zachované srdeční funkci. Tento kardioprotektivní signál IL-33 je vyvážen úrovní rozpustného ST2, který váže IL-33 a znemožňuje jeho přístup k receptoru ST2 pro kardioprotektivní signalizaci. Výsledkem je, že srdce je vystaveno většímu stresu v přítomnosti vysokých hladin rozpustného ST2.

Molekulární biologie

Gen se nachází na dlouhém rameni chromozomu 2 (2q12). Je 40 536 bází dlouhý a nachází se na Watsonově (plus) vlákně. Kóduje protein 556 aminokyselin (molekulová hmotnost 63 358 Da). Jsou známy jak membránově vázané, tak rozpustné formy. Je známo, že protein interaguje MyD88, IRAK1, IRAK4 a TRAF6. Ukazuje se, že je to nezbytné pro normální funkci T pomocných buněk typu 2 (Th2 buňky).

Klinický význam

Mutace v tomto genu byly spojeny s atopická dermatitida a astma.

Protein kódovaný tímto genem slouží jako a srdeční biomarker.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115602 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026069 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: IL1RL1 interleukin 1 receptor like 1“.
^ Tominaga S, Yokota T, Yanagisawa K, Tsukamoto T, Takagi T, Tetsuka T (prosinec 1992). "Nukleotidová sekvence komplementární DNA pro lidský ST2". Biochim. Biophys. Acta. 1171 (2): 215–8. doi:10.1016 / 0167-4781 (92) 90125-j. PMID 1482686.
^ Dale M, Nicklin MJ (duben 1999). „Klastr receptoru interleukinu-1: genová organizace IL1R2, IL1R1, IL1RL2 (IL-1Rrp2), IL1RL1 (T1 / ST2) a IL18R1 (IL-1Rrp) na lidském chromozomu 2q“. Genomika. 57 (1): 177–9. doi:10.1006 / geno.1999.5767. PMID 10191101.
^ Brint, Elizabeth K; Xu, Damo; Liu, Haiying; Dunne, Aisling; McKenzie, Andrew N J; O'Neill, Luke A J.; Liew, Foo Y (2004). „ST2 je inhibitorem signalizace receptoru interleukinu 1 a Toll-like receptoru 4 a udržuje toleranci endotoxinu“. Přírodní imunologie. 5 (4): 373–9. doi:10.1038 / ni1050. PMID 15004556. S2CID 29364769.
^ Braunwald, Eugene (2013). "Srdeční selhání". JACC: Srdeční selhání. 1 (1): 1–20. doi:10.1016 / j.jchf.2012.10.002. PMID 24621794.

Další čtení

Tominaga S, Yokota T, Yanagisawa K a kol. (1993). "Nukleotidová sekvence komplementární DNA pro lidský ST2". Biochim. Biophys. Acta. 1171 (2): 215–8. doi:10.1016 / 0167-4781 (92) 90125-j. PMID 1482686.
Gayle MA, Slack JL, Bonnert TP a kol. (1996). "Klonování domnělého ligandu pro receptor T1 / ST2". J. Biol. Chem. 271 (10): 5784–9. doi:10.1074 / jbc.271.10.5784. PMID 8621446.
Yanagisawa K, Naito Y, Kuroiwa K a kol. (1997). "Exprese genu ST2 v pomocných T buňkách a vazba proteinu ST2 na buňky RPMI8226 odvozené od myelomu". J. Biochem. 121 (1): 95–103. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a021577. PMID 9058198.
Kumar S, Tzimas MN, Griswold DE, Young PR (1997). „Exprese ST2, homologu receptoru interleukinu-1, je vyvolána prozánětlivými stimuly“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 235 (3): 474–8. doi:10.1006 / bbrc.1997.6810. PMID 9207179.
Löhning M, Stroehmann A, Coyle AJ a kol. (1998). „T1 / ST2 je přednostně exprimován na myších buňkách Th2, nezávisle na interleukinu 4, interleukinu 5 a interleukinu 10, a je důležitý pro funkci efektoru Th2“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (12): 6930–5. Bibcode:1998PNAS ... 95.6930L. doi:10.1073 / pnas.95.12.6930. PMC 22690. PMID 9618516.
Moritz DR, Rodewald HR, Gheyselinck J, Klemenz R (1998). „Antigen T1 související s receptorem IL-1 je exprimován na nezralých a zralých žírných buňkách a na předcích žírných buněk fetální krve“. J. Immunol. 161 (9): 4866–74. PMID 9794420.
Saccani S, Polentarutti N, Penton-Rol G a kol. (1999). „Divergentní účinky LPS na expresi členů rodiny receptorů IL-1 v mononukleárních fagocytech in vitro a in vivo“. Cytokin. 10 (10): 773–80. doi:10.1006 / cyto.1998.0359. PMID 9811530.
Dale M, Nicklin MJ (1999). „Klastr receptoru interleukinu-1: genová organizace IL1R2, IL1R1, IL1RL2 (IL-1Rrp2), IL1RL1 (T1 / ST2) a IL18R1 (IL-1Rrp) na lidském chromozomu 2q“. Genomika. 57 (1): 177–9. doi:10.1006 / geno.1999.5767. PMID 10191101.
Iwahana H, Yanagisawa K, Ito-Kosaka A a kol. (1999). „Různé použití promotoru a více iniciačních míst transkripce lidského genu ST2 souvisejícího s receptorem interleukinu-1 v buňkách UT-7 a TM12“. Eur. J. Biochem. 264 (2): 397–406. doi:10.1046 / j.1432-1327.1999.00615.x. PMID 10491084.
Tominaga S, Kuroiwa K, Tago K a kol. (1999). "Přítomnost a exprese nové variantní formy produktu genu ST2 v lidské leukemické buněčné linii UT-7 / GM". Biochem. Biophys. Res. Commun. 264 (1): 14–8. doi:10.1006 / bbrc.1999.1469. PMID 10527832.
Li H, Tago K, Io K a kol. (2000). "Klonování a nukleotidová sekvence lidské ST2L cDNA". Genomika. 67 (3): 284–90. doi:10,1006 / geno.2000.6269. PMID 10936050.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Sweet MJ, Leung BP, Kang D a kol. (2001). „Nová cesta regulující lipopolysacharidem indukovaný šok ST2 / T1 prostřednictvím inhibice exprese Toll-like receptoru 4“. J. Immunol. 166 (11): 6633–9. doi:10,4049 / jimmunol.166.11.6633. PMID 11359817.
Tago K, Noda T, Hayakawa M a kol. (2001). "Distribuce tkání a subcelulární lokalizace variantní formy lidského genu ST2, ST2V". Biochem. Biophys. Res. Commun. 285 (5): 1377–83. doi:10.1006 / bbrc.2001.5306. PMID 11478810.
Lécart S, Lecointe N, Subramaniam A, et al. (2002). "Aktivované, ale ne odpočívající lidské Th2 buňky, na rozdíl od Th1 a T regulačních buněk, produkují rozpustný ST2 a exprimují nízké hladiny ST2L na buněčném povrchu". Eur. J. Immunol. 32 (10): 2979–87. doi:10.1002 / 1521-4141 (2002010) 32:10 <2979 :: AID-IMMU2979> 3.0.CO; 2-5. PMID 12355452.
Brint EK, Fitzgerald KA, Smith P a kol. (2003). "Charakterizace signálních drah aktivovaných homologem receptoru interleukinu 1 (IL-1) T1 / ST2. Role Jun N-terminální kinázy při indukci IL-4". J. Biol. Chem. 277 (51): 49205–11. doi:10,1074 / jbc.M209685200. PMID 12368275.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Haga Y, Yanagisawa K, Ohto-Ozaki H a kol. (2003). "Účinek produktu genu ST2 na růst nezávislý na ukotvení buněčné linie glioblastomu, T98G". Eur. J. Biochem. 270 (1): 163–70. doi:10.1046 / j.1432-1033.2003.03377.x. PMID 12492487.
Weinberg EO, Shimpo M, Hurwitz S, et al. (2003). „Identifikace sérového rozpustného receptoru ST2 jako nového biomarkeru srdečního selhání“. Oběh. 107 (5): 721–6. doi:10.1161 / 01.CIR.0000047274.66749.FE. PMID 12578875.
Gevaert K, Goethals M, Martens L a kol. (2004). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115602 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026069 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: IL1RL1 interleukin 1 receptor like 1“.

[pmid1482686-6] Tominaga S, Yokota T, Yanagisawa K, Tsukamoto T, Takagi T, Tetsuka T (prosinec 1992). "Nukleotidová sekvence komplementární DNA pro lidský ST2". Biochim. Biophys. Acta. 1171 (2): 215–8. doi:10.1016 / 0167-4781 (92) 90125-j. PMID 1482686.

[pmid10191101-7] Dale M, Nicklin MJ (duben 1999). „Klastr receptoru interleukinu-1: genová organizace IL1R2, IL1R1, IL1RL2 (IL-1Rrp2), IL1RL1 (T1 / ST2) a IL18R1 (IL-1Rrp) na lidském chromozomu 2q“. Genomika. 57 (1): 177–9. doi:10.1006 / geno.1999.5767. PMID 10191101.

[pmid15004556-8] Brint, Elizabeth K; Xu, Damo; Liu, Haiying; Dunne, Aisling; McKenzie, Andrew N J; O'Neill, Luke A J.; Liew, Foo Y (2004). „ST2 je inhibitorem signalizace receptoru interleukinu 1 a Toll-like receptoru 4 a udržuje toleranci endotoxinu“. Přírodní imunologie. 5 (4): 373–9. doi:10.1038 / ni1050. PMID 15004556. S2CID 29364769.

[9] Braunwald, Eugene (2013). "Srdeční selhání". JACC: Srdeční selhání. 1 (1): 1–20. doi:10.1016 / j.jchf.2012.10.002. PMID 24621794.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]