IFNAR2 - IFNAR2

IFNAR2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1N6U, 1N6V, 2HYM, 2KZ1, 2LAG, 3S8W, 3S9D, 3SE3, 3SE4
Identifikátory
Aliasy	IFNAR2, IFN-R, IFN-alfa-REC, IFNABR, IFNARB, IMD45, interferon alfa a beta podjednotka receptoru 2
Externí ID	OMIM: 602376 MGI: 1098243 HomoloGene: 49242 Genové karty: IFNAR2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 21 (lidský)
Konec	33,265,675 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 16 (myš)
Konec	91,405,589 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba interferonu typu I; • vazba protein kinázy; • aktivita receptoru interferonu typu I.; • aktivita cytokinových receptorů;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • extracelulární oblast; • buněčná membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • membrána; • intracelulární; • extracelulární;
Biologický proces	• signální dráha receptoru buněčného povrchu; • reakce na virus; • Kaskáda JAK-STAT; • regulace signální dráhy zprostředkované interferonem typu I.; • interferonová signální dráha typu I; • reakce na interferon-alfa; • reakce na interferon-beta; • obranná reakce na virus; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3455
	15976
	ENSG00000159110
	ENSMUSG00000022971
	P48551
	O35664
NM_207585; NM_000874; NM_001289125; NM_001289126; NM_001289128;
	NM_207584
	NM_001110498; NM_010509; NM_001347258
NP_000865; NP_001276054; NP_001276055; NP_001276057; NP_997467;
	NP_997468
	NP_001103968; NP_001334187; NP_034639
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Řetězec beta interferonu-alfa / beta receptoru je protein že u lidí je kódován IFNAR2 gen.^[5]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je membránový protein typu I, který tvoří jeden ze dvou řetězců receptoru pro interferony alfa a beta. Vazba a aktivace receptoru stimuluje proteinové kinázy Janus, které zase fosforylují několik proteinů, včetně STAT1 a STAT2. Pro tento gen bylo nalezeno několik variant transkriptu kódujících alespoň dvě různé izoformy.^[6]

Interakce

IFNAR2 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000159110 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022971 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Novick D, Cohen B, Rubinstein M (červen 1994). "Lidský interferon alfa / beta receptor: charakterizace a molekulární klonování". Buňka. 77 (3): 391–400. doi:10.1016/0092-8674(94)90154-6. PMID 8181059. S2CID 140206806.
^ „Entrezův gen: interferonový (alfa, beta a omega) receptor 2 IFNAR2“.
^ ^A ^b Usacheva A, Smith R, Minshall R, Baida G, Seng S, Croze E, Colamonici O (červen 2001). „Proteinový receptor obsahující motiv WD pro aktivovanou proteinkinázu C (RACK1) je nutný pro nábor a aktivaci signálního měniče a aktivátoru transkripce 1 přes interferonový receptor typu I“. J. Biol. Chem. 276 (25): 22948–53. doi:10,1074 / jbc.M100087200. PMID 11301323.
^ Croze E, Usacheva A, Asarnow D, Minshall RD, Perez HD, Colamonici O (listopad 2000). „Receptor pro aktivovanou C-kinázu (RACK-1), protein obsahující motiv WD, se specificky asociuje s lidským IFN receptorem typu I“. J. Immunol. 165 (9): 5127–32. doi:10,4049 / jimmunol. 165,9,5127. PMID 11046044.
^ Piehler J, Schreiber G (květen 1999). "Biofyzikální analýza interakce lidského ifnar2 exprimovaného v E. coli s IFNalpha2". J. Mol. Biol. 289 (1): 57–67. doi:10.1006 / jmbi.1999.2726. PMID 10339405.
^ ^A ^b Li X, Leung S, Kerr IM, Stark GR (duben 1997). „Funkční subdomény STAT2 potřebné pro předběžnou asociaci s alfa interferonovým receptorem a pro signalizaci“. Mol. Buňka. Biol. 17 (4): 2048–56. doi:10,1128 / mcb.17.4.2048. PMC 232052. PMID 9121453.
^ Nguyen VP, Saleh AZ, Arch AE, Yan H, Piazza F, Kim J, Krolewski JJ (březen 2002). „Vazba Stat2 na podjednotku receptoru interferonu-alfa 2 není vyžadována pro signalizaci interferonu-alfa“. J. Biol. Chem. 277 (12): 9713–21. doi:10,1074 / jbc.M111161200. PMID 11786546.

Další čtení

Caraglia M, Marra M, Pelaia G, Maselli R, Caputi M, Marsico SA, Abbruzzese A (2005). "Alfa-interferon a jeho účinky na signální transdukční dráhy". J. Cell. Physiol. 202 (2): 323–35. doi:10.1002 / jcp.20137. PMID 15389589. S2CID 4833543.
Raz R, Cheung K, Ling L, Levy DE (1995). „Tři odlišná místa na lidském chromozomu 21 přispívají k citlivosti na interferon-alfa / beta.“ Somat. Cell Mol. Genet. 21 (2): 139–45. doi:10.1007 / BF02255789. PMID 7570186. S2CID 972314.
Lutfalla G, Holland SJ, Cinato E, Monneron D, Reboul J, Rogers NC, Smith JM, Stark GR, Gardiner K, Mogensen KE (1995). „Mutantní buňky U5A jsou doplněny podjednotkou receptoru interferonu alfa beta generovanou alternativním zpracováním nového člena genu klastru cytokinového receptoru“. EMBO J.. 14 (20): 5100–8. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb00192.x. PMC 394613. PMID 7588638.
Domanski P, Witte M, Kellum M, Rubinstein M, Hackett R, Pitha P, Colamonici OR (1995). „Klonování a exprese dlouhé formy beta podjednotky interferonového alfa beta receptoru, která je nutná pro signalizaci“. J. Biol. Chem. 270 (37): 21606–11. doi:10.1074 / jbc.270.37.21606. PMID 7665574.
Novick D, Cohen B, Tal N, Rubinstein M (1995). "Rozpustné a membránou ukotvené formy lidského IFN-alfa / beta receptoru". J. Leukoc. Biol. 57 (5): 712–8. doi:10,1002 / jlb.57.5.712. PMID 7759950.
Platanias LC, Uddin S, Domanski P, Colamonici OR (1996). „Rozdíly v signalizaci interferonu alfa a beta. Interferon beta selektivně indukuje interakci alfa a betaL podjednotek interferonového receptoru typu I“. J. Biol. Chem. 271 (39): 23630–3. doi:10.1074 / jbc.271.39.23630. PMID 8798579.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Croze E, Russell-Harde D, Wagner TC, Pu H, Pfeffer LM, Perez HD (1996). „Lidský interferonový receptor typu I. Identifikace fosfoproteinu spojeného se specifickým receptorem interferonu beta.“. J. Biol. Chem. 271 (52): 33165–8. doi:10.1074 / jbc.271.52.33165. PMID 8969169.
Li X, Leung S, Kerr IM, Stark GR (1997). „Funkční subdomény STAT2 potřebné pro předběžnou asociaci s alfa interferonovým receptorem a pro signalizaci“. Mol. Buňka. Biol. 17 (4): 2048–56. doi:10,1128 / mcb.17.4.2048. PMC 232052. PMID 9121453.
Piehler J, Schreiber G (1999). "Biofyzikální analýza interakce lidského ifnar2 exprimovaného v E. coli s IFNalpha2". J. Mol. Biol. 289 (1): 57–67. doi:10.1006 / jmbi.1999.2726. PMID 10339405.
Chuntharapai A, Gibbs V, Lu J, Ow A, Marsters S, Ashkenazi A, De Vos A, Jin Kim K (1999). „Stanovení zbytků podílejících se na vazbě ligandu a přenosu signálu v lidském receptoru IFN-alfa 2“. J. Immunol. 163 (2): 766–73. PMID 10395669.
Hattori M, Fujiyama A, Taylor TD, Watanabe H, Yada T, Park HS, Toyoda A, Ishii K, Totoki Y, Choi DK, Groner Y, Soeda E, Ohki M, Takagi T, Sakaki Y, Taudien S, Blechschmidt K , Polley A, Menzel U, Delabar J, Kumpf K, Lehmann R, Patterson D, Reichwald K, Rump A, Schillhabel M, Schudy A, Zimmermann W, Rosenthal A, Kudoh J, Schibuya K, Kawasaki K, Asakawa S, Shintani A, Sasaki T, Nagamine K, Mitsuyama S, Antonarakis SE, Minoshima S, Shimizu N, Nordsiek G, Hornischer K, Brant P, Scharfe M, Schon O, Desario A, Reichelt J, Kauer G, Blocker H, Ramser J, Beck A, Klages S, Hennig S, Riesselmann L, Dagand E, Haaf T, Wehrmeyer S, Borzym K, Gardiner K, Nizetic D, Francis F, Lehrach H, Reinhardt R, Yaspo ML (2000). „Sekvence DNA lidského chromozomu 21“. Příroda. 405 (6784): 311–9. Bibcode:2000Natur.405..311H. doi:10.1038/35012518. PMID 10830953.
Croze E, Usacheva A, Asarnow D, Minshall RD, Perez HD, Colamonici O (2000). „Receptor pro aktivovanou C-kinázu (RACK-1), protein obsahující motiv WD, se specificky asociuje s lidským IFN receptorem typu I“. J. Immunol. 165 (9): 5127–32. doi:10,4049 / jimmunol. 165,9,5127. PMID 11046044.
Usacheva A, Smith R, Minshall R, Baida G, Seng S, Croze E, Colamonici O (2001). „Proteinový receptor obsahující motiv WD pro aktivovanou proteinkinázu C (RACK1) je nutný pro nábor a aktivaci signálního měniče a aktivátoru transkripce 1 přes interferonový receptor typu I“. J. Biol. Chem. 276 (25): 22948–53. doi:10,1074 / jbc.M100087200. PMID 11301323.
Nguyen VP, Saleh AZ, Arch AE, Yan H, Piazza F, Kim J, Krolewski JJ (2002). „Vazba Stat2 na podjednotku receptoru interferonu-alfa 2 není vyžadována pro signalizaci interferonu-alfa“. J. Biol. Chem. 277 (12): 9713–21. doi:10,1074 / jbc.M111161200. PMID 11786546.
Chill JH, Nivasch R, Levy R, Albeck S, Schreiber G, Anglister J (2002). "Lidský interferonový receptor: modelování na základě NMR, mapování vazebného místa IFN-alfa 2 a pozorované utahování vyvolané ligandem". Biochemie. 41 (11): 3575–85. doi:10.1021 / bi011778f. PMID 11888273.
Velichko S, Wagner TC, Turkson J, Jove R, Croze E (2002). „Aktivace STAT3 interferony typu I závisí na konkrétních tyrosinech umístěných v cytoplazmatické doméně řetězce interferonového receptoru 2c. Aktivace více STATS probíhá redundantním použitím dvou tyrosinových zbytků.“. J. Biol. Chem. 277 (38): 35635–41. doi:10,1074 / jbc.M204578200. PMID 12105218.
Usacheva A, Kotenko S, Witte MM, Colamonici OR (2002). „Dvě odlišné domény v N-koncové oblasti Janus kinázy 1 interagují s cytokinovými receptory“. J. Immunol. 169 (3): 1302–8. doi:10,4049 / jimmunol.169.3.1302. PMID 12133952.
Gauzzi MC, Canini I, Eid P, Belardelli F, Gessani S (2002). „Ztráta receptorů IFN typu I a snížená citlivost IFN během terminálního zrání lidských dendritických buněk odvozených od monocytů“. J. Immunol. 169 (6): 3038–45. doi:10,4049 / jimmunol.169.6.3038. PMID 12218119.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000159110 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022971 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8181059-5] Novick D, Cohen B, Rubinstein M (červen 1994). "Lidský interferon alfa / beta receptor: charakterizace a molekulární klonování". Buňka. 77 (3): 391–400. doi:10.1016/0092-8674(94)90154-6. PMID 8181059. S2CID 140206806.

[entrez-6] „Entrezův gen: interferonový (alfa, beta a omega) receptor 2 IFNAR2“.

[pmid11301323-7] A ^b Usacheva A, Smith R, Minshall R, Baida G, Seng S, Croze E, Colamonici O (červen 2001). „Proteinový receptor obsahující motiv WD pro aktivovanou proteinkinázu C (RACK1) je nutný pro nábor a aktivaci signálního měniče a aktivátoru transkripce 1 přes interferonový receptor typu I“. J. Biol. Chem. 276 (25): 22948–53. doi:10,1074 / jbc.M100087200. PMID 11301323.

[pmid11046044-8] Croze E, Usacheva A, Asarnow D, Minshall RD, Perez HD, Colamonici O (listopad 2000). „Receptor pro aktivovanou C-kinázu (RACK-1), protein obsahující motiv WD, se specificky asociuje s lidským IFN receptorem typu I“. J. Immunol. 165 (9): 5127–32. doi:10,4049 / jimmunol. 165,9,5127. PMID 11046044.

[pmid10339405-9] Piehler J, Schreiber G (květen 1999). "Biofyzikální analýza interakce lidského ifnar2 exprimovaného v E. coli s IFNalpha2". J. Mol. Biol. 289 (1): 57–67. doi:10.1006 / jmbi.1999.2726. PMID 10339405.

[pmid9121453-10] A ^b Li X, Leung S, Kerr IM, Stark GR (duben 1997). „Funkční subdomény STAT2 potřebné pro předběžnou asociaci s alfa interferonovým receptorem a pro signalizaci“. Mol. Buňka. Biol. 17 (4): 2048–56. doi:10,1128 / mcb.17.4.2048. PMC 232052. PMID 9121453.

[pmid11786546-11] Nguyen VP, Saleh AZ, Arch AE, Yan H, Piazza F, Kim J, Krolewski JJ (březen 2002). „Vazba Stat2 na podjednotku receptoru interferonu-alfa 2 není vyžadována pro signalizaci interferonu-alfa“. J. Biol. Chem. 277 (12): 9713–21. doi:10,1074 / jbc.M111161200. PMID 11786546.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]